DFNA9 is a dominantly inherited form of adult-onset progressive hearing impairment caused by mutations in the COCH gene. COCH encodes cochlin, a crucial extracellular matrix protein. We established a genomically humanized mouse model for the Dutch/Belgian c.151C>T founder mutation in COCH. Considering upcoming sequence-specific genetic therapies, we exchanged the genomic murine Coch exons 3-6 for the corresponding human sequence. Introducing human-specific genetic information into mouse exons can be risky. To mitigate unforeseen consequences on cochlin function resulting from the introduction
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We identified three novel members of the R2R3-MYB clade of anthocyanin regulators in the genome of the purple flowering Petunia inflata S6 wild accession, and we called them ANTHOCYANIN SYNTHESIS REGULATOR (ASR). Two of these genes, ASR1 and ASR2, are inactivated by two different single base mutations in their coding sequence. All three of these genes are absent in the white flowering species P. axillaris N and P. parodii, in the red flowering P. exserta, and in several Petunia hybrida lines, including R27 and W115. P. violacea and other P. hybrida lines (M1, V30, and W59) instead harbor funct
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Enterobacter cloacae complex (ECC), a member of the genus Enterobacter within the family Enterobacteriaceae, is an important opportunistic pathogen associated with nosocomial infections. Colistin is considered a last-resort antimicrobial for multidrug-resistant Gram-negative infections; however, the emergence and dissemination of plasmid-mediated colistin resistance genes, particularly mcr variants, have raised significant public health concerns. Among these, mcr-10 has been increasingly detected in ECC isolates from diverse clinical and environmental sources, underscoring the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Human epidermal growth factor-2 (HER2) overexpression is an oncogenic driver in many solid tumors, including urothelial bladder cancer (UBC). In addition, activating mutations in the ERBB2 gene have been shown to play an oncogenic role similar to ERBB2 amplification.
OBJECTIVE: To describe and compare the frequency and nature of genomic alterations (GA) of ERBB2-altered (mutations, amplification) and ERBB2 wild-type UBC.
PATIENTS AND METHODS: Using a hybrid capture-based comprehensive profiling assay, 9518 UBC cases were grouped by ERBB2 alteration and evaluated for all classes o
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sperm DNA fragmentation is a known etiology for male infertility. We evaluated the impact of sperm DNA fragmentation index (DFI) on blastocyst euploidy in IVF cycles with egg donors. This observational retrospective study, which was conducted in a university affiliated fertility clinic, included IVF-ICSI-pre-implantation Genetic Screening (PGS) egg donor cycles in which DFI was tested prior to IVF, between January 1st, 2014 and July 31st, 2016. Twenty-seven cycles with DFI > 15% were included in the study group and compared with 18 cycles of DFI < 15% within control group. Research group parti
СтатьяНаблюдательное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genetic association studies have the potential to identify causative genetic variants with small effects in complex diseases, but it is not at all clear which study designs best balance power with sample size, especially when taking into account the difficulty of obtaining a sample of the necessary structure. The 14 contributions from the Genetic Analysis Workshop 15 group 3 used data sets with rheumatoid arthritis as primary phenotype from problem 2 (real data) and Problem 3 (simulated data) to investigate design and analysis problems that arise in candidate-gene, candidate-region, and genome
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hypospadias is a congenital anomaly of the genitalia characterized by abnormalities of the urethra and foreskin, with the urethral meatus located in an abnormal position anywhere from the distal ventral penile shaft to the perineum. Because the incidence of hypospadias is approximately 1/200-1/300 live male births, it is one of the most common congenital malformations, but its etiology is largely uncharacterized. Genomic analysis of hypospadic tissue indicated a potential role for activating transcription factor 3 (ATF3) in the development of this anomaly. ATF3 may be involved in homeostasis,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The APTIMA HPV Assay (AHPV) is designed to detect HPV E6/E7 mRNA from 14 high-risk types in Cytyc PreservCyt liquid-based cytology specimens.
OBJECTIVES: To compare AHPV analytical sensitivity for RNA and DNA; to compare the sensitivity of AHPV and Hybrid Capture 2 (HC2) assays for HPV DNA detection; to compare assay performance with and without sample denaturation; to compare assay results with cytology.
STUDY DESIGN: Analytical sensitivity of AHPV for detecting E6/E7 RNA was assessed by spiking samples with various quantities of HPV 16 E6/E7 in vitro RNA transcript or HPV 16-po
Сравнительное исследованиеОценочное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer (BC) still poses a threat worldwide which demands continuous efforts to present safer and efficacious treatment options via targeted therapy. Beside kinases' aberrations as Aurora B kinase which controls cell division, BC adopts distinct metabolic profiles to meet its high energy demands. Accordingly, targeting both aurora B kinase and/or metabolic vulnerability presents a promising approach to tackle BC. Based on a previously reported indolinone-based Aurora B kinase inhibitor (III), and guided by structural modification and SAR investigation, we initially synthesized 11 sulfona
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Klebsiella pneumoniae can be found in environmental habitats as well as in hospital settings where it is commonly associated with nosocomial infections. One of the factors that contribute to virulence is its capacity to form biofilms on diverse biotic and abiotic surfaces. The second messenger Bis-(3'-5')-cyclic dimeric GMP (c-di-GMP) is a ubiquitous signal in bacteria that controls biofilm formation as well as several other cellular processes. The cellular levels of this messenger are controlled by c-di-GMP synthesis and degradation catalyzed by diguanylate cyclase (DGC) and phoph
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Current methods for the early detection and minimal residual disease (MRD) monitoring of urothelial carcinoma (UC) are invasive and/or possess suboptimal sensitivity. We developed an efficient workflow named urine tumor DNA multidimensional bioinformatic predictor (utLIFE). Using UC-specific mutations and large copy number variations, the utLIFE-UC model was developed on a bladder cancer cohort (n = 150) and validated in The Cancer Genome Atlas (TCGA) bladder cancer cohort (n = 674) and an upper tract urothelial carcinoma (UTUC) cohort (n = 22). The utLIFE-UC model could discriminate 92.8% of
Письмо в редакциюПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HBV-DNA was measured by the spot hybridization technique in serial serum samples obtained from 47 HBsAg carriers followed up for a mean of 4 years. The levels of HBV-DNA were compared to the conventional HBV serology and immunopathology to determine the relation of active HBV replication to the outcome of hepatitis and the suitability of Italian HBsAg carriers for treatment with DNA inhibitors. HBV-DNA was found in 26 carriers (53%) and persisted with comparable serum levels in 24 of them throughout the follow up. The occurrence rate of an unfavorable outcome as determined by histological evid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Adenoid cystic carcinoma (AdCC) of the breast is a rare indolent carcinoma of salivary gland-type tumors, frequently associated with MYB genetic alteration. Solid and basaloid adenoid cystic carcinoma (SB-AdCC) is considered a sparse variant of AdCC. This study sought to search for clinicopathological and genomic features in SB-AdCC. Registered clinicopathological data on a cohort of 13 AdCC of the breast cases, including six conventional adenoid cystic carcinoma (C-AdCC) cases and seven SB-AdCC cases, were collected. MYB gene rearrangement via fluorescent in situ hybridization was investigate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Agamid adenovirus 1 (AgAdv-1) is a significant cause of disease in bearded dragons (Pogona sp.). Clinical manifestations of AgAdv-1 infection are variable and often nonspecific; the manifestations range from lethargy, weight loss, and inappetence, to severe enteritis, hepatitis, and sudden death. Currently, diagnosis of AgAdv-1 infection is achieved through a single published method: standard nested polymerase chain reaction (nPCR) and sequencing. Standard nPCR with sequencing provides reliable sensitivity, specificity, and validation of PCR products. However, this process is comparatively exp
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The genetic alterations that drive the transition from actinic keratoses (AKs) to cutaneous squamous cell carcinomas (SCCs) have not been defined precisely. Amplification and/or overexpression of the MYC proto-oncogene have been demonstrated in several human, malignant tumours including head and neck SCCs.
OBJECTIVES: To evaluate the presence of MYC genomic aberrations in both AKs and SCCs.
METHODS: Skin biopsy specimens corresponding to AKs, SCCs and control samples were included in two paraffin-embedded tissue microarrays. MYC cytogenetic profile was evaluated by fluorescence i
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Responses and adverse events to medication vary greatly among patients with Crohn's disease (CD). The aim of this study was to investigate whether global gene expression profiles could predict such responses and possible side effects.
MATERIAL AND METHODS: Tissue specimens from the descending colon were obtained from 32 CD patients (in 18 patients from areas without inflammation and in 14 patients from inflamed areas). Gene profiling was done using the Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 GeneChip array. Hybridization data were analyzed with dChip software.
RESULTS: There were no
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In the past decade, plant biologists have made several major discoveries pertaining to the genetic basis of apomixis (clonal propagation by seed) that have shown promise in preserving high-value hybrid rice and sorghum genotypes. This progress was made possible by foundational gene discovery efforts in model species and natural apomicts, but pleiotropic obstacles still limit its broad agricultural adoption, especially in eudicots. Thus, it follows that investigations of novel apomicts should lead to the development of new molecular tools for plant breeding. The two most common ways to identify
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ecuador ranks among the world's leading banana exporters; however, postharvest enzymatic browning, driven by polyphenol oxidases (PPOs), remains an important determinant of fruit quality loss and reduced market value. The genes encoding PPOs in Musa paradisiaca L., a triploid hybrid (AAB) widely cultivated in Ecuador, have not previously been described at the genomic or transcriptional level. The objective of this study was to generate a preliminary de novo draft assembly of Ecuadorian M. paradisiaca, identify PPO-coding loci recovered in this assembly, and compare their relative expression ac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Accurate prediction of anticancer drug responses remains a significant challenge due to the intricate interplay between genomic features and pharmacological mechanisms. We present Matrix Completion with Low-rank Regularization and Principal Component Analysis (MCLRP), a multimodal framework that synergistically integrates low-rank matrix completion with transcriptomic principal component analysis through dual-stream feature interaction. This innovative architecture not only leverages the similarities among drugs and mutation patterns in cell lines via matrix completion but also pre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A gram-positive, facultatively anaerobic, and coccoid or ovoid-shaped bacterium designated M2458T was isolated from the intestinal contents of APPswe/PSΔE9 mouse model of Alzheimer's disease. With the polyphasic approach, the taxonomic position of the novel isolate was confirmed. Strain M2458T grew well at 37 °C on YCFA agar. Strain M2458T belongs to the family Streptococcaceae and class Bacilli, and it is closed to Lactococcus formosensis NBRC 109475T (97.59% sequence similarity) according to its 16S rRNA gene sequence. In a comparison of two housekeeping genes, rpoA and rpoB, strain M2458T w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.