Phage-plasmids are unique mobile genetic elements that function as plasmids and temperate phages. While it has been observed that such elements often encode antibiotic resistance genes and defense system genes, little else is known about other functional traits they encode. Further, no study to date has documented their environmental distribution and prevalence. Here, we performed genome sequence mining of public databases of phages and plasmids utilizing a random forest classifier to identify phage-plasmids. We recovered 5,712 unique phage-plasmid-like genomes from a remarkable array of dispa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Aerobic composting is an effective pathway for the resource utilization of livestock waste; successful treatment achieves not only efficient nutrient conversion but also attenuates hazardous contaminants like antibiotics and antibiotic resistance genes (ARGs), thereby reducing the safety risks associated with waste application. As a globally prevalent livestock disinfectant, Sodium dichloroisocyanurate (NaDCC) inevitably accumulates as residues in manure. However, whether these residues compromise the microbial mitigation of antibiotics and ARGs during composting remains unclear. Here, we inve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Soil antibiotic resistant genes (ARGs) and mobile genetic elements (MGEs) are associated with agricultural land-use differences. However, assessing the soil antibiotic resistome differences between farmland and pastureland is often limited due to geographically unbalanced sample collection. Leveraging a typical agro-pastoral ecotone in northern China as the study model, we compared the soil microbiome and resistome between 15 adjacent farmland and pastureland pairs using metagenomic sequencing.
RESULTS: Results showed that farmland soils harbored higher soil ARG diversity (+ 2.75%
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microplastics (MPs) and nanoplastics (NPs) act as dynamic environmental vectors across the soil-water continuum, allowing them to enter organisms through direct ingestion, leading to potential tissue accumulation. Under specific exposure conditions, these vectors can undergo trophic transfer through food chains, contributing to combined toxicological risks. This paper reviews how the adsorption and co-transport behaviors of chemical pollutants by MPs and NPs are collectively regulated by the intrinsic physicochemical properties of the material and environmental weathering processes. The format
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This letter engages with the seminal review by Argyrakopoulou et al. Obesity and the Gut-Brain Axis in Type 1 Diabetes Mellitus: Terra Incognita? Curr Obes Rep, https://doi.org/10.1007/s13679-025-00654-8IF:11.0Q1B1 . on the putative role of the gut-brain axis in the rising prevalence of obesity within type 1 diabetes mellitus (T1DM).
OBJECTIVE: We aim to commend the authors while proposing key future research avenues to advance the field from correlation to causation and therapeutic application. We also seek to integrate recent high-impact evidence to contextualize our perspective
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The extensive production of environmental pollutants has heightened susceptibility to intestinal disorders, potentially through alterations in the gut microbiota. However, the precise role of the gut microbiota in environmental pollutant-induced inflammation remains incompletely understood.
METHODS: In this study, wild-type and IL-10-/- mice were employed to simulate the responses of healthy individuals and those genetically predisposed to inflammatory bowel disease (IBD) to environmental toxicants. Mice were exposed to metalaxyl, and an integrated multi-omics approach combining
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer remains a leading cause of morbidity and mortality among women worldwide, with significant heterogeneity in its development and treatment response. Recent advances in understanding the roles of the microbiome and epigenetic regulation have opened new avenues for addressing the complexities of breast cancer progression and therapeutic resistance. This review explores the intricate relationship between the gut and intratumoral microbiomes and epigenetic modifications, such as DNA methylation, histone modifications, and non-coding RNAs. Specifically, we examine how microbial metabol
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cereal vinegar sediment (CVS), a byproduct of traditional vinegar fermentation, has been regarded as a health-promoting product. However, its role in genetically induced hyperlipidemia remains unclear. This study systematically evaluated the effects of Dade-CVS (DD-CVS) and Hengshun-CVS (HS-CVS) on apolipoprotein-E-deficient (Apoe-/-) mice. Both CVS varieties significantly improve certain serological parameters of Apoe-/- mice, although the overall impact on serum indicators remains limited. Nevertheless, 16S rRNA sequencing revealed that CVS treatment reshaped gut microbial communities to a n
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The co-contamination of heavy metals and antibiotic resistance genes (ARGs) poses an increasing challenge to agroecosystems, yet its relationships with rhizosphere metabolism and microbial communities remain poorly understood. We integrated metagenomic sequencing, untargeted metabolomics, and absolute qPCR in a wheat pot experiment to characterize resistome patterns across unplanted bulk soil (O), root-zone soil (PS), and rhizosphere soil (PR) under three Cd treatments. At the booting stage, observed ARG subtype richness and total TPM-normalized ARG abundance were higher in root-associated com
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Climate change is increasing the frequency of extreme temperature events, irregular rainfall patterns and periods of water deficit, which alter soil properties and limit crop performance. These factors often occur simultaneously with other adverse conditions, generating multifactorial stress scenarios that pose a major challenge for agricultural systems. This review examines the reduction and degradation of cropland during the first quarter of the 21st century. Despite this trend, global agricultural productivity has increased in recent decades, largely due to improved knowledge of crop nutrit
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Course-based Undergraduate Research Experiences (CUREs) provide an accessible, scalable platform for scientific discovery. Here, we present the WormFood CURE, which mines environmental bacterial isolates for bioactive secondary metabolites using Caenorhabditis elegans phenotype suppression as a functional readout. Utilizing the multivulva (Muv) phenotype, our pilot cohort interrogated 41 wild bacterial isolates for suppression of Ras/MAPK signaling. We identified one Bacillus safensis isolate BAC-08 and one Bacillus altitudinis isolate BAC-44 that significantly inhibited ectopic vulval precurs
СтатьяПрепринтПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
1,4-Butanediol (1,4-BDO) is a short-chain diol with extensive applications in various industries. Traditional petroleum-based synthesis methods face challenges such as harsh reaction conditions and environmental pollution. Recent advances in bio-based 1,4-BDO synthesis harness synthetic biology tools to engineer the microbial pathways for sustainable production. Three principal biosynthetic routes, the CoA-dependent route, the lignocellulose-derived sugar-catabolizing route, and the amino acid-catabolizing route, have been rationally optimized using enzyme engineering, and dynamic metabolic re
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Blastocystis sp. is a predominant anaerobic eukaryote of the human gastrointestinal tract, with carriage rates exceeding 50% in some populations, particularly in low- and middle-income countries, using molecular methods. Despite its widespread occurrence, its clinical importance continues to be a matter of debate because of its genetic diversity [having 44 subtypes (STs)] and its varied associations with host pathology.
SCOPE: This review summarizes recent findings (2021-2026) on the epidemiology, transmission, pathogenicity, host-microbiome interactions, and subtype-specific char
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Synthetic microbial cocultures, which combine the designed capabilities of multiple microbes into one process, have significant potential for sustainable production of fuels and chemicals. Most studies of defined cocultures have tested relatively low cell densities in batch cultures, not the high cell density fed-batch or continuous processes with cell retention typically required to achieve industrially relevant volumetric productivities. Here, we explore the impact of increased cell density on isopropanol production from the syntrophic coculture of Clostridium ljungdahlii with a genetically
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) in drinking water raises public health concerns, while its anthropogenic sources, transmission dynamics, and health risks remain poorly understood, hindering the development of effective strategies to reduce human exposure. Here we conduct a systematic investigation of anthropogenic contributions to AMR across urban water compartments in a megacity, combining metagenomics and culturomics. We identify 1,309 antibiotic resistance genes (ARGs), and tracking their dynamics across microbial communities and fecal Enterobacteriaceae isolates indicates that ecological co
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IgA nephropathy (IgAN) is the most common glomerulonephritis worldwide, and inflammatory bowel disease (IBD) comprises a group of chronic, relapsing inflammatory bowel disorders. Although IgAN and IBD differ in clinical manifestations, both involve interactions among genetic susceptibility, epigenetic abnormalities, and gut microbiota dysbiosis, ultimately pointing to mucosal immune dysregulation and chronic inflammation. They share similar alterations in gut microecology, characterized by a reduction in short-chain fatty acid-producing protective commensals and an increase in pathogenic symbi
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD), comprising Crohn's disease (CD) and ulcerative colitis (UC), is a chronic relapsing-remitting condition characterized by systemic and intestinal inflammation and immune dysregulation. Up to 47% of IBD patients develop extraintestinal manifestations, yet kidney and urological involvement remain underrecognized. Accumulating evidence has linked IBD to nephrolithiasis, glomerular diseases, tubulointerstitial nephritis, acute kidney injury, chronic kidney disease, and, rarely, amyloid A amyloidosis. Population studies have consistently shown elevated risks for var
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Postbiotics offer improved safety and stability over live probiotics for modulating intestinal immunity, yet the receptor-mediated mechanisms underlying mucosal tolerance remain unclear. Nucleotide-binding oligomerization domain 2 (NOD2), a cytosolic sensor of bacterial cell wall components and a major genetic risk factor for inflammatory bowel disease (IBD), may link microbial signals to regulatory immune programs. Here, we show that heat-killed Lactobacillus sakei CVL-001 (HK CVL-001) promotes intestinal homeostasis through NOD2 signaling. HK CVL-001, but not its culture supernatant, signifi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development of patient-derived organoids (PDOs) has substantially advanced the study of gastrointestinal diseases by providing three-dimensional human models that faithfully recapitulate the structural, molecular, and functional characteristics of native tissues. Unlike conventional two-dimensional cultures and animal models, intestinal organoids preserve epithelial architecture, cellular heterogeneity, and patient-specific genetic features, enabling more physiologically relevant investigations of gastrointestinal physiology and disease. Recent technological advances, including co-culture
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) is a One Health challenge driven by microbial exchange among humans, animals and the environment. Zoological institutions offer useful settings for environmental AMR surveillance. This single-zoo cross-sectional study examined the occurrence, antimicrobial susceptibility and genomic characteristics of nontyphoidal Salmonella enterica (NTS) and clinically relevant Enterococcus spp. in faecal samples from 101 clinically healthy captive ungulates representing seven conservation-priority species at a major urban zoo in the United Arab Emirates. NTS was detected in 4/
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования