Surveillance methods of circulating antibiotic resistance genes (ARGs) are of utmost importance in order to tackle what has been described as one of the greatest threats to humanity in the 21st century. In order to be effective, these methods have to be accurate, quickly deployable, and scalable. In this study, we compare metagenomic shotgun sequencing (TruSeq DNA sequencing) of wastewater samples with a state-of-the-art PCR-based method (Resistomap HT-qPCR) on four wastewater samples that were taken from hospital, industrial, urban and rural areas. ARGs that confer resistance to 11 antibiotic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Difficult-to-treat Streptococcus agalactiae infections are increasingly described in patients with urinary tract infections (UTIs). This occurrence could be due to the production of virulence determinants. This study aimed to characterize the molecular features of S. agalactiae responsible for UTIs.
MATERIALS AND METHODS: In this cross-sectional study, 70 S. agalactiae isolated from UTIs were examined. Antibiotic susceptibility testing was performed using the disk diffusion method. All S. agalactiae isolates were confirmed by atr and dltS PCR assays. Virulence, alpha protein-like,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mycobacterium bovis BCG is a live, attenuated tuberculosis vaccine. While the vaccine protects infants from tuberculosis, complications including disseminated infections have been reported following vaccination. Genetically diverse BCG sub-strains now exist following continuous passaging of the original Pasteur strain for vaccine manufacture. This genetic diversity reportedly influences the severity of disseminated BCG infections and the efficacy of BCG immunization.
METHODS: M. bovis BCG was isolated from infants suspected of being infected with tuberculosis. The whole genome of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pseudomonas is the most common cause of microbial keratitis especially in people who use contact lens. The virulence of Pseudomonas aeruginosa in different eye infections is associated with different virulence factors .
METHODS: In this study, 54 P. aeruginosa isolates including 39 isolates from keratitis and 15 isolates from conjunctivitis were evaluated for their ability to form biofilm, production of protease, elastase, alkaline protease and their antibiotic-resistant patterns. The distribution of the exoS and exoU genes in the test strains were determined using PCR assays.
RE
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Farm animals have been recognised as important carriers and reservoirs of extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing Escherichia coli. The aim of this study was to report the draft genome sequences of two multidrug-resistant (MDR) CTX-M-15-producing E. coli strains (47VL and 13B) isolated from different bovine hosts (a calf and a dairy cow), housed separately in a commercial dairy farm in Brazil.
METHODS: Total genomic DNA of the E. coli isolates was sequenced using an Illumina MiSeq paired-end 300-bp sequencing platform. Sequence reads were de novo assembled using the A5-mise
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, the trends of antimicrobial resistance in Neisseria gonorrhoeae were analysed in Shandong Province of China during 2007 to 2014. Furthermore, the ceftriaxone (CRO) genetic resistance determinants, including penA, mtrR, penB, ponA, and pilQ genes, were sequenced and the molecular mechanisms of decreased susceptibility or resistance to CRO in N. gonorrhoeae were elucidated. Overall, the increasing trends of resistance to penicillin (PEN), tetracycline (TET), and ciprofloxacin (CIP), and decreasing trends of susceptibility to CRO and azithromycin (AZM) were observed in Shandong Pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Because a shortage of new antimicrobial agents is a critical issue at present, and with the spread of multidrug-resistant (MDR) pathogens, the use of fosfomycin to treat infections is being revisited as a "last-resort option." This drug offers a particular benefit in that it is more effective against bacteria growing under oxygen-limited conditions, unlike other commonly used antimicrobials, such as fluoroquinolones and aminoglycosides. In this study, we showed that Escherichia coli strains, including enterohemorrhagic E. coli (EHEC), were more susceptible to fosfomycin when grown anaerobicall
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION AND OBJECTIVE: Enterococci belonging to human and animal gastrointestinal flora are widely-distributed in the environment. They are opportunistic bacteria that can cause severe infections, with the ability to acquire, express and transfer antimicrobial resistance. The aim of the present study was to investigate antimicrobial resistance profiles of Enterococcus spp. strains isolated from cloacal swabs of laying hens of small backyard flocks.
MATERIALS AND METHODS: Susceptibility to 21 antimicrobial agents was tested by the disc diffusion method in 115 Enterococcus spp. strains. Va
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In a recent multi-centre Italian survey (2003-2004), conducted in 45 laboratories throughout Italy with the aim of monitoring microorganisms responsible for severe infections and their antibiotic resistance, Acinetobacter baumannii was isolated from various wards of 9 hospitals as one of the most frequent pathogens. One hundred and seven clinically significant strains of A. baumannii isolates were included in this study to determine the in vitro activity of tigecycline and comparator agents.
METHODS: Tests for the susceptibility to antibiotics were performed by the broth microdilu
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Extended-spectrum cephalosporins (ESCs) are third and fourth generation cephalosporin antimicrobials used in humans and animals to treat infections due to multidrug-resistant (MDR) bacteria. Resistance to ESCs (ESC-R) in Enterobacterales is predominantly due to the production of extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) and plasmid-mediated AmpC β-lactamases (AmpCs). The dynamics of ESBLs and AmpCs are changing across countries and host species, the result of global transmission of ESC-R genes. Plasmids are known to play a key role in this dissemination, but the relative importance of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Staphylococcus epidermis is one of the most frequent causes of device-associated infections due to biofilm formation. Current reports noted that subinhibitory concentrations of antibiotics induce biofilm production in some bacteria. Accordingly, we evaluated the effect of exposure of different subinhibitory concentrations of cloxacillin, cefazolin, clindamycin, and vancomycin on the biofilm formation of methicillin-resistant S. epidermidis (MRSE). Antimicrobial susceptibility testing and minimum inhibitory/bactericidal concentration of antimicrobial agents were determined. MRSE isolates were s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multidrug-resistant Acinetobacter baumannii is an important healthcare-associated pathogen, necessitating therapeutic strategies. This study evaluates the antibacterial efficacy of imipenem-encapsulated chitosan/hydroxypropyl methylcellulose phthalate (Imp-Chi) nanoparticles against clinical A. baumannii isolates.
METHODS: A. baumannii clinical isolates (n = 105) from hospitalized patients were characterized for antibiotic resistance via broth microdilution and classified as MDR, XDR, or PDR. An exploratory PCR screen was performed for the selected AmpC-family genes mox, cit, and
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Klebsiella pneumoniae is a well-known opportunistic pathogen in humans and can cause chronic obstructive pulmonary disease (COPD) in Cystic Fibrosis (CF) patients. This pathogen has developed resistance to β-lactam antibiotics due to the expression of extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) genes, leading to current treatment challenges in these patients. Bacteriophages are alternative and effective treatment options against multidrug-resistant (MDR) pathogens. In this study, a lytic bacteriophage was isolated from untreated sewage, tested against multidrug-resistant K. pneumoniae
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pseudomonas aeruginosa (P. aeruginosa) is one of the most common ones that harm fish. P. aeruginosa has been regarded as one of the most significant threats to the fishing industry, which also affects public health. Thus, the present investigation was done in two steps; the first step was to examine the prevalence and the antibiogram of P. aeruginosa among Nile tilapia (Oreochromas niloticus (O. niloticus)) from aquaculture farms in Kafr El-shiekh Governorate with an emphasis on their antibiotic resistance genes (BlaTEM, tetA, and sul1). The second step was to investigate the effect of levamis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Lower respiratory tract infection (LRTI) remains the leading infectious cause of morbidity and mortality globally. Key bacterial pathogens include Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Staphylococcus aureus and Streptococcus pneumoniae. This study examined the prevalence and antimicrobial resistance patterns of major bacterial pathogens from community- and hospital-acquired LRTIs across six major hospitals in Vietnam.
METHODS: Between January 2022 and May 2023, 1000 bacterial isolates were collected through an isolate-based surve
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background/Objectives: The spread of antimicrobial resistance (AMR) is a growing global health concern. Wild animals can play an important role in the amplification and dissemination of AMR and in conservation efforts aiming at controlling diseases in vulnerable wild animal populations. These animals can serve as reservoirs for antibiotic resistance genes and are key in the spread of AMR across ecosystems and hosts. Therefore, monitoring AMR in wild animals is crucial in tackling the spread of resistance in the environment and human population. This study investigated the phenotypic and genoty
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The rise of carbapenem-resistant hypervirulent Klebsiella pneumoniae (CR-hvKp) strains represents a major clinical threat, particularly in Asia. These strains possess both extensive drug resistance and enhanced virulence traits, leading to high morbidity and mortality. This study aimed to characterize the genomic profile of a CR-hvKp isolate (BB-7) obtained from a clinical case in eastern India and to investigate its resistance and virulence mechanisms.
METHODS: K. pneumoniae BB-7 was obtained from the urine sample of a 75-year-old male and identified by using the VITEK2 system an
СтатьяКлинический случайПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Many multidrug-resistant (MDR) bacteria have evolved through the accumulation of antibiotic resistance genes (ARGs). Although the potential risk of probiotics as reservoirs of ARGs has been recognized, strategies for blocking the transfer of ARGs while using probiotics have rarely been explored. The probiotic Escherichia coli Nissle 1917 (EcN) has long been used for treating intestinal diseases. Here, we demonstrate frequent transfer of ARGs into EcN both in vitro and in vivo, raising concerns about its potential risk of accumulating antibiotic resistance. Given that no CRISPR-Cas
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Infant gut microbiota is highly malleable, but the long-term longitudinal impact of antibiotic exposure in early life, together with the mode of delivery on infant gut microbiota and resistome, is not extensively studied.
METHODS: Two hundred and eight samples from 45 infants collected from birth until 2 years of age over five time points (week 1, 4, 8, 24, year 2) were analysed. Based on shotgun metagenomics, the gut microbial composition and resistome profile were compared in the early life of infants divided into three groups: vaginal delivery/no-antibiotic in the first 4 days
Video-Audio MediaСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Studies on antimicrobial resistance (AMR) profiles and epidemiological affirmation for AMR transmission are limited in fisheries and aquaculture settings. Since 2015, based on Global Action Plan on AMR by World Health Organization (WHO) and World Organization for Animal Health (OIE), several initiatives have been under taken to enhance the knowledge, skills and capacity to establish AMR trends through surveillance and strengthening of epidemiological evidence. The focus of this study was to determine the prevalence of antimicrobial resistance (AMR), its resistance profiles and molecular charac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования