Molecular clones containing the NGF gene promoter regions and exons I were isolated from mouse and rat genomic libraries with synthetic oligonucleotide hybridization probes that corresponded to the 5' end of mouse submandibular gland NGF mRNA. The nucleotide sequences of the 5' flanking regions and exons I were determined and compared. There was 95% similarity in exons I and the adjacent promoter regions between mouse and rat sequences. Further upstream, the similarity decreased to 76%. Both mouse and rat promoter regions were only 33% similar to the presumptive human NGF gene promoter region.
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Phenotypic females with Y-chromosomal material in their genome have an increased risk for development of gonadal malignancy. The detection and identification of Y-chromosomal material in these cases can be of critical importance for medical management. Chromosome analysis in four patients with Turner syndrome revealed the characteristic 45,X chromosome complement together with a second cell population containing a small marker chromosome (46,X, + mar). Molecular-hybridization analyses utilizing cloned, Y chromosome-specific DNA sequences were performed to determine whether Y-chromosomal materi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We explored the relevance of genomic microarrays (GM) in the refinement of prognosis in newly diagnosed low-risk chronic lymphocytic leukaemia (CLL) patients as defined by isolated del(13q) or no lesions by a standard 4 probe fluorescence in situ hybridization (FISH) analysis. Compared to FISH, additional lesions were detected by GM in 27 of the 119 patients (22.7%). The concordance rate between FISH and GM was 87.4%. Discordant results between cytogenetic banding analysis (CBA) and GM were observed in 45/119 cases (37.8%) and were mainly due to the intrinsic characteristics of each technique.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oral lichen planus (OLP) is a chronic T cell-mediated inflammatory disease of unknown etiology. We previously proposed that the intracellular bacteria detected in OLP lesions are important triggering factors for T cell infiltration. This study aimed to identify OLP-associated bacterial species through the characterization of intratissue bacterial communities of OLP lesions. Seven pairs of bacterial communities collected from the mucosal surface and biopsied tissues of OLP lesions were analyzed by high-throughput sequencing of the 16S rRNA gene. The intratissue bacterial communities were charac
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Kabuki syndrome is mainly caused by dominant de-novo pathogenic variants in the KMT2D and KDM6A genes. The clinical features of this syndrome are highly variable, making the diagnosis of Kabuki-like phenotypes difficult, even for experienced clinical geneticists. Herein we present molecular genetic findings of causal genetic variation using array comparative genome hybridization and a Mendeliome analysis, utilizing targeted exome analysis focusing on regions harboring rare disease-causing variants in Kabuki-like patients which remained KMT2D/KDM6A-negative. The aCGH analysis revealed a pathoge
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A new molecular assay (Viral CNS Flow Chip kit, Master Diagnóstica, Spain) has been developed for the detection of eight viruses causing acute meningitis and encephalitis, i.e. herpes simplex viruses 1-2, varicella zoster virus, human enterovirus, human parechovirus, Toscana virus, human cytomegalovirus and Epstein Barr virus. The new assay is a multiplex one-step RT-PCR followed by automatic flow-through hybridization, colorimetric detection and image analysis. The limit of detection was 50 copies/reaction, and 10 copies/reaction for human enterovirus and the other seven viruses, respectively
СтатьяВалидационное исследованиеПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The prevalence of Haldane's rule suggests that sex chromosomes commonly have a key role in reproductive barriers and speciation. However, the majority of research on Haldane's rule has been conducted in species with conventional sex determination systems (XY and ZW) and exceptions to the rule have been understudied. Here we test the role of X-linked incompatibilities in a rare exception to Haldane's rule for female sterility in field cricket sister species (Teleogryllus oceanicus and T. commodus). Both have an XO sex determination system. Using three generations of crosses, we introgressed X c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Noroviruses (NoVs) have high levels of genetic sequence diversities, which lead to difficulties in designing robust universal primers to efficiently amplify specific viral genomes for molecular analysis. We here described the practicality of sequence-independent amplification combined with DNA microarray analysis for simultaneous detection and genotyping of human NoVs in fecal specimens. We showed that single primer isothermal linear amplification (Ribo-SPIA) of genogroup I (GI) and genogroup II (GII) NoVs could be run through the same amplification protocol without the need to design and use
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: We developed a new human papillomavirus (HPV) genotyping assay based on multiplex polymerase chain reaction and next-generation sequencing (NGS) methods for large-scale cervical cancer screening.
METHODS: We first trained the assay on 1,170 self-collected samples, balancing the cutoff points for high-risk types. Then using 4,262 separate self-collected specimens, we compared concordance, sensitivity, and specificity for cervical intraepithelial neoplasia type 2 (CIN2) or higher and CIN type 3 (CIN3) or higher of the HPV sequencing assay with that of Hybrid Capture 2 (HC2) direct s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Telomere erosion may be counteracted by telomerase. Here we explored telomere length (TL) and telomerase activity (TA) in primary cutaneous T-cell lymphoma (CTCL) by using quantitative polymerase chain reaction and interphase quantitative fluorescence in situ hybridization assays. Samples from patients with Sézary syndrome (SS), transformed mycosis fungoides (T-MF), and cutaneous anaplastic large cell lymphoma were studied in parallel with corresponding cell lines to evaluate the relevance of TL and TA as target candidates for diagnostic and therapeutic purposes. Compared with controls, short
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Over the last decade, small noncoding RNA molecules such as microRNAs (miRNAs) have emerged as critical regulators in the expression and function of eukaryotic genomes. It has been suggested that viral infections and neurological disease outcome may also be shaped by the influence of small RNAs. This has prompted us to suggest that HIV infection alters the endogenous miRNA expression patterns, thereby contributing to neuronal deregulation and AIDS dementia. Therefore, using primary cultures and neuronal cell lines, we examined the impact of a viral protein (HIV-1 Tat) on the expression of miRN
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Monosomy 1p36 is an increasingly recognized chromosomal anomaly. We describe two patients with monosomy 1p36 who had brain abnormalities detected on prenatal ultrasound. The first patient was ascertained prenatally with ultrasound abnormalities, including ventriculomegaly, a single umbilical artery, a unilateral club foot, a ventricular septal defect, and intra-uterine growth retardation. Amniocentesis showed a normal karyotype. A postnatal MRI showed moderate to severe non-obstructive hydrocephalus, bilateral colpocephaly, and abnormal myelination of the anterior limb of the internal capsule.
Клинический случайСтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Genomic profiling using next-generation sequencing (NGS) is fundamental for driving prognostic and therapy in cancer. Formalin-fixed paraffin embedded (FFPE) tissue is the widely used material, whereas non-FFPE may represent an alternative. However, studies comparing the NGS performance of non-FFPE materials to FFPE are still lacking in the literature. The objective of this study was to characterize in non-FFPE preparations the nucleic acid yield and NGS performance on both a capture-based and an amplicon-based NGS platform. NGS quality metrics obtained from non-FFPE preparations w
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To screen the genes with significant changes in DNA methylation level in active tuberculosis patients, we used the methylation chips and expanded the sample size to verify candidate genes.
METHODS: ① This study enrolled 9 cases of active tuberculosis patients, 3 cases of latent tuberculosis patients and 3 cases of healthy controls whose age and gender were all matched. Genome DNA was extracted from peripheral blood mononuclear cell in blood samples collected from these candidates, and bisulfite conversion treatment was then conducted. After hybridization with the Illumina HD 450K I
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: One of the important challenges in microarray analysis is to take full advantage of previously accumulated data, both from one's own laboratory and from public repositories. Through a comparative analysis on a variety of datasets, a more comprehensive view of the underlying mechanism or structure can be obtained. However, as we discover in this work, continual changes in genomic sequence annotations and probe design criteria make it difficult to compare gene expression data even from different generations of the same microarray platform.
RESULTS: We first describe the extent of di
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT.—: Comprehensive genomic profiling has demonstrated that approximately 20% of pancreatic carcinomas with acinar differentiation harbor potentially targetable BRAF fusions that activate the MAPK pathway.
OBJECTIVES.—: To validate the above finding by BRAF break-apart fluorescence in situ hybridization (FISH) in a large series of pure acinar cell carcinomas (ACCs), evaluate tumors for the presence of BRAF V600E mutations, and compare clinicopathologic features of tumors with BRAF rearrangements with those without.
DESIGN.—: Thirty cases of pure ACC and 6 cases of mixed acinar-neuroendo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: We systematically characterized metastatic murine B16-F10 melanoma, a sub-line derived from murine melanoma B16-F1 cells.
MATERIALS AND METHODS: RNA-sequencing and network analyses (Ingenuity Pathway Analysis) were performed to identify novel potential metastasis mechanisms. Chromosomal aberrations were identified by multicolor fluorescence in situ hybridization (mFISH) using all 21 murine whole chromosome painting probes.
KEY FINDINGS: Numerous genes were overexpressed in B16-F10 cells, some of which have been already described as being metastasis-linked. Nr5a1/sf1, a known prognostic
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: The spread of carbapenemase-producing Enterobacterales (CPE) with colistin resistance is a critical public health issue. We genetically characterized the clinical isolate Enterobacter roggenkampii OIPH-N260, which harboured carbapenemase genes blaIMP-1 and blaGES-5 with multiple resistance genes, including mcr-9 and blaCTX-M-9.
METHODS: This isolate was characterized by whole-genome sequencing, comparative analysis of resistance plasmids, susceptibility tests, bacterial conjugation, S1-nuclease digested pulsed-field-gel electrophoresis, and Southern blot hybridization.
RESULTS: T
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
G0 human lymphocytes were exposed in vitro to plutonium-239 alpha-particles, with doses ranging from 0 to 1.62 Gy, to provide a dose response curve and to compare complex rearrangements produced by high LET radiation with low LET data from previous work. Metaphase chromosomes 1 and 2 were painted using fluorescence in situ hybridization (FISH) whole chromosome probes. All unstable and stable aberrations involving the painted chromosomes were scored. The whole genome corrected alpha-coefficient for dicentrics was 0.244 +/- 0.023 and for total translocations 0.346 +/- 0.032, when considering sim
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The vitamin K-dependent gamma-carboxylation of glutamate to gamma-carboxyglutamate was originally well characterized in the mammalian blood clotting cascade. gamma-Carboxyglutamate has also been found in a number of other mammalian proteins and in neuropeptides from the venoms of marine snails belonging to the genus Conus, suggesting wider prevalence of gamma-carboxylation. We demonstrate that an open reading frame from a Drosophila melanogaster cDNA clone encodes a protein with vitamin K-dependent gamma-carboxylase activity. The open reading frame, 670 amino acids in length, is truncated at t
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования