Currently available rapid blood culture diagnostics detect few gram-negative resistance determinants, limiting their clinical utility. We prospectively evaluated the prototype BIOFIRE FILMARRAY Antimicrobial Resistance (AMR) Panel, a rapid multiplex PCR test that detects 31 AMR genes, on residual positive blood culture broths from patients with gram-negative bacteremia due to five target organisms at a New York City hospital. Predicted antimicrobial resistance based on the AMR Panel was compared to results from broth microdilution testing of bloodstream isolates recovered in culture. A simulat
СтатьяОценочное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Community-acquired lower respiratory tract infection (LRTI) is a common reason for hospitalisation. Antibiotics are frequently used while diagnostic microbiological methods are underutilised in the acute setting.
OBJECTIVES: We aimed to investigate the relative proportion of viral and bacterial infections in this patient group and explore methods for proper targeting of antimicrobial therapy.
METHODS: We collected nasopharyngeal samples prospectively from adults hospitalised with LRTIs during three consecutive winter seasons (2016-2019). Syndromic nasopharyngeal testing was perfo
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Despite clinical relevance, commercially available molecular tools for accurate β-lactamase detection are limited. In this study, we evaluated the performance of the ARM-DⓇ Kit, β-Lactamase, a commercially available multiplex PCR assay designed to detect nine β-lactamase genes, including the five major plasmid-mediated carbapenemases, ESBL and AmpC genes circulating in the United States.
METHODS: A diverse collection of 113 Gram-negative isolates, including 42 with multiple β-lactamases genes, was selected from the U.S. Centers for Disease Control and Prevention (CDC) & Food and D
СтатьяОценочное исследованиеПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic analysis of congenital adrenal hyperplasia (CAH) has been challenging because of high homology between CYP21A2 and its pseudogene CYP21A1P. This study aimed to evaluate the clinical utility of long-read sequencing (LRS) in diagnosis of CAH attributable to 21-hydroxylase deficiency by comparing with multiplex ligation-dependent probe amplification plus Sanger sequencing. In this retrospective study, 69 samples, including 49 probands from 47 families with high-risk of CAH, were enrolled and blindly subjected to detection of CAH by LRS. The genotype results were compared with control meth
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aims to perform a prenatal genetic diagnosis of a high-risk fetus with trisomy 7 identified by noninvasive prenatal testing (NIPT) and to evaluate the efficacy of different genetic testing techniques for prenatal diagnosis of trisomy mosaicism.
METHODS: For prenatal diagnosis of a pregnant woman with a high risk of trisomy 7 suggested by NIPT, karyotyping and chromosomal microarray analysis (CMA) were performed on an amniotic fluid sample. Low-depth whole-genome copy number variation sequencing (CNV-seq) and fluorescence in situ hybridization (FISH) were used to clarify
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction. Viral infections are increasingly an important cause of central nervous system (CNS) complications.Hypothesis/Gap Statement. There is no comprehensive insight about CNS infections due to viral agents among Iranian children.Aim. This study aimed to investigate the viral aetiology, clinical and epidemiological profile of children with acute infections of the CNS.Methodology. A prospective study was conducted on children at the referral hospital in Isfahan, Iran, from June 2019 to June 2020. A multiplex PCR assay was used to detect the viral causative agent in cerebrospinal fluid an
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: In the context of the pandemic, the rapid emergency use authorisation of diagnostic assays for SARS-CoV-2 has meant there are few peer-reviewed published studies of clinical performance of commercial assays.
AIMS: To evaluate the clinical performance of AusDiagnostics respiratory multiplex tandem PCR assay including SARS-CoV-2.
METHODS: We reviewed the results following implementation of AusDiagnostics respiratory multiplex tandem PCR assay including SARS-CoV-2, and compared with an in-house RT-PCR assay at our State Reference Laboratory.
RESULTS: Initial validation using AusDia
Оценочное исследованиеСтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Determining whether and when multiplex nucleic acid amplification tests (NAATs) for respiratory viruses should be repeated is difficult. We analyzed 5 years of results for a multiplex NAAT targeting 14 respiratory viruses, to determine how often repeat tests were ordered and the time period in which results were likely to change. Results for NAATs performed on nasopharyngeal specimens and repeated within 90 days after initial testing were analyzed. Logistic regression models were used to compare time periods between tests with respect to the odds of a change in the sample result. During the st
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: We aimed to investigate the validity of noninvasive prenatal diagnosis (NIPD) based on direct haplotype phasing without the proband or other family members and its feasibility for clinical application in the case of Duchenne muscular dystrophy (DMD).
METHODS: Thirteen singleton-pregnancy families affected by DMD were recruited. The pathogenic variants in the pregnant females have been identified by multiplex ligation-dependent probe amplification (MLPA). We resolved maternal haplotypes for each family by performing targeted linked-read sequencing of their high molecular weight DNA,
СтатьяВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Duchenne Muscular Dystrophy is an X-linked recessive disorder characterized by progressive muscular degeneration, patients often develop cardiac failure in the later stage and death occurs before 20 years of age. For a disease with poor postnatal prognosis such as Duchenne Muscular Dystrophy (DMD), providing the carrier mother with the option of prenatal diagnosis in a subsequent pregnancy is accepted practice in many places where termination of pregnancy is allowed. Though methods of direct sequencing such as Sanger's sequencing has been widely used, Next-Generation Sequencing is b
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Vibrio vulnificus, Aeromonas hydrophila, methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), group A Streptococcus, and group B Streptococcus are commonly detected causative agents of necrotizing fasciitis (NF) in Chia-Yi Chang Gung Memorial Hospital. The aim of this study was to develop and evaluate a multiplex PCR method for the simultaneous detection of five of the most important human pathogens involved in NF by using a novel combination of species-specific genes.
METHODS: The samples used were collected from 99 patients with surgically confirmed NF of the extremities who were
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Infectious meningitis and encephalitis are potentially life-threatening conditions caused mostly by bacterial and viral agents. Rapid diagnosis and prompt treatment are associated with a more favorable outcome. In recent years nucleic acid amplification tests have been developed to speed detection and identification of pathogens directly from cerebrospinal fluid (CSF). The aim of this study was to compare the diagnostic accuracy of a commercially available multiplex PCR assay for etiological diagnosis of infectious meningitis directly from CSF samples with culture. A secondary endpoint was to
Оценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to identify the cause of azoospermia in a 38-year-old infertile man who was referred for genetic testing. Cytogenetic evaluation was performed by G-banding, C-banding, and FISH using centromeric probes for chromosomes X and Y and showed the presence of a monocentric isochromosome Y with a complex, mosaic karyotype 45,X/46,X,i(Y)(q10)/46,XX/47,XX,i(Y)(q10). Multiplex PCR for the commonly deleted genes in the AZFa, AZFb, and AZFc regions of the Y chromosome was performed and indicated the presence of all 3 regions. Further, PCR amplification followed by DNA sequencing of the SRY
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogenic microbes may colonize the female genital tract via sexual transmission and cause health issues like inflammation or malignancy, summarized as sexually transmitted disease (STD). A major representative of such pathogens is Trichomonas vaginalis (T.v.), whose role in the etiology of cervical cancer remains elusive. Traditional morphologic screening of cervical smears is able to detect T.v., although its identification may be complicated by look-alikes such as degenerated granulocytes and basal cells. In addition, the parasite's endosymbiont Mycoplasma hominis (M.h.) cannot be detected
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Spinal muscular atrophy (SMA) is mainly caused by deletions in SMA-related genes. The objective of this study was to develop gene-dosage assays for diagnosing SMA.
METHODS: A multiplex, quantitative PCR assay and a CNVplex assay were developed for determining the copy number of SMN1, SMN2, and NAIP. Reproducibility and specificity of the two assays were compared to a multiple ligation-dependent probe amplification (MLPA) assay. To evaluate reproducibility, 30 samples were analyzed three times using the three assays. A total of 317 samples were used to assess the specificity of the
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Listeria monocytogenes is a foodborne pathogen causing listeriosis, which potentially affects all individuals, especially pregnant women and immunocompromised persons. The present study investigated the prevalence, antimicrobial susceptibility and serotypes distribution of the isolated L. monocytogenes from Iran. Twenty two (4.97%) of 442 human, food and livestock samples were found to be positive for L. monocytogenes. L. monocytogenes was identified in 8.8% of 125 human samples, 2.99% of 267 food and 6% of 50 livestock samples. The standard disk diffusion method and minimum inhibitory concent
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human rhinovirus (RV) is a common cause of acute respiratory infection (ARI) in children. We aimed to characterize the clinical and demographic features associated with different RV species detected in children attending hospital with ARI, from low-income families in North-east Brazil. Nasopharyngeal aspirates were collected from 630 children <5 years with ARI. Clinical diagnosis and disease severity were also recorded. Samples were analyzed by multiplex PCR for 18 viral and atypical bacterial pathogens; RV positive samples underwent partial sequencing to determine species and type. RV was the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CHARGE syndrome MIM #214800 is an autosomal dominant syndrome involving multiple congenital malformations. Clinical symptoms include coloboma, heart defects, choanal atresia, retardation of growth or development, genital hypoplasia, and ear anomalies or deafness. Mutations in the chromodomain helicase DNA binding protein 7 (CHD7) gene have been found in 65-70% of CHARGE syndrome patients. Here, we describe a 16-month-old boy with typical CHARGE syndrome, who was referred for CHD7 gene analysis. Sequence analysis and multiplex ligation-dependent probe amplification were performed. A heterozygou
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer is the most frequent tumor in Li-Fraumeni syndrome (LFS), a rare inherited cancer syndrome associated with germline mutations in the TP53 gene. Recent data show that breast cancer in germline TP53 mutation carriers is commonly HER2+ (63-83 %). We assessed the prevalence of germline TP53 mutations in a cohort of women with HER2+ breast cancer diagnosed age ≤50 years. We identified blood specimens from 213 women with primary invasive HER2+ breast cancer age ≤50 years from a single center. Exon grouping analysis sequencing and multiplex ligation-dependent probe amplification techniq
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования