Large-scale metabolomics enables systematic profiling of circulating small-molecule metabolites and provides an integrative view of genetic, environmental, lifestyle, and microbial influences on human health, yet comprehensive evidence linking metabolites to diverse traits, diseases, comorbidity, prediction, and causality remains limited. Here, we analyze 251 Nuclear magnetic resonance (NMR)-derived plasma metabolites in 212,751 UK Biobank participants, with independent validation in 177,013 individuals from a newly released data wave. Testing across 884 health-related traits, 722 prevalent di
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The predictive value of intratumoral microbiota for the efficacy of neoadjuvant immunochemotherapy, as well as the changes in microbiota before and after treatment, has remained largely unexplored.
METHODS: We employed 2bRAD sequencing for Microbiome (2bRAD-M) to analyze 42 specimens from patients with locally advanced oral squamous cell carcinoma (OSCC), focusing on trends in intratumoral microbiota changes before and after neoadjuvant immunochemotherapy, and predicting responses to the treatment.
RESULTS: (1) There was no significant difference between the MPR_before group and n
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease (IBD), encompassing ulcerative colitis (UC) and Crohn's disease (CD), is a prevalent chronic gastrointestinal disorder. Conventional therapies are often limited by adverse effects and suboptimal long-term efficacy. Probiotics have emerged as promising therapeutic alternatives for IBD because of their ability to modulate the gut microbiota, reinforce intestinal barrier integrity, and regulate immune responses. However, their clinical translation is hampered by challenges within the harsh gastrointestinal milieu, including low viability, poor colonization, and insuffic
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The maintenance of gastrointestinal homeostasis relies on a tightly coordinated interplay between the intestinal epithelium, the immune system, and the commensal microbiome. Disruption of this balance underlies inflammatory bowel disease (IBD), encompassing Crohn's disease and ulcerative colitis, and is characterized by chronic, relapsing mucosal inflammation driven by genetic susceptibility, environmental factors, immune dysregulation, and microbial imbalance. Persistent inflammation promotes repeated cycles of epithelial injury and aberrant repair, creating a permissive environment for dyspl
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Thyroid carcinoma is characterized by significant heterogeneity and immune evasion, in which myeloid cells play a pivotal role in tumor microenvironment (TME) remodeling. However, the key regulatory genes and their underlying mechanisms are not yet fully elucidated.
OBJECTIVE: This study aims to identify and validate critical myeloid-derived genes involved in driving thyroid cancer progression by employing an integrated multiomics approach.
METHODS: We performed single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) on thyroid cancer tissues, integrated with High-dimensional weighted gene co-exp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ralstonia solanacearum species complex (RSSC) pathogens cause destructive plant wilt diseases of a wide variety of crops, leading to significant agricultural losses worldwide. These bacteria rapidly spread through the water-transporting xylem where they grow prolifically and produce abundant biofilm that clogs xylem vessels. To understand RSSC biofilm behavior in planta, we examined their complex fluid mechanics. Rheological analyses revealed that unlike all previously analyzed microbial biofilms, RSSC biofilms are shear-thinning, viscoelastic fluids at physiologically relevant shear forces. T
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cystic fibrosis (CF) is a genetic disorder characterized by chronic airway inflammation and lung function decline. CF-related diabetes (CFRD) is the main extrapulmonary complication and it is tightly linked to an impaired lung function, but the underlying mechanisms behind these observations are incompletely understood. In the present study, we aimed to compare airway microbiome compositions between pwCF with and without CFRD. METHODS: Sputum samples from pwCF with and without CFRD were analysed for inflammatory cytokines using MesoScale assays and total bacterial load using quanti
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Conventional selectable marker genes (SMGs) in plant transformation, such as those conferring antibiotic resistance, raise biosafety concerns due to their permanent genomic integration. Alternative systems, such as the phosphite (Phi)/phosphite dehydrogenase (PtxD) system, have been developed to address these concerns. This system works by enabling transgenic plants to convert non-metabolizable, toxic Phi into usable orthophosphate (Pi), thereby providing both a detoxification mechanism and a positive growth advantage for selection. Building on this principle of detoxification-based positive s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While shotgun metagenomics is often used to profile antibiotic resistome in gut microbial communities, few studies have investigated if the choice of sequencing platform and assembly strategy affect what mobile genetic elements and antimicrobial resistance genes are recovered. In this study, we compared three platforms (Illumina, Oxford Nanopore, and PacBio HiFi) and seven assembly strategies on gut metagenomes from cattle, pig, and human as case studies. Long-read assemblies recovered 5- to 7-fold more plasmid sequence than Illumina in cattle and pig (mean 17.0 Mb vs. 3.1 Mb), while Illumina
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The global surge in fluoroquinolone resistance (FQR) underscores the urgent need for robust environmental surveillance. From a One Health perspective, rivers serve as critical conduits and hotspots for antimicrobial resistance (AMR) dissemination.
METHODS: To address this issue, we conducted a systematic metagenomic surveillance of FQR across spatially prioritized freshwater ecosystems using distribution data of five major markers (gyr, par, qnr, aac, and qep) retrieved from the National Center for Biotechnology Information Pathogen Detection Isolate Browser.
RESULTS: Among 164 ri
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Lake sediments represent a typical reservoir of antibiotic resistance genes (ARGs), an emerging contaminant. As a key nutrient for sediment microorganisms, elevated sulfate levels can profoundly influence sulfur cycling and related microbial processes. However, the impact of sulfate loads on the profiles of ARGs in lake sediments remains poorly understood. This study utilized a microcosm experiment to examine how sulfate addition at various concentrations (200, 400, and 600 mg/kg dry weight) affects the sediment resistome, via metagenomic analysis. Sulfate addition significantly increased sedi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medicinal-plant immunity and specialized metabolism are mechanistically linked, but rigorous receptor validation, causal multi-omics, and field trials are needed for reliable translational applications. Medicinal plants combine classical immune signaling with lineage-specific specialized metabolism. This review focuses on the immune systems of medicinal plants and on how pathogen perception reshapes the biosynthesis of pharmacologically valuable secondary metabolites. We synthesize evidence for pattern-triggered immunity (PTI) and effector-triggered immunity (ETI), emphasizing pattern-recognit
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microscopic colitis (MC) is a chronic inflammatory bowel disorder characterised by chronic watery diarrhoea in the setting of a normal or near-normal endoscopic appearance, with diagnosis relying on histologic evaluation of colonic biopsies. It is traditionally divided into lymphocytic colitis (LC), defined by an increased intraepithelial lymphocyte count, and collagenous colitis (CC), characterised by a thickened subepithelial collagen band. However, these categories do not fully capture the biological heterogeneity of the disease. Conventional histology remains crucial for diagnosis yet prov
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Understanding the occurrence of antibiotic-resistant bacteria (ARB) and associated antibiotic resistance genes (ARGs) in remote marine environments is crucial for accessing treats of ARG pollution on a border ecological scale. While most studies focused on anthropogenically disturbed settings, the Challenger Deep, as the deepest ocean habitat, offers a unique opportunity to investigate minimally disturbed resistomes. We revived 123 bacterial isolates from the Challenger Deep sediment, assessed their antibiotic susceptibility, and identified their taxonomy via 16S rRNA gene sequencing. Among th
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ethanol is a non-food carbon source that is derived from syngas fermentation and has the potential to serve as a raw material for microbial processes that produce various value-added chemicals. Vibrio natriegens is a new type of chassis cell that has been developed in recent years for use in biotechnology and synthetic biology. It has a very fast growth rate and a broad substrate spectrum, but its ability to utilize ethanol is limited and its tolerance is poor. Adaptive Laboratory Evolution (ALE) provides a powerful tool for studying the resistance phenotype, production activity, and genetic s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Carbon quantum dots (CQDs) have attracted growing interest for enhancing anaerobic ammonium oxidation (anammox) due to their tunable surface chemistry and excellent electron transfer properties. In this study, a series of CQDs with different surface functional groups were prepared by adjusting microwave power and combining l-lysine modification. l-lysine modification introduced nitrogen-containing functional groups into CQDs and enhanced their surface polarity, structural ordering and electrochemical activity, which contributed to improved electron transfer characteristics. The reactor supplem
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Calcium oxalate (CaOx) nephrolithiasis is usually framed as a physicochemical disorder of urinary supersaturation, yet stable crystal retention also requires a permissive tubular epithelial state. Here, we tested whether circulating phenylalanine (Phe) functions as a systemic priming factor that sensitizes renal tubular epithelium to CaOx crystal retention under lithogenic stress. Targeted amino-acid metabolomics in patients with CaOx stones, two-sample Mendelian randomization, glyoxylate-induced mouse nephrolithiasis, HK-2 cell injury assays, renal transcriptomics, pathway-rescue experiments
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurofibromatosis type 1 (NF1) is a genetic condition presenting with variable symptomatology, however most individuals will demonstrate cognitive and behavioural difficulties, including autism. Using a heterozygous germline knockout mouse model of NF1 (Nf1 +/-), we performed in-depth behavioural evaluations encompassing learning and memory, stereotypy, social interaction, anxiety- and depression-like behaviour. Anatomical and functional studies of the brain and gastrointestinal tract were followed by the first investigation of gut microbiota composition (via full-length 16S rRNA sequencing) i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The persistence of antibiotic resistance in aquatic environments poses a public health concern, particularly when drinking water sources act as reservoirs for multidrug-resistant opportunistic pathogens. However, the linkage between environmental resistomes and the resistance phenotypes of cultivable bacteria remains under-characterized. This case study investigated this relationship in a karst drinking water source in Guizhou, China.
METHODS: Surface water samples from seven sites were analyzed for antibiotic residues using LC-MS/MS. Metagenomic sequencing was conducted on sele
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Microbial-derived short-chain fatty acids regulate a variety of pathways in the healthy colonic mucosa. In particular, butyrate serves as the primary energy source for colonocytes and regulates gene transcription by stabilizing the transcription factor hypoxia-inducible-factors (HIF) and functioning as a histone deacetylase (HDAC) inhibitor. A limitation of butyrate as a therapeutic is its rapid metabolism in differentiated colonocytes. Furthermore, intestinal stem cells (ISCs) respond differently to butyrate, preferentially using glucose for energy procurement. To address these limitations, w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования