Molecular mimicry, defined as similar structures shared by molecules from dissimilar genes or proteins, is a general strategy used by pathogens to infect host cells. Severe acute respiratory syndrome (SARS) is a new human respiratory infectious disease caused by SARS coronavirus (SARS-CoV). The spike (S) protein of SARS-CoV plays an important role in the virus entry into a cell. In this study, eleven synthetic peptides from the S protein were selected based on its sequence homology with human proteins. Two of the peptides D07 (residues 927-937) and D08 (residues 942-951) were recognized by the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We purified from natural rubber latex (NRL) by means of high-performance liquid chromatography a 27-kD protein, recognized characteristically by IgE in sera from latex-allergic children with spina bifida or other congenital anomalies and histories of multiple surgeries. N-terminal sequence analysis of the purified 27-kD protein was unsuccessful suggesting that its N-terminus is blocked. To obtain internal sequence information from the protein it was digested with trypsin and the purified tryptic peptides were subjected to sequence analysis. Thirteen of the 14 sequenced peptides revealed no sig
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mutations in XPD helicase, required for nucleotide excision repair (NER) as part of the transcription/repair complex TFIIH, cause three distinct phenotypes: cancer-prone xeroderma pigmentosum (XP), or aging disorders Cockayne syndrome (CS), and trichothiodystrophy (TTD). To clarify molecular differences underlying these diseases, we determined crystal structures of the XPD catalytic core from Sulfolobus acidocaldarius and measured mutant enzyme activities. Substrate-binding grooves separate adjacent Rad51/RecA-like helicase domains (HD1, HD2) and an arch formed by 4FeS and Arch domains. XP mut
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycoprotein C is one of the duck plague virus (DPV) glycoproteins and is encoded by the DPV UL44 gene. DPV glycoprotein C (DPV-gC) comprises 431 amino acids with a putative molecular mass of 47.35 kDa. Sequence analysis indicated that the protein possesses typical characteristics of type-I membrane glycoproteins, containing an N-terminal signal sequence, an external domain, a C-terminal membrane anchor region, and a short cytoplasmic domain. Comparisons of 22 alphaherpesvirus-gC protein sequences revealed eight conservative Cys-residue sites, which may play a crucial role in the biological fu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The xanthine permease XanQ of Escherichia coli is used as a study prototype for function-structure analysis of the ubiquitous nucleobase-ascorbate transporter (NAT/NCS2) family. Our previous mutagenesis study of polar residues of XanQ has shown that Asn-93 at the middle of putative TM3 is a determinant of substrate affinity and specificity. To study the role of TM3 in detail we employed Cys-scanning mutagenesis. Using a functional mutant devoid of Cys residues (C-less), each amino acid residue in sequence 79-107 (YGIVGSGLLSIQSVNFSFVTVMIALGSSM) including TM3 (underlined) and flanking sequences
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The neuroligins are postsynaptic cell adhesion proteins whose extracellular domain belongs to the alpha/beta-hydrolase fold family of proteins, a family characterized through the enzyme acetylcholinesterase (AChE) and other enzymes with various substrate specificities. Neuroligin associations with the pre-synaptic neurexins participate in synapse maturation and maintenance. Alternative splicing of the neuroligin and neurexin genes results in multiple isoforms and presumably regulation of activity, while mutations appear to be associated with autism spectrum disorders. The crystal structures of
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
LRAT (lecithin:retinol acyltransferase), an enzyme whose levels are modulated during malignant conversion, has been reported as the founder member of a new LRAT-like family that includes tumor suppressors TIG-3(1-164) and Ha-Rev107(1-162). The mechanisms that link these three proteins to carcinogenesis as well as the significance of a reported shared sequence homologous region remain unclear. This begs the question if the tumor suppressors possess enzyme properties and/or if the LRAT enzyme possesses tumor suppressor properties. We use the reported homologous region as a first approach to addr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leptospirosis is one of the neglected zoonosis, affecting human and animal populations worldwide. Reliable effective therapeutics and concerns to look for more research into the molecular analysis of its genome is therefore needed. In the genomic pool of the Leptospira interrogans many hypothetical proteins are still uncharacterized. In the current research, we performed extensive in silico analysis to prioritize the potential hypothetical proteins of L. interrogans serovar Copenhageni via stepwise reducing the available hypothetical proteins (Total 3606) of the assembly to only 15, based on n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The neisserial surface protein A (NspA) from Neisseria meningitidis is a promising vaccine candidate because it is highly conserved among meningococcal strains and induces bactericidal antibodies. NspA is a homolog of the Opa proteins, which mediate adhesion to host cells. Here, we present the crystal structure of NspA, determined to 2.55-A resolution. NspA forms an eight-stranded antiparallel beta-barrel. The four loops at the extracellular side of the NspA molecule form a long cleft, which contains mainly hydrophobic residues and harbors a detergent molecule, suggesting that the protein migh
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transketolase (TKL) plays a key role in plant photosynthesis and has been predicted to be a potent herbicide target. Homology modeling and molecular dynamics simulation were used to construct a target protein model. A target-based virtual screening was developed to discover novel potential transketolase inhibitors. Based on the receptor transketolase 1 and a target-based virtual screening combined with structural similarity, six new compounds were selected from the ZINC database. Among the structural leads, a new compound ZINC12007063 was identified as a novel inhibitor of weeds. Two novel ser
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mitotic chromosome condensation, sister chromatid cohesion, and higher order folding of interphase chromatin are mediated by condensin and cohesin, eukaryotic members of the SMC (structural maintenance of chromosomes)-kleisin protein family. Other members facilitate chromosome segregation in bacteria [1]. A hallmark of these complexes is the binding of the two ends of a kleisin subunit to the apices of V-shaped Smc dimers, creating a tripartite ring capable of entrapping DNA (Figure 1A). In addition to creating rings, kleisins recruit regulatory subunits. One family of regulators, namely Kite
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The XPD helicase (Rad3 in Saccharomyces cerevisiae) is a component of transcription factor IIH (TFIIH), which functions in transcription initiation and Nucleotide Excision Repair in eukaryotes, catalyzing DNA duplex opening localized to the transcription start site or site of DNA damage, respectively. XPD has a 5' to 3' polarity and the helicase activity is dependent on an iron-sulfur cluster binding domain, a feature that is conserved in related helicases such as FancJ. The xpd gene is the target of mutation in patients with xeroderma pigmentosum, trichothiodystrophy, and Cockayne's syndrome,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Half the world's population is chronically infected with Helicobacter pylori, causing gastritis, gastric ulcers and an increased incidence of gastric adenocarcinoma. Its proton-gated inner-membrane urea channel, HpUreI, is essential for survival in the acidic environment of the stomach. The channel is closed at neutral pH and opens at acidic pH to allow the rapid access of urea to cytoplasmic urease. Urease produces NH(3) and CO(2), neutralizing entering protons and thus buffering the periplasm to a pH of roughly 6.1 even in gastric juice at a pH below 2.0. Here we report the structure of HpUr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Transport protein particle (TRAPP) is a multiprotein complex that functions in localising proteins to the Golgi compartment. The TRAPPC11 subunit has been implicated in diseases affecting muscle, brain, eye and to some extent liver. We present three patients who are compound heterozygotes for a missense variant and a structural variant in the TRAPPC11 gene. TRAPPC11 structural variants have not yet been described in association with a disease. In order to reveal the estimated genesis of identified structural variants, we performed sequencing of individual breakpoint junctions and a
СтатьяКлинический случайПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PY100 is a lytic bacteriophage with a broad host range within the genus Yersinia. The phage forms plaques on strains of the three human pathogenic species Yersinia enterocolitica, Y. pseudotuberculosis, and Y. pestis at 37 degrees C. PY100 was isolated from farm manure and intended to be used in phage therapy trials. PY100 has an icosahedral capsid containing double-stranded DNA and a contractile tail. The genome consists of 50,291 bp and is predicted to contain 93 open reading frames (ORFs). PY100 gene products were found to be homologous to the capsid proteins and proteins involved in DNA me
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Variola virus, the causative agent of smallpox, encodes approximately 200 proteins. Over 80 of these proteins are located in the terminal regions of the genome, where proteins associated with host immune evasion are encoded. To date, only two variola proteins have been characterized. Both are located in the terminal regions and demonstrate immunoregulatory functions. One protein, the smallpox inhibitor of complement enzymes (SPICE), is homologous to a vaccinia virus virulence factor, the vaccinia virus complement-control protein (VCP), which has been found experimentally to be expressed early
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate protein family classification is essential since proteins within the same family share conserved structural domains and biochemical functions that deter mine their biological roles. G protein-coupled receptors (GPCRs) represent one of the largest and most diverse protein families in eukaryotes, serving as targets for ap proximately 35% of FDA-approved drugs. While traditional sequence alignment methods, such as BLAST, provide foundational tools for identifying homologous sequences, they exhibit limited accuracy in distinguishing closely related GPCR families with low sequence homology
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein kinases exert major regulatory effects in eukaryotic signaling events. As these proteins play central regulatory and sensory functions they are interesting targets for antiparasitic drug development and serve as vaccine candidates. A cDNA with an open reading frame of 1122 bp coding for the regulatory subunit of the cAMP-dependent protein kinase (Ov-pka-r) of the pathogenic human nematode Onchocerca volvulus has been isolated. The predicted protein displays 84% homology to the corresponding protein of Caenorhabditis elegans and 71% to the human homologue. The O. volvulus protein has un
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transmissible spongiform encephalopathies (TSEs) are fatal neurodegenerative diseases caused by misfolded prion protein. The prion-like protein (Doppel), encoded by the prion-like protein gene (PRND), is linked to neurodegeneration and TSE susceptibility. While PRND polymorphisms have been studied in various species, their genetic features in non-human primates remain unexplored. Cynomolgus monkeys (Macaca fascicularis), which are genetically close to humans, are a valuable model to study the role of PRND polymorphisms in prion disease susceptibility. We performed polymerase chain reaction (PC
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The voltage-gated potassium channel KCNQ1 (KV7.1) assembles with the KCNE1 accessory protein to generate the slow delayed rectifier current, IKS, which is critical for membrane repolarization as part of the cardiac action potential. Loss-of-function (LOF) mutations in KCNQ1 are the most common cause of congenital long QT syndrome (LQTS), type 1 LQTS, an inherited genetic predisposition to cardiac arrhythmia and sudden cardiac death. A detailed structural understanding of KCNQ1 is needed to elucidate the molecular basis for KCNQ1 LOF in disease and to enable structure-guided design of new anti-
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.