Acute respiratory distress syndrome (ARDS) is one of the most common and serious complications in the development of sepsis. Endoplasmic reticulum stress (ERS) plays an important role in the pathophysiologic process of sepsis-associated ARDS. The aim of this study was to identify and analyze hub genes related to ERS in sepsis-associated ARDS using bioinformatics and machine learning algorithms, which may serve as diagnostic markers and therapeutic targets. Based on the GSE32707 dataset from the GEO database, differentially expressed genes (DEGs) between patients with sepsis-associated acute re
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Septic shock in children is an infectious disease caused by low immunity, and its mortality is very high. Early prediction of the risk of death in children with septic shock is helpful for clinicians to judge the severity of the disease, take active treatment measures, and improve the adverse outcomes of patients. However, the mechanism of death from sepsis in children remains unclear. This study aims to use bioinformatics and machine learning algorithms to identify key genes and pathways associated with fatal sepsis in children, and provide theoretical basis for rational drug use
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular Carcinoma (HCC) is closely linked to inflammatory reactions, with chronic liver diseases acting as major risk factors. In the inflammatory microenvironment, repeated damage and repair of liver cells lead to genetic mutations, abnormal proliferation, and tumorigenesis.
OBJECTIVE: This study aimed to investigate the expression profile of specific cell clusters under inflammatory stimulation in HCC and identify potential therapeutic drugs.
METHODS: Comprehensive analysis of HCC transcriptome data and single-cell sequencing data from TCGA, ICGC, and GEO databases was c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sarcopenia (SARC), a progressive degenerative disorder associated with aging, is characterized by a gradual loss of muscle mass and strength and imposes major burdens on individuals and society. Current diagnostic and therapeutic methods for SARC remain limited, highlighting the urgent need for novel biomarkers. The present research was designed to investigate the role of lactate metabolism-related differentially expressed genes (LMRDEGs) in SARC, identify key genes and pathways, and develop a diagnostic model for the disease. Differentially expressed genes (DEGs) were identified using data fr
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Osteoarthritis is a systemic disease that primarily damages articular cartilage and also affects the synovium, ligaments, and bone tissues. The key mechanisms involved are chondrocyte death and degradation of the extracellular matrix. This study aims to identify differentially expressed genes (DEGs) associated with ferroptosis and investigate their roles in the development of osteoarthritis. We used several methods, such as transcriptomic data analysis, gene enrichment analysis, protein-protein interaction network construction, animal model experiments, and immune cell infiltration analysis. O
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vitamin D deficiency is soaring among shift workers due to multiple issues, including poor UVB experience. The objective of this study was to identify precise mechanisms by which vitamin D deficiency might aggravate depressive symptoms among shift workers. Shift work is also associated with disrupting circadian rhythm, leading to depressive symptoms. Differential expressed genes (DEGs) in depression patients (GSE80655, GSE169459, GSE217811, GSE190518, GSE98793, GSE23848, GSE76826, GSE101521, and GSE54572) and in shift workers (GSE122541) with controls were examined in the GEO database. Genes a
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accumulating evidence suggests that oxidative stress plays a crucial role in the pathogenesis of Parkinson's disease (PD). The aims of this study were to identify oxidative stress-related hub genes, validate them through the construction of a diagnostic model, explore their interactions with miRNAs and transcription factors (TFs) and predict potential drug targets. Differentially expressed genes (DEGs) in the substantia nigra of PD patients were identified by analyzing a combination of datasets selected from the GEO database, including GSE7621, GSE20141, GSE49036, and GSE20163. The candidate g
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Background: Abdominal aortic aneurysm (AAA) represents a permanent and localized widening of the abdominal aorta, posing a potentially lethal risk of aortic rupture. Several recent studies have highlighted the role of pyroptosis, a pro-inflammatory programed cell death, as critical molecular regulators in AAA occurrence, progression, and rupture. However, the potential effects of pyroptosis in AAA and its upstream microRNA (miRNA) have not been comprehensively clarified. Methods: Through a search of the gene expression omnibus (GEO) database, the expression profiles of mRNAs (GSE7084, GSE57691
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Reactive Oxygen Species (ROS), a hallmark of cancer, is related to prognosis, tumor progression, and treatment response. Nevertheless, the correlation of ROS-based molecular signature with clinical outcome and immune cell infiltration has not been thoroughly studied in bladder cancer (BLCA). Accordingly, we aimed to thoroughly examine the role and prognostic value of ROS-related genes in BLCA.
METHODS: We obtained RNA sequencing and clinical data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) for bladder cancer (BLCA) patients and identified ROS-associated genes using the GeneCards and Molec
СтатьяВалидационное исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Mitochondria are involved in septic shock and inflammatory response syndrome, which severely affects the life security of patients. It is necessary to recognize and explore the immune-mitochondrial genes in septic shock.
METHODS: The GSE57065 dataset was acquired from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and filtered by limma and the weighted correlation network analysis (WGCNA) to identify mitochondrial-related differentially expressed genes (MitoDEGs) in septic shock. The function of MitoDEGs was analyzed using the Gene Ontology (GO) analysis, Kyoto Encyclopedia of Genes and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Globally, pre-eclampsia (PE) poses a major threat to the health and survival of pregnant women and fetuses, contributing significantly to morbidity and mortality. Recent studies suggest a pathological link between PE and ferroptosis. We aim to utilize non-negative matrix factorization (NMF) clustering and machine learning algorithms to pinpoint disease-specific genes related to the process of ferroptosis in PE and investigate likely underlying biochemistry mechanisms.
METHODS: The acquisition of four microarray datasets from the Gene Expression Omnibus (GEO) repository, the integr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: More and more evidence supports the association between myocardial infarction (MI) and osteoarthritis (OA). The purpose of this study is to explore the shared biomarkers and pathogenesis of MI complicated with OA by systems biology.
METHODS: Gene expression profiles of MI and OA were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. The Weighted Gene Co-Expression Network Analysis (WGCNA) and differentially expressed genes (DEGs) analysis were used to identify the common DEGs. The shared genes related to diseases were screened by three public databases, and the protein-p
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Hashimoto's thyroiditis (HT) is widely recognized as a risk factor for papillary thyroid carcinoma (PTC). This study aimed to identify key targets involved in the progression of HT to PTC.
METHODS: Microarray datasets (GSE138198) for PTC, HT, and PTC with HT in the background (PTC-W) were obtained from the Gene Expression Omnibus (GEO) database. Differentially expressed genes (DEGs) were identified and analyzed between normal and diseased groups. Functional enrichment analysis was performed using Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG). Protein-protein i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The issue of multi-drug-resistant tuberculosis (MDR-TB) presents a substantial challenge to global public health. Regrettably, the diagnosis of drug-resistant tuberculosis (DR-TB) frequently necessitates an extended period or more extensive laboratory resources. The swift identification of MDR-TB poses a particularly challenging endeavor. To identify the biomarkers indicative of multi-drug resistance, we conducted a screening of the GSE147689 dataset for differentially expressed genes (DEGs) and subsequently conducted a gene enrichment analysis. Our analysis identified a total of 117 DEGs, con
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To compare the frequency and clinical significance of familial and de novo chromosomal inversions during prenatal diagnosis. This was a retrospective study of inversions diagnosed prenatally in an Asian population by applying conventional GTG-banding to amniocyte cultures. Data from 2005 to 2019 were extracted from a single-center laboratory database. The types, frequencies, and inheritance patterns of multiple inversions were analyzed. Pericentric variant inversions of chromosome 9 or Y were excluded. In total, 56 (0.27%) fetuses with inversions were identified in the 15-year database of 21,1
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The rapid evolution of the novel coronavirus disease (COVID-19) pandemic has resulted in an urgent need for effective clinical tools to reduce transmission and manage severe illness. Numerous teams are quickly developing artificial intelligence approaches to these problems, including using deep learning to predict COVID-19 diagnosis and prognosis from chest computed tomography (CT) imaging data. In this work, we assess the value of aggregated chest CT data for COVID-19 prognosis compared to clinical metadata alone. We develop a novel patient-level algorithm to aggregate the chest CT volume int
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Since late 2019, when SARS-CoV-2 was reported at Wuhan, several sequence analyses have been performed and SARS-CoV-2 genome sequences have been submitted in various databases. Moreover, the impact of these variants on infectivity and response to neutralizing antibodies has been assessed. In the present study, we retrieved a total number of 176 complete and high-quality S glycoprotein sequences of Iranian SARS-COV-2 in public database of the GISAID and GenBank from April 2020 up to May 2021. Then, we identified the number of variables, singleton and parsimony informative sites at both gene and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Whereas accelerated attention beclouded early stages of the coronavirus spread, knowledge of actual pathogenicity and origin of possible sub-strains remained unclear. By harvesting the Global initiative on Sharing All Influenza Data (GISAID) database ( https://www.gisaid.org/ ), between December 2019 and January 15, 2021, a total of 8864 human SARS-CoV-2 complete genome sequences processed by gender, across 6 continents (88 countries) of the world, Antarctica exempt, were analyzed. We hypothesized that data speak for itself and can discern true and explainable patterns of the disease. Identica
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA replication timing and three-dimensional (3D) genome organization are associated with distinct epigenome patterns across large domains. However, whether alterations in the epigenome, in particular cancer-related DNA hypomethylation, affects higher-order levels of genome architecture is still unclear. Here, using Repli-Seq, single-cell Repli-Seq, and Hi-C, we show that genome-wide methylation loss is associated with both concordant loss of replication timing precision and deregulation of 3D genome organization. Notably, we find distinct disruption in 3D genome compartmentalization, striking
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Increasing evidence demonstrated that long noncoding RNA (lncRNA) could affect inflammatory tumor immune microenvironment by modulating gene expression and could be used as a biomarker for HBC-related hepatocellular carcinoma (HCC) but still needs further research. The aim of the present study was to determine an lncRNA signature for the diagnosis of HBV-related HCC.
METHODS: HBV-related HCC expression profiles (GSE55092, GSE19665, and GSE84402) were abstracted from the GEO (Gene Expression Omnibus) data resource, and R package limma and RobustRankAggreg were employed to identify
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования