BACKGROUND: Atherosclerosis involves complex interactions between lipids, immune cells, vascular smooth muscle cells, and fibroblasts within the arterial wall. While significant advances in single-cell technologies have shed light on the roles of immune cells and vascular smooth muscle cells in plaque development, fibroblasts remain underexplored, leaving critical gaps in understanding their contributions to disease progression and plaque stability. Comprehensive characterization of fibroblast phenotypes in atherosclerosis is essential to unravel their diverse functions and to distinguish betw
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Peritoneal metastases (PM) in colorectal cancer portend a poor prognosis. We sought to elucidate molecular features differentiating primary tumors (PT) from PMs and actionable targets facilitating transcoelomic dissemination and progression.
EXPERIMENTAL DESIGN: We performed multiomic profiling of 227 samples from 136 patients, including 56 PTs and 120 synchronous PMs comprising 34 matched PT-PM pairs. Whole-exome and bulk RNA sequencing analyses were conducted to identify underlying genomic aberrations and transcriptomic differences between primary and peritoneal lesions. We spatial
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The stria vascularis (SV) is a secretory epithelium that maintains fluid homeostasis and generates the endocochlear potential in the cochlear duct. Multiomic studies have identified genes in the SV that could contribute to the pathogenesis of Menière's Disease (MD), a disorder defined by episodic vertigo, sensorineural hearing loss, and tinnitus. This systematic review identified genes expressed in the SV cell types (marginal, intermediate, and basal) and gap junction proteins to evaluate their pathophysiological connections to MD.
METHODS: We conducted a literature search on 1293 ar
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUNDCurrent clinical sequencing methods cannot effectively detect DNA methylation and allele-specific variation to provide parent-of-origin information from the proband alone. Parent-of-origin effects can lead to differential disease, and the inability to assign parent of origin in de novo cases limits prognostication in the majority of affected individuals with retinoblastoma, a hereditary cancer with suspected parent-of-origin effects.METHODSTo directly assign parent of origin in patients with retinoblastoma, we extracted genomic DNA from blood samples for sequencing using a programmab
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Supravalvar aortic stenosis (SVAS) is a characteristic feature of Williams-Beuren syndrome (WBS). Its severity varies: ~20% of people with Williams-Beuren syndrome have SVAS requiring surgical intervention, whereas ~35% have no appreciable SVAS. The remaining individuals have SVAS of intermediate severity. Little is known about genetic modifiers that contribute to this variability.
METHODS AND RESULTS: We performed genome sequencing on 473 individuals with Williams-Beuren syndrome and developed strategies for modifier discovery in this rare disease population. Approaches include e
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Modic changes (MCs), vertebral end plate and bone marrow damage observed by magnetic resonance imaging, are an independent risk factor for low back pain. The compositions of and interaction between microbiota and metabolites in the lumbar cartilaginous end plates (LCEPs) of patients with MCs have not been identified.
METHODS: Patients with lumbar disc degeneration who were undergoing lumbar spinal fusion surgery were recruited between April 2020 and April 2021. LCEPs were collected for 16S rRNA sequencing and liquid chromatography-mass spectrometry (LC/MS)-based targeted metabolom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Recent breakthroughs in the genetic manipulation of mitochondrial DNA (mtDNA) have enabled the precise introduction of base substitutions and the effective removal of genomes carrying harmful mutations. However, the reconstitution of mtDNA deletions responsible for severe mitochondrial myopathies and age-related diseases has not yet been achieved in human cells. Here, we developed a method to engineer specific mtDNA deletions in human cells by co-expressing end-joining (EJ) machinery and targeted endonucleases. As a proof-of-concept, we used mito-EJ and mito-ScaI to generate a pane
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Type 1 von Willebrand disease (VWD) is associated with a reduction in qualitatively normal von Willebrand factor (VWF). Current diagnostic guidelines only take into consideration the contribution of basal VWF levels, despite a lack of correlation with bleeding severity. Defects in stimulated VWF release, which occurs after hemostatic challenge, may contribute to bleeding in type 1 VWD, but the pathogenic mechanisms are poorly defined. In this study, a layered multiomic approach including messenger RNA (mRNA) and microRNA (miRNA) sequencing was used to evaluate transcriptome-wide differences be
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD19 chimeric antigen receptor T-cell therapy (CD19-CAR) has changed the treatment landscape and outcomes for patients with pre-B-cell acute lymphoblastic leukemia (B-ALL). Unfortunately, primary nonresponse (PNR), sustained CD19+ disease, and concurrent expansion of CD19-CAR occur in 20% of the patients and is associated with adverse outcomes. Although some failures may be attributable to CD19 loss, mechanisms of CD19-independent, leukemia-intrinsic resistance to CD19-CAR remain poorly understood. We hypothesize that PNR leukemias are distinct compared with primary sensitive (PS) leukemias an
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thyroid cancer (THCA) is the most prevalent malignant disease of the endocrine system, in which 5-year survival can attain about 95%, but patients with metastasis have a poor prognosis. Very little is known about the role of CAPN8 in the metastasis of THCA. In particular, the effect of CAPN8 on the tumor immune microenvironment (TIME) and immunotherapy response is unclear.
