The heterogeneity of hepatocellular carcinoma (HCC) and individual disparities in immunotherapy response necessitate the urgent development of accurate evaluation tools. Programmed cell death (PCD) is implicated in the occurrence and development of HCC. Moreover, immune-related genes have a crucial role in cancer progression and patient prognosis. This study employed 10 clustering algorithms to conduct high-resolution molecular subtyping based on PCD-related genes, immune-related genes, microRNA, long non-coding RNA, and methylation data. Subsequently, we developed hepatocellular carcinoma con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colon cancer remains one of the leading causes of cancer-related deaths worldwide and is associated with high rates of recurrence and metastasis despite advances in therapy. The tumor microenvironment (TME), characterized by complex immune and stromal interactions, plays a pivotal role in tumor progression and treatment resistance. Neutrophil extracellular traps (NETs), an emerging component of the TME, have been implicated in promoting tumor invasion, metastasis, and immune evasion. However, their specific role in colon cancer remains unclear.
METHODS: Comprehensive transcriptomi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The vascular endothelial growth factor (VEGF) signaling family plays a role in neurodegenerative diseases, including Alzheimer's disease (AD). Previous work has shown widespread effects of the members FLT1, FLT4, and VEGFB on AD outcomes. However, these analyses have focused within the non-Hispanic White (NHW) population.
NETHODS: The goal of this study was to analyze the effects of the VEGF family in underrepresented populations, leveraging large and diverse bulk RNA sequencing and tandem mass tag-mass spectrometry (TMT-MS) proteomic data. Outcomes included measures of AD patho
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heterogeneity in the severity of Parkinson's disease (PD) inhibits the effective interpretation of clinical trial outcomes. Multi-omics analysis may help explain the pathological mechanisms underlying disease progression and reveal biomarkers of clinical severity. We performed Multi-Omics Factor Analysis (MOFA) on whole blood RNA, miRNA and cerebrospinal fluid (CSF) and blood plasma proteomics from the Parkinson's Progression Marker Initiative (PPMI), to identify molecular factors correlated with motor (MDS-UPDRS3) and cognitive (Semantic Fluency Test, SFT) function. Three molecular factors si
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gemcitabine and cisplatin (GP) serve as first-line induction chemotherapy (IC) for nasopharyngeal carcinoma (NPC), yet predictive markers are lacking. Here we performed multi-omics profiling, including proteomics, phosphoproteomics, genomics and transcriptomics, on 240 patients with NPC who were receiving GP-IC or concurrent chemoradiotherapy (CCRT) alone. Through multi-omic integration, we identified three proteomic subtypes with distinct therapeutic vulnerabilities. The S1 subtype showed a predominant interferon-γ response and had favorable outcomes with CCRT alone. The S2 subtype featured c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Obesity is a systemic disorder with heterogeneous fat distribution and complex metabolic complications. Conventional genome-wide association studies (GWAS) typically analyze individual obesity-related traits separately, limiting the identification of shared genetic architecture and key regulatory mechanisms, particularly those involving non-coding variants.
METHODS: We integrated GWAS data for five obesity traits (body mass index, waist circumference, visceral fat, liver fat, and body fat percentage) using genomic structural equation modeling (GSEM) to construct a multivariate phe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune diseases (AIDs) affect 5-10% of the global population, yet effective diagnosis and treatment remain challenging due to their complexity and heterogeneity. Autoantibodies serve as crucial biomarkers for disease classification and prognosis, making comprehensive autoantigen profiling essential for advancing our understanding of autoimmune pathogenesis. Phage ImmunoPrecipitation sequencing (PhIP-Seq) has emerged as a transformative high-throughput technology that combines phage display with next-generation sequencing to comprehensively profile antibody-antigen interactions. This review
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Central nervous system (CNS) tumors represent a heterogeneous group of neoplasms associated with significant morbidity and mortality despite their relatively low incidence. Advances in the fifth edition of the World Health Organization (WHO) classification have emphasized the integration of histopathological, immunohistochemical, and molecular features, fundamentally transforming diagnostic and prognostic frameworks in neuro-oncology. This manuscript aims to provide an overview of CNS tumor biology, focusing on key diagnostic markers, genetic and epigenetic alterations, and emerging therapeuti
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To build a comprehensive biobank integrated in the Swedish Heart Failure Registry (SwedeHF) comprising comprehensive clinomic data, proteomic, transcriptomic and genomic information in combination with clinical and diagnostic characteristics and additional ICD-code registry data.
METHODS: Blood and urine samples will be biobanked at SwedeHF registration with an optional second sampling after 6 months in patients with HF attending routine clinical visits at nine hospitals with access to healthcare integrated biobanking. Circulating and urine biomarkers will be investigated by proteomic,
СтатьяМногоцентровое исследованиеНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 2 diabetes (T2D) subgroups defined by clinical variables differ in disease progression and treatment response. To uncover potential molecular drivers of this heterogeneity, we performed a multi-omics analysis of 826 drug-naïve T2D patients from two phase 3 trials of the insulin sensitizer chiglitazar. Here we show that severe insulin-resistant diabetes (SIRD) is characterized by distinct miRNA profiles (e.g., miR-122-5p) correlated with liver injury, and metabolic shifts in amino acids and primary bile acids. Mild obesity-related diabetes (MOD) showed the lowest level of phenylacetylgluta
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bronchial asthma is a highly heterogeneous chronic inflammatory airway disorder. Syndrome differentiation-guided Traditional Chinese Medicine (TCM) treatment for asthma delivers distinct advantages, including fewer adverse reactions and superior anti-inflammatory efficacy. Nevertheless, the intrinsic biological mechanisms underlying TCM asthma syndromes remain largely uncharacterized, restricting the objective and standardized differentiation of TCM subtypes.
