Parathyroid hormone (PTH) type 1 receptor (PTH1R), as a typical class B1 G protein-coupled receptor (GPCR), is responsible for regulating bone turnover and maintaining calcium homeostasis, and its dysregulation has been implicated in the development of several diseases. The extracellular domain (ECD) of PTH1R is crucial for the recognition and binding of ligands, and the receptor may exhibit an autoinhibited state with the closure of the ECD in the absence of ligands. However, the correlation between ECD conformations and PTH1R activation remains unclear. Thus, this study combines enhanced sam
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid evolution of SARS-CoV-2 has underscored the need for a detailed understanding of antibody binding mechanisms to combat immune evasion by emerging variants. In this study, we investigated the interactions between Class I neutralizing antibodies BD55-1205, BD-604, OMI-42, P5S-1H1, and P5S-2B10 and the receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 spike protein using multiscale modeling which combined coarse-grained simulations and atomistic reconstruction of conformational landscapes together with mutational scanning of the binding interfaces, dynamic profiling of binding and immune
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The ongoing evolution of SARS-CoV-2 variants has underscored the need to understand not only the structural basis of antibody recognition but also the dynamic and allosteric mechanisms that could be the underlying contributors to their complex broad and escape-resistant neutralization activities. In this study, we employed a multi-scale approach integrating structural analysis, hierarchical molecular simulations, mutational scanning and network-based allosteric modeling to dissect how class 4 antibodies (represented by S2X35, 25F9, and SA55) and class 5 antibodies (represented by S2H97, WRAIR-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A significant body of experimental structures of SARS-CoV-2 spike trimers for the BA.1 and BA.2 variants revealed a considerable plasticity of the spike protein and the emergence of druggable binding pockets. Understanding the interplay of conformational dynamics changes induced by the Omicron variants and the identification of cryptic dynamic binding pockets in the S protein is of paramount importance as exploring broad-spectrum antiviral agents to combat the emerging variants is imperative. In the current study, we explore conformational landscapes and characterize the universe of binding po
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The polysaccharides (PS) surrounding encapsulated bacteria are generally unable to activate T cells and hence do not induce B cell memory (BMEM). PS conjugate vaccines recruit CD4(+) T cells via a carrier protein, such as tetanus toxoid (TT), resulting in the induction of PS-specific BMEM. However, the requirement for T cells in the subsequent activation of the BMEM at the time of bacterial encounter is poorly understood, despite having critical implications for protection. We demonstrate that the PS-specific BMEM induced in humans by a meningococcal serogroup C PS (Men C)-TT conjugate vaccine
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Prion diseases are fatal neurodegenerative disorders where the formation of amyloids is thought to be infectious by templating their conformation on to natively-folded counterparts. Postulated nearly four decades ago, the search for the mechanism behind the conformational templating has proceeded to no avail. Here, we extend the thermodynamic hypothesis of protein folding (Anfinsen's dogma) to the amyloid phenomenon and illustrate that the amyloid conformation (cross-β) is one of two conformational states that are thermodynamically accessible to any protein sequence depending on concentration.
ОбзорСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leading deep learning-based methods for fixed-backbone protein sequence design do not model protein sidechain conformation during sequence generation despite the large role the three-dimensional arrangement of sidechain atoms play in protein conformation, stability, and overall protein function. Instead, these models implicitly reason about crucial sidechain interactions based on backbone geometry and known amino acid sequence labels. To address this, we present FAMPNN (Full-Atom MPNN), a sequence design method that explicitly models both sequence identity and sidechain conformation for each r…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The conformational state of distinct prolines can determine the folding of a protein but equally other biological processes when coupled to a conformation-sensitive secondary reaction. For the neuronal tau protein, the importance of proline conformation is underscored by its interaction with different prolyl cis/trans isomerases. The proline conformation would gain even further importance after phosphorylation of the preceding residue by various proline-directed kinases. A number of molecular diseases including Alzheimer's disease and traumatic brain injury were thereby recently qualified as "
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The molecular conformation of the halogen-free thyroid hormone analogue, N-acetyl-4'-methoxy-3,5,3'-trimethyl-L-thyronine ethyl ester, has beeen determined by X-ray diffraction techniques. The observed molecular conformation is similar to that found for the natural hormone 3,5,3'-triiodo-L-thyronine (T3). In this structure, the 3'-methyl group is distal, the overall conformation is cisoid, and the diphenyl ether conformation is twist--skewed. These structural similarities with T3 show that the conformation features required by the active hormone can still be maintained with methyl substitution
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The misfolding and un-natural fibrillation of proteins/peptides are associated with many conformation diseases, such as human islet amyloid polypeptide (hIAPP) in type 2 diabetes (T2D). Inspired by molecular chaperones maintaining protein homeostasis in vivo, many polymer-based artificial chaperones were introduced to regulate protein/peptide folding and fibrillation. However, the pure polymer chaperones prefer to agglomerate into large-size micelles in the physiological environment and thus lose their chaperone functions, which greatly restricts the application of polymer-based chaperones. He
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
K-turn motifs are universal RNA structural elements providing a binding platform for proteins in several cellular contexts. Their characteristic is a sharp kink in the phosphate backbone that puts the two helical stems of the protein-bound RNA at an angle of 60°. However, to date no high-resolution structure of a naked K-turn motif is available. Here, we present the first structural investigation at atomic resolution of an unbound K-turn RNA (the spliceosomal U4-Kt RNA) by a combination of NMR and small-angle neutron scattering data. With this study, we wish to address the question whether the
Поиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluoroalcohols such as 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol (HFIP) are strong inducers of protein secondary structure. Here, hydrolyzed (3,3,3-trifluoropropyl)trimethoxysilane (3F) is demonstrated to exhibit greater protein conformation inducing activity than HFIP, which is preserved when 3F is copolymerized in tetraethylorthosilicate (TEOS) sol-gels through protein molecular imprinting. Hydrolyzed 3F formed a pre-polymerization complex with the template protein, β-lactoglobulin, inducing distinct α-helical structures as evidenced by circular dichroism. Fluorescence resonance energy transfer betw…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
WASP (Wiskott-Aldrich syndrome protein) has been proposed to adopt a closed conformation (autoinhibited conformation) due to interaction between the carboxy terminal and the GTPase binding domain. Various WASP-interacting proteins have been suggested to relieve this autoinhibition. We have used the split YFP (Yellow Fluorescent Protein) to analyze the conformation of WASP. Saccharomyces cerevisiae cells expressing YFP1-154-WASP-YFP155-238 were found to exhibit YFP fluorescence while cells expressing of YFP1-154-WASP and WASP-YFP155-238 did not suggesting an intramolecular complementation of th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plasma high-density lipoproteins (HDLs) are protein-lipid nanoparticles that transport lipids and protect against atherosclerosis. Human apo … forms, the large particles showed minimal conformational heterogeneity, suggesting a fully extended protein conformation. Mutation-induced structural perturbations in lipid-bound protein were attenuated compared to the free protein and indicated close coupling between the two belt-forming apoA-I molecules. These perturbations propagated to distant lipoprotein sites, e …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Micrometer and submicrometer diameter fibers of recombinant dragline spider silk analogues, synthesized via protein engineering strategies, have been electrospun from 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol (HFIP) and compared with cast films via Raman spectroscopy in order to assess changes in protein conformation that may result from the electrospinning process. Although the solvent casting process was shown to result in predominantly beta-sheet conformation similar to that observed in the bulk, the electrospinning process causes a major change in conformation from beta-sheet to alpha-helix. A pos…
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The wild-type p53 protein can be driven into a conformation corresponding to that adopted by structural mutant forms by heterodimerization with a mutant subunit. To seek partially folded states of the wild-type p53 core domain (p53C) we used high hydrostatic pressure (HP) and subzero temperatures. Aggregation of the protein was observed in parallel with its pressure denaturation at 25 and 37 degrees C. However, when HP experiments were performed at 4 degrees C, the extent of denaturation and aggregation was significantly less pronounced. On the other hand, subzero temperatures under pressure l
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transglutaminase 2 (TG2) is an enzyme which in the open conformation exerts transamidase activity, leading to protein cross-linking and fibrosis. In the closed conformation, TG2 participates in transmembrane signaling as a G protein. The unspecific transglutaminase inhibitor cystamine causes vasorelaxation in rat resistance arteries. However, the role of TG2 conformation in vascular function is unknown. We investigated the vascular effects of selective TG2 inhibitors by myography in isolated rat mesenteric and human subcutaneous resistance arteries, patch-clamp studies on vascular smooth muscl
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rabies is a fatal zoonosis which could affect all mammals. Glycoprotein (G protein) from the rabies virus plays an important role in the binding of virus to target cells. However, expression of the G protein with native conformation has been a great challenge for many years. In this study, we solved this problem by replacing the original signal peptide of rabies virus G protein with the one from the heavy chain of human IgG. The expression levels of recombinant G protein dramatically increased from a few μg/L to 50 mg/L in the culture supernatants. The identity of the recombinant G protein was
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rabies virus (RABV) causes lethal encephalitis and is responsible for approximately 60,000 deaths per year. As the sole virion-surface protein, the rabies virus glycoprotein (RABV-G) mediates host-cell entry. RABV-G's pre-fusion trimeric conformation displays epitopes bound by protective neutralizing antibodies that can be induced by vaccination or passively administered for post-exposure prophylaxis. We report a 2.8-Å structure of a RABV-G trimer in the pre-fusion conformation, in complex with two neutralizing and protective monoclonal antibodies, 17C7 and 1112-1, that recognize distinct epit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PEGylation can improve the protein efficacy by prolonging serum half-life and reducing proteolytic sensitivity and immunogenicity. However, PEGylation may decrease the bioactivity of a protein by interfering with binding of its substrate or receptors. Here, staphylokinase (SAK), a thrombolysis agent for therapy of myocardial infarction, was mono-PEGylated at the C-terminus of SAK far from its bioactive domain. Phenyl, propyl, and amyl moieties were used as linkers between SAK and polyethylene glycol (PEG), respectively. Flexible propyl and amyl linkers lead to loose conformation. In contrast,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования