BACKGROUND: Spinal cord injury (SCI) is a severe neurological disorder lacking early diagnostic biomarkers and precise therapeutic targets. PANoptosis, a combined cell death process involving apoptosis, necroptosis, and pyroptosis, is implicated in poor functional recovery after SCI, yet its biomarkers remain unexplored. This study aims to identify biomarkers associated with PANoptosis in SCI.
METHODS: Differentially expressed genes (DEGs) associated with SCI were identified using bioinformatics analysis, followed by functional enrichment. Weighted gene co-expression network analysis (WGCNA)
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute pancreatitis (AP) is a life-threatening inflammatory disorder characterized by diverse etiologies and complex pathophysiological mechanisms involving immune dysregulation, systemic metabolic reprogramming, and gut microbiota disturbances. Although single-omics studies have provided partial insights into AP pathogenesis, comprehensive integrative multi-omics analyses investigating the intricate interactions among immunity, metabolism, and the microbiome in AP remain limited.
METHODS: We conducted an integrative multi-omics analysis of peripheral blood transcriptomics, untarge
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
While platelets are well-documented contributors to tumorigenesis, their role in multiple myeloma (MM) progression and risk stratification remains underexplored. To assess platelet function in MM and verify the prognostic value of platelet-related genes(PRGs) in patients with multiple myeloma, further providing new ideas for the development of MM. We combined the clinical assessment of platelet activation in MM patients with functional co-culture experiments using MM cell lines (RPMI8226, MM.1 S) to investigate platelet-driven tumor progression. Additionally, an integrated analysis of bulk (GS
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Cancer-related pain remains a critical clinical challenge, with existing opioid-based therapies often yielding inadequate relief and significant side effects. This study investigates the therapeutic potential of JK5G postbiotics-a formulation of inactivated Lactobacillus strains and metabolites-in modulating the gut-microbiome-immune axis to alleviate pain in cancer patients.
METHODS: This study employs a randomized, double-blind, placebo-controlled trial design involving 149 participants divided into two groups: a control group receiving patient-controlled subcutaneous analgesi
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Previous studies identified subtypes among individuals at elevated risk of type 2 diabetes mellitus (T2DM), yet the molecular signatures distinguishing these subtypes remain poorly characterized. We aimed to identify and characterize T2DM risk subtypes using routine and non-routine clinical variable lists, and to compare their metabolomic, proteomic, and lifestyle profiles.
METHODS: In the Netherlands Epidemiology of Obesity study (median age 56 years; median BMI 29 kg/m2), we applied partitioning around medoids (PAM) clustering using two variable lists (routine, N = 5235; non-rou
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nitenpyram (NIT) is an insecticide used primarily for flea control in pets, especially cats and dogs. Some studies suggest that NIT is associated with cancer development, but the mechanisms involved are unclear. In this study, we integrated multi-platform bioinformatics analysis, protein-protein interaction (PPI) network construction, gene enrichment analysis and molecular docking to explore the carcinogenic mechanism of NIT in depth. We first targeted the oncogenic targets under NIT exposure, and then mapped the cross-cancer expression profiles based on 26 core genes, and quantitatively analy
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Broccoli harvest involves cutting the stalk and creating a wound site known as the incision site (IC), which immediately triggers a self-adaptive stage (SAS, ~12 h) before precooling. This early postharvest stage is critical for wound perception, signaling, healing, redox balance, and mineral redistribution. Here, we employed a multi-omics approach combining transcriptomics, metabolomics, and mineralomics to characterize dynamic responses at the IC across 0, 3, 6, and 12 h post-wounding. A total of 6599 shared DEGs were identified across timepoints, with 4137 DEGs specific to 3 versus 0 h, sub
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Breast cancer is the most common malignancy in women and includes molecular subtypes with distinct clinical outcomes, such as luminal A and luminal B. Although luminal tumors account for most cases, the epigenetic mechanisms differentiating luminal A from the more aggressive luminal B subtype remain unclear. We developed an interpretable machine learning pipeline to reduce genomic noise and identify methylation-dependent regulatory signatures by distinguishing these subtypes.
METHODS: The INTEND algorithm was trained on 4,441 paired RNA-seq and DNA methylation samples from 14 canc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis has emerged as a major threat to human mortality. Increasing evidence explores the impact of mitochondrial metabolism on the prognosis of sepsis patients and its therapeutic potential. To enhance risk stratification and identify potential targets, we conducted a retrieval and analysis of differential expression of mitochondrial metabolism related genes (MMRG) between sepsis and normal samples from public databases. Immune infiltration analysis was preformed to gain comprehensive knowledge of features of the established risk model. Additionally, single-cell sequencing results suggested M
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Diet is a modifiable determinant of gut microbiome composition, yet the impact of contrasting whole-dietary patterns on microbial metabolic capacity and coordinated host metabolic signatures remains incompletely characterized. In a randomized crossover feeding trial, 34 Australian adults were provided with a Healthy Australian Diet (HAD), aligned with national dietary guidelines, and a Typical Australian Diet (TAD), reflecting average population intake for two weeks each, separated by a two-week washout. Fecal microbiome composition and function were assessed using shotgun metagenomics, plasma
СтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Clear cell renal cell carcinoma (ccRCC), the most common and lethal subtype of renal cell carcinoma, exhibits marked intratumoral heterogeneity and complicates clinical management. Although long noncoding RNAs (lncRNAs) regulate diverse cellular processes, their landscape and biomarker potential in ccRCC remain poorly defined. Here we performed single-nucleus and bulk transcriptomic, proteomic, and metabolomic analyses on a cohort of 100 ccRCC patients. The expression pattern of lncRNAs were described based on metacells. Malignant cells displayed broader but lower lncRNA expression, likely ref
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A well-defined causal relationship between nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) and abdominal aortic aneurysm (AAA) is lacking, and it remains unknown whether AAA risk varies across different NAFLD stages. This study applied Mendelian randomization (MR) to evaluate the stratified effects of different NAFLD stages on AAA. Multi-omics data were integrated to identify potential mediating pathways. Large-scale genome-wide association study summary data were analyzed using inverse-variance weighted as the primary MR method. MR-Egger and weighted median MR methods were employed as complementary
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triaptosis, an emerging form of cell death, remains poorly characterized in terms of its heterogeneity within clear cell renal cell carcinoma (ccRCC). Utilizing single-cell transcriptomics, we delineate a landscape of triaptosis heterogeneity and identify monocytes and macrophages as exhibiting the highest triaptosis activity, which further increases upon terminal differentiation. These high-activity cells also demonstrate enhanced pro-angiogenic signaling toward endothelial cells. Within epithelial cells, subpopulations with the strongest triaptosis activity are located at the late differenti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Salt stress affects not only the growth and development of medicinal plants but also their secondary metabolism and medicinal quality. In this study, we employed an integrative approach combining physiological assays with multi-omics analyses to systematically investigate the response mechanisms of Tussilago farfara L. to salt stress. The results showed that salt stress induced the accumulation of osmoprotectants and enhanced antioxidant enzyme activities, while significantly reshaping secondary metabolic pathways. Metabolomic analysis revealed differential response patterns of various compoun
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reprogramming of metabolic pathways represents a central indicator in cancer pathogenesis, but the metabolic heterogeneity of bladder cancer (BLCA) at different stages is not well understood. This study aims to analyze metabolic reprogramming in BLCA across stages and its impact on patient survival.
METHODS: Single-cell sequencing data were used to examine metabolic heterogeneity of epithelial cells and cell subpopulation differentiation in BLCA at various clinical stages. Spatial transcriptome data were analyzed for copy number variability and riboflavin metabolism in BLCA epithe
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: The gut microbiome-metabolome interplay in hemodialysis (HD) patients remains poorly characterized. Using multi-omics approaches, we compared HD patients with healthy controls (HC) to identify microbial signatures, metabolic perturbations, and their integrated correlations.
METHODS: This case-control study included 192 participants (96 HD-HC pairs under identical dietary and living conditions). The gut microbiota composition was analyzed using 16S ribosomal RNA gene sequencing, and fecal metabolomes were analyzed using ultra-high-performance liquid chromatography and high-resolu
СтатьяМногоцентровое исследованиеНаблюдательное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To analyze the alterations in gut microbiota structure and serum metabolic profiles of children with human metapneumovirus (hMPV) infection using 16S rRNA high-throughput sequencing and liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS)-based untargeted metabolomics. Through integrated multi-omics analysis, we aim to explore the correlation between gut microbiota dysbiosis and host metabolic disorder, provide preliminary evidence for potential intervention targets, and offer primary clues for the development of preventive and therapeutic strategies including probiotic supplementation a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gut microbiota alterations have been linked to childhood eating disorders, but the functional and metabolic changes in non-organic anorexia (NOA) remain poorly understood. This study aimed to characterize the gut microbial composition, function, and metabolic profiles in children with NOA using an integrated multi-omics approach. A case-control study was conducted involving 88 children aged 1-5 years (48 NOA, 40 healthy controls). Gut microbiota composition was assessed via 16S rRNA gene sequencing of all fecal samples. Subsequently, the five most representative samples from each group were se
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glycosylation is one of the most important posttranslational modifications. When the glycosylation machinery is affected, this leads to a congenital disorder of glycosylation (CDG). CDG are a class of rare multisystemic diseases that often affect the endoplasmic reticulum (ER). Although vascular complications have been reported in CDG, the contribution of endothelial dysfunction to these phenotypes remains incompletely understood. Here, we evaluated the effect of glycosylation deficiency on endothelial dysfunction by generating two endothelial cell models using pharmacological inhibitors: tuni
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ETHNOPHARMACOLOGICAL RELEVANCE: Traumatic brain injury (TBI) is a major cause of death and long-term disability in humans. Xuefu Zhuyu Decoction (XFZYD) has potential therapeutic effects on TBI, but its molecular mechanism involving non-coding RNAs (ncRNAs) remains unclear.
AIM OF THE STUDY: To elucidate the mechanism of XFZYD, this study proposed an integrated ncRNA-based network pharmacology (ncRNP) strategy, combined with multi-omics analysis, in vivo and in vitro experiments. Unlike traditional network pharmacology which primarily focuses on protein-coding targets, the ncRNP strategy shif
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.