Intra-abdominal infections (IAI) resulting from the perforation of hollow viscera are associated with high morbidity and mortality. In addition to timely surgical source control, rapid and accurate pathogen identification is crucial to guide targeted antimicrobial therapy, particularly in polymicrobial infections involving potentially virulent pathogens. In this prospective study (ClinicalTrials.gov NCT07562204), we compared real-time multiplex PCR Unyvero A50 (Curetis®) as a point-of-care (POC) tool with conventional microbiological culture (cMB). 50 patients with suspected hollow organ perfo
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the 2023 Australian winter respiratory virus season, 2,000 clinical samples were prospectively tested over 47 days (July-August 2023) using the BioFire Respiratory Panel 2.1 plus (RP2.1+) assay, which detects 19 viral and 4 bacterial targets. These samples were retrospectively tested with the RespiV PlexPlus (RespiV) assay, which detects 14 viral targets. RespiV demonstrated high overall percentage agreement with RP2.1+ (99.2%), with a negative percent agreement exceeding 99% for the majority of shared targets. Positive percent agreement was more variable across targets, with more posit
СтатьяОценочное исследованиеСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Distinguishing tuberculous meningitis (TBM) from other causes of meningitis remains challenging in high-burden settings because clinical features overlap and existing assays often delay etiologic confirmation. We evaluated MeltArray CNS, a highly multiplexed PCR assay targeting 85 meningitis-associated pathogens, for etiologic diagnosis in patients with suspected meningitis. Analytical performance was assessed using pre-characterized targets. MeltArray was compared head-to-head with metagenomic next-generation sequencing (mNGS) in 79 cerebrospinal fluid (CSF) specimens, with discre
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Lower respiratory tract infections frequently involve polymicrobial disease and antimicrobial-resistant pathogens, yet conventional culture may provide an incomplete and delayed microbiological picture. This study evaluated the complementary contribution of multiplex molecular testing and conventional culture in a high-AMR cohort in Egypt.
METHODS AND RESULTS: This retrospective cross-sectional study included 133 specimens collected at Souad Kafafi University Hospital, Egypt, during 2022-2023: 98 sputum records tested using the BioFire FilmArray Pneumonia Plus Panel and conventional cult
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory infections caused by pathogens such as SARS-CoV-2, influenza viruses, and Mycoplasma pneumoniae pose significant diagnostic challenges due to overlapping clinical symptoms, particularly during seasonal outbreaks. Conventional single-pathogen tests and commercial multiplex PCR kits are often costly, time-consuming, and lack flexibility for resource-limited settings. To address these limitations, we developed a novel fluorescence melting curve analysis-based (FMCA-based) multiplex PCR assay for simultaneous detection of six respiratory pathogens, including SARS-CoV-2, influenza A vir
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Although the existence of Candida species in the respiratory tract is often considered commensal, it is crucial to recognize the significance of Candida colonization in immunocompromised or COVID-19 patients. The emergence of Candida auris as an emerging pathogen further emphasizes the importance of monitoring yeast infection/colonization, particularly in COVID-19 patients.
METHODS: In this study, respiratory samples mainly from COVID-19 patients, primarily those suspected of having a fungal infection, were cultured on Sabouraud dextrose agar plates and the yeast colonies were i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We compared pathogen detection between saliva, nasopharyngeal and oropharyngeal swabs in children with respiratory symptoms. The sensitivity in nasopharyngeal swabs was 93% (95% confidence interval [CI]: 78%-98%), in oropharyngeal swabs 79% (95% CI: 60%-90%), in saliva overall 76% (95% CI: 58%-88%) and in 18 saliva samples collected with drooling or sponges, 94% (95% CI: 74%-99%). Saliva could be a relevant specimen alternative.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To present the frequency and spectrum of viral infections in primary immunodeficient children. Methods: The data was obtained from the Kuwait National Primary Immunodeficiency Disorders (PIDs) Registry during the period of 2004-2018. Results: A total of 274 PID children were registered in KNPIDR during the study period with predominance of immunodeficiencies affecting cellular and humoral immunity, followed by combined immunodeficiencies with associated syndromic features and diseases of immune dysregulation. Overall infectious complications affected 82.4% of the patients, and viral
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Scrub typhus, murine typhus, and leptospirosis are widely neglected infectious diseases caused by Orientia tsutsugamushi, Rickettsia typhi, and pathogenic Leptospira spp., respectively. Patients usually present with non-specific symptoms and therefore are commonly diagnosed with acute undifferentiated febrile illness. Consequently, patients face delayed treatment and increased mortality. Antibody-based serological test currently used as gold standard has limitations due to insufficient antibody titers, especially in the early phase of infection. In this study, we aimed to develop multiplex PCR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present a rare male fetus with karyotype of mosaic 45,X that comprises two types of aberrant Y chromosomes arising de novo (Yq12 deletion and isodicentric Yq11.22). Both types of the aberrant Y chromosomes lack the AZFc region which are expected to result in oligospermia but unaffected male external genitalia. Genetic analyses by karyotyping, chromosome microarray (CMA), and multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA) for the fetus revealed conflicting results. Additional molecular cytogenetics tools including fluorescence in situ hybridization (FISH) and multicolor banding (mBA
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Members of the ST127 uropathogenic E. coli (UPEC) clone have a high virulence potential and are also highly virulent in insect infection models. However, strains of this lineage are reported in relatively low numbers in many studies. ST127 strains are also usually widely susceptible to antibiotics and, consequently, their true prevalence may be under-recognized as they will be eradicated during empirical therapy. A genuine concern is the possibility that members of this highly virulent lineage will acquire resistance, leading to a more serious threat. The aim of this study was to desi
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: This study evaluated the AID carbapenemase line probe assay (LPA) for the detection and identification of carbapenem resistance genes in Enterobacteriaceae and other Gram-negative bacilli (GNB) using bacterial cultures and DNA extracts directly from patient urine samples.
METHODS: The AID carbapenemase LPA detects 13 different carbapenemase genes. Test probe accuracy was verified for using clinical Enterobacteriaceae isolates harbouring bla KPC , bla VIM , bla NDM , bla GIM , bla AIM , bla SPM , bla IMP and bla OXA-48 and a well-characterized set of Escherichia coli DH5α strains t
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Central nervous system (CNS) infections are an important cause of childhood morbidity and mortality. The aetiologies of these potentially vaccine-preventable infections have not been well established in Cambodia.
METHODS: We did a one year prospective study of children hospitalised with suspected CNS infection at Angkor Hospital for Children, Siem Reap. Cerebrospinal fluid specimens (CSF) samples underwent culture, multiplex PCR and serological analysis to identify a range of bacterial and viral pathogens. Viral metagenomics was performed on a subset of pathogen negative specimens
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: Streptococcus agalactiae, commonly known as group B Streptococcus (GBS), has been recognised as a worldwide causative pathogenic agent of neonatal sepsis, meningitis and pneumonia. To better understand the behaviour of S. agalactiae in pregnant women from a hospital from the North of Portugal, retrospective analyses were performed to describe epidemiological, clinical and microbiological characteristics of the isolates obtained.
METHODS: Based on laboratorial records and the hospital's patient files, a 6-year retrospective study was performed to analyse S. agalactiae isolates from scree
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Viral respiratory infections continue to pose a major global healthcare burden. At the community level, the co-circulation of respiratory viruses is common and yet studies generally focus on single aetiologies. We conducted the first comprehensive epidemiological analysis to encompass all major respiratory viruses in a single population. Using extensive multiplex PCR diagnostic data generated by the largest NHS board in Scotland, we analysed 44230 patient episodes of respiratory illness that were simultaneously tested for 11 virus groups between 2005 and 2013, spanning the 2009 influenza A pan
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We hypothesized that de novo variants (DNV) might participate in the genetic determinism of sporadic early-onset Alzheimer disease (EOAD, onset before 65 years). We investigated 14 sporadic EOAD trios first by array-comparative genomic hybridization. Two patients carried a de novo copy number variation (CNV). We then performed whole-exome sequencing in the 12 remaining trios and identified 12 non-synonymous DNVs in six patients. The two de novo CNVs (an amyloid precursor protein (APP) duplication and a BACE2 intronic deletion) and 3/12 non-synonymous DNVs (in PSEN1, VPS35 and MARK4) targeted g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Triazole resistance in Aspergillus fumigatus is associated with mutations in cyp51 genes, therefore, a single-tube multiplex PCR was proposed for rapid detection of such mutations.
METHODS: Relevant markers (n = 21) located in cyp51A and cyp51B were amplified in a multiplex reaction and subsequently analyzed by mini-sequencing.
RESULTS: A set of nonresistant A. fumigatus were tested. The markers F46, G89, M172, D255, L358, E427 and C454 located in cyp51A, as well as P394 and S35 from cyp51B, were found to be modified.
CONCLUSIONS: A. fumigatus triazole resistance in Portugal is rare, n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic food-borne bacteria have been associated with severe morbidity and mortality in humans and animals. This study was aimed at determining the prevalence of Staphylococcus aureus, Salmonella spp., and Escherichia coli present in cattle and pigs slaughtered in selected abattoirs in Vhembe District and at determining the susceptibility of the isolates to antibiotics. A total of 176 swab samples (28 cattle and 16 pigs) of the rump, flank, brisket, and neck of the animals were analyzed using standard microbiological methods. E. coli isolates were genotyped to detect pathogenic strains. Of
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Approximately 10 % of all cutaneous melanoma cases occur in a familial context. The major susceptibility gene for familial melanoma is CDKN2A. In Latin America, genetic studies investigating melanoma predisposition are scarce. The aim of this work was to investigate germline CDKN2A point mutations and genomic rearrangements in a cohort of 59 Brazilian melanoma-prone patients. Screening of CDKN2A alterations was performed by sequencing and multiplex ligation probe amplification. Germline CDKN2A mutations affecting p16(INK4a) were detected in 8 unrelated probands (13.6 %), including 7 familial c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hereditary spastic paraplegia (HSP) is a clinically and genetically heterogeneous group of neurodegenerative diseases. Mutations in the spastin (SPAST) gene are the most common cause of pure HSP. However, few data are available regarding the clinical and genetic spectrum of HSP among Chinese patients.
METHODS: Clinical data were collected at diagnosis and follow-up of 42 Chinese patients with pure HSP. All seventeen exons of the SPAST gene were directly sequenced. Additionally, we used a multiplex ligation dependent probe amplification (MLPA) assay targeting the SPAST gene to eval
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования