The use of comparative genomics for the study of different microbiological species has increased substantially as sequence technologies become more affordable. However, efforts to fully link a genotype to its phenotype remain limited to the development of one mutant at a time. In this study, we provided a high-throughput alternative to this limiting step by coupling comparative genomics to the use of phenotype arrays for five sequenced Shewanella strains. Positive phenotypes were obtained for 441 nutrients (C, N, P, and S sources), with N-based compounds being the most utilized for all strains
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & OBJECTIVE: Juvenile idiopathic arthritis (JIA) is characterized by chronic synovitis, cartilage damage and bone erosion. Both genetic and environmental factors and microbes probably play a role in pathogenesis. Microbes are recognized by Toll like receptors (TLRs) and activate innate immune response. We studied the ability of bacterial and viral products to produce matrix metalloproteinases (MMPs) and cytokines by fibroblast like synoviocytes (FLS) from patients with JIA.
METHODS: FLS were cultured from synovial fluid (SF) of patients with JIA and subsequently stimulated for 48 h
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Evidence is mounting that microorganisms originating from livestock impact the air quality of the animal houses themselves and the public in the surrounding neighborhoods. The aim of this study was to develop efficient bacterial source tracking capabilities to identify sources of Escherichia coli aerosol pollution caused by pigs. Airborne E. coli were isolated from indoor air, upwind air (10 and 50 m away) and downwind air samples (10, 50, 100, 200 and 400 m away) for five swine houses using six-stage Andersen microbial samplers and Reuter-Centrifugal samplers (RCS). E. coli strains from pig f
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Half a century ago, chronic granulomatous disease (CGD) was first described as a disease fatally affecting the ability of children to survive infections. Various milestone discoveries have since been made, from an insufficient ability of patients' leucocytes to kill microbes to the underlying genetic abnormalities. In this inherited disorder, phagocytes lack NADPH oxidase activity and do not generate reactive oxygen species, most notably superoxide anion, causing recurrent bacterial and fungal infections. Patients with CGD also suffer from chronic inflammatory conditions, most prominently gran
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Restenosis is a major problem for patients undergoing percutaneous transluminal coronary angioplasty (PTCA). Inflammatory processes and genetic factors have been suggested to be involved in the pathogenesis of both atherosclerosis and restenosis. The recently discovered family of Toll-like receptors (TLRs) consists of molecules that initiate signaling after host-pathogen interactions. Recently it has been shown that the TLRs are involved in the development and progression of atherosclerosis by interfering with lipid metabolisms and by mediating inflammation. TLR-2 is a key innate immunity rece
СтатьяPortraitПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Within a framework of dual involvement of mucosa and submucosa on the one hand, and of the muscularis propria of the bowel wall on the other, it might be valid to consider involvement of the vascular supply as the essential means in itself of not only causing the morphologic lesions in inflammatory bowel disease, but also especially in accounting for persisting patterns of inflammatory response both in ulcerative colitis and in Crohn's disease. Inflammatory bowel disease as a group constitutes a spectrum of biologic and pathobiologic manifestations in terms not only of inflammatory involvement
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Natural T (NT) lymphocytes recognize infected cells or microbial compounds without the classical genetic restriction of polymorphic major histocompatibility complex (MHC) molecules. This innate recognition pathway results in a broad and rapid antimicrobial response that may be critical for controlling the spread of intracellular pathogens, requiring the elimination of the infecting agent from both extracellular spaces and host cells. NT cells are mainly composed of alphabeta and gammadelta T lymphocytes that express natural killer (NK) receptors and recognize preferentially various nonpeptidic
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The skin is an important interface between man and his environment; it is an important portal of entry for hazardous agents and a vulnerable target tissue as well. It is a uniquely accessible model system for detecting hazards and for studying mechanisms of a wide variety of biologic funcitons. Environmental causes of skin reactions comprise a vast array of physical, chemical and biological agents. To appreciate the role of the skin as an interface with man's environment, it is necessary to understand the multiple adaptive mechanisms, and the defenses of the skin against the environmental stre
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance (AMR) in food-producing animals poses a significant One Health challenge and requires risk-based approaches that extend beyond hazard detection towards actionable prioritization. This study assessed AMR-associated risk along the broiler processing line using three complementary approaches. Neck skin and cecal samples were collected at three successive processing stages: pre-evisceration, post-evisceration and post-chilling. First, microbial loads were quantified by enumerating Campylobacter spp., Escherichia coli and total aerobic bacteria. Second, Salmonella Infantis
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Poplar canker triggered by Cytospora chrysosperma severely damages forest production, and screening efficient antagonistic bacteria is a sustainable strategy for eco-friendly disease management. This study aimed to characterize the taxonomic status, genomic features and biocontrol potential of strain XZL-8.
METHODS: Polyphasic identification and whole-genome sequencing were conducted to confirm the species of strain XZL-8. Functional annotation against NR, COG, GO and KEGG databases and antiSMASH secondary metabolite prediction were carried out to decode its functional genes. A
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oyster aquaculture is widely recognized as an effective way to mitigate coastal eutrophication, but critical knowledge gaps remain regarding how it modulates nitrogen removal processes, which requires further investigation. In this study, sediments from oyster farming (OY) and non-oyster farming (NOY) areas in Tieshan Bay, China, were analyzed to explore the impacts of oyster farming on denitrification and anammox in coastal sediments. OY sediments exhibited significantly higher sediment oxygen demand (SOD), total organic carbon (TOC), ammonium (NH4+), ferrous iron (Fe2+), and sulfide than NOY
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antimicrobial resistance is a major global health threat shaped not only by clinical settings but also by environmental reservoirs, in line with the One Health framework. Antarctic and Subantarctic soils represent a largely unexplored component of the environmental resistome, particularly beta-lactamases, whose diversity, structural features, and biogeographic patterns remain poorly resolved. Here, we applied an integrative metagenomic approach combining sequence-, structure-, and function-based similarity to systematically identify putative beta-lactamase orthologs across an extensive collect
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Symbiotic relationships significantly transform both symbiont and host biology. The most visible changes include a massive reduction of the endosymbiont genome and the development of specialized host organs, cells, and compartments for symbiont housing. However, insect symbiosis studies have often focused on Pseudomonadota or specific symbiosis stages, limiting our understanding of how symbiont diversity arises from particular microbial clades, how the symbiont genomes evolve, and the consequences of symbiosis for diverse host-symbiont pairs. Scale insects, which have experienced repeated gain
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Antibiotic resistance genes (ARGs) are ubiquitous in aquatic ecosystems, but the ecological risk patterns and associated factors remain unclear across aquatic environments with contrasting hydrodynamic conditions. Using an integrated analytical framework, we explored interactions among antibiotics, microbial communities, mobile genetic elements (MGEs), and ARGs in a dynamic river and a slow-flow wetland. Antibiotics were widely detected in both systems, with generally higher total concentrations in the dynamic river (50.0-148.4 ng/L) than in the slow-flow wetland (2.5-101.7 ng/L). Total abunda
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Inflammatory bowel disease-associated colorectal cancer (IBD-CRC) represents a distinct clinical and molecular entity characterized by long-standing inflammation and a unique "dysplasia-carcinoma" sequence. While epithelial genetic alterations are well-documented, the role of the mesenchymal stroma as a dynamic driver of malignant transformation remains underappreciated. In this review, we propose a conceptual framework where intestinal fibroblasts contribute significantly to niche construction as key components of the Tumor Microenvironment (TME) architecture. These cells are not merely passi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The gut microbiota is an ecological community of symbiotic and commensal microorganisms that play crucial roles in nutrient metabolism, maintaining the structural integrity of the intestinal mucosal barrier, immunomodulation, and pathogen protection. The composition of the gut microbiota varies with age, ethnicity, lifestyle, and dietary habits. Given the microbiota's growing role as a modulator of various physiological and pathological conditions, our study aimed to investigate the genetic profile of the microbiome individuals residing in the Friuli-Venezia Giulia region. We analyzed fecal sw
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Colon cancer (CC) remains a major global health burden and ranks among the most common malignant tumors. In recentyears, its growing occurrence in younger age groups has presented a substantial challenge to public health systems worldwide. Type 2diabetes (T2D) and gut microbiota may influence its pathogenesis, but the causal relationship remains unexplored. This study aims to examine the causal association between T2D and CC and explore the possible mediating effects of gut microbiota inthis relationship.
MATERIAL AND METHODS: A two-sample Mendelian randomization (MR) design was
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dissemination of antibiotic resistance genes (ARGs) in agricultural soils poses a growing threat to ecosystem health and food security, highlighting the need to identify key environmental drivers. Although soil-borne phytopathogens disrupt microbial communities, their specific impact on ARG dynamics remains poorly understood. In this study, we examined how Fusarium oxysporum f. sp. niveum (FON) invasion changes soil ARG profiles. Our results indicate that increasing FON loads heighten the abundances of soil ARGs, virulence factor genes (VFGs), and mobile genetic elements (MGEs). This invas
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The plastisphere, a unique ecological niche on plastic surfaces, enriches microbial antibiotic resistance genes (ARGs) and virulence factors (VFs), posing environmental and health risks. Although aquatic sediment is a major sink for plastic contaminants, the resistance, virulence and dissemination potentials of sedimented plastispheres remain poorly characterized compared to floating plastics. Through investigation of metagenomes from two sites in the Pearl River in China, one of the world's plastic pollution hotspots, we report that water plastisphere showed 2.4 and 3.6 times more ARG and VF
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) comprises a heterogeneous group of extranodal non-Hodgkin lymphomas. With the publication of the fifth edition of the World Health Organization Classification of Hematolymphoid Tumors, the diagnostic framework for CTCL has shifted from primarily morphologic phenotypes toward an emphasis on molecular drivers. Current research suggests that malignant clones may arise from somatic mutations at the hematopoietic stem cell stage and may follow a continuous hematogenous dissemination model with bidirectional trafficking between the skin and systemic circulation. At t
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования