BACKGROUND: A subset of people living with HIV (PLHIV), known as immunological non-responders (INR), fails to achieve adequate CD4⁺ T cell recovery despite viral suppression with antiretroviral therapy (ART). These individuals face an increased risk of adverse clinical outcomes. This study aims to explore the intracellular mechanisms and molecular signatures underlying this incomplete immune recovery using a multi-omics approach.
METHODS: The study analysed CD4⁺ and CD8⁺ T cells from 100 ART-naïve PLHIV. Participants were classified into controls (baseline CD4⁺ > 200 cells/µL, n = 49) and cas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fracture repair in renal osteodystrophy remains challenging because impaired bone quality compromises fixation stability, while current systemic therapies regulating bone metabolism do not sufficiently address the disease-specific mechanisms underlying defective repair. An integrated strategy combining early fracture stabilization with mechanism-guided local treatment is therefore needed. Here, integrated single-cell RNA sequencing and multi-omics analyses identify inflammatory macrophages as a key pathogenic population, characterized by glycolytic reprogramming driven by hypoxia-inducible fac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatocellular carcinoma remains difficult to treat because immune resistance is organized not only by malignant cell states but also by the spatial architecture of the tumor microenvironment. Single-cell RNA sequencing has clarified cellular heterogeneity in liver cancer, yet tissue dissociation removes the positional relationships that determine whether immune cells can reach and eliminate tumor nests. Spatial transcriptomic, proteomic, and multiplex imaging technologies now make it possible to map immune exclusion, stromal barriers, vascular gatekeeping, tertiary lymphoid structures, macrop
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Eupatorium lindleyanum is a medicinal plant rich in bioactive sesquiterpenoids, yet the genetic and regulatory basis underlying their biosynthesis remains completely unexplored. In particular, the marked tissue-specific accumulation of these compounds-abundant in aerial organs but scarce in roots-lacks a molecular explanation.
RESULTS: Here, we integrated UPLC-MS/MS-based metabolomics with RNA-Seq transcriptomics to comprehensively profile sesquiterpenoid metabolites and their associated gene expression signatures across root, stem, leaf, and flower tissues of Eupatorium lindleyan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Neonatal calf diarrhea is a leading cause of calf mortality and substantial economic loss in the livestock industry, yet the dynamic microbial and metabolic signatures accompanying disease onset remain poorly defined. Here, we integrated 16S rRNA high-throughput sequencing, untargeted metabolomics, and machine learning approaches to longitudinally profile fecal samples from neonatal calves at 0, 5, 10, 15, and 20 days of age. Diarrheic calves exhibited significantly reduced gut microbial α-diversity, as indicated by lower Chao1 richness and Shannon index compared with healthy count
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanisms by which exercise modulates liver metabolism are poorly understood. Leveraging data from molecular transducers of physical activity consortium (MoTrPAC), we analyzed liver adaptations across 1, 2, 4, and 8 weeks of exercise in male and female rats using multi-omics approaches. Female livers displayed a progressive increase in oxidative phosphorylation (OXPHOS) protein complexes, while male livers showed an increased acetylation of OXPHOS, tricarboxylic acid cycle, and fatty acid oxidation enzymes. Mechanistic examination revealed that these sex-specific acetylation events are pa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atrazine (ATR), a widely used triazine herbicide, has been linked to neurotoxicity, yet the epigenetic mechanisms underlying its dopaminergic effects remain unclear. This study investigated whether coordinated miRNA dysregulation and DNA methylation alterations contribute to ATR-induced Parkinson's disease (PD)-like neurotoxicity. Male Sprague-Dawley rats were administered ATR (50 mg/kg/day) for 90 days, resulting in motor and cognitive deficits with dopaminergic dysfunction, including increased α-synuclein and reduced tyrosine hydroxylase expression. Small RNA sequencing identified 72 differe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Autism spectrum disorder (ASD) is a heterogeneous neurodevelopmental disorder with incompletely elucidated underlying biological mechanisms. Circulating proteins serve as an intermediate molecular layer linking genetic variation to downstream biological processes. This study aimed to systematically investigate the causal associations between the plasma proteome and ASD risk, followed by multi-omic and clinical validation.
METHOD: Two-sample Mendelian randomization (MR) was performed to screen 1124 plasma proteins for potential causal links with ASD. Genetically prioritized protein
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The pathogenesis of ulcerative colitis (UC) involves genetic susceptibility and immune dysregulation. However, a more comprehensive understanding of its underlying mechanisms is still required.
METHODS: Weighted correlation network analysis (WGCNA) and Mendelian randomization (MR) were used to investigate the association and causality between lipid metabolism and UC. Hub genes were identified by applying ensemble machine learning (LASSO, SVM, XGBoost) to the merged transcriptomic data, followed by cell-type-specific localization using public single-cell RNA-seq data from UC tissue
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer remains a leading cause of mortality worldwide and a significant barrier to improving quality of life across all populations. The protein kinase D family, including PRKD3, has been demonstrated to play a crucial role in cancer development through its involvement in regulating key cellular processes. Although growing evidence highlights the role of PRKD3 in the tumorigenesis of certain cancers, a comprehensive pan-cancer analysis of PRKD3 remains unavailable. To address this, we performed an integrative pan-cancer analysis of PRKD3 using multi-omics datasets from The Cancer Genome Atlas,
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) exhibits pronounced biological diversity, a feature increasingly attributed to alterations in cellular metabolic reprograms. Serine metabolism supports nucleotide synthesis, redox balance, and epigenetic regulation via one-carbon metabolism, yet its role in shaping the tumor cellular interactions and immune landscape at single-cell level remains unclear.
METHODS: Single-cell transcriptomic profiles (GSE284449) were jointly analyzed with bulk expression datasets (GSE271719), together with Mendelian randomization (MR)-based inference, to dissect serine metabo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Alzheimer's disease (AD) is a heterogeneous disease with diverse disease progression trajectories and brain pathology. Identifying AD subtypes is essential for understanding AD etiology, heterogeneity, and developing precise treatment.
METHODS: We applied a subspace-merging algorithm to integrate multi-omics data from brain tissues of three large AD cohorts and identify data-driven AD subtypes. Within each cohort, we performed multiple analyses to characterize subtype-specific biology. A Phenome-wide Association Study (PheWAS) of expression quantitative trait loci (eQTLs) target
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tongchuan Douchi is a representative Mucor-type fermented soybean product, yet the dynamic evolution of its flavor during long-term fermentation remains insufficiently understood. In this study, an integrated strategy combining gas chromatography-ion mobility spectrometry (GC-IMS), electronic nose (E-nose), and untargeted metabolomics was used to characterize flavor changes in Tongchuan Douchi fermented for 6, 12, 18, and 36 months. The results showed pronounced stage-dependent changes in both volatile organic compounds (VOCs) and taste-related non-volatile metabolites. Prolonged fermentation
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Sleep disorders are multifactorial conditions influenced by genetic and environmental factors. However, the causal roles of specific cellular senescence-related genes in distinct sleep disorders subtypes remain unclear. This study aimed to dissect these relationships by integrating multi-omics data to identify potential causal pathways in sleep apnea and insomnia.
METHODS: We conducted a multi-stage Mendelian randomization (SMR) study. We first performed an exploratory SMR analysis integrating a comprehensive list of senescence-related genes with genome-wide association study (GWA
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) has revolutionized rhinology by enabling the high-resolution dissection of nasal pathophysiology at the genetic level. This article provides a comprehensive overview of scRNA-seq technology and discusses the progressive developments in its application for diagnosing diseases in rhinology, chiefly infective nasal diseases and chronic inflammatory states. It has been instrumental in identifying infection-related genes, linking cellular dynamics to clinical variables such as age and smoking, and deconvoluting complex diseases like chronic rhinosinusitis (CRS
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mild cognitive impairment (MCI), a precursor to Alzheimer's disease (AD), requires precise early diagnosis. Single-omics approaches often miss disease complexity, motivating integrative and interpretable solutions.
NEW METHOD: We present the Attention-based Multimodal Graph Fusion Network (A-MGFN), which integrates clinical, genomic, epigenomic, and transcriptomic data via biologically curated features - Clinico-Genetic Risk Score (CGRS), Curated Epigenomic Signature (CES), and Differential Expression Signature (DES). Each modality is encoded by a modality-specific graph convoluti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myalgic Encephalomyelitis/Chronic Fatigue Syndrome (ME/CFS) is a complex, multi-system disease characterized by a multitude of symptoms across various organ systems. Diagnosis has relied heavily on heterogeneous clinical symptom presentation and evolving case definitions, with treatment focused on addressing presenting symptoms due to the paucity of validated biomarkers. Meanwhile, advances have been made in understanding the underlying pathophysiology through strong epidemiologic, clinical, and basic science studies. This narrative review synthesizes recent advances that are likely to drive a
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Meningitis remains a serious threat to human health; however, the molecular mechanisms underlying this condition, particularly those related to macrophage involvement, have not been fully elucidated. The aim of this study was to identify macrophage-associated hub genes in meningitis and to assess their diagnostic value and associations with immune cell infiltration.
METHODS: Multiple datasets from the Gene Expression Omnibus were analyzed to identify differentially expressed genes (DEGs). Immune cell infiltration was estimated using the CIBERSORT algorithm (Cell-type Identificatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atherosclerotic cardiovascular disease (ASCVD) remains the leading cause of global morbidity and mortality, despite significant advances in lipid-lowering and cardiometabolic therapies. Increasing evidence indicates that atherosclerosis cannot be fully understood as a disease confined to the arterial wall, but rather reflects complex interactions between vascular, immune, metabolic, and perivascular compartments. Among these, perivascular adipose tissue (PVAT) has emerged as a critical regulator of vascular homeostasis and plaque biology due to its unique anatomical proximity and functional co
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Parkinson's disease (PD) is a progressive neurodegenerative disorder characterized by pathological aggregation of α-synuclein and selective loss of dopaminergic neurons. The molecular mechanisms involving microRNA regulation of protein homeostasis remain incompletely understood.
METHODS: We integrated single cell RNA-seq, miRNA-seq, bulk RNA-seq, weighted gene co-expression network analysis (WGCNA), and multi-source weighted data integration to screen key miRNAs and core gene modules. The candidate miRNA combination was validated in an MPP+-induced SH-SY5Y PD cell model by measuri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования