Membrane-assisted amyloid formation is implicated in human diseases, and many of the aggregating species accelerate amyloid formation and induce cell death. While structures of membrane-associated intermediates would provide tremendous insights into the pathology and aid in the design of compounds to potentially treat the diseases, it has not been feasible to overcome the challenges posed by the cell membrane. Here, we use NMR experimental constraints to solve the structure of a type-2 diabetes related human islet amyloid polypeptide intermediate stabilized in nanodiscs. ROSETTA and MD simulat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aggregation of alpha-synuclein (AS) is pivotally implicated in the development of Parkinson's disease (PD), inhibiting this process might be effective in treating PD. Here, by using circular dichroism spectroscopy, thioflavin T fluorescence, and atomic force microscopy, we found that trehalose at low concentration disaggregates preformed A53T AS protofibrils and fibrils into small aggregates or even random coil structure, while trehalose at high concentration slows down the structural transition into β-sheet structure and completely prevents the formation of mature A53T AS fibrils. Further
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Vsp proteins are the major outer membrane proteins of Brachyspira hyodysenteriae, the causative agent of swine dysentery. Eight vsp genes have been identified in B. hyodysenteriae strain B204, arranged into two four-gene loci, and at least two of the corresponding proteins are produced in vitro. The aims of this study were to characterise the vsp genes of the virulent Australian B. hyodysenteriae strain X576 and their corresponding proteins, Genomic sequence comparison with strains B204 and WA1 demonstrated that the number of vsp genes varies between B. hyodysenteriae strains, although the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Paxillin is a 68-kDa focal adhesion protein that is phosphorylated on tyrosine residues in fibroblasts in response to transformation by v-src, treatment with platelet-derived growth factor, or cross-linking of integrins. Paxillin has been shown to have binding sites for the SH3 domain of Src and the SH2 domain of Crk in vitro and to coprecipitate with two other focal adhesion proteins, vinculin and focal adhesion kinase (p125fak). After preliminary studies showed that paxillin was a substrate for the hematopoietic oncogene p210BCR/ABL, we investigated the role of this protein in hematopoietic
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteolytic activity constitutes a fundamental process essential for the survival of the malaria parasite and is thus highly regulated. Falstatin, a protease inhibitor of Plasmodium falciparum, tightly regulates the activity of cysteine hemoglobinases, falcipain-2 and 3 (FP2, FP3), by inhibiting FP2 through a single surface exposed loop. However, the multimeric nature of falstatin and its interaction with FP2 remained unexplored. Here we report that the N-terminal falstatin region is highly disordered, and needs chaperone activity (heat-shock protein 70, HSP70) for its folding. Protein-protein
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Light-harvesting protein LHCB4 is a monomeric antenna of photosystem II (PSII) that connects the PSII core (C) with strongly (S) and moderately (M) bound LHCII trimers, forming the stable dimeric supercomplex C2S2M2. LHCB4 is known to stabilize LHCII attachment to the PSII core dimer (C2). Here, we show that LHCB4 is essential for the intrinsic stability of the PSII core dimer itself, a fundamental structural unit required for efficient photochemistry. In the lhcb4 mutant, clear-native PAGE revealed the absence of C2S2M(2) and only small amounts of C2S2 and C2S supercomplexes. Single-particle
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mokola virus (MOKV) belongs to the lyssavirus genus. As other genus members-including rabies virus (RABV)-it causes deadly encephalitis in mammals. MOKV entry into host cells is mediated by its transmembrane glycoprotein G. First, G binds cellular receptors, triggering virion endocytosis. Then, in the acidic endosomal environment, G undergoes a conformational change from its pre- toward its post-fusion state that catalyzes the merger of the viral and endosomal membranes. Here, we have determined the crystal structure of a soluble MOKV G ectodomain in which the hydrophobic fusion loops have bee
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The RNA binding proteins EloR and KhpA are important components of the regulatory network that controls and coordinates cell elongation and division in S. pneumoniae. Loss of either protein reduces cell length, and makes the essential elongasome proteins PBP2b and RodA dispensable. It has been shown previously in formaldehyde crosslinking experiments that EloR co-precipitates with KhpA, indicating that they form a complex in vivo. In the present study, we used 3D modeling and site directed mutagenesis in combination with protein crosslinking to further study the relationship between EloR and K
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For several reasons the major outer membrane protein from Neisseria gonorrhoeae (gonococcal protein [PI]) is an attractive component for a gonococcal vaccine. This paper describes the influence of two different physical forms of PI on its immunogenic activity. To this end PI was delivered in liposomes and in protein-detergent complexes. In both forms PI was present in a multimeric form. The liposomes were composed of phosphatidylcholine and cholesterol. The effect of dicetylphosphate as a negatively charged amphiphile and three lipoidal adjuvants was investigated. Two lipoidal adjuvants (Avrid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DP1 family of integral membrane proteins stabilize high membrane curvature in the endoplasmic reticulum and phagophores. Mutations in the human DP1 gene REEP1 are associated with Hereditary Spastic Paraplegia type 31 and distal hereditary motor neuropathy. Four missense mutations map to a putative dimerization interface but the impact of these mutations on DP1 structure and tubule formation are unknown. Combining biophysical measurements, functional assays, and computational modeling in the context of the model protein Yop1, we found that missense mutations have variable effects on DP1 dim
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transforming growth factor-β/bone morphogenetic protein (TGF-β/BMP) signaling plays a fundamental role in embryonic skeletal development and postnatal bone homeostasis. The signaling pivot protein BMP-2 belongs to the TGF-β superfamily and has been implicated in the pathogenesis of osteonecrosis of femoral head (ONFH). The biologically functional BMP-2 is a homodimer that has two tightly packed cores at its dimerization interface; each core is defined by the intermolecular interaction between a helical arm from one monomer and a hydrophobic pocket from another monomer. Inhibition and disruptio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Celiac disease (CD) is an inflammatory syndrome that affects mainly the intestine, but also other organs. This ailment is also affected by the physicochemical behavior of gluten as such. From the medical standpoint, this pathology results from a combination of genetic and environmental factors. At the same time, gliadin (the alcohol-soluble fraction of gluten) along with other related oligomers, such as 33-gliadin, present high immunogenicity and are responsible for triggering of this disease. Within CD characterization, there are mainly two different approaches to carry out this study; one fo
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Amyloid fibrillation is a nucleation-dependent process known be involved in the development of more than 20 progressive and chronic diseases. The detection of amyloid formation at the nucleation stage can greatly advance early diagnoses and treatment of diseases. In this work, we developed a new assay for the early detection of amylin fibrillation using the biarsenical dye 4,5-bis(1,3,2-dithiarsolan-2-yl)fluorescein (FlAsH), which could recognise tetracysteine motifs and transform from non-fluorescent form into strongly fluorescent complexes. Due to the close proximity of two cysteine residues
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
FrpB is an integral outer membrane protein from the human pathogen Neisseria meningitidis. It is a member of the TonB-dependent transporter family and promotes the uptake of iron across the outer membrane. There is also evidence that FrpB is an antigen and hence a potential component of a vaccine against meningococcal meningitis. FrpB incorporating a polyhistidine tag was overexpressed in Escherichia coli into inclusion bodies. The protein was then solubilized in urea, refolded and purified to homogeneity. Two separate antigenic variants of FrpB were crystallized by sitting-drop vapour diffusi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pentraxins are a superfamily of conserved proteins that are characterized by a cyclic multimeric structure. The classical short pentraxins, C-reactive protein (CRP) and serum amyloid P component (SAP), are acute-phase proteins produced in the liver in response to inflammatory mediators. Short pentraxins regulate innate resistance to microbes and the scavenging of cellular debris and extracellular matrix components. In contrast, long pentraxins have an unrelated, long amino-terminal domain coupled to the carboxy-terminal pentraxin domain, and differ, with respect to short pentraxins, in their g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) can transfer membrane proteins into the gas phase under native-like conditions, preserving noncovalent assemblies and overall folds. Nevertheless, how much of their secondary structure survives after desolvation remains elusive. Here we address this issue using long-time-scale (submillisecond) molecular dynamics (MD) simulations to study how membrane proteins preserve architecture in the gas phase and examine residue-level determinants of transmembrane (TM) stability. We selected four representative membrane proteins with distinct oligomeric s
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The study of membrane protein function and structure requires their successful detection, expression, solubilization, and/or reconstitution, which poses a challenging task and relies on the availability of suitable tools. Several research groups have successfully applied Nanobodies in the purification, as well as the functional and structural characterization of membrane proteins. Nanobodies are small, single-chain antibody fragments originating from camelids presenting on average a longer CDR3 which enables them to bind in cavities and clefts (such as active and allosteric sites). Notably, Na
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infiltrating activated monocytes are important mediators of damaging inflammation during influenza A virus (IAV) infection. We show that soluble respiratory proteins [collectins, surfactant proteins D (SP-D) and mannose binding lectin (MBL), H-ficolin and LL-37] inhibit replication of seasonal IAV in human monocytes. The collectins and H-ficolin also increased viral uptake by the cells, while LL-37 did not. H-ficolin was able to inhibit replication of the 2009 pandemic H1N1 strain (Cal09) in monocytes, but SP-D and LL-37 had significantly fewer inhibitory effects on this strain than on seasona
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A cadmium-binding, genetically encoded protein tag, consisting of three repeats of metallothionein (3MT), can be used in electron microscopy for the visualization of multimeric- but not monomeric-tagged proteins due to insufficient electron density in monomeric proteins. Here, we present a technique for detecting monomeric 3MT-tagged green fluorescent protein (GFP-3MT) using a platinum compound to intensify the electron density. Substitution of cadmium by platinum as a result of incubating purified cadmium-binding 3MT-tagged GFP (GFP-Cd-3MT) with cis-diamminedichloroplatinum(II) (cisDDP) was a
Оценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hereditary spastic paraplegias comprise a group of clinically heterogeneous syndromes characterized by lower extremity spasticity and weakness, with distal axonal degeneration in the long ascending and descending tracts of the spinal cord. The early onset hereditary spastic paraplegia SPG3A is caused by mutations in the atlastin/human guanylate-binding protein-3 gene (renamed here atlastin-1), which codes for a 64-kDa member of the dynamin/Mx/guanylate-binding protein superfamily of large GTPases. The atlastin-1 protein is localized predominantly in brain, where it is enriched in pyramidal neu
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования