OBJECTIVE: To identify an immunologic basis for the male sex bias in ankylosing spondylitis (AS).
METHODS: Cohorts of male and female patie … ch as the frequency of IFNγ and Th1 cells in serum, were independent of a patient's sex. Results of microarray analysis supported an altered Th17 axis in male patients, with a specific increase in IL17RA. In addition, male and female patients with AS displayed shared gene expression patterns, while male patients with AS had additional alterations in gene expression t …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bisphenol A (BPA) is an environmental compounds is known to possess endocrine disruption potentials. Bisphenol A has epigenetic effects as deregulated expression of microRNAs; such epigenetic marks can induce up/down alterations in gene expression that may persist throughout a lifetime. Bisphenol A (BPA) exposure has been documented in pregnant women, but consequences for development of offspring after BPA exposure during pregnancy are not yet widely studied. Therefore, the aim of this study was to gain a comprehensive understanding of microRNAs changes in the placenta transcriptom
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exome sequencing of primary tumors identifies complex somatic mutation patterns. Assignment of relevance of individual somatic mutations is difficult and poses the next challenge for interpretation of next generation sequencing data. Here we present an approach how exome sequencing in combination with SNP microarray data may identify targets of chromosomal aberrations in myeloid malignancies. The rationale of this approach is that hotspots of chromosomal aberrations might also harbor point mutations in the target genes of deletions, gains or uniparental disomies (UPDs). Chromosome 11 is a freq
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tetralogy of Fallot (TOF) is 1 of the most common heart defects in children, and the underlying mechanisms remain largely elusive. MicroRNAs (miRNAs) are a class of regulators of gene expression and are increasingly recognized for their roles in heart development.
METHODS: To identify miRNAs abnormally expressed in TOF, microarrays were used to analyze the miRNA expression profiles of 5 samples of myectomy tissues from right ventricular outflow tract (RVOT) obstruction of infants with nonsyndromic TOF and 3 age-matched normal RVOT tissues.
RESULTS: In total, 41 candidate miRNAs w
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: The ciliary body (CB) of the human eye consists of the non-pigmented (NPE) and pigmented (PE) neuro-epithelia. We investigated the gene expression of NPE and PE, to shed light on the molecular mechanisms underlying the most important functions of the CB. We also developed molecular signatures for the NPE and PE and studied possible new clues for glaucoma.
METHODS: We isolated NPE and PE cells from seven healthy human donor eyes using laser dissection microscopy. Next, we performed RNA isolation, amplification, labeling and hybridization against 44×k Agilent microarrays. For microarra
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glucocorticoids (GC) induce apoptosis in lymphoblasts and are thus essential in the treatment of acute lymphoblastic leukemia (ALL). Their effects result from gene regulations via the GC receptor (NR3C1/GR), but it is unknown how these changes evolve, what the primary GR targets are, and to what extent responses differ between ALL subtypes and nonlymphoid malignancies. We delineated the transcriptional response to GC on the exon level in a time-resolved manner in a precursor B- and a T childhood ALL model employing Exon microarrays and combined this with genome-wide NR3C1-binding site detectio
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: MYCN is a transcription factor that is expressed during the development of the neural crest and its dysregulation plays a major role in the pathogenesis of pediatric cancers such as neuroblastoma, medulloblastoma and rhabdomyosarcoma. MeCP2 is a CpG methyl binding protein which has been associated with a number of cancers and developmental disorders, particularly Rett syndrome.
METHODS AND FINDINGS: Using an integrative global genomics approach involving chromatin immunoprecipitation applied to microarrays, we have determined that MYCN and MeCP2 co-localize to gene promoter region
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the present study was to identify gene expression changes in the rapid cardiac pacing-induced delayed antiarrhythmic protection i … teins (e.g. vasopressin V1 and V2 receptors). RT-QPCR was used either to confirm the results of the microarray analysis and also to study 46 genes which are already known to have a role in the late phase of PC. By this method 17 genes were up-regulated and 6 genes down-regulated in the IC group; their expression ratios changed either to the opposite or showed no alte …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ductal concretions in chronic pancreatitis (CP) are one of the causes of ductal obstruction, resulting in pancreatic ductal hypertension (PDH) and duct ectasia. Ductal epithelium subjected to chronic stress by PDH may undergo molecular alterations, thereby not only initiating and sustaining the inflammatory process but also activating molecules that have transforming potential. Acino-ductal metaplasia and pancreatic intraepithelial neoplasia (PanIN) are frequently seen in CP. Using laser capture microdissection, cDNA microarrays and Ingenuity Pathways Analysis, we found an altered Notch pathwa
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Identification of new markers assessing endometrial receptivity may help in improving the clinical outcome of IVF. This study aimed at identifying genes expressed in human endometrium during the implantation window that could be used as such markers.
METHODS: A series of normoresponder patients (n = 31) underwent endometrial biopsies (n = 62, 2 per patient) during the early secretory phase, 2 days after the LH surge (LH + 2) and the mid-secretory phase (LH + 7) of the same natural cycle that preceded a new ICSI attempt for male infertility factor. Samples were analyzed using DNA m
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Dupuytren's contracture (DC) is the most common inherited connective tissue disease of humans and is hypothesized to be associated with aberrant wound healing of the palmar fascia. Fibroblasts and myofibroblasts are believed to play an important role in the genesis of DC and the fibroproliferation and contraction that are hallmarks of this disease. This study compares the gene expression profiles of fibroblasts isolated from DC patients and controls in an attempt to identify key genes whose regulation might be significantly altered in fibroblasts found within the palmar fascia of Dupuytren's p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND & AIMS: Loss of gastric parietal cells is a critical precursor to gastric metaplasia and neoplasia. However, the origin of metapl … Mist1 and intrinsic factor, suggesting that SPEM derived from transdifferentiation of chief cells. Microarray analysis of microdissected SPEM lineages induced by DMP-777 showed up-regulation of transcripts associated with G1/S cell-cycle transition including minichromosome maintenance deficient proteins, as well as a number of secreted factors, including human epidi …
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mechanisms by which trisomy 21 leads to the characteristic Down syndrome (DS) phenotype are unclear. We used whole genome microarrays to characterize for the first time the transcriptome of human adult brain tissue (dorsolateral prefrontal cortex) from seven DS subjects and eight controls. These data were coanalyzed with a publicly available dataset from fetal DS tissue and functional profiling was performed to identify the biological processes central to DS and those that may be related to late onset pathologies, particularly Alzheimer disease neuropathology. A total of 685 probe sets wer
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To define the roles of transforming growth factor alpha (TGFalpha) in cartilage degradation.
METHODS: Primary rat articular chon … lpha in experimental knee osteoarthritis (OA) with the levels of TGFalpha in humans with knee OA, a microarray analysis of mRNA from 13 normal and 12 late-stage OA cartilage samples was performed. Seven OA samples showed TGFA mRNA levels similar to those in the normal controls, but expression was markedly increased in the other 5 OA samples. These data confirm that T …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The CD53 antigen is a member of the tetraspanin membrane protein family that is expressed in the lymphoid-myeloid lineage. Its biological role remains unknown. Using microarrays, we identified CD53 as one of the principal genes up-regulated by exposure of macrophages to LPS. Northern blot analysis confirmed the induction of CD53 in RAW264.7 macrophages treated with LPS or SNAP (a nitric oxide donor). Cells stably transfected with sense CD53 cDNA had increased levels of intracellular GSH and lower levels of peroxide, and were more resistant to H2O2 and to UVB irradiation. Cells harboring antise
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY QUESTION: Do human adult Leydig cells (ALCs) within hyperplastic micronodules display characteristics of foetal LCs (FLCs)?
SUMMARY ANSWER: The gene expression profiles of FLCs and all ALC subgroups were clearly different, but there were no significant differences in expressed genes between the normally clustered and hyperplastic ALCs.
WHAT IS KNOWN ALREADY: LCs are the primary androgen producing cells in males throughout development and appear in chronologically distinct populations; FLCs, neonatal LCs and ALCs. ALCs are responsible for progression through puberty and for maintenance
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cannabis use is on the rise yet the systematic molecular impact of key cannabinoid components on various tissues in diverse organisms remains incompletely understood. We aim to systematically elucidate the molecular pathways and networks affected by delta-9-tetrahydrocannabinol (THC) and cannabidiol (CBD) across species and tissue types.
METHODS: We curated 105 THC- and CBD-related RNA sequencing (RNAseq) and microarray datasets from Gene Expression Omnibus (NCBI GEO) with a focus on mammalian species (human, non-human primate rhesus macaque, mouse, rat). Differentially expressed
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIMS: Psoriasis, an autoimmune diseases of the skin, characterized by patches of abnormal/inflammed skin, although not usually life-threatening, it causes severe discomfort, esthetic impairments, and may lead to impaired social functions and social withdrawal. Besides UV-phototherapy, various anti-inflammatory treatments are applied, depending on the severity of symptoms. In 2008, adalimumab (fully humanized human anti-TNF antibody) was launched for the treatment of psoriasis. In the quest to better understand the pathomechanism of adalimumab's therapeutic effects, and the acquired
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: This study aimed to investigate the clinical application of genetic testing in the prenatal diagnosis of fetal agenesis of the corpus callosum (ACC).
METHODS: Fetuses with ACC confirmed by prenatal systematic ultrasound and fetal MRI imaging underwent invasive prenatal diagnostic procedures. Amniotic fluid samples from the fetuses were collected for karyotype analysis and/or chromosomal microarray analysis (CMA). For ACC fetuses with normal karyotype and/or CMA results, whole-exome sequencing (WES) was further performed.
RESULTS: Among the 15 ACC fetuses, karyotype analysis was p…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Aortic aneurysm and dissection (AAD) are a set of life-threatening diseases. This study aimed to investigate the genetic mechanisms of AAD by integrating transcriptome-wide association study (TWAS) and mRNA expression profile.
METHODS: The genome-wide association study (GWAS) summary data of AAD was obtained from the UK Biobank, which contains 452,264 White British individuals, including 1470 AAD patients. The TWAS analysis was performed by integrating expression quantitative trait loci (eQTL) data of aorta and the GWAS dataset of AAD using the FUSION software. The TWAS significan
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.