The island of Cyprus is located in the Eastern Mediterranean, where leishmaniasis is endemic. Although human visceral and cutaneous leishmaniasis (VL and CL) cases have already been documented on the island, there are limited data on the Leishmania species in northern Cyprus. In this report, we present a CL case diagnosed by both microscopic examination and quantitative real-time PCR (qPCR). The patient, a 79-year-old man residing in northern Cyprus, developed an ulcerative lesion on his left leg. The lesion was surgically excised for histopathological examination, and tissue sections were sta
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We analyzed 612 specimens from 135 patients with monkeypox virus clade IIb in South Korea by using real-time PCR. Crusted and anogenital skin lesions and rectal swab specimens demonstrated the highest positivity rates. Viral loads varied by lesion type, anatomic site, and time since symptom onset, supporting our specimen selection for clade IIb detection.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Broad-spectrum antibiotics are invaluable tools for treating pathogenic infections, but their sustained use can contribute to changes in gut microbiome membership and the emergence of antimicrobial resistance. While these unintended side effects are independently well documented, the relationship between them has seldom been investigated. To address this, we quantified the effects of 28-d antibiotic cocktail exposure on metagenome-assembled genomes and antibiotic resistance genes in common marmosets using a custom whole-genome shotgun sequencing pipeline and quantitative polymerase chain react
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The most common cancer in women is breast cancer (BC). MicroRNA-21 was one of the first oncomiRs to be found at elevated levels … at 95°C for 20 s, annealing at 52°C for 20 s, and extension at 72°C for 30 s. Two separate runs of real-time polymerase chain reaction and reverse transcription (RT) were then performed. Relative quantification of the gene expression levels (fold change) based on computed tomography values was used to examine the data from RT-qPCR for miR-21 and Glyceraldehyde-3-phosphate dehydroge …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine epidemic diarrhea (PED) is a highly contagious intestinal disease owing to porcine epidemic diarrhea virus (PEDV) infection. It is extremely detrimental to newborn piglets and has caused huge economic losses to the global pig industry. In this study, three PEDV strains of G2a PEDV-WF/2023, G2b PEDV-SX/2024 and PEDV-HS/2024 were successfully isolated from small intestine tissue samples with the analysis of their molecular structure characteristics, genetic characteristics and pathogenicity. Notably, these three PEDV strains had multiple unique aa mutations and extensive N-glycosylation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Miamiensis avidus (syn. Philasterides dicentrarchi) leads to high mortality and economic losses in olive flounder (Paralichthys olivaceus) aquaculture. In this study, we developed a real-time PCR assay targeting the cytochrome c oxidase subunit I (cox1) gene of M. avidus to sensitively detect and quantify the parasite in seawater. The assay showed a strong linear correlation between the log copy number of the standard plasmid and Ct values (R2 = 0.9985), achieving an amplification efficiency of 96.26%. The cox1 gene copy number was estimated at 6017 ± 2794 copies per cell. The assay specifical
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Candida auris has emerged as a major fungal pathogen responsible for persistent outbreaks, highlighting the importance of an effective screening strategy to control its spread in healthcare settings. Following a confirmed C. auris infection, we incorporated a specific qPCR assay into the screening process. Contact patients and environmental samples were screened weekly using culture and qPCR methods. We used these results to manage patients' cohorting, room disinfection, and new admissions in real time. The qPCR allowed us to identify 37 colonized patients and detect 47 contaminated environmen
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
American foulbrood (AFB) and European foulbrood (EFB), caused by Paenibacillus larvae and Melissococcus plutonius, respectively, are severe bacterial diseases that significantly affect honey bee health and productivity worldwide. Rapid and accurate diagnosis is essential for effective disease management in apiaries. We developed and validated a multiplex point-of-care (POC) quantitative real-time PCR (qPCR) assay that enables simultaneous and rapid detection of P. larvae and M. plutonius directly in apiaries. Our POC qPCR assay, using the XQ station (Postbio), had diagnostic sensitivity and sp
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Implementing quantitative polymerase chain reaction (qPCR) within a community-based research framework expands the scope and scale of community-driven monitoring and research efforts. The increasing accessibility of qPCR technology and methodology has allowed the incorporation of community partners in numerous ways, ranging from sample collection to running qPCR tests. Here, we report on a community-driven study at Crystal Lake in Beulah, MI, in which qPCR was demonstrated to be a more valuable water testing technique than culture-based methods. Historically high levels of the enteric bacteria
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Goose parvovirus (GPV) remains a major pathogen in waterfowl production, threatening animal health and industry sustainability. In this study, a real-time recombinase polymerase amplification (RPA) assay was developed for rapid and specific detection of GPV. The assay employed a primer‒probe system targeting the VP1 gene and operated under isothermal conditions at 40°C. Analytical sensitivity was determined using serial dilutions of plasmid DNA, establishing a detection limit of 3.0 × 10¹ copies/μL with high linearity (R² = 0.99). No cross-reactivity was observed with other common avian pathog
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
African swine fever (ASF), caused by African swine fever virus (ASFV), has inflicted severe economic losses on China's pig industry. Existing ASFV nucleic acid detection methods struggle to identify infected pigs in the pre-viremic stage, especially for recently emerged recombinant ASFV strains that exhibit delayed clinical symptoms and prolonged virus shedding, posing great challenges to ASF prevention and control. To fit the problem, this study established a TaqMan duplex quantitative polymerase chain reaction (qPCR) assay targeting the ASFV p72 gene and porcine Hp gene for early diagnosis o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Canine astrovirus (mamastrovirus 5 [MAstV5], formerly CaAstV; family Astroviridae, taxon species Mamastrovirus canis) and canine kobuvirus (aichivirus A2 [AiV-A2], formerly CaKoV; Picornaviridae, Kobuvirus aichi) are emerging enteric viruses increasingly detected in both diarrheic and subclinical dogs. Although primarily associated with gastrointestinal illness, recent evidence suggests a potential for systemic dissemination, which remains insufficiently explored. To improve detection, we developed and validated a duplex quantitative real-time PCR (dqPCR) assay for simultaneous identification
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic myeloid leukemia (CML) is a clonal myeloproliferative disorder caused by the BCR::ABL1 fusion gene, resulting from a reciprocal translocation between chromosomes 22 and 9. Quantification of BCR::ABL1 transcript levels in peripheral blood by RT-qPCR represents the gold standard for molecular response (MR) monitoring, providing essential clinical information on treatment efficacy. Xpert® BCR-ABL Ultra is a fully automated in vitro diagnostic test that quantitatively detects e13a2 and e14a2 BCR::ABL1 transcripts using a single-use cartridge that integrates RNA extraction, cDNA synthesis,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Cystic echinococcosis (CE) is a zoonotic disease that causes fluid-filled cysts in internal organs and is a major public health p … healthy controls, and expression levels of miR-146a were evaluated in each group using quantitative real-time polymerase chain reaction. Due to the small and unbalanced control group, bootstrapped confidence intervals were used; time-dependent changes in follow-up patients were analyzed using a linear mixed-effects model and Welch's F test to address variance heterogeneity.
RESULTS …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Echinococcosis, a serious zoonotic parasitic disease caused by tapeworms of the genus Echinococcus, is clinically characterized by a long latent period of up to 10 years. An accurate diagnosis is critical for the efficient management and treatment of patients. The aim of this study was to identify robust diagnostic signatures for echinococcosis.
METHODS: Using co-immunoprecipitation and RNA sequencing (RNA-seq), we comparatively profiled the Argonaute 2-binding microRNAs (abmiRNAs) in hepatocytes of Echinococcus multilocularis-infected mice. Using receiver operating characteristic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Ticks and the pathogens they transmit are widespread in Caribbean animal populations. There is; however, limited information on the diversity of ticks and tick-borne pathogens (TTBPs) in the region. This study aims to identify TTBPs across multiple Caribbean countries using a high-throughput real-time microfluidic PCR system.
METHODS: Six Caribbean territories: Barbados, Guyana, St. Kitts, St. Lucia, Tobago and Trinidad were targeted in this study. Nucleic acids were extracted from individual ticks, and a high-throughput microfluidic real-time PCR system was used to screen for 4
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The yellow fever virus (YF), belonging to the Flaviviridae family, has an RNA genome of 10,862 nucleotides and continues to cause significant epidemics in Africa and South America despite an effective vaccine. Timely laboratory identification is essential for emergency immunization campaigns, but delays often lead to unconfirmed outbreaks. The presence of other diseases with similar symptoms complicates differential diagnosis, particularly in endemic regions, and the recent resurgence of YF activity has renewed interest in this arboviral disease. Genomic DNA (gDNA) and plasmids with cloned tar
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Porcine circovirus 3 (PCV-3) is associated with various pathological conditions, including systemic disease and reproductive disorders; however, its role in skeletal abnormalities has never been elucidated. This study included 36 cases displaying spinal malformations, rib swelling, head edema, gait abnormalities, and/or increased late-term abortions. Investigated animals consisted of 9 aborted fetuses, 9 piglets, 12 weaners, and 6 finishers. Histologically, PCV-3 associated lesions were identified in 23/36 cases (64%), including (peri-)arteritis and rib fractures with prominent callus formatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Japanese encephalitis virus (JEV) poses a significant public health threat in Asia, the Western Pacific, and Australia, necessitating robust surveillance and management strategies. This study evaluates three RT-qPCR assays (Universal JEV, ACDP JEV G4, and VIDRL2 JEV G4) for detecting JEV in piggery wastewater, a promising approach for early outbreak detection. We assessed assay limit of detection (ALOD), process limit of detection (PLOD), and recovery efficiency using gamma-irradiated JEV seeded into wastewater samples, alongside field-derived samples from an Australian piggery. The ACDP JEV G
СтатьяСравнительное исследованиеОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To develop and evaluate a nucleic acid amplification test for spectinomycin-resistant Neisseria gonorrhoeae (N. gonorrhoeae).
METHODS: N. gonorrhoeae-specific primers NG1/NG2 and primers specific to the N. gonorrhoeae rpsE gene mutation (80_82 delTTA) were designed. Genomic nucleic acids of spectinomycin-sensitive and resistant N. gonorrhoeae, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa, and Salmonella typhi were used as templates to be amplified by PCR and quantitative real-time PCR (qPCR). The sensitivity and specificity of the method were evaluated accordingly.
RESULTS: The NG1/NG
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.