METHODS: We integrated transcriptomic, proteomic, metabolomic and oral microbiome data from asthma patients and healthy con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Explore the potential microbiome and serum metabolome factors and their interactions associated with obesity.
METHODS AND RESULTS: We performed a systematic multi-omics analysis using paired metagenomic and metabolomic profiles-including untargeted serum metabolomics, lipidomics, and short-chain fatty acids (SCFAs)-with body mass index (BMI) from a cohort of 495 US men. Single omics analysis identified 52 gut bacteria species and 31 serum metabolites for potential associations with BMI. Among the identified bacteria, Collinsella stercoris (C. stercoris) (Coef.=-0.147, P = 0.015) was neg
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing limitations of chemical pesticides such as environmental pollution, pathogen resistance, and threats to human and ecosystem health have increased the demand for sustainable, biologically based crop protection methods. Eco-smart biocontrol has emerged as a game-changing paradigm that uses beneficial microorganisms associated with plants to suppress phytopathogens, boost plant immunity, and make agroecosystems more resilient over time. Moving beyond traditional single-strain biocontrol, eco-smart biocontrol integrates multi-omics discovery, artificial intelligence-assisted predict
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIMS: Oxidative damage caused by drought stress is a key factor limiting crop survival and distribution. The desert plant Pugionium dolabratum exhibits extreme drought tolerance, but its intrinsic antioxidant regulatory mechanism remains unclear.
METHODS: In this study, a progressive soil drought treatment was used systematically to evaluate the growth status of P. dolabratum seedlings and the dynamic response of the ascorbate-glutathione (AsA-GSH) cycle.
KEY RESULTS: Integrated transcriptomic and proteomic analyses identified a set of genes significantly and concordantly regu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spatial and temporal intratumoral heterogeneity (ITH) remains a major challenge in the diagnosis, prognosis, and treatment of breast cancer. Recent advances in single-cell and spatial omics technologies have enabled unprecedented resolution of subclonal architectures, evolutionary trajectories, and microenvironmental interactions. This systematic and conceptual review aimed to synthesize and integrate current evidence on spatiotemporal ITH in human breast cancer, bridging empirical data with mechanistic interpretation through high-resolution profiling platforms. METHODS: We conduct
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tumor necrosis factor-alpha-induced proteins (TNFAIPs) are key regulators of inflammation, apoptosis, and immune signaling, yet their integrated roles in breast cancer (BC) remain poorly characterized. While individual TNFAIP members have been studied in other cancers, a comprehensive multi-omics characterization of this gene family in BC is still needed.
METHODS: We performed an integrative bioinformatics analysis using public datasets (UALCAN, TIMER, bc-GenExMiner, cBioPortal, STRING, GeneMANIA, Enrichr, MethSurv, GDSC, CTRP, and HPA) to evaluate TNFAIP family members in BC. Exp
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Although genetic-environmental interactions are established in autism spectrum disorder (ASD), how environmental toxicants confer susceptibility remains unclear. This study aimed to investigate potential relationship between genetically predicted cerebrospinal fluid (CSF), metabolite levels and ASD liability, and to prioritize regulatory genes, key pathways, and candidate environmental toxicants. Methods: Using two ASD GWAS datasets (exploration data: 18,381 ASD cases/27,969 controls; validation data: 18,235 ASD cases/36,741 controls), we applied multi-omics approaches to prioritiz
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gestational diabetes mellitus (GDM) is a prevalent metabolic disorder during pregnancy associated with adverse maternal and fetal outcomes, highlighting the urgent need for novel, genetically supported drug targets due to suboptimal glycemic control and safety concerns with existing therapies. This study integrated cis-expression quantitative trait loci (cis-eQTL) of druggable genes with genome-wide association data to identify putative causal genes for GDM through two-sample Mendelian randomization (MR), with significant associations further validated using multi-tissue summary data-based Men
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Renal fibrosis (RF), a common pathological process driving chronic kidney disease (CKD) progression to end-stage renal failure, is closely associated with oxidative phosphorylation (OXPHOS). Arctigenin (ATG), the main active component of burdock seed, exhibits anti-inflammatory and anti-fibrotic activities, but its mechanisms in RF treatment remain unclear. Here, we performed integrated transcriptomic and proteomic analyses to identify key targets and pathways of ATG in a unilateral ureteral obstruction-induced rat RF model. Multi-omics enrichment analysis revealed that NDUFS8 and NDUFS2 were
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Patients with intracranial space-occupying lesions are highly susceptible to postoperative pneumonia (POP) due to extensive surgical trauma, impaired consciousness, and prolonged immobilization, which severely compromise recovery and increase mortality. While the "gut-lung axis" highlights the role of gut microbiota in distal pulmonary immune regulation, how preoperative gut signatures predict neurosurgical infections remains poorly understood.
METHODS: This prospective study enrolled 50 patients, collecting preoperative and postoperative fecal and plasma samples. 16S rDNA sequenc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования