Neonatal diabetes mellitus (NDM) typically presents within the first 6 months of life and generally lacks islet autoantibodies. Genetic elucidation of NDM is a prime example of precision medicine in diabetes. However, no published genetic data exist for NDM in Thailand. We aimed to assess the genetic etiology of Thai NDM using whole exome sequencing (WES). We enrolled 14 Thai patients with NDM and measured GAD65, IA-2, and ZnT8 autoantibodies. We then performed WES and analyzed 43 NDM-related genes to identify causative variants. All subjects tested negative for the three islet autoantibodies.…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pediatric kidney diseases encompass a diverse group of disorders, ranging from congenital anomalies to glomerulopathies. Unlike adults, where lifestyle factors predominate, approximately 30% of pediatric cases constitute inherited kidney diseases. This high heritability underscores the critical importance of early and accurate genetic testing. While targeted gene panels have historically been the first-line diagnostic tool, they are limited by fixed gene content and an inability to detect complex structural variants. Next-generation sequencing, specifically exome sequencing and genome sequenci…
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Wilson disease (WD) is an autosomal recessive disorder of copper metabolism caused by mutations in the ATP7B gene, resulting in toxic copper … g and no KF rings. Targeted genetic testing identified a single pathogenic ATP7B variant, and whole exome sequencing (WES) later revealed a second variant of uncertain significance (VUS). Repeat liver biopsy showed hepatic copper content of 258 mcg/g, meeting diagnostic criteria. The patient was started on trientine, and ALT normalized within 3 months, …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: It is important for porcine models to replicate gene mutations present in human diseases to improve the translatability of animal studies. In this study, the high efficacy of a whole exome sequencing kit was demonstrated for the improved pig reference genome (Sus scrofa 11.1) to profile biomedically relevant swine breeds and enable high-depth sequencing required for intratumor heterogeneity profiling.
RESULTS: We identify a total of 751,624 single nucleotide variants (SNVs) and 113,597 insertions and deletions (INDELs) across 93 samples from 12 porcine breeds. The identified mutat…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Exome sequencing (ES) benefits the genetic work-up for fetuses with structural anomalies, but data on its utility for fetuses without anomalies and stillbirths is more limited. We report our experience with prenatal ES for all three indications.
METHOD: We retrospectively reviewed results from 344 trio-ES performed for fetuses with structural anomalies (N = 262), stillbirths (N = 39), and fetuses without anomalies (N = 43), many of which had a relevant family history. We classified pathogenic variants (P), likely pathogenic variants (LP), or variants of uncertain significance (VUS)…
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hepatocellular carcinoma (HCC) is the most common primary liver cancer. Chronic hepatitis and liver cirrhosis lead to accumulation of genetic alterations driving HCC pathogenesis. This study is designed to explore genomic landscape of HCC in Egyptian patients by whole exome sequencing.
METHODS: Whole exome sequencing using Ion Torrent was done on 13 HCC patients, who underwent surgical intervention (7 patients underwent living donor liver transplantation (LDLT) and 6 patients had surgical resection}.
RESULTS: Mutational signature was mostly S1, S5, S6, and S12 in HCC. Analysis of…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To evaluate the application of whole exome sequencing (WES) in the diagnosis of hereditary eye diseases. Methods: A total of 24 patients who came to the Obstetrics and Gynecology Hospital of Fudan University for reproductive genetic counseling from December 2020 to December 2023 with the main complaint of congenital eye disorders were included in this study. All cases had no known infections or exposure to known teratogenic drugs, karyotype and chromosome microarray analysis (CMA) abnormalities. Genomic DNA was extracted from the peripheral blood of the probands and their family mem…
Аннотация на английскомСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Moyamoya vasculopathy secondary to various genetic disorders is classified as moyamoya syndrome (MMS). Recent studies indicate MMS occurs due to a combination of genetic modifiers and causative mutations for the primary genetic disorders. We performed whole-exome sequencing (WES) in 13 patients with various genetic disorders who developed MMS. WES successfully revealed the genetic diagnoses of neurofibromatosis type 1 (NF-1), Down syndrome, multisystemic smooth muscle dysfunction syndrome, Noonan syndrome, and alpha thalassemia. The previously reported modifier genes, RNF213 and MRVI1, were co…
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Osteogenesis imperfecta (OI) is a group of phenotypically and genetically heterogeneous connective tissue disorders that share similar skeletal anomalies causing bone fragility and deformation. This study aimed to investigate the molecular genetic etiology and to determine the relationship between genotype and phenotype in OI patients with whole exome sequencing (WES).
METHODS: Multiplex-Ligation dependent Probe Amplification (MLPA) analysis of COL1A1 and COL1A2 and WES were performed on cases between the ages of 0 and 18 whose genetic etiology could not be determined before using…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cost-effectiveness of whole exome sequencing (WES) remains controversial due to variant call variability, necessitating sensitivity and specificity evaluation. WES was performed by three companies (AA, BB, and CC) using reference standards composed of DNA from hydatidiform mole and individual blood at various ratios. Sensitivity was assessed by the detection rate of null-homozygote (N-H) alleles at expected variant allelic fractions, while false positive (FP) errors were counted for unexpected alleles. Sensitivity was approximately 20% for in-house results from BB and CC and around 5% for …
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Defects in erythrocyte membrane proteins can cause the most common type of inherited hemolytic anemia, so called hereditary spherocytosis (HS). It is characterized by the appearance of spherocytes in peripheral blood, hemolytic anemia, splenomegaly, jaundice and gallstones. Due to difficulty of diagnosis solely based on aforementioned parameters, the addition of genetic testing seems to be effective and most acknowledged. Up to date, pathogenic variations in five genes encoding membrane proteins (ANK1, SPTA1, SPTB, SLC4A1, EPB42) are identified to cause HS. Here, we have studied the genetic sp
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Whole-exome sequencing (WES) is an effective method in the prenatal setting for identification of the underlying genetic etiology of fetal ultrasound abnormalities. To investigate the diagnostic value of WES in fetuses with ultrasound abnormalities that resulted in fetal demise or pregnancy termination.
METHODS: 61 deceased fetuses with ultrasound abnormalities and normal copy number variation Sequencing were retrospectively collected. Proband-only or trio-WES were performed on the products of conception.
RESULT: Collectively, 28 cases were positive with 39 variants (10 pathogeni…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate germline predisposition in lymphoma, we performed whole-exome sequencing and discovered a novel variant (c.817-1G>T) in programmed cell death 1 ligand 2 (PD-L2) in a family with early-onset lymphomas and other cancers. The variant was present in the proband with follicular lymphoma and his son with Hodgkin's lymphoma. It was in the terminal splice acceptor site of PD-L2 and embedded in a putative enhancer of Janus kinase 2 (JAK2) and programmed cell death 1 ligand (PD-L1). We also found that gene expression of PD-L2, PD-L1, and JAK2 was significantly increased. Using 3' rapid am…
Письмо в редакциюПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nowadays, exome sequencing is a robust and cost-efficient genetic diagnostic tool already implemented in many clinical laboratories. Despite it has undoubtedly improved our diagnostic capacity and has allowed the discovery of many new Mendelian-disease genes, it only provides a molecular diagnosis in up to 25-30% of cases. Here, we comprehensively evaluate the results of a large sample set of 4974 clinical exomes performed in our laboratory over a period of 5 years, showing a global diagnostic rate of 24.62% (1391/4974). For the evaluation we establish different groups of diseases and demonstr…
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Recent research found that biallelic HPDL variants can cause neurodevelopmental disorder with progressive spasticity and brain white matter abnormalities (NEDSWMA), with only a few reports. Clinical phenotypic information on individuals with damaging HPDL variants may also be incomplete. The phenotype of NEDSWMA is characterized by severe neurodevelopmental delay, brain atrophy, and spasticity in infancy.
METHODS: Exome sequencing was used in the proband and his parents to identify the underlying genetic cause. Candidate mutations were validated by classic Sanger sequencing. The c…
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
IMPORTANCE: Most studies of autosomal dominant polycystic kidney disease (ADPKD) genetics have used kidney specialty cohorts, focusing on PK … onal study used an unselected health system-based cohort in central and northeast Pennsylvania with exome sequencing (enrolled from 2004 to 2020) and electronic health record data (up to October 2021). The genotype-first approach included the entire cohort and the phenotype-first approach focused on patients with ADPKD diagnosis codes, confirmed by char …
СтатьяНаблюдательное исследованиеПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Hirschsprung disease (HSCR) is a complex genetic disease characterized by the absence of ganglion cells in the intestines, leading to a functional obstruction in infants. At least 24 genes have been identified for the pathogenesis of HSCR. They contributed to approximately 72% of HSCR cases. We aimed to elucidate further the genetic basis of HSCR in Indonesia using the whole-exome sequencing (WES) approach.
METHODS: WES was performed in 39 sporadic non-syndromic HSCR patients and 16 non-HSCR subjects as controls. Variants presented in controls were excluded, followed by in silico …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mitochondrial disease (MD) is genetically a heterogeneous group of disorders with impairment in respiratory chain complexes or pathways associated with the mitochondrial function. Nowadays, it is still a challenge for the genetic screening of MD due to heteroplasmy of mitochondrial genome and the complex model of inheritance. This study was designed to investigate the feasibility of whole exome sequencing (WES)-based testing as an alternative option for the diagnosis of MD.
METHODS: A Chinese Han cohort of 48 patients with suspect MD features was tested using nanoWES, which was a …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epidermolysis bullosa (EB) is a complex and heterogeneous dermatological disease. Four main types of EB have been described, each of them with distinct characteristics: EB simplex (EBS), dystrophic EB (DEB), junctional EB (JEB) and Kindler EB (KEB). Each main type varies in its manifestations, severity, and genetic abnormality.
METHODS: We sought mutations in 19 genes known to cause EB and 10 genes associated with other dermatologic diseases in 35 Peruvian pediatric patients of a rich Amerindian genetic background. Whole exome sequencing and bioinformatics analysis was performed.
…
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective: To analyze the clinical characteristics of patients with Möbius syndrome (MBS) and to explore likely pathogenic genes. Methods: C … DNA was extracted, and the pathogenic gene variations that may lead to MBS were identified by whole exome sequencing and bioinformatics analysis. Results: Among the 18 patients, there were 8 males and 10 females, and the age was (4.5±4.0) years (range, 8 months to 17 years). All patients showed congenital, bilateral or unilateral abduction deficit and f …
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования