In Algeria, the issue of antibiotic resistance is on the rise, being the Staphylococcus aureus infection as a significant concern of hospital-acquired infections. The emergence of antibiotic resistance in this bacterium poses a worldwide challenge. The aim of this study aims to establish the incidence of S aureus strains in Algeria as well as identify phenotypic and genotypic resistance based on the "mecA" and "nuc" genes. From 2014 to 2017, a total of 185 S aureus strains were isolated from patients at a hospital in the city of Rouïba, Algiers the number of isolates was slightly higher in mal
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Community-Acquired Pneumonia (CAP) is the primary cause of hospitalization in the United States and the third leading cause of d … HODS: The aim of this study is to identify the main microorganisms implicated in CAP by employing a multiplex Polymerase Chain Reaction (mPCR) at the foremost public hospital in Brazil. All patients who were admitted to the emergency department and diagnosed with severe CAP underwent an mPCR panel using nasopharyngeal and oropharyngeal swabs, with the aim of detecting 13 bacterial a …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic poses a threat to global health. Due to its high sensitivity, specificity, and stability, real-time fluorescence quantitative (real-time PCR) detection has become the most extensively used approach for diagnosing SARS-CoV-2 pneumonia. According to a report from the World Health Organization, emerging and underdeveloped nations lack nucleic acid detection kits and polymerase chain reaction (PCR) instruments for molecular biological detection. In addition, sending samples to a laboratory for testing may result in considerable delays between sampling and diagnosis, which is
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diagnostic approaches capable of ultrasensitive pathogen detection from low-volume clinical samples, running without any sophisticated instrument and laboratory setup, are easily field-deployable, inexpensive, and rapid, and are considered ideal for monitoring disease progression and surveillance. However, standard pathogen detection methods, including culture and microscopic observation, antibody-based serologic tests, and primarily polymerase chain reaction (PCR)-oriented nucleic acid screening techniques, have shortcomings that limit their widespread use in responding to outbreaks and regul
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The microbiological characteristics of Staphylococcus aureus causing infective endocarditis (IE) have not been investigated thoroughly. We c … and if possible, the primary site of infection. Genes coding virulence factors were analyzed using multiplex polymerase chain reactions. Fibrinogen and fibronectin-binding properties were assessed using in vitro binding assays. The fibronectin-binding protein A gene (fnbpA) was sequenced. Of 2,365 cases of SAB, 92 had IE. After matching, 37 pairs of S. aureus isolates from the IE c …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Malaria still poses one of the major threats to human health. Development of effective antimalarial drugs has decreased this threat; however, the emergence of drug-resistant Plasmodium falciparum, a cause of Malaria, is disconcerting. The antimalarial drug chloroquine has been effectively used, but resistant parasites have spread worldwide. Interestingly, the withdrawal of the drug reportedly leads to an increased population of susceptible parasites in some cases. We examined the prevalence of genomic polymorphisms in a malaria parasite P. falciparum, associated with resistance to
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Malaria infections may be symptomatic, leading to treatment, or "asymptomatic," typically detected through active surveillance, and not leading to treatment. Malaria elimination may require purging both types of infection. Using detection methods with different sensitivities, we conducted a cross-sectional study in two rural communities located along the border between China's Yunnan Province and Myanmar's Shan and Kachin States, to estimate the prevalence of asymptomatic and symptomatic malaria. In Mong Pawk, all infections detected were asymptomatic, and the prevalence of Plasmodium falcipar
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gay, bisexual, and other men who have sex with men (MSM) are at high risk for human papillomavirus (HPV) infection; vaccination is recommended for US males, including MSM through age 26 years. We assessed evidence of HPV among vaccine-eligible MSM and transgender women to monitor vaccine impact.
METHODS: During 2012-2014, MSM aged 18-26 years at select clinics completed a computer-assisted self-interview regarding sexual behavior, human immunodeficiency virus (HIV) status, and vaccinations. Self-collected anal swab and oral rinse specimens were tested for HPV DNA (37 types) by L1
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The increasing rates of antimicrobial resistance observed in the nosocomial pathogen Klebsiella pneumoniae are of major public h … Vitek 2 and MicroScan instruments were used for organism identification and susceptibility testing. Multiplex polymerase chain reactions (PCRs) were used to detect blaCTX-M, blaSHV and blaTEM genes in a proportion of the ESBL isolates. All isolates exhibiting reduced susceptibility to carbapenems were PCR tested for blaKPC and blaNDM-1 resistance genes.
RESULTS: Overall, 68.3% of t …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early diagnosis of prostate cancer and identification of new prognostic factors remain main issues in prostate cancer research. In this study, we sought to test a panel of cancer-specific markers in urine samples as an aid for early cancer diagnosis.
MATERIALS AND METHODS: Sedimented urine samples of 66 candidates for needle biopsy were tested. Real time-polymerase chain reaction (RT-PCR) was applied to detect the expression of transmembrane protease serine-2 and Ets-related gene fusion (TMPRSS2-ERG), Ets-related gene (ERG), prostate cancer antigen-3 (PCA3), and serine peptidase i
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Y chromosome microdeletions are the second most frequent genetic cause of male infertility after Klinefelter's syndrome.
OBJE … st one child in the last two years. Genomic DNA was extracted from peripheral blood samples and two multiplex polymerase chain reactions (PCR) analyses were performed using specific primers to confirm the presence or absence of Y chromosome microdeletions.
RESULTS: Microdeletions were detected in 12 of 120 (10%) cases, while no deletions were detected in the control group. Of total …
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Clinical manifestations of dengue vary in different areas of endemicity and between specific age groups, whereas predictors of outcome have remained controversial. In Brazil, the disease burden predominantly affects adults, with an increasing trend toward progression to dengue hemorrhagic fever (DHF) noted.
METHODS: A cohort of adults with confirmed cases of dengue was recruited in central Brazil in 2005. Patients were classified according to the severity of their disease. Associations of antibody responses, viremia levels (as determined by real-time polymerase chain reaction [PCR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Duchenne (DMD) and Becker (BMD) are allelic forms of a X-linked neuromuscular disorder. Both are caused by mutations arising in the gene enc … nd upon identifying the mutation itself in the proband. Large deletions are easily identified using multiplex polymerase chain reaction (PCR) whereas detection of point mutations is restricted to a few number of specialized laboratories. Hence carrier and prenatal diagnosis in 40% of families rely heavily on indirect approaches which presents major drawbacks and are not applicable i …
Аннотация на английскомСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recently developed molecular diagnostic tools facilitate rapid pathogen detection; however, their clinical application in Japan remains limited due to insufficient comparative data. This study aimed to evaluate the pathogen detection rates of the pneumonia panel relative to bacterial culture and compare viral detection rates between pneumonia and respiratory panels in Japanese patients.
METHODS: This retrospective study included 354 Japanese patients with suspected respiratory infections. Pathogen detection was performed using the BioFire® FilmArray® Pneumonia and Respiratory 2.1
СтатьяСравнительное исследованиеПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Escherichia coli causes >400,000 annual deaths in children aged <5 years worldwide, with morbidity and mortality exacerbated by antimicrobial-resistant strains. A high-throughput multiplexing assay called digital multiplex ligation assay (dMLA) was developed to detect simultaneously 43 priority genes in E. coli related to the following: antibiotic resistance (n = 19), virulence factors (n = 16), and phylogroup markers (n = 6) with controls (uidA, gapdh). Genes are detected via PCR amplification of adjacent probe pairs that ligate in the presence of target gene-specific DNA, followed by sequenc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Respiratory tract infection (RTI) is the most important cause of visiting both public and private medical care services. During the decade preceding Covid-19, in developing countries, there was a gap in the epidemiology of respiratory viral infections, probably due to the difficulty of detecting viral agents in clinical microbiology laboratories routine, at that time. In this context, the aim of this study was to describe the occurrence of virus, demographic factors associated and the likelihood of coinfections detection by multiplex PCR methods. The target also was to determine the involvemen
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chlamydia trachomatis (CT) and Neisseria gonorrhoeae (NG) are routinely tested and reported; however, Trichomonas vaginalis (TV) is the most common sexually transmitted infection (STI) in the United States and the prevalence of Mycoplasma genitalium (MG) infections is likely higher than estimated. We examined the clinical performance of the Alinity m STI assay for detection and surveillance of CT/NG/TV/MG in urine specimens from patients at a large academic medical center.
METHODS: Urine specimen from 198 patients was tested in this evaluation. Alinity m STI and Aptima Combo 2 CT/
СтатьяОценочное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Today, the spread of vancomycin-resistant strains isolated from Enterococcus faecalis (E. faecalis) has become a major health concern worldwide. Therefore, it is essential to provide a rapid and sensitive assay for identifying vanA gene for timely and appropriate antimicrobial control of resistant enterococcal infections. For this purpose, a cross-sectional study was performed on different clinical specimens of enterococci from Imam Reza hospital, Kermanshah, Iran. The antimicrobial susceptibility testing was determined by disk diffusion and MIC methods. Triplex-PCR and duplex-LAMP assays were
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lymphopenia is a frequent hematological manifestation, associated with a severe course of COVID-19, with an insufficiently understood pathogenesis. We present molecular genetic immunohistochemical, and electron microscopic data on SARS-CoV-2 dissemination and viral load (VL) in lungs, mediastinum lymph nodes, and the spleen of 36 patients who died from COVID-19. Lymphopenia <1 × 109/L was observed in 23 of 36 (63.8%) patients. In 12 of 36 cases (33%) SARS-CoV-2 was found in lung tissues only with a median VL of 239 copies (range 18-1952) SARS-CoV-2 cDNA per 100 copies of ABL1. Histomorphologic
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Cryptococcal meningitis (CM) remains an important cause of morbidity and mortality among immunocompromised patients. Laboratory diagnostics for CM includes antigen detection, staining and culture. Data on the performance of the Biofire® FilmArray® meningitis/encephalitis (ME) panel for detecting Cryptococcus neoformans/gattii is limited, with several reports describing false negativity for this target.
METHODS: A retrospective analysis of 1384 physician-ordered ME panel tests ordered between January 2017 to October 2018 was performed. ME panel results were compared to cerebrospina
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.