INTRODUCTION: Down-regulation of apoptosis genes has been implicated in the development and progression of malignant melanoma. We used cDNA microarray to evaluate pro-apoptotic gene expression comparing normal skin to melanoma (thin and thick), nodal disease and distant metastases.
METHODS: Twenty-eight specimens including skin (n = 1), thin melanoma (n = 6), thick melanoma (n = 7), nodal disease (n = 6), and distant metastases (n = 8), were harvested at the time of resection from 16 individuals. RNA was isolated and microarray analysis utilizing the Affymetrix GeneChip (54,000 genetic elemen
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immunotherapy has improved outcomes for a subset of patients with locally advanced cervical cancer. However, many tumors remain immunologically "cold" and fail to respond. Strategies that enhance tumor immunogenicity are therefore of increasing interest. Necroptosis, a regulated form of inflammatory cell death, has emerged as a potential mechanism capable of promoting the anti-tumor immune responses through the release of damage-associated molecular patterns and enhanced antigen presentation. In this study, we performed a systematic review and transcriptomic cross-study consensus analysis of a
СтатьяСистематический обзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ObjectiveProstate cancer (PCa) lacks reliable biomarkers to distinguish indolent from aggressive tumors. Tryptophan metabolism (TM) participates in regulating tumor immunity and malignant progression, yet its prognostic relevance in PCa remains poorly characterized.MethodsTranscriptomic and clinical data of TCGA-PRAD cohort (499 PCa samples and 52 normal prostate tissues) and independent external cohort GSE116918 were collected. Differentially expressed tryptophan metabolism-related genes (TMGs) were screened. Univariate Cox regression and LASSO penalized regression were performed to construct
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cellular senescence, a state of permanent arrest of the cell cycle in response to various damage, exerts dual impact on tumor initiation and progression and has emerged as a promising therapeutic target. However, an applicable tool to quantify senescence remains exclusive. In this study, we investigated the role of senescence in gastric cancer (GC) progression through the analysis of TCGA-STAD cohort. According to senescence-associated gene (SAG) expression signatures, TCGA-STAD was divided into distinct senescence clusters. Cluster B with elevated expression of SAGs was associated with a poor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cytokines are central regulators of inflammation and immune responses within the tumor microenvironment and have been implicated in cancer progression and prognosis. However, the prognostic value of coordinated cytokine-related transcriptional programs across cancer types has not been systematically explored. Pan-cancer transcriptomic and clinical data were analyzed to construct a cytokine-related prognostic signature using least absolute shrinkage and selection operator (LASSO) Cox regression. Patients were stratified into high-risk and low-risk groups based on the derived risk score. Prognos
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pancreatic cancer, characterized by an unfavourable prognosis, necessitates early diagnosis and prompt therapeutic intervention. This study aimed to delineate the functional implications of m6A/m1A/m5C-related genes in pancreatic carcinogenesis and establish a prognostic model. Utilizing data from the TCGA-PAAD cohort (n=178) combined with GTEx normal pancreatic tissues (n=332), we identified 43 genes associated with m6A/m1A/m5C methylation pathways. Significant expression differences in these genes were observed between neoplastic and non-neoplastic tissues, correlating with multiple biologic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sirtuins (SIRT1-SIRT7) are NAD⁺-dependent regulators of mitochondrial metabolism, chromatin remodeling, and stress resilience pathways-processes that are central to both aging biology and breast cancer (BC) heterogeneity. We systematically evaluated their prognostic and transcriptional patterns across molecular subtypes of BC. We constructed an integrated BC dataset comprising gene expression and survival data containing tumors from 55 datasets. Prognostic associations with recurrence-free survival (RFS, n = 4384) were evaluated by univariate Cox and Kaplan-Meier analyses using best cutoffs wi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fipronil (FPN), a widely used phenylpyrazole insecticide, has been associated with neurotoxicity. However, the precise molecular mechanisms underlying its effects on human neural cells, particularly glioblastoma, remain poorly understood. This study aimed to investigate the cytotoxic effects and molecular mechanisms of FPN on the human glioblastoma cell line GBM 8401. GBM 8401 cells were treated with FPN (0-200 μM) for 24 and 48 h. Cell viability was assessed using CCK-8 assay. Transcriptomic changes were analyzed using RNA sequencing. Differentially expressed genes (DEGs) were identified, and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer (BC) is a highly heterogeneous malignancy and remains the leading cause of cancer-related mortality among women worldwide. Although advances in molecular classification and targeted therapies have improved outcomes for certain subtypes, robust prognostic biomarkers applicable across clinical contexts are still lacking. The CRISPR-Cas9 system offers a powerful platform for identifying cancer cell vulnerabilities and may facilitate the development of clinically relevant prognostic models.
METHODS: We integrated genome-wide CRISPR-Cas9 screening data from the DepMap dat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prostate cancer (PCa) is biologically heterogeneous, and its molecular underpinnings remain incompletely define. In this study, we sought to identify genes shared between PCa cells and stem-like subpopulations and to develop a prognostic model.
METHODS: RNA sequencing was performed on PC3 cells and side population stem-like cells (SPC). Primary prostate tumor data were obtained from GSE172301, and The Cancer Genome Atlas (TCGA) provided transcriptomes with clinical annotations. Differential expression, immune microenvironment and infiltration analyses were conducted. Single-cell s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triple-negative breast cancer (TNBC) is an aggressive breast cancer subtype with limited therapeutic options and poor prognosis. Anoikis resistance contributes to tumour dissemination, metastasis and therapeutic resistance. However, anoikis-related molecular signatures integrating single-cell and bulk transcriptomic data for prognostic prediction in TNBC remain insufficiently characterised. Bulk RNA-seq data from TCGA-TNBC and GSE58812, together with single-cell transcriptomic data, were analysed. Anoikis-related genes were identified by WGCNA and single-cell module scoring. A prognostic signa
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND Wilms tumor (WT) development and the ability to form distant metastases are thought to be governed by a wide range of molecular factors, with prominent involvement of microRNAs (miRNAs). However, very few studies have explored alterations in miRNA expression between primary and metastatic WT, and all of them focused on a narrow set of miRNAs. MATERIAL AND METHODS We investigated miRNA expression in primary (10) and metastatic WT (6) and in healthy kidney specimens (10) using formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) samples. miRNA was extracted from FFPE samples using miRNeasy FFPE K
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In women with high-grade serous ovarian cancer, chemotherapy remains the primary standard treatment, despite growing recognition of the disease as highly heterogeneous. Here, we examine the feasibility and clinical utility of comprehensive multimodal molecular profiling to inform treatment decisions. We analyze blood, single-cell and bulk tumor tissue, and malignant ascites using up to eleven technologies (DNA, RNA, protein, and functional assays) within a four-week turnaround time. Hypothetical treatment recommendations are altered for 76% of patients, and multi-omics-guided maintenance thera
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteosarcoma (OS), the most prevalent primary malignant bone tumor with a dismal prognosis, exhibits significant heterogeneity in programmed cell death (PCD) pathways, but its subtype-specific functional mechanisms remain poorly characterized. This study integrated PCD-related gene signatures to delineate molecular subtypes in OS via consensus clustering, successfully defining four distinct subtypes with divergent prognostic outcomes and immune microenvironments. Differential expression, functional enrichment, and protein-protein interaction (PPI) network analyses revealed subtype-specific PCD
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mantle cell lymphoma (MCL) is a biologically heterogeneous B-cell malignancy. Although genomics and transcriptomics have delineated parts of the MCL disease spectrum, proteomics remains largely unexplored. Here, we conducted a comprehensive proteogenomic analysis integrating genomics, transcriptomics, and proteomics on peripheral blood samples from 27 patients with MCL and 4 healthy donors to investigate the translational and posttranslational dimensions of MCL. Our study identified 1296 downregulated and 468 upregulated proteins in MCL cells. The splicing pathways were significantly upregulat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Liposarcoma (LPS) is a common soft tissue sarcoma; however, its molecular pathogenesis and immune cell infiltration remain poorly understood. This study investigated potential driver genes and pathways in LPS and characterized immune cell infiltration patterns to identify potential markers for targeted therapy. Differentially expressed genes (DEGs) in LPS were analyzed by GO and KEGG pathway enrichment analysis. A protein-protein interaction network was constructed using the STRING database and visualized with Cytoscape. mRNA expression of genes with high |logFC| values was verified by RT-qPCR
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mucosa-associated lymphoid tissue (MALT) lymphoma, a common primary extranodal B cell lymphoma that arises in diverse mucosal tissues, has a pathogenesis closely linked to the supportive lymphoma microenvironment (LME). However, its microenvironmental heterogeneity and therapeutic implications remain unclear. Here, we report a cohort of 89 MALT lymphoma samples from multiple anatomical sites, profiled by bulk (n = 89), single-nucleus (n = 16), and spatial (n = 9) RNA sequencing. Integrative analysis of 120 bulk transcriptomes from our cohort and two independent cohorts, guided by cell-type-res
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glucokinase regulatory protein (GCKR) is a metabolic regulator implicated in glucose homeostasis, but its genetic and functional roles in cancer remain poorly understood. Through integrated pan-cancer multiomics and experimental analyses, we mapped the expression and mutational landscape of GCKR with a focus on gastric cancer. GCKR expression was downregulated in most tumors but upregulated in subsets such as kidney renal papillary carcinoma (KIRP) and lung adenocarcinoma (LUAD). Genomic profiling revealed recurrent alterations, with the highest mutation frequencies observed in sarcoma (SARC)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The reasons for the aggressive clinical phenotype of signet ring cell carcinoma (SRCC) have not been fully elucidated. Previous studies suggest similarities in the genotype of colorectal and gastric SRCC and a clear distinction from non-SRCC. The immune microenvironments of gastric and colorectal SRCC have not been comprehensively examined. We isolated RNA from formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) sections of 34 tumor specimens, 10 colorectal SRCC, 24 gastric SRCC, 4 non-SRCC colorectal (CCC), and 3 gastric adenocarcinoma (GCC) samples. The PanCancer Immune Profiling Panel was used to eval
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing incidence and mortality of thyroid cancer (THCA) exacerbates the global cancer burden. Glutamine metabolism is a hallmark metabolic feature of tumors, but its impact on the pathogenesis and progression of THCA remains unclear. Studies retrieved THCA data from TCGA and GEO databases. Cluster analysis, differential expression analysis, and weighted gene co-expression network analysis were used to identify key glutamine metabolism-related genes (GMRGs) in THCA. Identification of key genes through protein-protein interaction network construction, based on expression and diagnosis of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования