BACKGROUND: The impact of S. enterica colonization in cattle is highly variable and often serovar-dependent. The aim of this study was to compare the global transcriptomes of highly pathogenic bovine-adapted S. enterica serovar Dublin and the less pathogenic, bovine-adapted, serovar Cerro during interactions with bovine epithelial cells, to identify genes that impact serovar-related outcomes of S. enterica infections in dairy animals.
RESULT: Bovine epithelial cells were infected with S. enterica strains from serovars Dublin and Cerro, and the bacterial RNA was extracted and sequenced. The to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genus Listeria consists of six species: L. monocytogenes, L. innocua, L. welshimeri, L. ivanovii, L. seeligeri and L. grayi. Two of the species, L. monocytogenes and L. ivanovii are pathogenic. The heterogeneity of remaining species, previously assumed to be nonpathogenic, regarding their capability of acquiring virulence-associated genes may reflect their potential ability to be causative agents of diseases, especially in immunocompromised mannals. Virulence determinants involved in environmental tolerance, adhesion and invasion of eukaryotic cells and intracellular life function interact
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We present the complete genome sequence of uropathogenic Escherichia coli, strain CFT073. A three-way genome comparison of the CFT073, enterohemorrhagic E. coli EDL933, and laboratory strain MG1655 reveals that, amazingly, only 39.2% of their combined (nonredundant) set of proteins actually are common to all three strains. The pathogen genomes are as different from each other as each pathogen is from the benign strain. The difference in disease potential between O157:H7 and CFT073 is reflected in the absence of genes for type III secretion system or phage- and plasmid-encoded toxins found in s
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In December 2025, Madagascar reported its first confirmed cases of mpox, coinciding with the regional expansion of human monkeypox virus (MPV) Clade Ib across Central and East Africa. To characterize this outbreak, we generated the first near-complete MPV genome sequences from Madagascar using an amplicon-based nanopore sequencing approach applied directly to clinical samples. Eleven high-quality genomes were analyzed using maximum likelihood phylogenetics and Nextclade lineage assignment. All Malagasy sequences clustered within MPV Clade Ib and were closely related to strains circulating in t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dehalobacter is a genus of organohalide-respiring bacteria that is recognized for its fastidious growth using reductive dehalogenases (RDases). In the SC05 culture, however, a Dehalobacter population also mineralizes dichloromethane (DCM) produced by chloroform dechlorination using the mec cassette, just downstream of its active RDase. A closed genome of this DCM-mineralizing lineage has previously evaded assembly. Here, we present the genomes of two novel Dehalobacter strains, each of which was assembled from the metagenome of a distinct subculture from SC05. A pangenomic analysis of the Deha
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Foodborne outbreaks at geographically isolated tourist destinations pose distinctive One Health challenges, combining limited local surveillance capacity, complex intercontinental supply chains, and high visitor turnover. In May 2021, a diarrheal outbreak linked to a gastronomic festival in Fernando de Noronha, that is a remote UNESCO World Heritage island off northeastern Brazil, was attributed to Salmonella enterica serovar Newport ST164. We applied an integrated genomic approach and epidemiological investigation to propose a transmission chain contextualizing and refining case definition of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Salmonella enterica subsp. diarizonae (IIIb) is frequently isolated from the environment, cold-blooded reptiles, sheep and human … the conservation of a ~ 10 kb plasmid. A prominent feature of the two genomes is the presence of 24 genomic islands (GIs), in addition to 10 complete Salmonella pathogenicity islands (SPI) and fragments of SPI-7, a pathogenicity island first reported in the human-adapted serovar Typhi. Some of the GIs identified in SBO13 and SBO27 harbor genes putatively encoding …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Typhoid fever is endemic in some Pacific Island Countries including Fiji and Samoa yet genomic surveillance is not routine in such settings. Previous studies suggested imports of the global H58 clade of Salmonella enterica var Typhi (Salmonella Typhi) contribute to disease in these countries which, given the MDR potential of H58, does not auger well for treatment. The objective of the study was to define the genomic epidemiology of Salmonella Typhi in Fiji.
METHODS: Genomic sequencing approaches were implemented to study the distribution of 255 Salmonella Typhi isolates from the C
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antarctic krill (Euphausia superba) is a key species of the Antarctic ecosystem whose unique ecological status and great development potenti … Y7 is closely related to Brucella anthropi. Genomic island prediction showed that the strain has 60 genomic islands, which may produce HigB and VapC toxins. AntiSMASH analysis results showed that strain WY7 might produce many secondary metabolites, such as terpenes, siderophores and ectoine. Moreover, the genome contains genes involved in the degradation of aroma …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cholera is an acute secretory diarrhoeal disease caused by the bacterium Vibrio cholerae. The key determinants of cholera pathogenicity, cholera toxin (CT), and toxin co-regulated pilus (TCP) are part of the genome of two horizontally acquired Mobile Genetic Elements (MGEs), CTXΦ, and Vibrio pathogenicity island 1 (VPI-1), respectively. Besides, V. cholerae genome harbors several others MGEs that provide antimicrobial resistance, metabolic functions, and other fitness traits. VPI-1, one of the most well characterized genomic island (GI), deserved a special attention, because (i) it encodes man
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic non-O1/non-O139 Vibrio cholerae strains can cause sporadic outbreaks of cholera worldwide. In this study, multilocus sequence typing (MLST) of seven housekeeping genes was applied to 55 non-O1/non-O139 isolates from clinical and environmental sources. Data from five published O1 isolates and 17 genomes were also included, giving a total of 77 isolates available for analysis. There were 66 sequence types (STs), with the majority being unique, and only three clonal complexes. The V. cholerae strains can be divided into four subpopulations with evidence of recombination among the subpo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To investigate PG0836, PG0838, and PG0839 genes of Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis) in subgingival plaque of the chronic periodontitis patients, and find out the relationship between the prevalence of these three genes and the periodontal clinical parameters.
METHODS: A total of 270 subgingival plaque samples were collected from 90 chronic periodontitis (CP) patients. The periodontal clinical parameters including the probing depth (PD), clinical attachment loss (CAL), and bleeding on probing (BOP) were estimated. The extracted DNA from the P.gingivalis positive samples was am
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salmonella enterica serotype Typhi (S. Typhi) is a causative organism of typhoid fever. A number of Salmonella serovars express a capsular polysaccharide antigen known as Vi, the biosynthetic and export proteins of which are encoded within the viaB locus of Salmonella Pathogenicity Island -7 (SPI-7). SPI-7 is inserted between two partially duplicated copies of tRNA -pheU gene. We have investigated the frequency of viaB operon deletion and loss of SPI-7 due to storage of strains collected during the period 1987-2006 by PCR amplification of fliC (for confirmation of serotype Typhi), tviB (for st
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coastal ecosystems are vital for biodiversity but are increasingly threatened by urbanisation and pollution, which significantly alter local microbial communities. This study assessed bacterial diversity and functional profiles in urban and island beaches in Belém, Brazil. Urban beaches showed significantly higher microbial diversity and evenness, alongside functional plasticity due to pollutant input, while island beaches hosted more specialised and stable communities. Taxonomic analysis revealed the significant enrichment of opportunistic genera such as Comamonas, Clostridium and Paenibacill
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klebsiella quasipneumoniae is an opportunistic pathogen that predominantly resides in the human gut posing a significant risk of severe infe … were identified in the freshwater isolate and 1 in the clinical isolate. Genomic islets (GIts) and genomic islands (GIs) were also delineated using IslandViewer4. The freshwater isolate contained 13 GIs and 16 GIts, while the clinical isolate contained 14 GIs and 19 GIts, harbouring important virulence and antimicrobial resistance genes (such as acr, bdcA, fim a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study investigates the 2024 cholera outbreak in Gujarat, India, utilizing combined whole-genome analysis of clinical Vibrio cholerae isolates and wastewater surveillance. A total of, 69 V. cholerae isolates were recovered from affected patients, predominantly belonging to the O1 serogroup (51 isolates). Antimicrobial susceptibility test (AST) of 34 isolates revealed complete resistance to ampicillin and partial resistance to cotrimoxazole, whereas all isolates were susceptible to doxycycline, ciprofloxacin, chloramphenicol, tetracycline, and gentamicin. Whole-genome sequencing of 20 selec
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Australian silver gull is an urban-adapted species that frequents anthropogenic waste sites. The enterobacterial flora of synanthropic birds often carries antibiotic resistance genes. Whole-genome sequence analyses of 425 Escherichia coli isolates from cloacal swabs of chicks inhabiting three coastal sites in New South Wales, Australia, cultured on media supplemented with meropenem, cefotaxime, or ciprofloxacin are reported. Phylogenetically, over 170 antibiotic-resistant lineages from 96 sequence types (STs) representing all major phylogroups were identified. Remarkably, 25 STs hosted the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Helicobacter pylori is associated with inflammation of different areas, such as the duodenum and stomach, causing gastritis and gastric ulcers leading to lymphoma and cancer. Pathogenic islands are a type of clustered mobile elements ranging from 10-200 Kb contributing to the virulence of the respective pathogen coding for one or more virulence factors. Virulence factors are molecules expressed and secreted by pathogen and are responsible for causing disease in the host. Bacterial genes/virulence factors of the pathogenic islands represent a promising source for identifying novel d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report the complete genome sequence of a clinical isolate of Providencia stuartii strain CMC-4104, isolated from a splenic abscess. Oxford Nanopore Technologies (ONT) and Illumina sequencing reads were assembled using Geneious to generate a 4,504,925-bp circular chromosome containing multiple copies of the NDM-1 and PER-1 genes in a genomic resistance island.
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Escherichia coli (E. coli) has been increasingly implicated in the pathogenesis of Crohn's disease (CD). The phylogeny of E. coli isolated from Crohn's disease patients (CDEC) was controversial, and while genotyping results suggested heterogeneity, the sequenced strains of E. coli from CD patients were closely related.
RESULTS: We performed the shotgun genome sequencing of 28 E. coli isolates from ten CD patients and compared genomes from these isolates with already published genomes of CD strains and other pathogenic and non-pathogenic strains. CDEC was shown to belong to A, B1,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования