A colony of domestic rabbits in Tennessee, USA, experienced a high-mortality (~90%) outbreak of enterocolitis. The clinical characteristics were one to six days of lethargy, bloating, and diarrhea, followed by death. Heavy intestinal coccidial load was a consistent finding as was mucoid enteropathy with cecal impaction. Preliminary analysis by electron microscopy revealed the presence of virus-like particles in the stool of one of the affected rabbits. Analysis using the Virochip, a viral detection microarray, suggested the presence of an astrovirus, and follow-up PCR and sequence determinatio
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
N-myc downstream regulated gene 1 (NDRG1) is an important gene regulating tumor invasion. In this study, shRNA technology was used to suppress NDRG1 expression in CaSki (a cervical cancer cell line) and HO-8910PM (an ovarian cancer cell line). In vitro assays showed that NDRG1 knockdown enhanced tumor cell adhesion, migration and invasion activities without affecting cell proliferation. cDNA microarray analysis revealed 96 deregulated genes with more than 2-fold changes in both cell lines after NDRG1 knockdown. Ten common upregulated genes (LPXN, DDR2, COL6A1, IL6, IL8, FYN, PTP4A3, PAPPA, ETV…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Next-generation sequencing (NGS) techniques have already shown their potential in the identification of mutations underlying rare inherited disorders. We report here the application of linkage analysis in combination with targeted DNA capture and NGS to a Norwegian family affected by an undiagnosed mental retardation disorder with an autosomal recessive inheritance pattern. Linkage analysis identified two loci on chromosomes 9 and 17 which were subject to target enrichment by hybridization to a custom microarray. NGS achieved 20-fold or greater sequence coverage of 83% of all protein-coding ex
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of studies have demonstrated that endothelial cell is one of the target tissues of aldosterone. Here, we have conducted a transcriptome analysis of aldosterone-inducible genes in human endothelial cell lines stably expressing human mineralocorticoid receptor (MR) by retroviral system (MR-EAhy). We found that aldosterone in physiologic concentrations robustly induced MR-dependent transcriptional response in MR-EAhy. By DNA microarray analysis, we validated 12 aldosterone-up-regulated genes among which at least seven were concomitantly associated with increased protein expression. We al…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Severe meningococcal sepsis is still of high morbidity and mortality. Its management may be improved by an experimental model allowing better understanding of its pathophysiology. We developed an animal model of meningococcal sepsis in transgenic BALB/c mice expressing human transferrin. We studied experimental meningococcal sepsis in congenic transgenic BALB/c mice expressing human transferrin by transcriptional profiling using microarray analysis of blood and brain samples. Genes encoding acute phase proteins, chemokines and cytokines constituted the largest strongly regulated groups. Dynami…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pathogens adapt to the host environment by altering their patterns of gene expression. Microarray-based and genetic techniques used to characterize bacterial gene expression during infection are limited in their ability to comprehensively and simultaneously monitor genome-wide transcription. We used massively parallel cDNA sequencing (RNA-seq) techniques to quantitatively catalog the transcriptome of the cholera pathogen, Vibrio cholerae, derived from two animal models of infection. Transcripts elevated in infected rabbits and mice relative to laboratory media derive from the major known V. ch
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We provide the first description of a patient with a heterozygous deletion of the Attractin-like (ATRNL1) gene. The patient presented with a novel and distinctive phenotype comprising dysmorphic facial appearance, ventricular septal defect, toe syndactyly, radioulnar synostosis, postnatal growth retardation, cognitive impairment with autistic features, and ataxia. A 325 kb de novo deletion in ATRNL1 was demonstrated using SNP microarray and confirmed by FISH analysis using BAC probes. Sequence analysis of the undeleted allele did not identify any alterations, suggesting that the phenotype was
Клинический случайПисьмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology2009eng
BACKGROUND: The molecular biological properties of oral lichen planus (OLP) are largely unknown. The aim of this study was to identify the genes responsible for its pathogenesis at the genome scale using DNA microarray technology.
METHODS: The RNA samples extracted from the specimens of nine OLP patients and nine controls were analyzed with Affymetrix GeneChip. Real-time reverse transcriptase polymerase chain reaction (RT-PCR) analysis was applied to confirm GeneChip results.
RESULTS: A total of 985 differentially expressed genes (629 up-regulated and 356 down-regulated) were identified. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is the 5(th) most prevalent disease worldwide leading to severe morbidity and mortality in deve … d the presence of hemosiderin-laden macrophages in the absence of an overt inflammatory infiltrate. Microarray analysis of gene expression in diseased lungs and quantitative RT-PCR analysis of purified macrophages revealed a state of prolonged tissue injury and the presence of alternatively activated macrophages producing MMP-12. Taken together, these data show that …
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Otosclerosis is a complex disease that results in a common form of conductive hearing loss due to impaired mobility of the stapes. Stapedial motion becomes compromised secondary to invasion of otosclerotic foci into the stapedio-vestibular joint. Although environmental factors and genetic causes have been implicated in this process, the pathogenesis of otosclerosis remains poorly understood. To identify molecular contributors to otosclerosis we completed a microarray study of otosclerotic stapedial footplates. Stapes footplate samples from otosclerosis and control patients were used in the ana
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
WNT/beta-catenin signaling has an established role in nephron formation during kidney development. Yet, the role of beta-catenin during ureteric morphogenesis in vivo is undefined. We generated a murine genetic model of beta-catenin deficiency targeted to the ureteric bud cell lineage. Newborn mutant mice demonstrated bilateral renal aplasia or renal dysplasia. Analysis of the embryologic events leading to this phenotype revealed that abnormal ureteric branching at E12.5 precedes histologic abnormalities at E13.5. Microarray analysis of E12.5 kidney tissue identified decreased Emx2 and Lim1 ex…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hodgkin/Reed-Sternberg (HRS) cells of classical Hodgkin lymphoma (cHL) display unique characteristics that discriminate cHL from other B-cell lymphomas and normal B cells. Therefore, comparative gene expression profiling of Hodgkin and non-Hodgkin B cells could lead to the identification of candidate genes that are critical for the pathogenesis of cHL. We performed microarray analysis of Hodgkin and non-Hodgkin cell lines and identified activating transcription factor 3 (ATF3), a member of the cyclic AMP response element binding protein (CREB)/ATF family, as a differentially expressed candidat…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nonstructural (NS) proteins of hepatitis C virus (HCV) play major roles in viral replication and the pathogenesis of liver diseases. Current … sis and the induction of NS proteins 3 to 5B are confirmed by immunofluorescent staining. Using DNA microarray analysis, we characterized the changes in mRNA expression profile of 6416 genes and identified several genes, whose mRNAs are specifically upregulated by the induction of NS proteins. This cell line provides a unique in vitro hepatoma cell system for the inv …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Multidrug and Toxic Compound Extrusion (MATE) gene family are known not only for transport activities but also for regulating response t … rmonal and stress-responsive cis-elements were recorded in the upstream region of CaMATE genes. The microarray analysis showed the varied expression of CaMATE genes in various fruit tissues, including whole fruit, placenta, pericarp and seeds. The qRT-PCR expression analysis displayed the higher expression of CaMATE27 in the placenta tissue at different days post ant …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MicroRNAs have recently emerged as major players in host -bacterial pathogen interactions, either as part of the host defense mechanism to neutralize infection or as a bacterial arsenal aimed at subverting host cell functions. Here, we identify the newly evolved human microRNA miR-6762-5p as a new player in the host-Shigella interplay. A microarray analysis in infected epithelial cells allowed the detection of this miRNA exclusively during the late phase of infection. Conditional expression of miR-6762-5p combined with a transcriptome analysis indicated a role in cytoskeleton remodeling. Likew…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study aimed to explore the potential molecular mechanism of allergic rhinitis (AR) and identify gene signatures by analyzing microarray data using bioinformatics methods.
METHODS: The dataset GSE19187 was used to screen differentially expressed genes (DEGs) between samples from patients with AR and healthy controls. Gene ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analyses were applied for the DEGs. Subsequently, a protein-protein interaction (PPI) network was constructed to identify hub genes. GSE44037 and GSE43523 datasets were screened to valida
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The EEF1A2 gene encodes eukaryotic translation elongation factor 1α2, an integral component of the elongation factor complex. Heterozygous pathogenic variants in EEF1A2 are associated with neurodevelopmental disorders characterized by epilepsy, global developmental delay, and autism. To date, dilated cardiomyopathy has only been reported in two siblings with neurodevelopmental phenotypes and a homozygous missense variant in EEF1A2. This report describes a nine-year-old female patient who presented with neurodevelopmental phenotypes and dilated cardiomyopathy. Analysis of 193 epilepsy genes by
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Individuals carrying balanced constitutional reciprocal translocations generally have a normal phenotype, but often present reproductive disorders. The aim of our research was to analyze the meiotic process in an oligoasthenoteratospermic boar carrying an asymmetric reciprocal translocation involving chromosomes 1 and 14. Different multivalent structures (quadrivalent and trivalent plus univalent) were identified during chromosome pairing analysis. Some of these multivalents were characterized by the presence of unpaired autosomal segments with histone γH2AX accumulation sometimes associated w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pilomyxoid astrocytomas (PMAs) manifest a more aggressive clinical course than pilocytic astrocytomas (PAs). Development of effective therapies demands a better biological understanding of PMA. We first conducted gene expression microarray analysis of 9 PMA and 13 PA from infra- and supratentorial sites. Unsupervised hierarchical clustering analysis demonstrated that tumors are grouped according to anatomic site, not diagnosis. Gene expression profiles were then contrasted between eight PMAs and six PAs, all supratentorial/hypothalamic/chiasmal. Clinical outcome of PMAs varied, with four out o…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
People carrying a 22q11.2 microduplication display a phenotype varying from normal to severely affected. We report a phenotypically normal f … nherited the interstitial 22q11.2 microduplication from the mother. High-resolution oligonucleotide microarray analysis showed this microduplication is located in the common 3 Mb 22q11.2 deletion region between positions 17.298 Mb and 20.246 Mb with a length of 2.948 Mb. This report demonstrates the remarkable intrafamilial variability of a 22q11.2 microduplication p …
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования