Blood DNA methylation patterns are highly predictive of prenatal exposure to smoking, and differential methylation has been associated with maternal alcohol use. We extended this to determine whether DNA methylation patterns in cord blood are associated with prenatal exposure to opioids, cannabis, and polysubstance use. We also evaluated whether DNA methylation patterns have predictive utility. We examined 932 mother-child pairs in the Boston Birth Cohort between 1998 and 2020 with cord blood DNA methylation data. For each substance self-reported within 72 hr after birth, we performed an adjus
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Anderson-Fabry disease (AFD) is a rare X-linked lysosomal storage disorder characterized by marked clinical heterogeneity and incompletely understood genotype-phenotype correlations. While X-chromosome inactivation has been extensively investigated, the contribution of autosomal epigenetic mechanisms to phenotypic variability remains poorly defined. Here, we performed an exploratory genome-wide DNA methylation analysis in 32 AFD patients (22 females and 10 males; mean age 51.7 years) recruited within a multicenter regional research project in Calabria (Italy). DNA methylation profiling was con
СтатьяМногоцентровое исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cognitive-behavioral therapy (CBT) is a widely used treatment for mental disorders, yet the biological mechanisms underlying its effects and the factors contributing to treatment response remain poorly understood. DNA methylation, an epigenetic mechanism shaped by both genetic and environmental influences, may provide insights into individual differences in psychotherapy outcomes. We performed an epigenome-wide association study of psychotherapy response in 889 adults with obsessive-compulsive disorder (OCD) receiving the Bergen 4-Day Treatment, an intensive, concentrated exposure-based interv
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cervical cancer (CC) is an alarming global health problem, with predominantly higher incidence, lethal progression, and mortality among women of African ancestry (AA) than women of European ancestry (EA). Although persistent high-risk human papillomavirus (HPV) integration and infection are the key etiological factors, currently available evidence implicates epigenetic reprogramming as a prime contributor to ancestry-associated differences in CC pathogenesis. To address these disparities, we performed genome-wide DNA methylation profiling of HPV-positive cervical intraepithelial neoplasia (CIN
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Oral potentially malignant disorders exhibit heterogeneous malignant transformation risk that clinical approaches fail to adequately predict. Histopathologic dysplasia grading, the reference standard of risk assessment, is associated with poor interobserver reliability and limited prognostic discrimination. It is necessary to define other potential patient- and tissue-associated risk modifiers to improve patient-specific disease prediction.
TYPES OF STUDIES REVIEWED: PubMed was queried for patient- and specimen-derived factors as they relate to oral cancer and oral potentially mal
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Spatial transcriptomics technologies enable omics analysis while preserving the spatial and histopathological context of cells within tissue sections, and have rapidly become widespread across various research fields, including cancer research. In cancer studies, these technologies are widely employed to elucidate changes in cancer cells and the surrounding tumor microenvironment associated with tumor progression and the emergence of therapeutic resistance. Through the application of spatial transcriptomics, numerous novel insights have been obtained regarding the identification of therapeutic
СтатьяОбзорАннотация на английскомПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Endometrioid and mucinous ovarian carcinomas represent nearly a fifth of ovarian cancers, but their molecular characteristics and pathologic origins are poorly understood. To identify the genomic and epigenomic alterations characteristic of these ovarian cancer subtypes and evaluate links to morphologically similar tumors from other sites, we performed a combination of sequence, copy number, mutation signature, and rearrangement analyses from tumor samples and matched normal tissues of 133 patients, as well as methylation analyses of these tumors and tissues of 150 patients from Th
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Female survivors of physical or psychological violence, including sexual violence, report significant long-term consequences defined as post-traumatic stress disorder (PTSD). Among these, depression, affective difficulties, anomalous behaviours, and worsened reproductive health may also affect offspring through transgenerational transmission involving primordial germ cells (PGCs) and/or through social transmission and acquisition of behavioural patterns from parent(s) to children. The concept of epigenomic modification involves several molecular targets that are sensitive to environmental stre
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Repetitive neonatal painful procedures experienced in the neonatal intensive care unit (NICU) are known to alter the development of the nociceptive system and have long-lasting consequences. Recent evidence indicates that NICU stay affects the methylation of the opioid receptor mu 1 encoding gene (Mor-1). Additionally, a preclinical model of neonatal procedural pain established lower adult post-operative MOR-1 levels in the spinal cord. Thus, we hypothesized that neonatal procedural pain increases the DNA methylation status of Mor-1 in the spinal cord and dorsal root ganglia (DRGs)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gut microbiota-derived butyrate plays a vital role in attenuating hepatocellular carcinoma (HCC) in murine models. However, the precise molecular mechanisms by which butyrate exerts its effects are largely undefined. Plasma short-chain fatty acids (SCFAs) were quantitatively measured by using gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) to access their association with HCC prognosis. Tumor-infiltrating immune cells were characterized by flow cytometry. The interactions between butyrate and natural killer (NK) cells were studied using in vitro assays, including migration, cytotoxic degranulatio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Caffeine metabolic ratios (CMR) following monitored caffeine intake are the gold standard to probe cytochrome P450 (CYP) 1A2 activity, which metabolizes antipsychotics like clozapine and olanzapine. Given caffeine's ubiquity, we tested whether random CMR from dietary caffeine were associated with (1) clinical, genetic, and epigenetic factors linked to CYP1A2 activity; (2) plasma concentrations of clozapine and olanzapine; and (3) psychotropic treatment response. First, we analyzed two population-based studies (CoLaus|PsyCoLaus, N = 4898; SKIPOGH, N = 2054) to investigate random CMR association
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Viral infections, including COVID-19, are associated with an increased risk for type 1 diabetes (T1D), but potential underlying mechanisms remain unexplored. We evaluated whether COVID-19 or influenza A infection is characterized by differential DNA methylation at immune and T1D susceptibility genes in young children at risk for T1D.
METHODS: Epigenome-wide association analysis using the Illumina MethylationEPIC microarray was performed in blood taken at age 1.5 years (IQR, 1.49-1.52 y) from 740 prospectively followed children with increased risk of T1D. SARS-CoV-2 and influenza A
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic stress is associated with cardiovascular disease (CVD) risk and elevated amygdala activity. Previous research suggests a plausible connection between amygdala activity, hematopoietic tissue activity, and cardiovascular events; however, the underlying biological mechanisms linking these relationships are incompletely understood. Chronic stress is thought to modulate epigenomic modifications. Our investigation focused on associations between amygdala activity (left (L), right (R), maximum (M), and average (Av) AmygA), and splenic (SpleenA), and bone marrow activity (BMA) as determined by
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hidradenitis suppurativa (HS) is a common, chronic and debilitating inflammatory disease that most commonly affects intertriginous skin. Despite its high heritability, the genetic underpinnings of HS remain poorly understood.
OBJECTIVES: To identify genetic signals associated with HS, determine genetic relationships with other diseases and investigate potential molecular genetic mechanisms.
METHODS: We performed a genome-wide association meta-analysis of six studies, totalling 4540 patients with HS and > 1 million control participants, and identified genetic correlations with oth
СтатьяМетаанализПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epigenetic differences across racial/ethnic groups can provide insights into health disparities, including likely mechanisms and multifactorial upstream exposures at play. We compared the blood DNA methylome of Native Hawaiian (NatH) women, an understudied group with high chronic disease burden, with that of White women. Blood genome-wide DNA methylation profiling was performed in generally healthy, non-smoking NatH (n = 143) and White (n = 181) postmenopausal women in the Multiethnic Cohort. CpGs showing significant (Bonferroni p < 0.05) and substantial (delta-beta > 0.1) differential methyla
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Intrahepatic cholangiocarcinoma (iCCA) is the second most prevalent primary liver cancer. Although the genetic characterization of iCCA has led to targeted therapies for treating tumors with FGFR2 alterations and IDH1/2 mutations, only a limited number of patients can benefit from these strategies. Epigenomic profiles have emerged as potential diagnostic and prognostic biomarkers for improving the treatment of cancers. In this study, we conducted whole-genome bisulfite sequencing on 331 iCCAs integrated with genetic, transcriptomic, and proteomic analyses, demonstrating the existen
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent studies suggest that differential DNA methylation could play a role in the mechanism of cerebral vasospasm (CVS) and delayed cerebral ischemia (DCI) after aneurysmal subarachnoid hemorrhage (aSAH). Considering the significance of this matter and a lack of effective prophylaxis against DCI, we aim to summarize the current state of knowledge regarding their associations with DNA methylation and identify the gaps for a future trial. PubMed MEDLINE, Scopus, and Web of Science were searched by two authors in three waves for relevant DNA methylation association studies in DCI after aSAH. PRIS
Систематический обзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Circulating cell-free DNA (cfDNA) is emerging as a non-invasive biomarker in solid organ transplantation (SOT) monitoring and data on its diagnostic potential have been increasing in recent years. This review aims to summarize the main advances in technologies, clinical applications and future perspectives of cfDNA for transplantation, and to approach the contribution of epigenetics to improve the specific detection of rejection.
METHODS: Published literature investigating cfDNA as a biomarker for the diagnosis of transplant rejection was systematically reviewed, specifically cl
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epigenome-wide association studies have identified multiple DNA methylation sites (CpGs) associated with alcohol consumption, an important lifestyle risk factor for cardiovascular diseases. This study aimed to test the hypothesis that an alcohol consumption epigenetic risk score (ERS) is associated with blood pressure (BP) traits.
RESULTS: We implemented an ERS based on a previously reported epigenetic signature of 144 alcohol-associated CpGs in meta-analysis of participants of European ancestry. We found a one-unit increment of ERS was associated with eleven drinks of alcohol con
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Early childhood development is a strong predictor of long-term health outcomes, potentially mediated via epigenetics (DNA methylation). The aim of the current study was to examine how childhood experiences, punitive parenting, and an intergenerational psychotherapeutic intervention may impact DNA methylation in young children and their mothers.
METHODS: Mothers and their infants/toddlers between 0 and 24 months were recruited at baseline (n = 146, 73 pairs) to participate in a randomized control trial evaluating the effectiveness of The Michigan Model of Infant Mental Health Hom
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.