This prospective cohort study investigated the longitudinal development of the salivary bacteriome, virome, and metabolome during early infancy. We assessed the associations between oral bacteria, viruses, and metabolites from 10 mother-infant dyads, with oral samples collected at 1 and 2 years of age. Forty saliva and plaque samples underwent untargeted metabolomic analysis, and infant saliva samples underwent metagenomic sequencing. Maternal salivary and plaque metabolomic profiles remained largely stable, whereas infant profiles were clearly separated from maternal profiles and changed with
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Sepsis is a life-threatening organ dysfunction syndrome with persistently high global mortality, driven by dysregulated host immune response. Existing single-target therapies fail to simultaneously address hyperinflammation and impaired tissue repair, leading to limited clinical efficacy and repeated translational failures.
METHODS: Integrated multi-omics datasets (scRNA-seq, miRNA-seq, blood/lung RNA-seq) delineated immune cell dynamics and dysregulated pathways in sepsis. Guided by omics findings, we designed two small-molecule combinations (C1, C2) targeting the identified pa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gene knockout (KO) techniques are important for understanding gene function and their impact on organismal traits. This study investigates the effects of targeted KO of SCARB1, TYR, and TYRP1 genes in Oujiang Color common carp, focusing on pigmentation changes, metabolic dysregulation, and host-microbiome interactions. Our multi-omics approach revealed that SCARB1 KO led to complete loss of red pigmentation, while TYR and TYRP1 KOs resulted in hypopigmentation and altered pigmentation patterns. Transcriptomic analysis identified seven key genes (PLA2G4, C3, F2, ERN1, UGP2, purA, and GRIN2A), l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumor heterogeneity remains a major barrier to effective cancer therapy, driving the need for novel biomarkers and targeted strategies. A bibliometric analysis underscored the lack of a systematic pan-cancer study of PLAUR. By integrating functional experiments, multi-omics analyses, and machine learning, we systematically investigated urokinase-type plasminogen activator receptor (PLAUR) across malignancies. PLAUR overexpression was observed in 10 cancer types, with significant prognostic value in 7 of these. Epigenetic analysis revealed its association with specific methylation patterns. Fun
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Age-related hearing loss (ARHL) is a prevalent sensory disorder lacking disease-modifying interventions. The biological drivers, particularly the contribution of the gut microbiota and gut-inner ear crosstalk, remain poorly defined. Here, we utilize germ-free (GF) mice and fecal microbiota transplantation (FMT) to isolate microbiota-dependent effects on ARHL progression. Through integrated metagenomic, metabolomic, and proteomic profiling, we map molecular signatures of auditory aging and uncover functional gut-inner ear network, prioritizing 5-hydroxytryptophan (5-HTP) as a key intermediate m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Pseudomonas aeruginosa is a gram-negative bacterial pathogen capable of forming antimicrobial-tolerant subpopulations known as persister cells. These cells are transient phenotypic variants that can tolerate antimicrobial treatment and have been associated with chronic infections and the development of antibiotic resistance. While persister cells are classically associated with reduced metabolic activity, the characteristics of their metabolism are not well understood, especially in the context of biocides. In this work, we performed an experimental and computational system-level a
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Drug-resistant tuberculosis (DR-TB) undermines global TB control, yet how resistant Mycobacterium tuberculosis strains interact with the lung microbiome, phage communities, and local host immunity remains poorly defined.
METHODS: In a prospective cohort of 130 pulmonary TB patients (49 DR-TB, 81 drug-susceptible TB [DS-TB] patients), bronchoalveolar lavage fluid (BALF) was subjected to paired metagenomic and transcriptomic profiling. Microbial and bacteriophage community structures were assessed by diversity metrics and differential abundance testing, whereas host responses were c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is a globally neglected zoonotic disease caused by pathogenic Leptospira species and characterized by diverse clinical manifestations. However, the molecular immune responses occurring in circulating human immune cells during acute infection remain incompletely understood. Although several leptospiral virulence determinants have been investigated, a detailed characterization of host immune signaling during human infection is still limited. To characterize host molecular responses during acute leptospirosis, we performed integrated transcriptomic and proteomic profiling of periphe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Triple-negative breast cancer (TNBC) is a highly aggressive and heterogeneous breast cancer subtype with limited treatment options. Predicting patient response to chemo-immunotherapy remains challenging, highlighting the need for robust stratification strategies.
METHODS: We performed a multi-parametric analysis combining histological, genomic, transcriptomic, proteomic, and immune profiling in the immunocompetent MMTV-R26Met TNBC mouse model and compared outcomes with patient data from human TNBC cohorts and TNBC tumor microarray. To enable therapeutic testing and functional vali
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Primary Sjögren's syndrome (pSS) is epidemiologically associated with an increased risk of Alzheimer's disease (AD); however, the shared IFN-γ-related immune mechanisms underlying this association remain poorly understood.
METHODS: Peripheral blood transcriptomic, single-cell transcriptomic, and epigenomic datasets from patients with AD and pSS were integrated and analyzed. These findings were further validated using peripheral blood samples from patients and in vitro IFN-γ stimulation experiments to systematically characterize the shared IFN-γ-related immune features.
RESULTS: I
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Understanding complex cellular niches, such as tertiary lymphoid structures, requires spatially resolved, multi-omics approaches that link transcriptional states and protein expression levels within individual cells. Here, we present an integrated spatial multi-omics workflow that enables sequential mapping of hundreds of genes via the Xenium In Situ platform and more than 40 protein markers via imaging mass cytometry technology on a single formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissue section. We applied this multi-modal approach to colorectal liver metastases and matched adjace
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Colorectal cancer (CRC) is a leading cause of cancer-related mortality, necessitating the discovery of novel metabolic biomarkers. Hexokinases (HKs) are pivotal in dysregulated glucose metabolism. However, the role of HKDC1, which is the fifth and most recently identified isoform, remains poorly understood in CRC.
METHODS: We employed an integrated multi-omics approach to characterize HKDC1. Candidate glycolysis-related genes were screened using WGCNA and differential expression analysis across TCGA, GEO, and GTEx datasets. Spatial transcriptomics and single-cell RNA sequencing (s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs (miRNAs) are small noncoding RNAs that play critical regulatory roles in gene expression by targeting messenger RNAs (mRNAs) for degradation or translational inhibition. Their ability to modulate multiple genes simultaneously places them at the center of many biological processes, including those involved in tumorigenesis. Depending on their targets, miRNAs can act as oncogenes or tumor suppressors, contributing to cancer development and progression. Advances in high-throughput sequencing now allow simultaneous profiling of miRNA and mRNA expression in the same biological samples. Wh
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Emerging evidence indicates that coagulation-related molecular programs are associated with thrombosis, tumor progression, and molecular dysregulation in gastric cancer (GC). However, thrombosis-associated molecular features in GC and their potential links to inherited susceptibility remain insufficiently understood. Integrated analyses of transcriptomic data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) and Gene Expression Omnibus (GEO) datasets were performed to identify thrombosis-associated genes and establish a machine learning-based prognostic signature. Genome-wide association study (GWAS), expre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer (GC) constitutes a significant global public health burden due to its high morbidity rates and poor prognosis, underscoring the critical need for identifying novel therapeutic targets and elucidating their mechanisms. As a key member of the lanthionine synthetase C-like enzyme family, LANCL2 has shown aberrant expression in multiple malignancies. However, its biological significance in GC remains unclear. To this end, a series of exploration and research were conducted. Through integrated analyses of multi-omics databases and experimental validation, LANCL2 was up-regulated in S
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Endoplasmic Reticulum (ER) stress is implicated in Alzheimer's disease (AD) development. This study aims to identify ER stress-related genes associated with AD risk.
METHODS: This study used a multi-omics framework based on Summary-data-based Mendelian Randomization (SMR) to investigate associations between ER stress-related genes and AD. Blood-derived quantitative trait loci (QTL) datasets, including methylation (mQTL), expression (eQTL), and protein (pQTL) data, were integrated with AD genome-wide association study (GWAS) results from FinnGen R12 (discovery) and GCST90027158 (va
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nanoplastics (NPs) are emerging contaminants posing significant risks to human health due to their enhanced cellular penetration. NPs have been shown to damage human testes and epididymides, impairing male fertility. However, the specific testicular damage and underlying mechanisms induced by NPs at different ages have not been thoroughly investigated.
RESULTS: In this study, we exposed young (3-month-old) and old (17-month-old) male mice to long-term (3 months) polystyrene nanoplastics (PS-NPs). The results showed that PS-NPs extensively disrupted testicular structures and functi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Immune-related genes (IRGs) have been implicated in autoimmune diseases, but their causal role in GD remains unclear. We conducted a multi-omics Mendelian randomization (MR) analysis integrating genome-wide association study (GWAS) data from GD patients with blood-based methylation quantitative trait loci(mQTLs), expression QTLs(eQTLs), and protein QTLs(pQTLs). SMR analysis was performed to assess the causal associations between IRGs and GD, followed by HEIDI tests to screen for pleiotropy. Colocalization analysis identified shared genetic determinants. We further validated the findings in Fin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Thyroid cancer, the most prevalent endocrine malignancy, frequently presents with lymph node metastasis (LNM), a critical prognostic factor in influencing recurrence and survival. Even with progress in diagnostic and therapeutic strategies, the mechanisms underlying LNM, especially the role of microbial dysbiosis and metabolic reprogramming, remain incompletely understood. This study aimed to elucidate the interplay between gut microbiota, host metabolism, and LNM in thyroid cancer through a multi-tiered analytical framework to address this gap. We selected 90 patients with differentiated thyr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Ischemic stroke (IS), a leading cause of global disability and premature mortality, results from cerebral artery occlusion and subsequent ischemic necrosis. Fatty acid metabolism (FAM) plays a crucial role in energy supply and oxidative damage associated with IS, yet reliable biomarkers and targeted therapies remain elusive, necessitating systematic investigation.
METHODS: We integrated peripheral blood transcriptomes (GSE22255 and GSE58294) to identify FAM-related differentially expressed genes (FRDEGs). Consensus clustering of FRDEG expression classified IS subtypes. Weighted gen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования