BACKGROUND: Early-onset pre-eclampsia (ePE) is a severe pregnancy complication characterized by dysregulated trophoblast functions and impaired placentation during early pregnancy, leading to substantial maternal and fetal morbidity. While circumstantial evidence indicates defective secretion from endometrial glands impairs placental development, direct evidence linking maternal glandular dysfunction to ePE pathogenesis remains elusive.
METHODS: We established endometrial glandular organoids from women with ePE and healthy pregnancies, analyzing their secretomes by iTRAQ-based proteomics, RNA
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the mechanisms of early clearance of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) may illuminate new therapeutic strategies for tuberculosis (TB). We previously found genetic, epigenetic, and transcriptomic signatures associated with resistance (resister, RSTR) to tuberculin skin test (TST)/interferon gamma release assay (IGRA) conversion among highly exposed TB contacts. We hypothesized that integration of these datasets with multi-omic latent factor methods would detect pathways differentiating RSTR patients from those with asymptomatic TB infection (TBI, also known as latent TB infection
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The microbiome has emerged as a key determinant of human health and reproduction, with recent evidence suggesting a dysbiotic microbiome is implicated in adverse perinatal health outcomes. The existing research has been limited by the sample collection and timing, cohort design, sample design, and lack of data on the preconception microbiome. This prospective, longitudinal cohort study will recruit 2000 Australian women, in order to fully explore the role of the microbiome in the development of adverse perinatal outcomes. Participants are enrolled for a maximum of 7 years, from 1 year preconce
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Failure to respond to induction chemotherapy portends a poor outcome in childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL) and is more frequent in T-cell ALL (T-ALL) than B-cell ALL. We aimed to address the limited understanding of clinical and genetic factors that influence outcome in a cohort of patients with T-ALL induction failure (IF).
METHODS: We studied all cases of T-ALL IF on two consecutive multinational randomized trials, UKALL2003 and UKALL2011, to define risk factors, treatment, and outcomes. We performed multiomic profiling to characterize the genomic landscape.
RESULTS: IF
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methods to differentiate human pluripotent stem cells into kidney organoids were first introduced about 5 years ago, and since that time, the field has grown substantially. Protocols are producing increasingly complex three-dimensional structures, have been used to model human kidney disease, and have been adapted for high-throughput screening. Over this same time frame, technologies for massively parallel, single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) have matured. Now, both of these powerful approaches are being combined to better understand how kidney organoids can be applied to the understanding
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To explore the application value of a multi - omics fusion model based on exosome metabolomics and the expression levels of programmed death - 1/programmed death - ligand 1 (PD-1/PD-L1) in the early prediction of the efficacy of immunotherapy for advanced liver cancer, screen key biomarkers affecting the response to immunotherapy, construct and validate a highly efficient prediction model, and provide a basis for clinical individualized treatment decisions. A total of 824 patients with advanced liver cancer who received PD-1/PD-L1 inhibitor treatment were selected. They were randomly divided i
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma (HBV-HCC) remains a major global health challenge due to late diagnosis and high tumor heterogeneity. Cytokines, as key mediators of the tumor microenvironment, contribute to immune evasion and tumor progression in HBV-HCC. However, their prognostic significance remains unclear. Bulk RNA sequencing revealed differentially expressed cytokine genes in HBV-HCC. A cytokine-based gene signature was created using the LASSO model, and Single-cell RNA sequencing analyzed gene expression at the cellular level. Serum and in vitro assays confirmed the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: The therapeutic effect and mechanism of protocatechuic aldehyde (PAL) on vascular dementia (VaD) were studied from a multi-group perspective. Methods: The pharmacological property of PAL was assessed by using both an in vivo two-vessel occlusion (2VO) rat model and an in vitro astrocyte-neuron co-culture system with oxygen-glucose deprivation (OGD) injury. On the basis of neurobehavioral test, Morris' water maze test and hematoxylin and eosin staining, the pathological transformation of cognitive function and ischemic cerebral tissue was assessed. Key metabolites and targets throug
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with polycystic ovary syndrome (PCOS) are at an elevated risk of depression, yet the underlying mechanisms remain elusive. Emerging evidence implicates the gut-brain axis and systemic lipid homeostasis alterations as potential key contributors. We profiled untargeted plasma lipidomes of PCOS patients with and without comorbid depression (PCOS-DP) and integrated these data with our prior gut microbial and host transcriptomic datasets to construct multi-omics interaction networks. The causal role of the candidate gut microbial was preliminary explored in a germ-free PCOS mouse model usi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastric cancer is marked by profound molecular and microenvironmental heterogeneity that limits therapeutic progress. Here, we present a 15-layer multi-omics atlas that integrates genomics, epigenomics, transcriptomics, proteomics, multiple post-translational modifications (PTMs), protein-protein interactions, metabolomics, and microbiome profiles from 159 primary gastric adenocarcinomas and 30 matched normal adjacent tissues. Using cell-state deconvolution, we define tumor ecotypes that refine genomic and histological subtypes by capturing distinct tumor microenvironment architectures linked
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Numerous experiments and clinical practices have demonstrated the distinct therapeutic effect of dried ginger (DG) and processed ginger (PG) in the treatment of ulcerative colitis (UC), while, the differences in efficacy and mechanisms are not yet fully understood. By integrating metabolomics and gut microbiome analyses, combined with liquid chromatography-mass spectrometry technology for serum metabolism detection, 16S rRNA gene microbiota sequencing and Spearman correlation analysis, the pharmacological effects and mechanisms of action of the two were explored. Pharmacodynamic results demons
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Microvascular invasion (MVI) is closely related to the recurrence and metastasis of hepatocellular carcinoma (HCC), but the underlying cellular mechanism remains largely elusive. This study aims to elucidate the regional cellular discrepancy between MVI-positive (MVI+) and MVI-negative (MVI-) HCC by integrating Spatial transcriptomics (ST) and spatial metabolomics (SM).
METHODS AND FINDINGS: ST and SM were performed on six tissue samples from four patients (including 2 MVI+, 2 MVI-, and 2 paratumor tissues), with the integration of 79 public single-cell RNA sequencing datasets of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Overcoming resistance to immune checkpoint blockade (ICB) therapy in gastric cancer (GC) remains a major clinical challenge. Here, we apply multi-omics profiling, including single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics, to GC tissues from patients receiving neoadjuvant ICB therapy to identify drivers of resistance. We identify tumor-intrinsic Yes-associated protein 1 (YAP1) as a key regulator of immunosuppressive cellular communities that contribute to ICB non-responsiveness. To mitigate the off-target toxicity of verteporfin, a YAP1 inhibitor, we develop macrophage-membrane-camouflag
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic non-communicable diseases (NCDs), including cardiovascular disease, type 2 diabetes, obesity, and metabolic syndrome, account for more than 70% of global mortality and impose a disproportionate burden on low- and middle-income countries. Traditional, population-level dietary guidelines often fail to address population-level dietary guidelines often fail to account for the considerable inter-individual variability in metabolic responses to food. Personalized nutrition (PN), informed by genomics, metabolomics, gut microbiome composition, and behavioral factors, has emerged as an effectiv
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monitoring T cell repertoires in human tissues provides important insights into immune response mechanisms in cancer, infectious diseases, and autoimmunity. However, retrieving VDJ information from single-cell and spatial transcriptomics workflows with 3'-barcoding of cDNA remains resource-intensive or requires specialized sequencing equipment. Here, we introduce circVDJ-seq for simplified and cost-efficient T cell receptor (TCR) profiling from 3'-directed workflows like single-cell or single-nucleus RNA sequencing, ATAC + RNA multi-omics, and spatial transcriptomics. Application of circVDJ-se
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer (GC) remains a major global health burden, particularly in East Asia, with complex etiologies involving Helicobacter pylori infection, diet, host genetics, and environmental exposures. GC development follows the Correa sequence (CS), a multistep cascade from gastritis to atrophy, erosion, and carcinoma. Although gut microbiota (GM) dysbiosis and metabolic reprogramming have each been implicated in GC, their integrated dynamics across CS remain incompletely defined.
METHODS: We recruited participants across five groups: normal controls (G1), gastritis (G2), atrophy (
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Unhealthy diets, especially high red meat intake, induce gut dysbiosis and abnormal accumulation of a harmful histidine metabolite imidazole propionate (IMP), thereby promoting ulcerative colitis (UC) development. Although combined treatment with a MAGL inhibitor (MAGL11) and icaritin (Y003) exerts combined therapeutic effects in the classical DSS‑induced UC model, its protective effects and molecular mechanisms against IMP‑driven metabolic model remain unclear.
PURPOSE: The present study was designed to evaluate the therapeutic effect of MAGL11 and Y003 on IMP‑driven metabolic in
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) is a lethal malignancy characterized by significant heterogeneity. We conducted a multi-omics integrated clustering analysis to categorize PDAC molecular subtypes.
METHODS: Multi-omics data from The Cancer Genome Atlas-Pancreatic Adenocarcinoma (TCGA-PAAD) were integrated using ten clustering algorithms. Comparisons across PDAC subtypes were performed regarding prognosis, gene mutations, pathways, tumor microenvironment (TME), and chemotherapy sensitivity. A prognostic model was constructed utilizing Cox and Lasso regression based on subtype
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pulmonary fibrosis (PF) following severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infection is a life-threatening complication. Despite growing concerns about PF after SARS-CoV-2 infection, early recognition remains challenging. Additionally, the role of changes in respiratory and intestinal microbiota in PF progression remains insufficiently understood. To address this gap, this study uses a multi-omics approach to analyze microbiota and clinical changes in PF patients following SARS-CoV-2 infection, developing a predictive model for PF progression with risk stratification to ena
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gut microbial dysbiosis and inflammation have been implicated in the pathophysiology of major depressive disorder (MDD). However, no attempts have been made to comprehensively investigate the potential relationship between gut microbiota, inflammation, brain function, and clinical features in MDD.
METHODS: We conducted an integrative multi-omics study to examine the multi-dimensional differences in gut microbiome, inflammatory cytokines, brain functional connectivity, and clinical features between 60 MDD patients and 70 healthy controls. Furthermore, the potential associations bet
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.