Chemical cross-linking has proved successful in combination with mass spectrometry as a tool for low-resolution structure determination of proteins. The integration of chemical cross-linking with Fourier transform ion cyclotron resonance (FTICR) mass spectrometry to determine protein interfaces was tested on the calcium-dependent complex between calmodulin (CaM) and a 26-amino acid peptide derived from the skeletal muscle myosin light chain kinase (M13). Different amine-reactive, homobifunctional cross-linkers and a "zero-length" cross-linker were employed. The covalently attached complexes we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Interactions of membrane proteins are important in various aspects of cell function. However, weak membrane protein-protein interactions are difficult to study using techniques such as co-immunoprecipitations. CD4 is a cell surface protein involved in T cell activation and the binding of the human immunodeficiency virus to HIV target cells. Here we report the use of cross-linking followed by affinity purification of CD4 in combination with mass spectrometry for identification of proteins that are in the proximity of CD4. Besides the components of the CD4 receptor complex, CD4 and lck, we have
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The S. pombe Cdc14-related phosphatase Clp1p/Flp1p regulates G2/M transition by antagonizing CDK activity and is essential for coordinating the nuclear division cycle with cytokinesis through the cytokinesis checkpoint. At the G2/M transition, Clp1p/Flp1p is released from the nucleolus and SPB and distributes throughout the nucleus to the spindle and the contractile ring. This early relocalization is analogous to vertebrate Cdc14 homologs and stands in contrast to S. cerevisiae Cdc14p, which is not released from the nucleolus until metaphase/anaphase transition. Here, we report that Clp1p/Flp1
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The fusion (F) protein of the paramyxovirus SV5 promotes both virus-cell and cell-cell fusion. Recently, the atomic structure at 1.4 A of an extremely thermostable six-helix bundle core complex consisting of two heptad repeat regions of the F protein has been described (K. A. Baker, R. E. Dutch, R. A. Lamb, and T. S Jardetsky, Mol. Cell 3, 309-319, 1999). To analyze the conformations of the F protein at various stages of the membrane fusion process and to understand further the role of formation of the six-helix bundle core complex in promotion of membrane fusion, antibodies to peptides corres
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Proteins are transported from the endoplasmic reticulum (ER) in vesicles formed by coat protein complex II (COPII). Soluble secretory proteins are thought to leave the ER in these vesicles by "bulk flow" or through recognition by hypothetical shuttling receptors. We found that Erv29p, a conserved transmembrane protein, was directly required for packaging glycosylated pro-alpha-factor (gpalphaf) into COPII vesicles in Saccharomyces cerevisiae. Further, an Erv29p-gpalphaf complex was isolated from ER-derived transport vesicles. In vivo, export of gpalphaf from the ER was saturable and depended o
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glutathionyl S-[4-(succinimidyl)benzophenone] (GS-Succ-BP), an analogue of the product of glutathione and electrophilic substrate, acts as a photoaffinity label of dimeric rat liver glutathione S-transferase (GST), isoenzyme 1-1. A time-dependent loss of enzyme activity is observed upon irradiation of the enzyme with long wavelength UV light in the presence of the reagent. The initial rate of inactivation exhibits nonlinear dependence on the concentration of the reagent, characterized by an apparent dissociation constant of the enzyme-reagent complex (K(R)) of 99 +/- 2 microM and k(max) of 0.0
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
(5R,6R) 6-(3-propylthio-1,2,5-thiadiazol-4-yl)-1-azabicyclo[3.2.1]oc tane (PTAC) is a selective muscarinic ligand with high affinity for central muscarinic receptors, agonist mode of action at the muscarinic M2 and M4 receptor subtypes and substantially less or no affinity for central dopamine receptors. In the present study PTAC, as well as the muscarinic agonists oxotremorine, RS86 and pilocarpine, inhibited dopamine D1 and D2 receptor agonist induced contralateral rotation in unilaterally 6-OHDA lesioned rats. The dose of SKF 38393 used to induce contralateral rotation also caused an intens
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
GM1 enhances nerve growth factor (NGF)-stimulated neuritogenesis and prevents apoptotic death of PC12 cells; both may be due to enhancement of TrkA dimerization. In this study, we examined the effect of GM1 on NGF-induced TrkA dimerization in Trk-PC12 (6-24) cells. NGF increased tyrosine phosphorylation of the 140-kDa protein (TrkA monomer), and preincubation with GM1 potentiated this effect. Adding the protein cross-linker bis(sulfosuccinimidyl) suberate with NGF resulted in the appearance of two major bands (220 and 330 kDa) when probed with antibodies against TrkA or phosphotyrosine, and GM
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have investigated the interaction of S-100 proteins (beta and/or alpha) and annexin II2-p11(2) with glial fibrillary acidic protein (GFAP) and desmin to have further information on the mechanisms whereby S-100 proteins and annexin II2-p11(2) affect assembly/disassembly of GFAP and desmin intermediate filaments (IFs). Analyses were conducted on either native IF subunits, GFAP or desmin rod domain, or headless GFAP or desmin. Our data indicate that: (i) S-100 proteins bind to GFAP and desmin N-terminal head domain; (ii) annexin II2-p11(2) binds to GFAP rod domain; (iii) annexin II2-p11(2) doe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The membrane proximal, immunoglobulin- (Ig-) like domain 3 of KGFR shows significant sequence similarity to the Ig light chain variable (V) domain. According to our model, based on this similarity, the F-G loop in KGFR corresponds to the complementarity determining region (CDR) 3 of the Ig V domain. The F-G loop in the membrane proximal domain of the keratinocyte growth factor receptor has previously been shown to participate in determining the FGF ligand binding specificity of KGFR [Gray, T. E., Eisenstein, M., Shimon, T., Givol, D., & Yayon, A. (1995) Biochemistry 34, 10325-10333]. Here, we
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Return of cell surface glycoproteins to compartments of the secretory pathway has been examined in HepG2 cells comparing return to the trans-Golgi network (TGN), the trans/medial- and cis-Golgi. Transport to these sites was studied by example of the transferrin receptor (TfR) and the serine peptidase dipeptidylpeptidase IV (DPPIV) after labeling these proteins with the N-hydroxysulfosuccinimide ester of biotin on the cell surface. This experimental design allowed to distinguish between glycoproteins that return to these biosynthetic compartments from the cell surface and newly synthesized glyc
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is known from animal experiments that the regulation of REM and Non-REM sleep is governed by cholinergic and serotonergic/adrenergic neurons in the brain stem. Cholinergic neurons in the gigantocellular field of the tegmentum seem to be responsible for the triggering and maintenance of REM sleep. These findings are of special interest for interpreting abnormalities of REM sleep in depression. Psychiatric sleep research in the last two decades has demonstrated that an early onset of REM sleep and heightened REM density frequently occurs in patients suffering from depression. Extrapolating fr
Клиническое исследованиеСтатьяРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The effect of continuous intrathecal infusion with morphine (5 mu/h) or naloxone (2 micrograms/h) was investigated with regard to analgesia and the apparent density of mu- and delta-opioid and neurokinin-I/substance P receptors in the rat spinal cord. Morphine infusion increased tail-flick and paw-pressure responses until day 4 after the mini-osmotic pump implant. A decline in antinociception, reflecting tolerance to morphine, was then apparent in both tests. Quantitative in vitro receptor autoradiography of [125I]FK-33824, [125I][D.Ala2]deltorphin-I and [125I] Bolton-Hunter substance P bindin
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Combining of subtype specific peptides from the hypervariable loop of the envelope glycoprotein gp120 of divergent HIV-1 isolates may help in designing a broadly protective immunogen against HIV-1 infection. To enhance the immunogenicity of such a polyvalent antigen, in the absence of oil-containing adjuvants, it is necessary to link the peptides to a protein carrier. It is preferable to use as carriers those proteins from HIV-1 itself which may contribute to eliciting protective immunity. The structural and non-structural proteins, gag P18 and nef, respectively, which can be prepared in high
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
With the aim of targeting toxins to selected cells in the gonad, we have prepared conjugates of ovine luteinizing hormone (oLH) with a single chain ribosome-inactivating protein called gelonin. The two proteins were thiolated by using N-succinimidyl-3-(2-pyridyldithio)propionate and subsequently reacted under appropriate conditions to form oLH-S-S-gelonin complex. A complete biochemical analysis of thiolated oLH and oLH-gelonin conjugates has been performed. The linkage of the hormone to the toxin probably occurred through a single amino group in the alpha-subunit, with the beta-subunit remain
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Purpose: The study aimed to predict and explore the possible clinical value and mechanism of genetic markers in adrenal cortical carcinoma using a bioinformatics analysis method. Methods: The RNA-seqs and miRNAs data were downloaded from TCGA database to identify the differentially expressed genes and differentially expressed miRNAs. The hub-genes were screened by building protein-protein interaction sub-networks with 12 topological analysis methods. We conducted the receiver operating characteristic curve to elevate the diagnostic value of hub-genes in distinguishing the death and alive group
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Tumors use indoleamine 2,3-dioxygenase-1 (IDO1) as a major mechanism to induce an immunosuppressive microenvironment. IDO1 expression is upregulated in many cancers and considered to be a resistance mechanism to immune checkpoint therapies. IDO1 is induced in response to inflammatory stimuli such as IFNγ and promotes immune tolerance by depleting tryptophan and producing tryptophan catabolites, including kynurenine, in the tumor microenvironment. This leads to effector T-cell anergy and enhanced Treg function through upregulation of FoxP3. As a nexus for the induction of key immunosuppressive
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Intestinal efflux transporters can significantly reduce the absorption of the drug after peroral application. In this work we studied secretion of glutathione conjugates triggered by glucose at the luminal side of the intestine. Glucose stimulated secretion of DNPSG, NEMSG and CDNB. We used some different monosaccharides and determined that glucose, galactose and alpha-methylglucopyranoside trigger the secretion, while mannitol and fructose do not. We concluded that interaction with SGLT transporter is the key process necessary for this triggering. To determine which of possible glutathione co
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Progenitor cells in bone marrow have been explored for the treatment of liver injury. Stem cell homing to the injured tissue is regulated through stromal cell derived factor-1 (SDF-1) and its receptor CXCR4. We hypothesized that syngenic bone marrow cells (BMCs) would restore hepatic function in the injured liver through the regulation by SDF-1/CXCR4 system. After injecting carbon tetrachloride (CCl(4)), the mice were injected with syngenic BMCs or normal saline. Morphological and functional analysis of the liver was performed. Flow cytometry for the stem cell markers and CXCR4 was done with t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Disuccinimidyl suberate (DSS) intramolecularly cross-linked hemoglobin (Hb) was developed as a novel red blood cell substitute. A multi-angle laser light scattering detector coupled with size exclusion HPLC was applied to determine the molecular weight of the modified Hb. SDS-PAGE was also used as a complement. It was proved that 83.8% of the product was intramolecularly cross-linked Hb with weight-average molecular weights (Mw) of 67.5 kD, 12% was dimeric Hb with Mw of 146.6 kD, and 4.2% was trimeric Hb with Mw of 306.4 kD. The tetramer structure of the cross-linked Hb was stable as shown in
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования