BACKGROUND: Allergic rhinitis (AR) remains a global health challenge. However, the transcriptional and epigenetic features associated with seasonal allergic rhinitis (SAR) and perennial allergic rhinitis (PAR) relative to non-allergic rhinitis (NAR) remain poorly characterised at single-cell resolution.
METHODS: We performed integrated single-cell transcriptomic and epigenomic profiling of nasal mucosal tissues from 22 patients, including NAR (n = 8), SAR (n = 6), and PAR (n = 8), to characterise transcriptional and epigenetic patterns associated with immune cell heterogeneity.
RESULTS: We i
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aortic dissection (AD) is a lethal cardiovascular emergency with a complex and underexplored genetic basis.
METHODS: We performed whole-genome sequencing on 151 patients with sporadic Stanford type B AD and 965 healthy controls in a Chinese population as a discovery phase analysis to assess both common and rare variants. Cross-ancestry meta-analyses incorporating 4 external genome-wide association data sets were used to identify population-specific risk loci. To pinpoint functional candidates, we integrated epigenomic profiles and single-cell transcriptomes from human aortic tissu
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Vascular smooth muscle cell (VSMC) degeneration is a major mechanism underlying abdominal aortic aneurysm (AAA) formation. However, the upstream signaling pathways that converge on the transcriptional machinery to drive VSMC degeneration remain elusive. Here, we integrated single-nucleus (sn) multi-omics, chromatin immunoprecipitation (ChIP)-seq, and wet lab validation to identify transcriptional effectors of VSMC-MAPK14, which we previously reported to promote AAA. Compared with wild-type (WT) mice, VSMC-Mapk14 knockout (KO) mice displayed reduced VSMC degeneration, as evidenced by decreased
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
NF-κB signaling can be subdivided into canonical and noncanonical pathways, culminating in the transcriptional activity of RELA and RELB, respectively. However, the upstream signals that activate these transcription factors and their specific regulatory roles in pancreatic ductal adenocarcinoma (PDAC) remain incompletely understood. We investigated the differential activation and function of RELA and RELB in PDAC using transcriptome-wide gene expression profiling, genome-wide occupancy mapping, and epigenomic analysis. Temporal activation patterns were assessed following TNFα or TWEAK stimulat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Prenatal maternal stress is a common exposure implicated in childhood allergies. However, evidence for placental DNA methylation as a mediator is limited, with prior studies focusing narrowly on HPA-axis genes. This study aimed to examine the impact of prenatal maternal stress on offspring allergic diseases and placental DNA methylation's mediating role from an epigenome-wide perspective.
METHODS: Within the Shanghai Parent-Child Cohort (n = 3883 pairs), maternal stress and childhood allergic diseases were assessed via questionnaires and medical records. Latent class analysis iden
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Organ preservation is a priority in early-stage rectal cancer as total mesorectal excision (TME) can reduce quality of life. The Canadian Cancer Trials Group CO.28 trial demonstrated that neoadjuvant chemotherapy followed by transanal excision was effective in patients with cT1-3, node-negative (N0) rectal cancer. Here, we explored circulating tumor DNA (ctDNA) from the trial as a potential future decision aid to guide TME.
MATERIALS AND METHODS: Fifty-three of 58 patients (91.4%) from CO.28 had at least one sample available for ctDNA analysis using the Guardant Reveal epigenomic ass
СтатьяКлиническое исследование II фазыПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The active vitamin D metabolite 1,25-dihydroxyvitamin D3 (1,25(OH)2D3) activates the vitamin D receptor (VDR) in immune cells, altering the epigenome to drive diverse responses. However, how the temporal dynamics, genomic positioning, and inducibility of VDR binding are integrated to determine transcriptional outcomes remains incompletely understood.
RESULTS: Here, we present a time-resolved analysis of VDR-mediated gene regulation in human THP-1 monocytes, integrating VDR ChIP-seq profiles at 40 min, 4, 8, and 24 h with matched transcriptome data following stimulation with 1,25(O
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) is a mitochondrial enzyme that connects de novo pyrimidine biosynthesis with the electron transport chain (ETC) function. However, its broader role in prostate cancer (PCa) signaling and response to therapy remains unclear. METHODS: We combined transcriptomic, metabolomic, epigenomic, and functional analyses with clinical outcome data to explore the effects of DHODH depletion in ancestry-annotated European American (EA) and African American (AA) prostate cancer cell line models. RESULTS: DHODH was markedly overexpressed in malignant prostate epi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUNDSuboptimal fetal growth (SFG), being born small for gestational age (SGA), and catch-up (CU) growth are, individually and together, linked to cardiometabolic risks. However, not all develop adverse outcomes. This study aimed to validate a transcriptomic signature to identify individuals at greatest cardiometabolic risk.METHODSUsing National Heart, Lung and Blood Institute (NHLBI) criteria to define cardiometabolic risk, healthy and prehypertensive 17-year-olds were identified in the Avon Longitudinal Study of Parents and Children (ALSPAC) (UK) childhood cohort. Epigenomic and transcr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Gastric cancer (GC), ranking among the most prevalent malignant tumors globally, is characterized by extensive genomic, transcriptomic, and epigenomic heterogeneity. DNA polymerase θ (POLQ) is a key regulator of microhomology-mediated end joining (MMEJ) that is highly expressed in cancer and has the potential to become a molecular target for the development of anticancer drugs. Although previous studies have shown that POLQ knockdown promotes apoptosis in tumor cells, the underlying mechanisms by which POLQ regulates apoptotic pathways remains elusive. METHODS: The impact of POLQ e
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endogenous retroviruses (ERVs) are abundant in the bovine genome and have been repeatedly co-opted for placental function, yet their organization and roles in epitheliochorial species remain less well defined than in primates and mice. Here, genomic, transcriptomic, and functional data are combined to provide an updated view of ERVs in the cattle placenta and to frame their contributions in terms of three interacting roles (Roles 1-3). Role 1 comprises structural fusogens, including syncytin-Rum1, BERV-K1/Fematrin-1, and additional trophoblast-biased loci, that support binucleate trophoblast c
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) remains a challenging disease due to its significant heterogeneity, therapy resistance, and relentless progression. Multiomics technologies offer the potential to provide uniquely precise views of disease progression and response to therapy. Here, we present a comprehensive multiomics view of CTCL clonal evolution, incorporating exome, whole-genome, epigenome, bulk, single-cell T-cell receptor, and single-cell RNA sequencing of 99 clinically annotated serial skin, peripheral blood, and lymph node samples from 34 patients with CTCL. We leveraged this extensive d
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Climate is becoming more variable, and the frequency and magnitude of drought and pathogen epidemics are changing. This creates a need to understand how limited water availability influences plant responses to biotic challenges. In Brassica napus L., drought decreases the disease progression and fungal colonization of the vascular pathogen Verticillium longisporum, yet the underlying regulatory mechanisms remain unclear. Here, we used an integrative approach combining transcriptome profiling, co-expression network analysis, and DNA methylation analysis to investigate host responses in hypocoty
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intracerebral hemorrhage (ICH) is a life-threatening subtype of stroke characterized by the acute accumulation of blood within the brain parenchyma and progressive secondary brain injury. After ICH, dysregulated neuroinflammation drives a cascade of secondary injury processes that shape neurological deterioration and long-term recovery. However, the molecular mechanisms that determine the magnitude, temporal evolution, and resolution of immune-inflammatory responses after ICH remain incompletely understood, limiting the development of targeted therapeutic strategies. Accumulating evidence indi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease (MASLD) has become the most common chronic liver disease in childhood, paralleling the global increase in pediatric obesity and metabolic dysfunction. Once considered a benign condition, pediatric MASLD is now recognized as a heterogeneous and potentially progressive disease that may advance from simple steatosis to steatohepatitis, fibrosis, and, rarely, cirrhosis, with lifelong hepatic and cardiometabolic consequences. Its pathogenesis is multifactorial, involving insulin resistance, adipose tissue dysfunction, chronic low-grade inflam
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite substantial advances in genomic testing, many individuals with neurodevelopmental disorders remain without a molecular diagnosis, while others receive a genetic diagnosis that does not fully explain phenotypic variability, developmental trajectory or tissue-specific consequences. Artificial intelligence (AI)-assisted methods are increasingly used for phenotyping, variant prioritisation, splice prediction, protein modelling, DNA methylation episignature classification and multi-omic analysis. However, these approaches differ substantially in evidentiary status and are often applied as s
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Electronic cigarette (E-cig) use has reached epidemic proportions worldwide, yet its cardiovascular consequences remain poorly defined. While several lines of evidences in human epidemiological and animal studies suggest chronic aerosol exposure accelerates atherosclerosis; the cellular and molecular mechanisms underlying this pathological remain unknown.
METHODS: We exposed hyperlipidemic mice to chronic e-cigarette aerosol inhalation and characterized the plaque cellular landscape by coupling SMC lineage tracing with single-cell transcriptomic/epigenomic profiling and histologic
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Classical Hodgkin lymphoma (cHL) is distinguished by a rare population of Hodgkin and Reed-Sternberg (HRS) cells that has largely extinguished its germinal center (GC) B-cell identity while maintaining survival, immune escape, and dependence on a highly organized tumor microenvironment (TME). This narrative review examines how interacting epigenetic mechanisms construct and stabilize this malignant state and evaluates whether it can be therapeutically reprogrammed. The relevant mechanistic and clinical literature available through 2026 was synthesized, encompassing lineage factor disruption, D
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Classical accounts of retinal aging emphasize oxidative, mitochondrial, inflammatory, vascular, proteostatic, and retinal pigment epithelium (RPE)-centered mechanisms. Omics studies now confirm and refine this non-uniformity, showing that aging-associated signals vary by cell type, anatomical niche, molecular layer, and functional reserve. Direct evidence from single-cell and single-nucleus transcriptomics is strong for lineage- and subtype-specific aging programs in neural retina, RPE, glia, vascular cells, and choroidal immune populations. Spatial omics can generate and test localization hyp
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Early life exposure to common pathogens and a high pathogen burden during childhood can have long-term effects on immune development and overall health. These infections can trigger molecular changes, including alterations in gene expression and DNA methylation (DNAm), which regulate immune and metabolic pathways. Our aim was to identify biological processes underlying differential patterns of DNAm and gene expression in whole blood by infection status in European children.
RESULTS: In the Rhea (Greece) and INMA (Spain) cohorts, serum/plasma samples collected at mean ages of 4 and
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования