Conquering the mutational drug resistance is a great challenge in anti-HIV drug development and therapy. Quantitatively predicting the mutational drug resistance in molecular level and elucidating the three dimensional structure-resistance relationships for anti-HIV drug targets will help to improve the understanding of the drug resistance mechanism and aid the design of resistance evading inhibitors. Here the MB-QSAR (Mutation-dependent Biomacromolecular Quantitative Structure Activity Relationship) method was employed to predict the molecular drug resistance of HIV-1 protease mutants towards
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Penile cancer (PeCa) is a common disease in poor and developing countries, showing high morbidity rates. Despite the recent progress in understanding the molecular events involved in PeCa, the lack of well-characterized in vitro models precludes new advances in anticancer drug development. Here we describe the establishment of five human primary penile cancer-derived cell cultures, including two epithelial and three cancer-associated fibroblast (CAF) cells. Using high-throughput genomic approaches, we found that the epithelial PeCa derived- cells recapitulate the molecular alterations of their
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) is the most common inherited cardiac disease in humans and results in significant morbidity and mortality. Research over the past 25 years has contributed enormous insight into this inherited disease particularly in the areas of genetics, molecular mechanisms, and pathophysiology. Our understanding continues to be limited by the heterogeneity of clinical presentations with various genetic mutations associated with HCM. Transgenic mouse models have been utilized especially studying the genotypic and phenotypic interactions. However, mice possess intrinsic cardi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in CCM1 (aka KRIT1), CCM2, or CCM3 (aka PDCD10) gene cause cerebral cavernous malformation in humans. Mouse models of CCM disease have been established by deleting Ccm genes in postnatal animals. These mouse models provide invaluable tools to investigate molecular mechanism and therapeutic approaches for CCM disease. However, the full value of these animal models is limited by the lack of an accurate and quantitative method to assess lesion burden and progression. In the present study we have established a refined and detailed contrast enhanced X-ray micro-CT method to measure CCM le
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantitative three dimensional structure activity relationship (3D-QSAR) studies were performed on phenothiazine derivatives as Butyrylcholinesterase (BuChE) inhibitors. Pharmacophore Alignment and Scoring Engine (PHASE) was used to develop predictive Common Pharmacophore Hypotheses (CPHs). The alignment thus obtained was used for Comparative Molecular Field Analysis (CoMFA)/Comparative Molecular Similarity Indices Analysis (CoMSIA) model development. A fourpoint common pharmacophore hypothesis, comprising of one acceptor, one hydrophobic region and two aromatic ring centres was generated. A s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Several neurodegenerative diseases, such as Parkinson's disease (PD), Alzheimer's disease (AD), Huntington's disease (HD), amyotrophic lateral sclerosis (ALS), or prion diseases, are known for their intimate association with protein misfolding and aggregation. These disorders are characterized by the loss of specific neuronal populations in the brain and are highly associated with aging, suggesting a decline in proteostasis capacity may contribute to pathogenesis. Nevertheless, the precise molecular mechanisms that lead to the selective demise of neurons remain poorly understood. As a conseque
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glaucoma is a neurodegenerative disease affecting 70million people worldwide. For some time, analysis of human glaucoma and animal models suggested that RGC axonal injury in the optic nerve head (where RGC axons exit the eye) is an important early event in glaucomatous neurodegeneration. During the last decade advances in molecular biology and genome manipulation have allowed this hypothesis to be tested more critically, at least in animal models. Data indicate that RGC axon degeneration precedes soma death. Preventing soma death using mouse models that are mutant for BAX, a proapoptotic gene,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding how chromatin's physicochemical properties shape its emergent organization is central to deciphering genome function. To address this, we present OpenCGChromatin, a high-performance coarse-grained model that achieves near-atomistic simulations of chromatin systems an order of magnitude larger than previously possible, spanning biomolecular condensates and fibers tens of kilobases in length. OpenCGChromatin simulations independently predict, from physicochemical principles, the linker-DNA-dependent chromatin structures observed by cryo-ET and the relative thermodynamic stability o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase (Rubisco) is foundational to life on Earth, catalyzing carbon dioxide (CO2) fixation to generate biomass. However, Rubisco is a slow and inefficient enzyme that has proven challenging to engineer. We applied the structure-informed machine learning (ML) model ESM-IF1 to identify plausible amino acid sites in the large subunit of Nicotiana tabacum Rubisco to target for directed evolution. ML-assisted library design followed by selection in Rubisco-dependent Escherichia coli identified multiple enriched variants displaying improved catalytic efficie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitochondrial crista junctions (CJs) operate as regulated gateways into the cristae microenvironment, whose protein, metabolite, and ion compositions are finely tuned for mitochondrial function. The Mic60-Mic19 complex of the mitochondrial contact site and cristae organizing system (MICOS) complex was suggested to span across CJs and act as a diffusion barrier, but little is known of how its dynamic architecture facilitates this task. To address this question, we determine the crystal structure of an amino-terminal dimeric helical bundle of human Mic60. These and previous structural and bioche
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While there is an abundance of static data for the structure of biological macromolecules, the data regarding their folding mechanisms and dynamics is scarce, posing a challenge to the training of AI models. The World Model approach, which has been very successful in robotics, can come in handy in this regard. From limited data, it can build a latent, approximated representation of the spatio-temporal folding environment that can be used to train downstream AI models. Here, we developed DreamFold, a World Model-based generative framework to perform biomolecular simulations. DreamFold encodes p
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sarcopenia is a growing public health crisis with an unmet need for effective pharmacotherapies. Ligusticum chuanxiong (L. chuanxiong), commonly known as Chuanxiong in China, is a medicinal plant widely utilized for conditions involving muscle wasting and weakness. Herein, we report the discovery of a novel antisarcopenia molecular scaffold from L. chuanxiong, designated as phenylpropanephthalide, which structurally integrates (Z)-ligustilide (6) and (E)-ferulic acid (7). Phenylpropanephthalides A-E (1-5) represent a new category of phthalides in nature, constituting a new chemical subclass of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Persulfides (RSSH) have been proposed as key players in biochemical transformations that often involve iron, including iron-sulfur cluster assembly, H2S regulation, post translational modifications, and mitochondrial sulfur oxidation. An example of the latter is found in the O2-mediated oxidation of glutathione persulfide to sulfite dianion (SO32-) catalyzed by ETHE1, a nonheme iron persulfide dioxygenase (PDO). The iron-mediated mechanism of persulfide oxidation by PDOs remains poorly understood, and there are no synthetic analogues to date. Herein, we report the synthesis, characterization,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Generation of some new complexes of dimethyltin(IV) of sterically congested 4-acylated amphiphilic edaravone having the general formula Me2SnLL' and Me2Sn(L')2 (where LH= , R = ─CH3, L(1)H; R = ─CH2CH3, L(2)H; R = ─C6H5, L(3)H; R = p-ClC6H4─, L(4)H and L' H= R'= p-OCH3C6H4─, L'(1)H; R'= p-CH3C6H4─, L'(2)H) has been accomplished. The newly generated complexes were characterized with the help of spectroscopic analysis [IR and NMR (1H, 13C and 119Sn)] assisted by DFT and HRMS studies. 119Sn NMR spectral data of some of these complexes revealed the existence of hexa-coordinated tin centres in thes
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Copper(II) nitrate reacts with tris(m-tolyl)phosphine (m-MePh)3P in 1 : 2 and 1 : 3 molar ratios to form [Cu((m-MePh)3P)2(NO3)] (1) which contains two isomers (1A and 1B) in the crystal lattice and [Cu((m-MePh)3P)3(NO3)] (2). The reaction of copper(II) nitrate with tris(p-tolyl)phosphine (p-MePh)3P in 1 : 3 molar ratio results in the {[Cu((p-MePh)3P)3(NO3)]·(DMF)·(H2O)} (3) complex. The complexes were characterized in the solid state using melting point (m.p), X-ray fluorescence spectroscopy (XRF), and attenuated total reflectance-Fourier transform infra-red (ATR-FT-IR) spectroscopy, and in so
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel series of Fe(III)-catalyzed crescent-shaped coumarin-appended benzo[4,5]imidazo[1,2-a]pyrimidines has been generated using a single-step multi-component approach that includes a coumarin-derived β keto ester, 2-aminobenzimidazole, and various aldehydes. The mild eco-friendly reaction conditions allowed us, for the first time, to construct a library of highly substituted benzo[4,5]imidazo[1,2-a]pyrimidine (CBPy) heterocycles with a wide range of substrate compatibility and excellent yields. This one-pot synthesis is green in nature and conforms to atom economy. The structure of one repr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pyruvate:ferredoxin oxidoreductase (PFOR) is a key Achilles' heel in anaerobic pathogens. We integrate electronic-structure calculations (DFT), cheminformatic QSAR metrics, and residue-resolved docking to distill a concise "recognition code" and translate it into practical design rules. Using nitazoxanide (Nita; ΔG(bind) ≈ -10.0 kcal·mol-1) as a well-established reference, productive binding requires a conserved triad: a hydrogen-bond donor addressing Thr-997 and Cys-840, a π-π stack with Phe-869, and a recurrent π-σ contact to Thr-997 that orients the scaffold. Deacetylation to tizoxanide unm
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The present work reports the functional modeling chemistry of YtfE, which features a nonheme diiron active site and mediates the direct reduction of NO2- to NO. The model complex, [Fe2(HPTP)Cl2]1+ (1), reduces NO2- to NO in a 100% yield within 12 h and generates [Fe4(HPTP)2(μ-O)3(μ-OH)]3+ (2). Similar to YtfE, the reaction involves stepwise oxidation of two Fe(II) centers and product (NO) inhibition, of which the latter produces [Fe2(HPTP)(NO)2Cl2]1+ (3). Complex 3 could also be synthesized by the reaction of [Fe2(HPTP)(NO)2(ClO4)]2+ (4) and chloride. Complex 1 catalyzes the reduction of NO2-
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Selective recognition and sensing of neurotransmitters in aqueous media using artificial receptors is an attractive but challenging goal in modern supramolecular chemistry. Despite advances in the development of optical receptors for some neurotransmitters, such as dopamine, limited efforts have been invested in developing receptors for epinephrine, a neurotransmitter of paramount importance and a widely used drug for heart attacks. Herein, a new fluorescent molecular receptor (referred to as 1) based on a 1,3-bis-benzimidazole-benzene derivative covalently linked to two phenyl boronic acids w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
O-Methyldehydroserine, ΔSer(Me), is a non-standard α,β-dehydroamino acid, which occurs naturally in Cyrmenins with potential pharmaceutical application. The C-terminal part and the side chain of the ΔSer(Me) residue constitute the β-methoxyacrylate unit, responsible for antifungal activity of Cyrmenins. The short model, Ac-ΔSer(Me)-OMe, was analyzed considering the geometrical isomer Z (1) and E (2). The Ramachandran diagrams were created for both isomers, using quantum chemical calculations, to show possible conformations for isolated molecules (in vacuo), in weakly polar (chloroform) and pol
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования