A recent study in mice deciphers the complex genetic regulatory network underlying the morphogenesis of the face. The enhancer landscape underlying craniofacial development provides multiple entry points to understand what makes up the face, in natural variation or pathological conditions.
СтатьяКомментарийПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
During the last 2 decades, progress in deciphering the human gene map as well as the discovery of specific defective genes encoding particular proteins in some serious human diseases have resulted in attempts to treat sick patients with gene therapy. There has been considerable focus on human recombinant proteins which were gene-engineered and produced in vitro (insulin, growth hormone, insulin-like growth factor-1, erythropoietin). Unfortunately, these substances and methods also became improper tools for unscrupulous athletes. Biomedical research has focused on the possible direct insertion
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The superoxide dismutase type 1 (SOD1) gene has been implicated in both sporadic and familial forms of amyotrophic lateral sclerosis (ALS). We report four ALS cases carrying pathogenic or likely pathogenic SOD1 variants, characterized by albuminocytologic dissociation and nerve root enhancement.
METHODS: We present the results of the diagnostic work-up, including lumbosacral magnetic resonance imaging (MRI) with gadolinium, electromyography (EMG), and cerebrospinal fluid (CSF) analysis. We also assessed the relationship between the albumin quotient (Q-Alb)-an index of blood-brai
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For animals, dietary protein is critical for the nutrition of the organism and, at the cellular level, protein nutrition translates into amino acid availability. Amino acid deprivation triggers the AAR (amino acid response) pathway, which causes enhanced transcription from specific target genes. The present results show that C/EBPbeta (CCAAT/enhancer-binding protein beta) mRNA and protein content were increased following the deprivation of HepG2 human hepatoma cells of a single amino acid. Although there was a modest increase in mRNA half-life following histidine limitation, the primary mechan
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cranial neural crest cells are multipotent cells that provide head skeletogenic mesenchyme and are crucial for craniofacial patterning. We analyzed the chromatin landscapes of mouse cranial neural crest subpopulations in vivo. Early postmigratory subpopulations contributing to distinct mouse craniofacial structures displayed similar chromatin accessibility patterns yet differed transcriptionally. Accessible promoters and enhancers of differentially silenced genes carried H3K27me3/H3K4me2 bivalent chromatin marks embedded in large enhancer of zeste homolog 2-dependent Polycomb domains, indi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic and epigenetic variation in enhancers is associated with disease susceptibility; however, linking enhancers to target genes and predicting enhancer dysfunction remain challenging. We mapped enhancer-promoter interactions in human pancreas using 3D chromatin assays across 28 donors and five cell types. Using a network approach, we parsed these interactions into enhancer-promoter tree models, enabling quantitative, genome-wide analysis of enhancer connectivity. A machine learning algorithm built on these trees estimated enhancer contributions to cell-type-specific gene expression. To tes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIM: Epigenetic regulation plays an important role in cellular development and differentiation. A detailed map of the DNA methylation dynamics that occur during cell differentiation would contribute to decipher the molecular networks governing cell fate commitment.
METHODS: Illumina MethylationEPIC BeadChip platform was used to describe the genome-wide DNA methylation changes observed throughout hematopoietic maturation by analyzing multiple myeloid and lymphoid hematopoietic cell types.
RESULTS: We identified a plethora of DNA methylation changes that occur during human hematopoietic differ
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cohesin organizes 3D chromatin architecture, including promoter-enhancer loops, yet its loss has surprisingly modest effects on steady-state gene expression. We address this paradox by demonstrating that cohesin acts at different stages of transcription in human cells. First, it promotes Pol II promoter recruitment by facilitating promoter-enhancer communication that maintains active promoter chromatin states. Second, it delays pause release by transiently associating with the transcriptional machinery during the pause-release transition. Kinetic modelling suggests that reduced Pol II recruitm
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary hearing loss accounts for about 60% of congenital deafness. Although adeno-associated virus (AAV)-mediated gene therapy shows substantial potential for treating genetic hearing impairments, there remain significant concerns regarding the specificity and safety of AAV vectors. The sophisticated nature of the cochlea further complicates the challenge of precisely targeting gene delivery. Here, we introduced an AAV-reporter-based in vivo transcriptional enhancer reconstruction (ARBITER) workflow, enabling efficient and reliable dissection of enhancers. With ARBITER, we successfully dem
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Arising from T progenitor cells, T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is an aggressive hematologic malignant tumor, accounting for 15% of childhood ALL and 25% of adult ALL. Composing of putative enhancers in close genomic proximity, super enhancer (SE) is critical for cell identity and the pathogenesis of multiple cancers. Belonging to the cytosolute linker protein group, FYB1 is essential for TCR signaling and extensively studied in terms of tumor pathogenesis and metastasis. Dissecting the role of FYN binding protein 1 (FYB1) in T-ALL holds the potential to improve the tr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent technological advances made in molecular biology and in vitro culture of human and other mammalian cells have led to broad medical and scientific acceptance of the feasibility of gene therapy for genetic diseases. Cancer might practically be one of the attractive targets for such therapy. For the treatment of cancer, it is important to manipulate the gene of interest such that it is expressed solely in cancer cells. We have developed a tissue-specific gene expression system, based on a tissue-specific promoter on a retroviral vector. A murine ecotropic retroviral vector was constructed
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alpha-fetoprotein (AFP) is the main component of mammalian fetal serum. It is synthesized by visceral endoderm of the yolk sac and by fetal liver. Immediately after birth AFP level in blood decreases dramatically. AFP synthesis is reactivated in liver tumors and germinogeneous teratoblastomas, in a lesser degree after chemical and mechanical liver injuries followed by regeneration (i.e., acute viral hepatitis). AFP blood level change is an important marker for liver tumors that is widely used in clinical practice. Therefore, the study of the molecular and cellular mechanisms participating in r
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clear cell sarcoma (CCS) is a rare and highly malignant soft tissue tumor, usually occurring in the deep soft tissues of the distal tendons and aponeurosis of the extremities, especially the feet and knees. CCS originating in the head and neck is extremely rare. The clinical manifestations of CCS in the head and neck are not typical, and the imaging manifestations have certain characteristics, but the diagnosis still depends on pathological examination and genetic testing.
CASE SUMMARY: A 33-year-old male patient had paroxysmal headache for more than 4 years, accompanied by nausea
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
There were some evidences to suggest the correlation between circulating lipid levels and cholecystitis, but no evidence had been indicated the causal relationship between lipid-lowering drugs and cholecystitis. To investigate this, we employed drug target Mendelian randomization (MR), summary-data-based MR (SMR), and genetic colocalization analyses to assess the association between lipid-lowering drugs and cholecystitis. In this study, we used 2 sets of genetic tools to proxy lipid-lowering drugs: elevated high-density lipoprotein cholesterol (CETP), decreased low-density lipoprotein choleste
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies have identified numerous susceptibility loci for spontaneous coronary artery dissection (SCAD), yet translating non-coding genetic associations into molecular mechanisms remains a major challenge. In the present issue, Liu et al. provide functional evidence linking the SCAD-associated variant rs13128814 at the ZNF827 locus to the regulation of a vascular smooth muscle cell (SMC)-specific enhancer. The authors show that the risk allele creates a de novo binding site for nuclear factor I (NFI) transcription factors within a developmentally regulated putative enhan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Zygotic genome activation (ZGA) marks the initial transcription event in embryogenesis, yet the cis-regulatory mechanism remains unclear. Here, utilizing massively parallel reporter assays, we functionally dissect enhancers across mouse genome in DUX-induced 2C-like cells (2CLCs). Through integrated analysis with epigenomic and transcriptomic data from 2CLCs and 2C embryos, active enhancers in totipotent cells are depicted. Among them, a notable proportion of promoters exhibit enhancer activities, showing elevated active chromatin features and correlating with enhanced gene expression during Z
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although emerging evidence indicates that alterations in proteins within nuclear compartments elicit changes in chromosomal architecture and differentiation, the underlying mechanisms are not well understood. Here we investigate the direct role of the abundant nuclear complex protein Matrin3 (Matr3) in chromatin architecture and development in the context of myogenesis. Using an acute targeted protein degradation platform (dTAG-Matr3), we reveal the dynamics of development-related chromatin reorganization. High-throughput chromosome conformation capture (Hi-C) experiments revealed substantial
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Somatostatin is a peptide hormone, which most commonly is produced by endocrine cells and the central nervous system. In mammals, somatostatin originates from pre-prosomatostatin and is processed to a shorter form, i.e., somatostatin-14, and a longer form, i.e., somatostatin-28. The two peptides repress growth hormone secretion and are involved in the regulation of glucagon and insulin synthesis in the pancreas. In recent years, the processing and secretion of somatostatin have been studied intensively. However, little attention has been paid to the regulatory mechanisms that control its expre
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.