Antibiotic resistance is recognized as a key determinant of outcome in patients with serious infections influencing empiric antibiotic practices especially for critically ill patients. Within the intensive care unit (ICU), nosocomial infections and increasingly community-onset infections are caused by multidrug-resistant bacteria. Escalating rates of antibiotic resistance adds substantially to the morbidity, mortality, and cost related to infections treated in the ICU. Both gram-positive organisms, such as methicillin-resistant Staphylococcus aureus and vancomycin-resistant enterococci, and gr
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To validate a multiplex qPCR (m-qPCR) assay for the simultaneous identification and quantification of Aggregatibacter actinomycetemcomitans and Porphyromonas gingivalis in subgingival samples.
MATERIAL AND METHODS: In vitro samples: DNA combinations of A. actinomycetemcomitans and P. gingivalis in similar or different concentrations were prepared. qPCR and m-qPCR were performed using the same primers and hydrolysis probes specific for 16SrRNA genes. Results were analyzed using intra-class (ICCs) and Lin's correlation coefficients (r) based on quantification cycle (Cq) values. Subgi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Neurofibromatosis type 1 (NF1) is a common autosomal dominant disorder caused by a heterozygous germline mutation in the tumor suppressor gene NF1. Because of the existence of highly homologous pseudogenes, the large size of the gene, and the heterogeneity of mutation types and positions, the detection of variations in NF1 is more difficult than that for an ordinary gene.
METHODS: In this study, we collected samples from 23 patients among 46 study participants from 12 unrelated Chinese families with NF1. We used a combination of Sanger sequencing, targeted next-generation sequenci
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Molecular drug susceptibility testing (DST) for antituberculosis drugs is important for improving the efficacy of multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) and extensively drug-resistant tuberculosis (XDR-TB) treatment. In this study, we developed a molecular high-throughput assay system based on allele-specific primer extension (ASPE) and MagPlex-TAG microspheres, referred to here as TAG-ASPE, which can detect mutations related to resistance to injectable second-line drugs and fluoroquinolones. Target genes were amplified by multiplex PCR using DNA from H37Rv and 190 clinical Mycobacterium tu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Diagnosis of drug-resistant tuberculosis predominantly relies on culture-based drug susceptibility testing, which take weeks to produce a result and a more time-efficient alternative method is multiplex allele-specific PCR (MAS-PCR). Also, understanding the role of mutations in causing resistance helps better drug designing.
AIMS: To evaluate the ability of MAS-PCR in the detection of drug resistance and to understand the mechanism of interaction of drugs with mutant proteins in Mycobacterium tuberculosis.
METHODS: Detection of drug-resistant mutations using MAS-PCR and validatio
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multiplex PCR tests have improved our understanding of respiratory viruses' epidemiology by allowing their wide range detection. We describe here the burden of these viruses in hospital settings over a five-year period.
METHODS: All respiratory samples from adult patients (>20 years old) tested by multiplex-PCR at the request of physicians, from May 1 2011 to April 30 2016, were included retrospectively. Viral findings are reported by season, patient age group, respiratory tract region (upper or lower) and type of clinical unit (intensive care unit, pneumology unit, lung transplan
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: In recent years, an increasing prevalence of macrolide resistance among pneumococci in Bangladesh has been observed. However, the scenario remains incomplete, as few isolates (<1%) are available from pneumonia cases and most pneumococcal meningitis cases (>80%) are culture-negative. This study optimised a triplex PCR method to detect macrolide resistance genes (MRGs) (mefA and ermB) and cpsA from culture-negative pneumococcal cases to predict the prevalence and level of macrolide resistance.
METHODS: The presence of MRGs among pneumococcal strains (n=153) with a wide range of eryt
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Patients with prostate cancer on active surveillance are monitored by repeat prostate specific antigen measurements, digital rectal examinations and prostate biopsies. A subset of patients on active surveillance will later reclassify with disease progression, prompting definitive treatment. To minimize the risk of under treating such patients on active surveillance minimally invasive tests are urgently needed incorporating biomarkers to identify patients who will reclassify.
MATERIALS AND METHODS: We assessed post-digital rectal examination urine samples of patients on active surveil
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-O1/non-O139 Vibrio cholerae inhabits estuarine and coastal waters globally, but its clinical significance has not been sufficiently investigated, despite the fact that it has been associated with septicemia and gastroenteritis. The emergence of virulent non-O1/non-O139 V. cholerae is consistent with the recognition of new pathogenic variants worldwide. Oyster, sediment, and water samples were collected during a vibrio surveillance program carried out from 2009 to 2012 in the Chesapeake Bay, Maryland. V. cholerae O1 was detected by a direct fluorescent-antibody (DFA) assay but was not succe
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we performed an evaluation of the new CE-marked multiplex real-time AmpliSens N.gonorrhoeae/C.trachomatis/M.genitalium/T.vaginalis-MULTIPRIME-FRT PCR assay compared to APTIMA tests, i.e., APTIMA COMBO 2 assay, APTIMA Trichomonas vaginalis assay (FDA-approved), and two different APTIMA Mycoplasma genitalium assays (research use only; one of them only used for discrepancy analysis). Vaginal swabs (n = 209) and first-void urine (FVU) specimens from females (n = 498) and males (n = 554), consecutive attendees (n = 1261) at a dermatovenerological clinic in Sweden, were examined. The
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stimulation of the G protein coupled receptor GPR120 has been shown to have anti-inflammatory and insulin-sensitizing effects, to promote glucagon like peptide-1 (GLP-1) secretion, and to play a key role in sensing dietary fat and control energy balance. In a search for differentially expressed genes potentially involved in food intake and body-weight regulation we identified GPR120 to be differentially regulated in the intestine of selectively bred diet induced obese (DIO) and diet resistant (DR) rats. Subsequently we investigated the effect of GPR120 receptor stimulation with the long chain
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Angiomyolipomas (AMLs) are relatively rare hamartomatous or benign tumors that occasionally occur as part of tuberous sclerosis complex (TSC). Mutations in either of the two genes, TSC1 and TSC2, have been attributed to the development of TSC. Between 1994 and January 2009, 83 patients were diagnosed with AML at the Samsung Medical Center. In that group of patients, 5 (6%) had AML with TSC (AML-TSC). Mutational analysis of the TSC2 gene was performed using 7 samples from the 5 AML-TSC patients and 14 samples from 14 patients with sporadic AML without TSC (AML-non-TSC). From this analysis, muta
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Antimicrobial resistance (AMR) in foodborne bacteria presents a significant threat to public health, especially in count … atory tests, and ESBL-producing isolates were screened for bla TEM, bla CTX-M, and bla SHV genes by multiplex polymerase chain reaction. All isolates were further examined for select virulence genes linked to major E. coli pathotypes.
RESULTS: Overall, 97.4% of E. coli isolates showed resistance to at least one antimicrobial agent, and 87.3% were classified as MDR. ESBL-producing E …
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The term food borne diseases or food-borne illnesses or more commonly food poisoning are used to denote gastrointestinal complications that occur following recent consumption of a particular food or drink. Millions of people suffer worldwide every year and the situation is quiet grave in developing nations creating social and economic strain. The food borne pathogens include various bacteria viz., Salmonella, Campylobacter, Escherichia coli, Listeria monocytogenes, Yersinia enterocolitica, Staphylococcus, Arcobacter, Clostridium perfringens, Cl. botulinum and Bacillus cereus and helminths viz.
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: α1-Antitrypsin deficiency (AATD) is a common, underdiagnosed disease caused by mutations in the polymorphic SERPINA1 gene. AATD often causes COPD, other respiratory ailments, and severe liver disease. AATD underdiagnosis is associated with the lack of a quick, high-precision test for SERPINA1 variants.
RESEARCH QUESTION: Can a rapid and more accurate molecular diagnostic assay be developed that identifies AATD-associated mutations and outperforms current limited methodology?
STUDY DESIGN AND METHODS: We developed a multiplexed polymerase chain reaction (PCR) assay that that uses
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: The Xinjiang Uygur Autonomous Region (Xinjiang) currently exhibits the high incidence rates of invasive meningococcal disease (IMD) in China. Current epidemiological data on meningococcal carriage rates among asymptomatic individuals remain sparse, with limited population-based studies systematically investigating the prevalence of Neisseria meningitidis colonization in the general population. This study employs a dual-pronged epidemiological approach to systematically characterize the clinical-epidemiological profile of IMD in Xinjiang and quantify the nasopharyngeal carriage preva
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: Staphylococcus aureus (S. aureus) is a zooanthroponotic, nosocomial, and community-associated pathogen that threatens livestock management and even public health. The goal of this investigation was to clarify the role of S. aureus in zoonotic illnesses. Besides that, a novel trial was conducted in the current Egyptian study using oil extracts such as cactus oil, tea oil, geranium oil, and thyme oil to demonstrate the susceptibility of methicillin-resistant S. aureus (MRSA) isolates to these organic oils in response to the alarming global concern regarding the decreased susceptibilit
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
ABSTRACT Diagnostic assays for the detection of St. Louis encephalitis (SLE) and western equine encephalomyelitis (WEE) viruses in mosquito pools and avian tissues were compared for sensitivity, accuracy and specificity. The in situ enzyme immunoassay (EIA), plaque assay on Vero cells, passage in Aedes albopictus Skuse C6/36 and C7/10 cells, antigen capture enzyme immunoassay (AC-EIA), and single and multiplex reverse transcription-polymerase chain reactions (RT-PCR) were evaluated using pools of 50 mosquitoes containing 1-2 experimentally infected individuals. RT-PCR was the most sensitive as
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Polymorphisms of the CC chemokine receptor 6 (CCR6) and RNASET2 tag SNP have been shown to be associated with the susceptibility … 3024/rs6902119) and one tagging SNP (rs9355610) within RNASET2 gene were selected for genotyping by multiplex polymerase chain reaction (PCR) and ligase detection reaction (LDR).
RESULTS: The frequency of rs9355610 genotypes in the patients with GD differed significantly from that in the controls (p = 0.017). The frequency of the minor G allele of rs9355610 was significantly higher …
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Klebsiella variicola was very recently described as a new bacterial species and is very closely related to Klebsiella pneumoniae; in fact, K. variicola isolates were first identified as K. pneumoniae. Therefore, it might be the case that some isolates, which were initially classified as K. pneumoniae, are actually K. variicola. The aim of this study was to devise a multiplex-PCR probe that can differentiate isolates from these sister species.
RESULT: This work describes the development of a multiplex-PCR method to identify K. variicola. This development was based on sequencing a K
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.