We describe monozygotic twin girls with genetic variation at two separate loci resulting in a blended phenotype of Prader-Willi syndrome and Pitt-Hopkins syndrome. These girls were diagnosed in early infancy with Prader-Willi syndrome, but developed an atypical phenotype, with apparent intellectual deficiency and lack of obesity. Array-comparative genomic hybridization confirmed a de novo paternal deletion of the 15q11.2q13 region and exome sequencing identified a second mutational event in both girls, which was a novel variant c.145+1G>A affecting a TCF4 canonical splicing site inherited from
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The AFF (AF4/FMR2) family of genes includes four members: AFF1/AF4, AFF2/FMR2, AFF3/LAF4 and AFF4/AF5q31. AFF2/FMR2 is silenced in FRAXE intellectual disability, while the other three members have been reported to form fusion genes as a consequence of chromosome translocations with the myeloid/lymphoid or mixed lineage leukemia (MLL) gene in acute lymphoblastic leukemias (ALLs). All AFF proteins are localized in the nucleus and their role as transcriptional activators with a positive action on RNA elongation was primarily studied. We have recently shown that AFF2/FMR2 localizes to nuclear spec
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Congenital heart defects (CHDs) are the most common types of birth defects, and global incidence of CHDs is on the rise. Despite the prevalence of CHDs, the genetic determinants of the defects are still in the process of being identified. Herein, we report a consanguineous Saudi family with three CHD affected daughters. We used whole exome sequencing (WES) to investigate the genetic cause of CHDs in the affected daughters. We found that all affected individuals were homozygous for a novel splice-altering variant (NM_001330069.1: c.265-1G>T) of PRKD1, which encodes a calcium/calmodulin-dependen
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A novel A*68020103 allele was completely characterized by sequencing in a Spanish bone marrow donor. A*68020103 has an eight nucleotides deletion at the 5'-end of intron 2, when compared with other A*6802 alleles. This alteration does not affect either its mRNA splicing process or serological detection.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: There are important differences in CsA pharmacokinetics between adult and pediatric patients, such that pharmacokinetic data can not necessarily be extrapolated from the adult to the pediatric setting. Research in adult renal transplant patients has shown that adequate cyclosporin exposure (AUC0-4) in the first week post-transplant is important for successful clinical outcome, and that cyclosporin concentration at 2 h post-dose (C2) provides the optimal single-time point marker for AUC0-4. Clinically, dose management based on C2 level results in a low incidence of acute rejection i
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report a new pathogenic mechanism in von Willebrand disease involving the use of a non-canonical splicing site. The proband, carrying the homozygous c.2269_2270del mutation previously classified as a type 3 mutation, showed severely reduced plasma and platelet von Willebrand factor antigen levels and functions, and no factor VIII binding capacity. A particular von Willebrand factor multimer pattern emerged in plasma, characterized by the presence of only two oligomers: the dimer and an unusually large band, with no intermediate components. There were von Willebrand factor multimers in plate
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Splicing mutations that lead to devastating genetic diseases are often located in nonconserved or weakly conserved sequences that normally do not affect splicing. Thus, the underlying reason for the splicing defect is not immediately obvious. An example of this phenomenon is observed in the neurodevelopmental disease familial dysautonomia (FD), which is caused by a single-base change in the 5' splice site (5'ss) of intron 20 in the IKBKAP gene (c.2204+6T>C). This mutation, which is in the sixth position of the intron and results in exon 20 skipping, has no phenotype in many other introns. To d
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ATXN2 is associated with an increased risk of Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS), while down-regulation of ATXN2 has been shown to mitigate TDP-43 proteinopathy in ALS models. In this study, we demonstrated that Ataxin-2 protein levels were upregulated in rNLS8 mice following doxycycline withdrawal, which coincided with TDP-43 overexpression, phosphorylation, and aggregation. To reduce Ataxin-2 protein levels, we explored the approach of splicing modulation at the RNA level. Through bioinformatical analysis, we identified an alternative 5' splicing site of ATXN2 in intron 8. This alternative
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In myeloid malignancies including acute myeloid leukemia (AML) and myelodysplastic syndromes (MDS), patient selection and therapeutic strategies are increasingly based on tumor-specific genetic mutations. Among these, mutations in DDX41, which encodes a DEAD-box type RNA helicase, are present in approximately 2-5% of AML and MDS patients; this disease subtype exhibits a distinctive disease phenotype characterized by late age of onset, tendency toward cytopenia in the peripheral blood and bone marrow, a relatively favorable prognosis, and a high frequency of normal karyotypes. Typically, indivi
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV) ubiquitously infects humans, establishing lifelong persistence in B cells. In vitro, EBV-infected B cells can establish a lymphoblastoid cell line (LCL). EBV's transcripts in LCLs (latency III) produce six nuclear proteins [EBV nuclear antigens (EBNAs)], two latency membrane proteins (LMPs) and various microRNAs and putative long non-coding RNAs [BamHI A rightward transcripts (BARTs)]. The BART and EBNA transcription units are characterized by extensive alternative splicing. We generated LCLs with B95-8 EBV-BACs, including one engineered with 'barcodes' in the first an
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over 72 mutations have been identified in the HEXA gene of which only four (T538C, A590C, G805A, and C1495T) are believed to cause a chronic form of Tay-Sachs disease (TSD). We identified a novel HEXA mutation (IVS7, -7 G-->A) leading to chronic TSD in a Canadian patient of English ancestry. The second allele in this patient was the exon 11 4-bp insertion mutation (/1277TATC), which is the most frequent TSD allele in Ashkenazi Jews. The IVS7, -7 G-->A mutation introduces a new 3' splice acceptor site 5 bp upstream of the normal intron 7 splice acceptor site. The mutation leads to reduction of
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exon skipping technologies enable exclusion of targeted exons from mature mRNA transcripts, which have broad applications in medicine and biotechnology. Existing techniques including antisense oligonucleotides, targetable nucleases, and base editors, while effective for specific applications, remain hindered by transient effects, genotoxicity, and inconsistent exon skipping. To overcome these limitations, here we develop SPLICER, a toolbox of next-generation base editors containing near-PAMless Cas9 nickase variants fused to adenosine or cytosine deaminases for the simultaneous editing of spli
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternate splicing is a critical regulator of gene expression in eukaryotes, however genetic mutations can cause erroneous splicing and disease. Most recorded splicing disorders are caused by mutations of splice donor/acceptor sites, however intronic mutations can affect splicing. Clinical exome analyses largely ignore intronic sequence, limiting the detection of mutations to within coding regions. We describe 'Trooper', a novel mouse model of CHARGE syndrome harbouring a pathogenic point mutation in Chd7. The mutation is 18 nucleotides upstream of exon 10 and creates a cryptic acceptor site,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Controlling the patterns of splicing of specific genes is an important goal in the development of new therapies. We have shown that the splicing of a refractory exon, SMN2 exon 7, could be increased in fibroblasts derived from patients with spinal muscular atrophy by using bifunctional targeted oligonucleotide enhancers of splicing (TOES) oligonucleotides that anneal to the exon and contain a 'tail' of enhancer sequences that recruit activating proteins. We show here that there are striking agreements between the effects of oligonucleotides on splicing in vitro and on both splicing and SMN2 pr
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Congenital insensitivity to pain with anhidrosis (CIPA) is a rare autosomal recessive genetic disease characterized by the lack of reaction to noxious stimuli and anhidrosis. It is caused by mutations in the NTRK1 gene, which encodes the high affinity tyrosine kinase receptor I for Neurotrophic Growth Factor (NGF).
CASE PRESENTATION: We present the case of a female patient diagnosed with CIPA at the age of 8 months. The patient is currently 6 years old and her psychomotor development conforms to her age (RMN, SPECT and psychological study are in the range of normality). PCR amplif
Клинический случайСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Alternative splicing (AS) is an important regulatory mode at the post-transcriptional level, through which many flowering genes regulate floral transition by producing multiple transcripts, and splicing factors have essential roles in this process. Hydrogen sulphide (H2S) is a newly found gasotransmitter that has critical physiological roles in plants, and one of its potential modes of action is via persulfidation of target proteins at specific cysteine sites. Previously, it has been shown that both the splicing factor AtU2AF65a and H2S are involved in the regulation of plant flowering. This s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sm-ring assembly is important for the biogenesis, stability, and function of uridine-rich small nuclear RNAs (U snRNAs) involved in pre-mRNA splicing and histone pre-mRNA processing. Sm-ring assembly is cytoplasmic and dependent upon the Sm-site sequence and structural motif, ATP, and Survival motor neuron (SMN) protein complex. While RNAs other than U snRNAs were previously shown to associate with Sm proteins, whether this association follows Sm-ring assembly requirements is unknown. We systematically identified Sm-sites within the human and mouse transcriptomes and assessed whether these sit
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
High levels of transcription and alternative splicing are recognized hallmarks of gene expression in the testis and largely driven by cells in meiosis. Because of this, the male meiosis stage of the cell cycle is often viewed as having a relatively permissive environment for gene expression. In this review, we highlight recent findings that identify the RNA binding protein RBMXL2 as essential for male meiosis. RBMXL2 functions as a "guardian of the transcriptome" that protects against the use of aberrant (or "cryptic") splice sites that would disrupt gene expression. This newly discovered prot
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angiogenesis is regulated by the balance of proangiogenic VEGF(165) and antiangiogenic VEGF(165)b splice isoforms. Mutations in WT1, the Wilms' tumor suppressor gene, suppress VEGF(165)b and cause abnormal gonadogenesis, renal failure, and Wilms' tumors. In WT1 mutant cells, reduced VEGF(165)b was due to lack of WT1-mediated transcriptional repression of the splicing-factor kinase SRPK1. WT1 bound to the SRPK1 promoter, and repressed expression through a specific WT1 binding site. In WT1 mutant cells SRPK1-mediated hyperphosphorylation of the oncogenic RNA binding protein SRSF1 regulated splic
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования