BACKGROUND: Liver cirrhosis is a progressive chronic disease with high morbidity and mortality, thereby posing a major challenge to global health. Evidence suggests that thyroid dysfunction, particularly hypothyroidism, is linked to liver diseases. Hypothyroidism disrupts metabolism, immune homeostasis, and inflammatory pathways, processes central to cirrhosis pathophysiology. However, its causal role and molecular mechanisms remain unclear.
METHODS: The study initiated by analyzing the association between thyroid dysfunction and cirrhosis through retrospective analysis of longitudinal data o
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: We developed an integrated multi-omics analysis in metastatic melanoma (MM) cohorts to associate DNA methylation profiles with tumor progression, survival, response to adjuvant immunotherapy, structure of the tumor immune microenvironment and transcriptional programs of immunity and melanoma differentiation.
METHODS: Lesions (n = 191) from a fully annotated, retrospective cohort of 165 AJCC 8th Stage III and IV melanoma patients (EPICA cohort) were characterized by reduced representation bisulfite sequencing, RNA sequencing, whole exome sequencing, quantitative immunohistochemistr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The development and severity of metabolic dysfunction-associated steatotic liver disease (MASLD) in children are closely related to alterations of gut microbiota. This study aims to investigate changes in the gut microbiota signature and microbial metabolites in children with MASLD. We collected fecal samples from children and adolescents aged 6-16 years, and the presence of MASLD was diagnosed by ultrasound. We performed 16S ribosomal DNA sequencing and targeted metabolomics in 36 and 25 subjects, consisting of healthy controls, children with obesity, and children with MASLD. The α-diversity
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The relationship between fine particulate matter (PM2.5) and cognition has been extensively investigated. However, the causal impact of acute PM2.5 purification on cognition improvement and the underlying biological mechanisms remain relatively opaque. Our double-blinded randomized controlled trial assessed the impact of acute PM2.5 purification on executive function, underpinned by multi-omics approaches including alternative splicing (AS) analysis. A total of 93 participants experienced a two-hour exposure to either reduced and normal PM2.5 levels. We measured the cognition of healthy young
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori infection is one of the most common gastric pathogens; however, the molecular mechanisms driving its progression to gastric cancer remain poorly understood. This study aimed to identify the key transcriptomic drivers and therapeutic targets of H. pylori-associated gastric cancer through an integrative transcriptomic analysis. This analysis integrates microarray and RNA-seq datasets to identify significant differentially expressed genes (DEGs) involved in the progression of H. pylori-associated gastric cancer. In addition to independent analyses, data were integrated using C
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Cistanche deserticola Y. C. Ma, revered as "desert ginseng" in traditional Chinese medicine, has been historically prescribed for treating five strains and seven injuries, and nourishing the five zang organs. While the total glycosides from C. deserticola (GCs) demonstrate hepatoprotective potential against acute alcoholic liver disease (ALD), their efficacy in chronic ALD and mechanism remain unexplored.
AIM OF THE STUDY: This study aimed to investigate the protective effects of GCs against chronic ALD and to elucidate its molecular mechanisms by multi-omics a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Curcuma wenyujin is recognized as one of the traditional Chinese medicinal herbs classified under the 'Eight Flavors of Zhejiang'. This herb is characterized by its high content of volatile oils and curcumin, with sesquiterpenes being the primary component. It exhibits a range of pharmacological activities, including anti-tumor, anti-inflammatory, and antiviral effects. The quality and yield of C. wenyujin are significantly influenced by abiotic stresses, with salt-alkali stress being one of the key factors among them. In this study, C. wenyujin was exposed to salt-alkali stress, with its leav
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Allergy is a common immune response often triggered by foods, medicine, and pollution, significantly affecting human health. Small-molecule metabolites, as the most direct phenotypic manifestations of biological systems, can directly elucidate gene functions and molecular mechanisms. However, the roles and mechanisms of small-molecule metabolites in allergies remain incompletely understood. In this study, we established an integrated strategy combining metabolomics, network pharmacology, and proteomics to identify active metabolites and clarify their regulatory roles in bovine serum albumin (B
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis is a life-threatening inflammatory condition, and its underlying genetic mechanisms are not yet fully elucidated. We applied methods such as Mendelian randomization (MR), genetic correlation analysis, and colocalization analysis to integrate multi-omics data and explore the relationship between genetically associated genes and sepsis, as well as sepsis-related mortality, with the goal of identifying key genetic factors and their potential mechanistic pathways.
METHODS: To identify therapeutic targets for sepsis and sepsis-related mortality, we conducted an MR analysis on 11
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Heart failure (HF) is characterized by complex molecular alterations, and recent studies suggest a potential role for sepsis-related genes in cardiovascular dysfunction. This study aimed to develop a predictive model for HF based on sepsis-related gene signatures.
METHODS: Three sepsis-related datasets (GSE65682, GSE54514, and GSE95233) were analyzed to identify differentially expressed genes (DEGs) following batch effect correction using the ComBat algorithm. With the use of elastic net regularization and the glmnet package in R, Lasso Cox regression was employed to screen out ge
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epidemiological evidence suggests that exposure to ambient fine particulate matter (PM2.5) during pregnancy may increase the risk of congenital heart disease; however, the underlying mechanisms remain unclear. This study aimed to investigate the effects of gestational PM2.5 exposure on offspring cardiac development and to elucidate the potential mechanisms involved. Gestational exposure to PM2.5 significantly reduced litter size, birth weight, and offspring cardiac mass. Further analyses revealed inflammatory infiltration, lipid peroxidation, and decreased ATP levels in the offspring hearts, i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Etomidate (ETO), widely employed as a surgical anesthetic and more recently recognized as a drug of abuse, has been frequently detected in aquatic environment. However, the toxicity assessment of ETO is insufficient. Adult zebrafish were used to investigate toxicological effects of ETO. Four weeks ETO exposure could induced abnormal behaviors, including reduced anxiety, memory impairment, and heightened aggression. The increased aggression was quantitatively characterized using machine learning, which revealed significantly elevated instantaneous velocity and drastic changes in angular velocit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Metabolic dysregulation and redox imbalance in immune cells are key drivers of systemic lupus erythematosus (SLE) pathogenesis. This study explores critical oxidative stress (OS) features and their interrelationships in SLE pathogenesis.
METHODS: Three transcriptomic datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) were analyzed to identify SLE- and OS-associated pathways via Gene Set Variation Analysis (GSVA). Multiple machine learning methods-including deep learning (DL), random forest (RF), XGBoost, support vector machine (SVM), and least absolute shrinkage and selection operator
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Autophagy plays an essential regulatory role in the development of osteoarthritis (OA), its specific regulatory mechanism remains unclear. This work aims to study the critical genes related to autophagy in OA and explore their potential value.
METHODS: Datasets were downloaded from the publicly available GEO database, and differentially expressed autophagy-related genes (ARGs) were obtained. LASSO regression analysis, SVM-RFE algorithm, and RF algorithm were used to screen signature genes. The diagnostic accuracy of autophagy-related signature genes (ARSGs) in OA was determined th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Ovarian cancer (OV) is the deadliest gynecologic malignancy owing to its late diagnosis and high metastatic propensity. Current biomarkers lack sufficient sensitivity and specificity for the detection of early-stage cancer. To address this gap, we integrated single-cell transcriptomic profiling of tumor tissues with analysis of circulating exosomal RNA, aiming to uncover candidate markers that reflect tumor heterogeneity and metastatic potential and that may serve as sensitive, non-invasive diagnostics.
METHODS: We integrated single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data from primar
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Treatment resistance and leukemic stem cell survival are significant challenges in managing chronic myeloid leukemia (CML). While Breakpoint Cluster Region-Abelson (BCR::ABL1) fusion drives disease initiation, emerging evidence suggests that non-coding RNAs, particularly long non-coding RNAs (lncRNAs), regulate critical cellular processes that promote leukemic transformation and treatment failure. We employed a comprehensive in silico approach integrating multiple omics platforms to investigate CML-associated lncRNAs. Candidate lncRNAs were identified by cross-referencing LncRNA Disease and Ln
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence of rosacea is high, while the drug options remain limited. Mendelian randomization (MR) is an effective way to prioritize plasma proteins as novel drug targets based on their causal effects on rosacea. The plasma proteins were categorized into different levels of drug targets by the MR and Bayesian colocalization analysis. Their genetic and protein expression was investigated using an RNA sequencing dataset and experiments in vitro and in vivo. MR and colocalization identified Granzyme K (GZMK) as a drug target, whose expression increased in the affected samples. A novel mouse m
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Alzheimer's disease (AD) is a complex neurodegenerative disorder with heterogeneous genetic and molecular underpinnings. Polygenic scores (PGS) capture little of this complexity.
METHODS: We conducted genome-, transcriptome-, and proteome-wide association studies (G/T/PWAS) on 15,480 individuals from the Alzheimer's Disease Sequencing Project R4 (ADSP) to identify AD-associated signals, followed by pathway enrichment analysis. Integrative risk models (IRMs) were developed using genetically regulated components of gene and protein expression and clinical covariates. Elastic-net l
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Inflammatory bowel disease (IBD) presents unpredictable therapeutic responses and complex immune dysregulation. Current precision medicine approaches lack robust molecular tools integrating transcriptomic signatures with immune dynamics for personalized treatment guidance.
METHODS: We performed multi-omics analyses of GEO datasets using machine learning algorithms (LASSO/Random Forest) to derive a four-gene signature. Validation employed ten algorithms and nomogram construction. Immune infiltration (CIBERSORT/ssGSEA), single-cell RNA sequencing, and DSS-colitis models characterize
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Advances in next-generation sequencing have significantly improved the molecular diagnosis of mitochondrial diseases (MDs), a group of heterogeneous neurogenetic disorders. However, progress in understanding their pathogenic mechanisms and translating this knowledge into effective therapies remains limited. Elucidating the molecular determinants of phenotypic variability in primary MDs is essential to uncover disease mechanisms and identify novel therapeutic targets. We investigated a cohort of eight adult patients with genetically confirmed Progressive External Ophthalmoplegia (PEO)-an extrem
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.