MATERIAL AND METHODS: Multiome datasets and multiple cohorts were acquired for analysis. Firstly, the expression and the prognostic value of CAPN8 were explored in public datasets and in vitro tumor tissues. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genome-wide association studies (GWAS) have linked more than a hundred non-coding genomic loci to Parkinson's disease (PD) risk. Deciphering their functional impact on gene regulation requires cell type-aware modeling approaches to assess the effects of sequence variation on enhancer function and target gene expression. To address this challenge, we generated a comprehensive matched dataset from 190 human donors (115 controls and 75 PD), comprising long-read whole-genome sequencing alongside single nucleus multiome atlases (snATAC-seq and snRNA-seq for 3.1 and 1.1 million nuclei respectively)
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Posterior Fossa A (PFA) is the most frequent and clinically aggressive ependymoma (EPN) subgroup, with relapse typically representing a terminal event despite intensive multimodal therapy. Ultra-high-risk PFA EPNs are characterised by chromosome 6q loss (6q-) with or without chromosome 1q gain (1q +). While the molecular mechanisms driving 1q+ have been elucidated, 6q- PFA pathobiology remains poorly understood. Here, we show that loss of 6q in PFA EPN results in deletion of LATS1 (Large Tumour Suppressor Kinase 1), thereby dysregulating the Hippo signalling pathway and enhancing YAP/TEAD acti
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) cells exist on a spectrum of epithelial (E) and quasi-mesenchymal (QM) transcriptional states, with differences in sensitivity to FOLFIRINOX (FFX). Glycogen synthase kinase 3β (GSK-3β) is a key regulator of PDAC cell epithelial-to-mesenchymal transition (EMT).
PATIENTS AND METHODS: In vitro analysis of PDAC cell lines combined with multiomic analysis of data from a GSK-3β inhibitor trial (NCT05077800) was conducted to evaluate treatment effects on EMT.
RESULTS: GSK-3β inhibition with elraglusib (ELRA) drives QM PDAC cells toward an E state, de
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cardiac fibrosis is a major cause of cardiac dysfunction and is associated with virtually all forms of heart disease. Recently, single-cell genomic approaches have revealed in unprecedented resolution the orchestrated cellular responses driving cardiac fibrosis. Yet, the fibrosis-inducing phenotypes that emerge in the heart after nonischemic cardiac stress and the transcriptional circuits that govern fibrogenic cellular phenotypes are not well understood.
METHODS: Applying a single-cell paired-multiomic approach-by which both transcriptomic and epigenetic information is captured f
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology2026eng
BACKGROUND: Cervical cancer remains a major global health concern, with disparities in screening access and outcomes, particularly among younger women in the United States. Although high-risk human papillomavirus infection is the primary etiologic factor, nongenetic and environmental contributors remain underexplored. We established the Sacred Womb Cervical Cytology Biorepository to support research on cervical cancer risk, molecular biomarkers, and gynecologic health disparities.
METHODS: We implemented standardized protocols for the recovery, processing, and long-term storage of residual Th
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Group 2 innate lymphoid cells (ILC2s) are key effector cells of type 2 immunity. A subset of ILC2s, which expresses KIT (CD117), display increased phenotypic plasticity and have previously been linked to severe asthma and psoriasis. However, the molecular mechanisms promoting a KIT+ ILC2 state remain poorly understood.
OBJECTIVE: We defined the molecular basis for the enhanced plasticity of KIT+ ILC2s and identified signals that induce this phenotype, including links with immune disease susceptibility.
METHODS: We combined bulk as well as single-cell transcriptome (RNA sequencing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Following EU restrictions on dental amalgam from January 1, 2025, and the Minamata Convention's COP-6 decision to phase out dental amalgam globally by 2034, the era of amalgam restorations is drawing to a close. However, populations with historical mercury exposure may retain persistent, species-dependent tissue mercury burdens, particularly within the kidney and brain. This persistent body burden may prolong internal mercury exposure after cessation or substantial reduction of the external source. We propose "Mercury Debt" as a conceptual construct describing residual, species-specific intern
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The number of patients with Alzheimer's Disease (AD) worldwide is expected to reach 152 million by 2050, but developing an effective AD treatment remains challenging. This study purified two polysaccharides (GSP1 and GSP2) from Ganoderma sinense, a traditional Chinese medicine, and investigated their potential therapeutic effects against AD.
MATERIALS AND METHODS: GSP1 and GSP2 were purified and characterized for key physicochemical properties, including monosaccharide composition and molecular weight. In vitro neuroprotective efficacy was evaluated using glutamate-challenged SH
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diabetic kidney disease (DKD) is characterized by heterogeneous renal histological patterns, among which interstitial fibrosis and tubular atrophy (IFTA) is a key determinant of patient outcomes and treatment response. However, blood biomarkers reflecting IFTA burden remain unestablished.
METHODS: We conducted SomaScan-based blood proteomic profiling in Korean patients with biopsy-confirmed diabetic nephropathy from Seoul National University Hospital (SNUH-DN; n = 129). Linear regression analyses were used to identify pathways associated with IFTA area, and those additionally upre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Compelling evidence supports the biomarker potential of microbiome in pancreatic adenocarcinoma. Given the knowledge gap on the characteristics and significance of microbiome in early-onset pancreatic ductal adenocarcinoma (eoPDAC, age <50 years), we aimed to evaluate microbiome profiles in resected specimens from individuals with eoPDAC and average-onset PDAC (aoPDAC, age >50 years).
MATERIALS AND METHODS: We carried out shotgun metagenomic sequencing in resected specimens from individuals with eoPDAC (n = 24) and aoPDAC (n = 20). Statistical tests included Wilcoxon test, permuta
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования