A series of benzoselenoates has been prepared and their inhibitory properties against the most relevant human Carbonic Anhydrases (CAs) isoforms, among which hCA I, II, IV, VII, IX, and XII were investigated. These inhibitors were designed considering the carboxylates and mono-/dithiocarbamates as lead and led to the observation that the COSe- is a new zinc-binding group (ZBG) for metalloenzymes possessing zinc ions at their active site. The substitution pattern on aromatic ring of the benzoselenoates is the crucial structural element influencing selectivity towards various isoforms. We elucid
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Leishmaniasis is a parasitic disease with frequent annual incidence. An important issue in chemotherapy is the emergence of resistance, toxicity and lack of cost-effectiveness within current drugs. Therefore, it is of utmost importance to design effective drugs against disease. Current contribution was devoted to the in-silico analysis of binding a few flavonoids/alkaloids to relevant leishmanial targets. Docking scores were used to prioritize acquired affinities and top ranked binders were subjected to subsequent 100-ns MD simulation in explicit water. Binding trajectories revealed the tighte
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The structural diversity in metallo-β-lactamases (MBLs), especially in the vicinity of the active site, has been a major hurdle in the development of clinically effective inhibitors. Representatives from three variants of the B3 MBL subclass, containing either the canonical HHH/DHH active-site motif (present in the majority of MBLs in this subclass) or the QHH/DHH (B3-Q) or HRH/DQK (B3-RQK) variations, were reported previously. Here, we describe the structure and kinetic properties of the first example (SIE-1) of a fourth variant containing the EHH/DHH active-site motif (B3-E). SIE-1 was ident
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Strategies that enable intermolecular site-selective C-H bond functionalisation of organic molecules provide one of the cornerstones of modern chemical synthesis. In chloroalkane synthesis, such methods for intermolecular site-selective aliphatic C-H bond chlorination have, however, remained conspicuously rare. Here, we present a copper(I)-catalysed synthetic method for the efficient site-selective C(sp3)-H bond chlorination of ketones, (E)-enones and alkylbenzenes by dichloramine-T at room temperature. A key feature of the broad substrate scope is tolerance to unsaturation, which would normal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kinases play central roles in many cellular processes, transferring the terminal phosphate groups of nucleoside triphosphates (NTPs) onto substrates. In the absence of substrates, kinases can also hydrolyse NTPs producing NDPs and inorganic phosphate. Hydrolysis is usually much less efficient than the native phosphoryl transfer reaction. This may be related to the fact that NTP hydrolysis is metabolically unfavorable as it unproductively consumes the cell's energy stores. It has been suggested that substrate interactions could drive changes in NTP binding pocket, activating catalysis only when
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Several lines of evidence suggest that the pathobiont Porphyromonas gingivalis is involved in the development and/or progression … ory cells, and three inflammatory cytokines. Finally, we identified an amino acid motif in the RgpA catalytic domain of P. gingivalis that shares sequence homology with type II collagen.
CONCLUSION: We conclude that pre-immunization against gingipain domains can reduce the severity of experimentally induced arthritis. We suggest that targeting gingipain domains b …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Klebsiella pneumoniae pullulanase (KPP) belongs to glycoside hydrolase family 13 subfamily 13 (GH13_13) and is the only enzyme that is reported to perform an induced-fit motion of the active-site loop (residues 706-710). Comparison of pullulanase structures indicated that only KPP has Leu680 present behind the loop, in contrast to the glycine found in other GH13_13 members. Analysis of the structure and activity of recombinant pullulanase from K. pneumoniae ATCC 9621 (rKPP) and its mutant (rKPP-G680L) indicated that the side chain of residue 680 is important for the induced-fit motion of the l
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The current review is intended to highlight recent advances in the search of new and effective modulators of the metalloenzymes Carbonic Anhydrases (CAs, EC 4.2.1.1) expressed in humans (h). CAs reversibly catalyze the CO2 hydration reaction, which is of crucial importance in the regulation of a plethora of fundamental processes at cellular level as well as in complex organisms. The first section of this review will be dedicated to compounds acting as activators of the hCAs (CAAs) and their promising effects on central nervous system affecting pathologies mainly characterized from memory and l
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CPAF (chlamydial protease-like activity factor) is a Chlamydia trachomatis protease that is translocated into the host cytosol during infection. CPAF activity results in dampened host inflammation signaling, cytoskeletal remodeling, and suppressed neutrophil activation. Although CPAF is an emerging antivirulence target, its catalytic mechanism has been unexplored to date. Steady state kinetic parameters were obtained for recombinant CPAF with vimentin-derived peptide substrates using a high-performance liquid chromatography-based discontinuous assay (kcat = 45 ± 0.6 s-1; kcat/Km = 0.37 ± 0.02
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Peroxiredoxins (Prxs) catalyse the rapid reduction of hydrogen peroxide, organic hydroperoxide and peroxynitrite, using a fully conserved peroxidatic cysteine (CP) located in a conserved sequence Pxxx(T/S)xxCP motif known as CP-loop. In addition, Prxs are involved in cellular signaling pathways and regulate several redox-dependent process related disease. The effective catalysis of Prxs is associated with alterations in the CP-loop between reduced, Fully Folded (FF), and oxidized, Locally Unfolded (LU) conformations, which are linked to dramatic changes in the oligomeric structure. Despite man
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Targeting Mycobacterium tuberculosis peptidoglycans with β-lactam antibiotics represents a strategy to address increasing resistance to antitubercular drugs. β-Lactams inhibit peptidoglycan synthases such as l,d-transpeptidases, a group of carbapenem-sensitive enzymes that stabilize peptidoglycans through 3 → 3 cross-links. M. tuberculosis encodes five l,d-transpeptidases (LdtMt1-5), of which LdtMt3 is one of the less understood. Herein, we structurally characterized the apo and faropenem-acylated forms of LdtMt3 at 1.3 and 1.8 Å resolution, respectively. These structures revealed a fold and c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
O2-evolving chlorite dismutases (Clds) efficiently convert chlorite (ClO2-) to O2 and Cl-. Dechloromonas aromatica Cld ( DaCld) is a highly active chlorite-decomposing homopentameric enzyme, typical of Clds found in perchlorate- and chlorate-respiring bacteria. The Gram-negative, human pathogen Klebsiella pneumoniae contains a homodimeric Cld ( KpCld) that also decomposes ClO2-, albeit with an activity 10-fold lower and a turnover number lower than those of DaCld. The interactions between the distal pocket and heme ligand of the DaCld and KpCld active sites have been probed via kinetic, thermo
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
When blood is exposed to variety of artificial surfaces and biologic substances, the plasma proteins factor XII (FXII) and prekallikrein undergo reciprocal proteolytic conversion to the proteases αFXIIa and α-kallikrein by a process called contact activation. These enzymes contribute to host-defense responses including coagulation, inflammation, and fibrinolysis. The initiating event in contact activation is debated. To test the hypothesis that single-chain FXII expresses activity that could initiate contact activation, we prepared human FXII variants lacking the Arg353 cleavage site required
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dynamin-related GTPase atlastin (ATL) catalyzes membrane fusion of the endoplasmic reticulum and thus establishes a network of branched membrane tubules. When ATL function is compromised, the morphology of the endoplasmic reticulum deteriorates, and these defects can result in neurological disorders such as hereditary spastic paraplegia and hereditary sensory neuropathy. ATLs harness the energy of GTP hydrolysis to initiate a series of conformational changes that enable homodimerization and subsequent membrane fusion. Disease-associated amino acid substitutions cluster in regions adjacent
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The minimal requirements for substrate recognition and turnover by iodotyrosine deiodinase were examined to learn the basis for its catalytic specificity. This enzyme is crucial for iodide homeostasis and the generation of thyroid hormone in chordates. 2-Iodophenol binds only very weakly to the human enzyme and is dehalogenated with a kcat/Km that is more than 4 orders of magnitude lower than that for iodotyrosine. This discrimination likely protects against a futile cycle of iodinating and deiodinating precursors of thyroid hormone biosynthesis. Surprisingly, a very similar catalytic selectiv
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Flavodiiron proteins (FDPs) contain a unique active site consisting of a non-heme diiron carboxylate site proximal to a flavin mononucleotide (FMN). FDPs serve as the terminal components for reductive scavenging of dioxygen (to water) or nitric oxide (to nitrous oxide), which combats oxidative or nitrosative stress in many bacteria. Characterizations of FDPs from spirochetes or from any oral microbes have not been previously reported. Here, we report characterization of an FDP from the anaerobic spirochete, Treponema (T.) denticola, which is associated with chronic periodontitis. The isolated
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The protozoan parasite Toxoplasma gondii develops within a parasitophorous vacuole (PV) in mammalian cells, where it scavenges cholesterol. When cholesterol is present in excess in its environment, the parasite expulses this lipid into the PV or esterifies it for storage in lipid bodies. Here, we characterized a unique T. gondii homologue of mammalian lecithin:cholesterol acyltransferase (LCAT), a key enzyme that produces cholesteryl esters via transfer of acyl groups from phospholipids to the 3-OH of free cholesterol, leading to the removal of excess cholesterol from tissues. TgLCAT contains
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Insertion of CS2 into the thermally unstable nickel(III) hydride [PPN][Ni(H)(P(o-C6H3-3-SiMe3-2-S)3)] (1), freshly prepared from the reaction of [PPN][Ni(OC6H5)P(C6H3-3-SiMe3-2-S)3] and 4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolane (HBpin; pin = OCMe2CMe2O) in tetrahydrofuran at -80 °C via a metathesis reaction, readily affords [PPN][Ni(III)(κ(1)-S2CH)(P(o-C6H3-3-SiMe3-2-S)3)] (2) featuring a κ(1)-S2CH moiety.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
TTR (transthyretin) was found recently to possess proteolytic competency besides its well-known transport capabilities. It was described as a cryptic serine peptidase cleaving multiple natural substrates (including β-amyloid and apolipoprotein A-I) involved in diseases such as Alzheimer's disease and atherosclerosis. In the present study, we aimed to elucidate the catalytic machinery of TTR. All attempts to identify a catalytic serine residue were unsuccessful. However, metal chelators abolished TTR activity. Proteolytic inhibition by EDTA or 1,10-phenanthroline could be reversed with Zn2+ and
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Protein-disulfide isomerase (PDI) has been proposed to exhibit an "unfoldase" activity against the catalytic A1 subunit of cholera toxin (CT). Unfolding of the CTA1 subunit is thought to displace it from the CT holotoxin and to prepare it for translocation to the cytosol. To date, the unfoldase activity of PDI has not been demonstrated for any substrate other than CTA1. An alternative explanation for the putative unfoldase activity of PDI has been suggested by recent structural studies demonstrating that CTA1 will unfold spontaneously upon its separation from the holotoxin at physiological tem
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования