Sex chromosome length, sex chromatin area and the pattern of sex chromosome replication were determined in the field mouseAkodon azarae (Rodentia Cricetidae). Among the animals studied a group of spontaneously deleted females was included. The complemont in deleted females was 38Xx, being the x a grossly deleted X-chromosome.Length of sex chromosomes expressed as percentage of the haploid set was: X-chromosome 7.89% (±1.18), x-chromosome 1.47% (±0.20), Y-chromosome 1.15% (±0.29). Area of sex chromatin expressed as percentage of the haploid genome was 7.28% (±1.18) in XX females and 3.26% (±0.7…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNAs that are being synthesized and remain tethered to chromatin during transcription are key participants in co-transcriptional gene regulation. They contribute to essential processes such as splicing, transcription elongation, and chromatin structure shaping. Co- and post-transcriptional RNA modifications have emerged as critical regulators of RNA metabolism and may modulate the function of chromatin-associated RNAs, including their interactions with chromatin. Here, we describe a method to isolate nascent, chromatin-associated RNA enriched for specific RNA modifications, using a combination…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chromatin dynamics shape gastric cancer at every stage. In this issue of Cancer Cell, Wang et al. uncover a premalignant chromatin state primed for oncogenic activation alongside a pseudo-gastric subtype that hijacks acid secretion to evade antitumor immunity, revealing gastric proton pumps as a potential therapeutic target.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic variation can alter gene output at multiple levels, from chromatin accessibility and enhancer-promoter communication to RNA processing, translation and protein turnover. The diagnostic challenge is not to catalogue these layers, but to determine which regulatory mechanism is plausible for a given variant, phenotype, tissue and developmental context. This targeted narrative review synthesises representative Mendelian mechanisms across five linked levels: chromatin, transcription, RNA processing and stability, translation, and post-translational proteostasis. Three cross-cutting princ…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The evolution of de novo genes from ancestrally nontranscribed sequences has been reported in a wide range of taxa. However, the DNA sequenc … transcription in other Drosophila species. ATAC-seq in 5 D. melanogaster genotypes showed that open chromatin correlates with the expression state of de novo genes, and is more prevalent in the transcribed than in the nontranscribed alleles. In the outgroup species D. simulans and D. yakuba, the sequences homologous to most D. melanogaster de novo genes hav …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Organisms must coordinate transcriptional responses to immune and metabolic stress, often within the same tissue. In Drosophila and mammals, … ver. Using unbiased CUT&RUN in adult Drosophila nuclei, we find that endogenous Atg8 exhibits broad chromatin occupancy at immune, metabolic, and autophagy loci, and accumulates in nuclei under prolonged high-sugar diet (HSD) and acute Gram-positive infection. We identify two conserved Atg8-interacting motifs (AIMs) within the Rel homology domain of NF-κB/D …
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcriptional remodelling during fasting ensures metabolic adaptation and provides health benefits across species. Although several regulators of fasting-induced transcription and chromatin are known, how nutrient levels directly influence RNA polymerase II (RNAPII) and epigenetic writers remains unclear. Here we show that lipid kinase class 3 phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K-3), a master regulator of autophagy, also functions on chromatin as a co-activator of epigenetic writers to promote RNAPII transcription. PI3K-3 overlaps with transcriptionally engaged RNAPII phosphorylated at Ser5 a…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Functional placentation relies on the precise balance between trophoblast stem cells (TSCs) self-renewal and differentiation, yet how permissive chromatin states are maintained to support trophoblast gene regulatory networks (GRNs) remains poorly understood. Here, we show that CHD8-dependent chromatin licensing is required for human and mouse TSCs maintenance. CHD8 depletion impairs cell-cycle progression and self-renewal and selectively downregulates key stemness-associated genes. In vivo, reduced placental CHD8 expression is associated with recurrent pregnancy loss in humans, and trophoblast…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular function depends on the spatial organization of cells and biomolecules within the tissue microenvironment. Advances in spatial omics have enabled profiling of molecular features such as transcriptome, proteome and epigenome, and there has been rapid progress of imaging-based approaches to study spatial three-dimensional (3D) genome organization. Here we present Spatial-ATAC-Hi-C, a microfluidic‑based platform for genome-wide, spatially resolved joint-profiling of 3D genome organization and chromatin accessibility on tissue slides. Applied to mouse and human brains, Spatial-ATAC-Hi-C r…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome organization determines cell fate and is fundamental for the development of complex organisms. In the nucleus, chromatin forms distinct structures at varying scales with dynamics that allow for genome compaction and accessibility to co-occur. Here, we review the current understanding of such structures and their dynamics, and the corresponding functional consequences. Key advances include elucidating the effects of chromatin structure on chromatin dynamics and vice-versa, defining trans-acting chromatin factors that modulate mesoscale chromatin organization and dynamics, and exploring t…
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eukaryotic genomic DNA is repeatedly wrapped into nucleosome spools: the basic building block of chromatin. This organization regulates the physical accessibility of the genome to gene transcription, replication, and repair regulatory factors. Chromatin compaction is controlled by multivalent weak interactions, resulting in a complicated conformational landscape that remains challenging to characterize. This work reports a method for characterizing chromatin compaction, Free Energy Spectroscopy (FES), which is based on DNA nanotechnology and transmission electron microscopy. This method experi…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During development, cells balance proliferation and differentiation to generate diverse cell types, yet how these transitions are fine-tuned … romocenters and reduced cell division, resulting in fewer stomata and increased trichome formation. Chromatin immunoprecipitation and ATAC-sequencing reveal increased chromatin accessibility at HDL-associated regions and reduced accessibility and expression of stomatal lineage-related genes. Chromatin-state and H3K9me2 analyses further suggest that HDL func …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenosine 5'-triphosphate-dependent switch/sucrose nonfermentable (SWI/SNF)-family chromatin remodelers regulate genome accessibility by repositioning nucleosomes, yet how these complexes diversified across evolution while preserving a common remodeling mechanism has remained unresolved. Here, we determine cryo-electron microscopy structures of the SWI/SNF and RSC (remodels the structure of chromatin) complexes from the thermophilic fungus Chaetomium thermophilum in apo and nucleosome-bound states, providing an evolutionarily informative structural bridge between budding yeast and metazoan rem…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Lgr5+ hepatocytes constitute a specialized lineage central to nutrient and xenobiotic metabolism. In metabolic liver dise … metabolic homeostasis, resulting in marked hepatic lipid accumulation and RILD. DPF2 loss increased chromatin accessibility and histone activation marks at Cyp2 promoters, driving CYP2 enzyme expression and excessive atRA catabolism. The resulting reduction in atRA decreased AMPK phosphorylation throughout the liver. Restoration of atRA rescued AMPK activit …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Histone cell cycle regulator A (HIRA) confers chromatin accessibility and regulates developmental hematopoiesis. Previously, we showed that HIRA expression is higher in patient samples from chronic myeloid leukemia (CML) compared to samples from healthy individuals. However, the underlying mechanism that connects HIRA with chromatin reorganization and pathogenesis of leukemia associated with abnormal hematopoiesis remains unexplained. We developed a HIRA-knockdown K562 CML cell line model for this study, as this cell line showed a maximal expression of HIRA in the myeloid lineage. A proteome-w…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medulloblastoma is a biologically heterogeneous childhood cerebellar tumor harboring frequent chromatin-modifying gene alterations. How these alterations promote transcriptional programs governing malignancy remains poorly defined. To address this knowledge gap, we evaluated chromatin states across medulloblastoma subgroups by multi-modal integration of histone modifications with mutational, DNA methylation and transcriptomic profiles. A bivalent/poised enhancer (EnhBiv) state was specifically enriched at the promoters of neurodevelopmental genes in Group 3/4 medulloblastoma. Integrative bioin…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dentinogenesis, a process essential for tooth function, relies on the precise differentiation of dental papilla cells into odontoblasts. This lineage commitment is governed by complex transcription factor networks. RUNX2 and KLF4, known key TFs co-expressed in this process, were proven to operate synergistically, but the specific cofactors coordinating their activity at the chromatin level remain unknown. Here, we identify the chromatin remodeller BRD9 as a novel interactor of both RUNX2 and KLF4 during odontoblastic differentiation. To probe their shared function, we generated neural crest-sp…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The hepatitis B virus (HBV) is a hepatotropic DNA virus that establishes chronic infections and contributes to liver disease and hepatocellular carcinoma. Although HBV persistence depends on the formation of a nuclear covalently closed circular DNA (cccDNA) minichromosome, the spatial organization of HBV within host chromatin and its impact on host transcriptional and epigenomic landscapes remain poorly understood. In this study, we analyzed the interactions between HBV DNA and host chromatin, the effects of infection on three-dimensional genome organization, and the resulting transcriptional …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования