INTRODUCTION: The WHO's End TB Strategy promotes using rapid molecular assays as initial diagnosis to reduce tuberculosis globally. This prospective study assessed commercial molecular platforms' effectiveness in diagnosing or ruling out tuberculosis (TB) in a low-prevalence setting.
METHODS: One hundred clinical samples (80 respiratory/20 non-respiratory) were included among all samples routinely received in a mycobacterial laboratory. Five real-time polymerase-chain-reaction (RT-PCR) assays (Xpert-MTB/Rif-Ultra, BDMAX-MDR-TB, RealTime-MTB, FluoroType-MTBDR, Anyplex-MTB/NTM) were characteriz
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) causes PRRS, but noninfectious PRRSV cannot. PCR and ELISA are commonly used for PRRSV detection but they cannot discriminate PRRSV infectivity. Virus isolation is a gold standard to determine virus infectivity. However, it is time-consuming. Therefore, we developed a propidium monoazide (PMA) qPCR assay for rapid and universal detection of infectious PRRSV in this study. After comparing the inactivation efficacies of distinct disinfectants, ultraviolet (UV) light, and heat, heat at 72°C for 15 min was determined as an effe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Identifying a proper reference gene allows us to understand fundamental changes in many biological processes. Normalization during gene expression analyses is essential for every tissue/cell type, including parathyroid tissue glandular cells. Quantitative method of gene expression analyses via qRT-PCR method provides the accurate examination of every target gene. There are limited reports to present commonly used reference genes in human parathyroid tissues rather than for glandular cell types. This study aims to determine and compare the most stable to least stable genes for parathyroid tissu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: This study aimed to validate qPCR assays for specific microbiota, for use on dental plaque samples stored on Whatman FTA cards to compare relative oral health risk in Rett syndrome.
METHODS: Supragingival dental plaque samples were collected, using a sterile swab, (COPAN FLOQswab™) swabbed onto Whatman FTA™ cards. DNA extraction was performed using a modified Powersoil™ protocol. Where published assays were unsuitable, species-specific qPCR assays for caries-associated, gingivitis-associated and oral-health-associated bacteria were designed using multiple sequence alignment, Primer3P
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of this work was to develop a real-time PCR assay with a TaqMan® probe that detects a species-specific part of the 16S rDNA gene of Ehrlichia canis. Canine blood samples (n = 207), collected and tested by a conventional PCR assay within a study conducted by De Salvo et al., were simultaneously analyzed with the novel designed real-time PCR, and the results of both assays were compared. The agreement between the two methods was 97.6 % with a kappa value of 0.92186. Hereby, the standard error was 0.034416 and the 95 % confidence interval from 0.8544 to 0.98931. While the conventional PCR
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Liquid biopsies offer less burdensome sensitive disease monitoring. Bone marrow (BM) metastases, common in various cancers including neuroblastoma, is associated with poor outcomes. In pediatric high-risk neuroblastoma most patients initially respond to treatment, but in the majority the disease recurs with only 40% long-term survivors, stressing the need for more sensitive detection of disseminated disease during therapy.
METHODS: To validate sensitive neuroblastoma mRNA RT-qPCR BM testing, we prospectively assessed serial BM samples from 345 international high-risk neuroblastoma
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endometriosis is one of the common diseases of women, especially in reproductive age, and it is one of the most important causes of infertility in women. The aim of this study was to investigate the level of mRNA-TLR-5 expression in women with endometriosis.
METHODS: The present study was performed in Nikan Hospital, Tehran, Iran, in 2021. The samples of endometrial mucosa for the eutopic group and an ovarian endometriotic cyst for the ectopic group were obtained from the patients who underwent laparoscopic surgery at the Fetal Infertility Center and were diagnosed with endometrio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Emerging tick-borne illnesses, such as anaplasmosis, babesiosis, or ehrlichiosis, are caused by obligate intracellular pathogens that have clinically comparable presentations. Diagnostics used in laboratories today are serologic assays and blood smear analyses, which have known diagnostic limits. This study evaluated the performance of a sample-to-answer direct real-time PCR laboratory-developed test for the multiplex qualitative detection of Anaplasma, Babesia, and Ehrlichia DNA in whole-blood specimens. Compared to two standard-of-care (SOC) methods, the DiaSorin tick-borne labor
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribonucleic acid (RNA) extraction and purification play pivotal roles in molecular biology and cell and gene therapy, where the quality and integrity of RNA are critical for downstream applications. Automated high-throughput systems have gained interest due to their potential for scalability and reduced labor requirements compared to manual methods. However, ensuring high-throughput capabilities, reproducibility, and reliability while maintaining RNA yield and purity remains challenging. This study evaluated and compared the performance of four commercially available high-throughput magnetic b
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sporotrichosis is a chronic granulomatous infection of the skin and subcutaneous tissue that can affect any organ through lymphatic spread. The prevalence of sporotrichosis infections is increasing and its treatment is challenging as there are no unified and standard diagnostic techniques or antifungal medications. Controlling further spread requires a rapid diagnosis. Assessment of clinical symptoms, histological analysis, serological testing, and pathogen culture are all necessary for the diagnosis of sporotrichosis. However, these procedures are unable to identify the species. T
СтатьяОценочное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxsackievirus A6 (CV-A6) has emerged as the predominant causative agent of hand, foot, and mouth disease (HFMD) in young children. Since the declaration of coronavirus disease 2019 (COVID-19) as a global pandemic, the incidence of infectious diseases, including HFMD, has decreased markedly. When social mitigation was relaxed during the COVID-19 pandemic in 2022, the re-emergence of HFMD was observed in Gwangju, South Korea, and seasonal characteristics of the disease appeared to have changed. To investigate the molecular characteristics of enterovirus (EV) associated with HFMD during 2022, 27
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To determine the etiology of cervico-vaginal infections by cytobacteriology and the efficacy of qPCR for the diagnosis of sensitive strains such as Streptococcus agalactiae, Borrelia crocidurae, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae and Treponema pallidum.
METHODOLOGY: This prospective cross-sectional study was performed between January and September 2021 in 346 women who were examined for cervico-vaginal infection at the Hôpital Principal de Dakar (HPD). Cytobacteriological (direct examination, agar culture) and molecular analyses were performed.
RESULTS: Vaginal flora imb
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is a zoonotic disease of global significance, contributing to morbidity and mortality worldwide. It is endemic to tropical regions, with outbreaks during monsoons. The disease manifestations are similar to that of other febrile illness such as dengue, malaria hence often misdiagnosed and underreported. The zoonoses if undetected, progresses to cause severe life-threatening complications also known as Weil's disease. Routine diagnostic tests are based on the detection of antibodies in patient serum and are not accurate during the initial phase of the infection. Therefore, it is ne
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative PCR (qPCR) is a widely-used technique for quantifying the expression of target genes across various tissues, as well as under different pathological and physiological conditions. One of the challenges associated with this method is the need to identify optimal reference genes (RGs) that maintain consistent expression levels under diverse experimental settings, thereby ensuring accurate biological interpretation. In this study, we conducted a thorough analysis of 18 candidate RGs (ACTB, BACH1, B2M, GAPDH, HMBS, HPRT1, PGK1, PPIA, PPIB, RPLP0, RPL19, RPS9, RPS15, RPS28, SDHA, TBP, U
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious diseases are increasingly introduced into Switzerland due to the increased travel activity in recent decades and the import of dogs. Dirofilariasis, caused by Dirofilaria immitis or D. repens, is one of them. An infection with D. repens, the cause of canine subcutaneous dirofilariosis, is often asymptomatic in dogs, but represents a potential zoonotic disease risk for humans. Due to the rapidly increasing number of human cases, D. repens is considered an emerging zoonosis in north-eastern Europe. The prevalence of D. repens infections in dogs and humans in Switzerland is unknown. Si
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Regions with a high prevalence of α-thalassemia (α-thal) require simple, rapid, and accurate tests for carrier screening and prenatal diagnosis. Diagnosis of multiple deletions in a single tube is necessary to clearly identify individuals with α0-thalassemia in the routine setting, especially in at-risk couples. Therefore, we aimed to develop a single-tube multiplex real-time PCR with EvaGreen and high-resolution melting (HRM) analysis for the identification of α0-thalassemia Southeast Asian (SEA), Thai and Chiang Rai (CR) type deletions. The results of the HRM analysis indicated that the ampl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction. Invasive mucormycosis (IM) is a potentially fatal infection caused by fungi of the order Mucorales. Histopathology, culture, and radiology are the mainstays of diagnosis, but they are not sufficiently sensitive, resulting in delayed diagnosis and intervention. Recent studies have shown that PCR-based techniques can be a promising way to diagnose IM.Hypothesis/Gap Statement. Early diagnosis of fungal infections using molecular diagnostic techniques can improve patient outcomes, especially in invasive mucormycosis.Aim. The aim of this study was to evaluate the utility of our in-hou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is a serious threat to global development. Rapid and accurate diagnosis is critical for containing the pandemic and treating patients in time. As the gold standard for SARS-CoV-2 diagnosis, the qualitative reverse transcription-PCR (RT-qPCR) test has long been criticized for its long detection time. In this study, we optimized the primers and probes targeting SARS-CoV-2 ORF1ab and N gene designed by the Chinese Center for Disease Control and Preventions (CDC) to increase their Tm values to meet the optimal elongation temperature of T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anthelmintic resistance to benzimidazole has been detected in the canine hookworm, Ancylostoma caninum. Benzimidazole resistance is believed to have developed originally in greyhounds, but has also been detected in non-greyhound pet dogs. The aim of this study was to validate a probe-based allele-specific real-time PCR tests for the F167Y polymorphism on the β-tubulin isotype-1 gene and to determine the geographic distribution.
METHODS: Allele-specific real-time PCR tests were established and validated to detect the codon 167 polymorphism in the Ancylostoma caninum β-tubulin isoty
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The diagnosis of pulmonary nocardiosis remains challenging. Rapid detection of Nocardia is of primary importance for early diagnosis and precise treatment of nocardiosis. In this study, our objective was to develop and validate a new TaqMan real-time PCR (qPCR) assay for rapidly detecting Nocardia spp. in respiratory samples. Based on published sequence data, primers in a conserved region of the 16S rRNA gene and a probe within that region that was specific for Nocardia were designed. The distinction effect of the qPCR assay was assessed between Nocardia and other respiratory-associated bacter
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.