This study identifies instability of MHC class I/peptide complexes and intermolecular competition for MHC class I presentation as factors responsible for the subdominance of cytotoxic T lymphocyte (CTL) epitopes. This evidence is based on the characterization of a new CTL epitope derived from the glycoprotein (GP) of lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV). This epitope, peptide GP117-125 (GP117) is presented to T cells by the mouse MHC class I molecule, H-2Db. In short-term experiments induction of GP117-specific CTL by vaccination rendered C57BL/6 mice only partially resistant to infection
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD8 T cell cross-reactivity between viruses can play roles in protective heterologous immunity and damaging immunopathology. This cross-reactivity is sometimes predictable, such as between lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) and Pichinde virus, where cross-reactive epitopes share six out of eight amino acids. Here, however, we demonstrate more subtle and less predictable cross-reactivity between LCMV and the unrelated vaccinia virus (VV). Epitope-specific T cell receptor usage differed between individual LCMV-infected C57BL/6 mice, even though the mice had similar epitope-specific T cell
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sialophorin, previously called gpL115, is the heavily sialylated surface protein that is defective in lymphocytes of Wiskott-Aldrich syndrome patients. Using the monoclonal antibody L10 as a probe, sialophorin expression was detected on isolated T lymphocytes and thymocytes, B cell lines, monocytes, neutrophils, and platelets, but not on erythrocytes, fibroblasts, and glioblastoma cells. This unusual distribution pattern suggests that sialophorin is expressed on all circulating cells except erythrocytes. Trace amounts of the sialophorin molecules on lymphocytes are incompletely sialylated, but
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Placenta-specific 1 (PLAC1) is expressed primarily in placental trophoblasts but not in normal tissues and is a targetable candidate for cancer immunotherapy because it is a cancer testis antigen known to be up-regulated in various tumors. Although peptide epitopes capable of stimulating CD8 T cells have been previously described, there have been no reports of PLAC1 CD4 helper T lymphocyte (HTL) epitopes and the expression of this antigen in head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC). Here, we show that PLAC1 is highly expressed in 74.5% of oropharyngeal and 51.9% of oral cavity tumors from
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Adhesion to host cells is the first and essential step in Mycobacterium tuberculosis (M. tuberculosis) infection. Among adhesion molecules, the PGRS domain of PE_PGRS33 plays a critical role in invasion but is dominated by B cell epitopes and lacks sufficient T cell epitopes, restricting its capacity to induce a balanced immune response.
METHODS: To overcome this limitation, we employed an integrative reverse vaccinology pipeline combining computational prediction and experimental validation. Helper and cytotoxic T lymphocyte epitopes were incorporated from multiple M. tuberculo
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Orf virus (ORFV) is an acute contact, epitheliotropic, zoonotic, and double-stranded DNA virus that causes significant economic losses in the livestock industry. The objective of this study is to design an immunoinformatics-based multi-epitope subunit vaccine against ORFV. Various immunodominant cytotoxic T lymphocytes (CTL), helper T lymphocytes (HTL), and B-cell epitopes from the B2L, F1L, and 080 protein of ORFV were selected and linked by short connectors to construct a multi-epitope subunit vaccine. Immunogenicity was enhanced by adding an adjuvant β-defensin to the N-terminal of the vacc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The objective is to analyse the physicochemical properties, spatial structure and protein-protein interactions (PPIs) of L7/L12 protein using bioinformatics methods and predict their B- and T-cell epitopes to lay a theoretical foundation for developing a novel multiepitope vaccine (MEV). The National Center for Biotechnology Information (NCBI) database was searched for the amino acid sequences of L7/L12 from Brucella melitensis. In addition, the online softwares, ProtParam and ProtScale, were used to predict the physicochemical properties: NetPhos3.1 and CD-search to predict the phosphorylatio
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The presentation of viral antigens on MHC class I molecules requires their intracellular fragmentation into peptides of appropriate length and anchor residue positions. Evidence has accumulated that the proteasome is the endoprotease in charge of the generation of MHC class I ligands in the cytoplasm. The generation of T cell epitopes derived from the leader peptides of endoplasmic reticulum (ER) targeted proteins, however. has been reported to be independent of the proteasome. Here we show that the H-2Db restricted antigen presentation of the immunodominant T cell epitope derived from the ER
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mimotopes provide an alternative to natural T cell epitopes for cancer immune therapy, as they can recruit and stimulate T cell repertoires that deviate from the repertoires engaged with the tumor and exposed to disease-related immune suppression. Here, mimotopes of a shared tumor-associated T cell epitope in cutaneous lymphoma were tested for their capacities to induce clinical and immunological responses in cancer patients. The mimotope sequences had been determined by a combinatorial peptide library approach without knowledge of the corresponding natural tumor-associated antigen. Vaccinatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
EBV-encoded latent membrane protein 1 (LMP1) has oncogenic potential and is expressed in many EBV-associated malignancies. Although LMP1 is regarded as a potential tumor-associated antigen for immunotherapy and several LMP1-specific MHC class I-restricted CTL epitopes have been reported, little is known regarding MHC class II-restricted CD4 helper T-lymphocyte (HTL) epitopes for LMP1. The goal of the present studies was to determine whether MHC class II-restricted CD4 T-cell responses could be induced against the LMP1 antigen and to evaluate the antitumor effect of these responses. We have com
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T cell cross-reactivity between different strains of the same virus, between different members of the same virus group, and even between unrelated viruses is a common occurrence. We questioned here how an intervening infection with a virus containing a sub-dominant cross-reactive T cell epitope would affect protective immunity to a previously encountered virus. Pichinde virus (PV) and lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) encode subdominant cross-reactive NP₂₀₅₋₂₁₂ CD8 T cell epitopes sharing 6 of 8 amino acids, differing only in the MHC anchoring regions. These pMHC epitopes induce cross-
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many novel vaccine strategies rely on recombinant viral vectors for antigen delivery, and adenovirus vectors have emerged among the most potent of these. In this report, we have compared the immune response induced through priming with adenovirus vector-encoded full-length viral protein to that elicited with an adenovirus-encoded minimal epitope covalently linked to beta(2)-microglobulin. We demonstrate that the beta(2)-microglobulin-linked epitope induced an accelerated and augmented CD8(+) T-cell response. Furthermore, the immunity conferred by vaccination with beta(2)-microglobulin-linked l
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
T cell immunity has a crucial role in vaccine-induced protection against respiratory viruses, yet a detailed characterization of T cell responses and epitopes in Syrian hamsters, a highly utilized preclinical, small animal model for SARS-CoV-2 research, is lacking. In this study, using an intranasal Chimpanzee adenoviral vectored vaccine (ChAd-SARS-CoV-2-S), we characterized the T cell response to the spike protein of SARS-CoV-2 in Syrian hamsters and identified immunogenic CD4+ and CD8+ T cell epitopes using IFN-γ ELISpot assays and cell depletions. The mucosal ChAd-SARS-CoV-2-S vaccine elici
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The specific CD8(+) T-cell response during acute lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) infection of mice is characterized by a rapid proliferation phase, followed by a rapid death phase and long-term memory. In BALB/c mice the immunodominant and subdominant CD8(+) responses are directed against the NP118 and GP283 epitopes. These responses differ mainly in the magnitude of the epitope-specific CD8(+) T-cell expansion. Using mathematical models together with a nonlinear parameter estimation procedure, we estimate the parameters describing the rates of change during the three phases and ther
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tuberculosis (TB), caused by Mycobacterium tuberculosis, remains a major global health burden due to latent infection, multidrug resistance, and the limited efficacy of the BCG vaccine. To address this challenge, we computationally designed and evaluated a circular mRNA-based multi-epitope vaccine candidate, TZ1391. Five experimentally validated M. tuberculosis antigens (ESAT-6, CFP-10, Ag85B, PPE18, and HspX) were used to predict immunodominant cytotoxic T lymphocyte (CTL), helper T lymphocyte (HTL), and B-cell epitopes. Three vaccine constructs (MTB-C1, MTB-C2, and MTB-C3) were assembled by
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The repertoire of CD4+ T-lymphocytes was investigated in six patients affected by tuberculosis, who had a negative PPD skin test at diagnosis. Polyclonal CD4+ T-cell lines from the peripheral blood failed to proliferate to PPD and to the 16- or 38-kDa proteins of Mycobacterium tuberculosis, while CD4+ T-cell lines from the site of disease responded to PPD, and to the 16- and 38-kDa proteins, and derived epitopes in vitro. The repertoire of CD4+ T-cells accumulating at the site of disease was found to be widely heterogeneous as demonstrated by the finding that at least seven different peptides
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The emergence of SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) is a major clinical threat; however, VOC remain susceptible to cytotoxic T lymphocyte (CTL) recognition. Therefore, it is crucial to identify potent CTL responses targeting conserved epitopes across VOCs. Here, we demonstrate that the nucleocapsid (N) protein induces efficient CTL responses in early pandemic COVID-19 convalescent donors. In the context of the HLA-A24-B52-C12 haplotype, prevalent in Japan, the KF9 peptide (N266-274: KAYNVTQAF) is immunodominant and restricted by HLA-C*12:02. KF9-specific T cells are cytotoxic and suppress vi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Celiac disease (CeD) is driven by CD4+ T-cell responses to dietary gluten proteins of wheat, barley, and rye when deamidated gluten epitopes are presented by certain disease-associated HLA-DQ allotypes. About 90% of the CeD patients express HLA-DQ2.5. In such patients, five gluten epitopes dominate the anti-gluten T-cell response; two epitopes unique to wheat, two epitopes present in wheat, barley, and rye and one epitope unique to barley. Despite presence of barley in commonly consumed food and beverages and hence being a prominent source of gluten, knowledge about T-cell responses elicited
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Although CD8+ T cells play a critical role in the control of HIV-1 infection,their antiviral efficacy can be limited by antigenic variation and immune exhaustion.The latter phenomenon is characterized by the upregulation of multiple inhibitory receptors, such as programmed death-1 (PD-1), CD244 and lymphocyte activation gene-3 (LAG-3), which modulate the functional capabilities of CD8+ T cells.
DESIGN AND METHODS: Here, we used an array of different human leukocyte antigen(HLA)-B*15:03 and HLA-B*42:01 tetramers to characterize inhibitory receptor expression as a function of differ
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The application of B-cell epitope identification to develop therapeutic antibodies and vaccine candidates is well established. However, the validation of epitopes is time-consuming and resource-intensive. To alleviate this, in recent years, multiple computational predictors have been developed in the immunoinformatics community. Brewpitopes is a pipeline that curates bioinformatic B-cell epitope predictions obtained by integrating different state-of-the-art tools. We used additional computational predictors to account for subcellular location, glycosylation status, and surface accessibility of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования