Multi-omics data integration holds great promise for precision medicine, yet its clinical adoption is hindered by high acquisition costs and the complexity of heterogeneous data representations. To address these challenges, we propose an uncertainty-aware multi-view dynamic decision framework for efficient and trustworthy disease classification. Unlike conventional static fusion strategies, our approach leverages evidential deep learning grounded in Dempster-Shafer theory to explicitly disentangle predictive confidence from epistemic uncertainty, enabling cost-sensitive and progressive inferen
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MOTIVATION: Single-cell chemical perturbation profiling offers a powerful opportunity to organize drugs by shared mechanism-associated transcriptional responses, but observed transcriptional responses are entangled with contextual variation from cell identity, dose, and treatment time. As a result, models that perform well in perturbation-response prediction may still learn latent spaces dominated by context-associated structure rather than transferable drug-associated signal. We developed DECANT to learn mechanism-aligned perturbation representations that remain stable across context shifts w
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Estimating malaria parasite migration is crucial for informing elimination strategies, particularly by identifying regions with higher parasite migration that may serve as transmission sources and intervention targets. Methods that infer spatial variations in gene flow from georeferenced genetic data, including Estimated Effective Migration Surfaces (EEMS) and related approaches such as estimating Migration And Population-size Surfaces (MAPS), have become widely used to visualize barriers and corridors of organism movement. However, when sampling locations are sparse or unevenly distributed, s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Medicinal plants remain one of the most important sources of therapeutically relevant compounds for pharmaceutical, nutraceutical, and biotechnological applications. However, the naturally low abundance of many specialized metabolites, considerable phytochemical variability, and increasing environmental pressures continue to limit the sustainable exploitation of plant-derived bioactive compounds. This review summarizes current strategies aimed at identifying, understanding, and enhancing the production of medicinally valuable metabolites while highlighting both biological limitations and emerg
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The heterogeneity of ovarian cancer (OV) poses significant challenges to disease subtype classification, risk stratification, and precision clinical management. Therefore, this study developed a prognostic model based on perioperative anesthesia-related drug target genes (PARDTGs) to find the clinical significance of PARDTGs in OV patients. This study comprehensively analyzed PARDTGs in OV by integrating multi-omics data, including bulk transcriptomic data, single-cell RNA-sequencing (scRNA-seq) data, and spatial transcriptomic data. Based on the expression characteristics of PARDTGs, we devel
СтатьяVideo-Audio MediaПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Parkinson's disease (PD), a degenerative disorder affecting the nervous system, manifests as unbalanced movements, stiffness, tremors, and coordination difficulties. Its cause, believed to involve genetic and environmental factors, underscores the critical need for prompt diagnosis and intervention to enhance treatment effectiveness. Despite the array of available diagnostics, their reliability remains a challenge. In this study, an innovative predictor PADG-Pred is proposed for the identification of Parkinson's associated biomarkers, utilising a genomic profile. In this study, a novel predict
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Psoriasis is a chronic skin disease, and topical sequential therapy with a combination of calcipotriol and calcipotriol betamethasone is currently approved topical treatment. However, the exact mechanism by which this treatment regimen relieves psoriasis is unknown.
METHOD: We assembled a cohort of 65 psoriasis patients and divided post-treatment cohort into responder group and non-responder group according to the Psoriasis Area Severity Index (PASI) score after 12-week treatment. We measured the expression levels of proteins in collected 130 serum samples using our in-depth prote
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Genomic bioinformatics analysis identified a bafilomycin biosynthetic gene cluster (named bfl) in the deepsea-derived S. samsunensis OUCT16-12, from which two new (1 and 2, named bafilomycins R and S) along with four known (3-6) bafilomycins were targetly obtained. The structure of 3 was clearly identified for the first time, thus named bafilomycin T herein. Differ from the fumarate substitution at C-21 of known bafilomycins, its location on C-23 is a unique feature of 1 and 2. The stereochemistry of the compounds was established based on NOE correlations, ketoreductase (KR)-types in PKS modul
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To explore the pathogenic variants and clinical classification of two fetuses with Short-rib thoracic dysplasia with or without polydactyly (SRTD).
METHODS: With informed consent obtained, the phenotypic characteristics of the fetuses were comprehensively examined, and genomic DNA was extracted from fetal skin tissue and peripheral blood samples of the parents with conventional phenol-chloroform method. Whole exome sequencing (WES) was carried out on both fetuses, and the candidate variants were validated by Sanger sequencing. The pathogenicity of the candidate variants was analyze
Аннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although many biomarkers associated with coronavirus disease 2019 (COVID-19) were found, a novel signature relevant to immune cells has not been developed. In this work, the "CIBERSORT" algorithm was used to assess the fraction of immune infiltrating cells in GSE152641 and GSE171110. Key modules associated with important immune cells were selected by the "WGCNA" package. The "GO" enrichment analysis was used to reveal the biological function associated with COVID-19. The "Boruta" algorithm was used to screen candidate genes, and the "LASSO" algorithm was used for collinearity reduction. A nove
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recent advances in developmental, molecular and cellular biology as well as biomedical technologies show a promising future for crossing the gap between biomedical basic sciences and clinical orthodontics. Orthodontic research shall utilise the advances and technologies in biomedical fields including genomics, molecular biology, bioinformatics and developmental biology. This review provides an update on the novel and promising evolutions in biomedicine and highlights their current and likely future implementation to orthodontic practice. Biotechnological opportunities in orthodontics and dento
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Periodontal disease (PD) is a chronic inflammation of the soft tissues that support the structure of the tooth, and miRNAs are highly dynamic molecules that participate in the regulation of gene expression interfering with multiple genetic targets. The dysregulation of the expression of miRNAs has been associated with different types of pathologies; therefore, they are excellent molecules to be studied as biomarkers. Material and Methods. A search was made in the electronic databases of PubMed, Scopus, and Science Direct. The following key words were used: "microRNAs," "miRNAs,"
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Long noncoding RNAs (lncRNAs), which is essential in regulating multiple biological functions, have been found to have pivotal roles in immune regulation. Since immune reaction and immunocytes are the key part in periodontitis progression, we aim to investigate the underlying lncRNA-immunity regulatory network of periodontitis.
METHODS: A series of bioinformatic algorithms were used to identify immune-related lncRNAs in periodontitis. Infiltrating immunocyte were calculated by MCP-count. Pathway activity were estimated by the GSVA. The relationships between immune-related lncRNA a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Nowadays, because of the huge economic burden on society causing by obesity and diabetes, they turn into the most serious public health challenges in the world. To reveal the close and complex relationships between diabetes, obesity and other diseases, search the effective treatment for them, a novel model named as representative latent Dirichlet allocation (RLDA) topic model is presented.
RESULTS: RLDA was applied to a corpus of more than 337,000 literatures of diabetes and obesity which were published from 2007 to 2016. To unveil those meaningful relationships between diabetes m
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Complex data driven experiments form the basis of biomedical research. Recent findings warn that the context in which the software is run, that is the infrastructure and the third party dependencies, can have a crucial impact on the final results delivered by a computational experiment. This implies that in order to replicate the same result, not only the same data must be used, but also it must be run on an equivalent software stack. In this paper we present the VFramework that enables assessing replicability of workflows. It identifies whether any differences in software dependencies among t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Actinobacillus suis disease has been reported in a wide range of vertebrate species, but is most commonly found in swine. A. suis is a commensal of the tonsils of the soft palate of swine, but in the presence of unknown stimuli it can invade the bloodstream, causing septicaemia and sequelae such as meningitis, arthritis, and death. It is genotypically and phenotypically similar to A. pleuropneumoniae, the causative agent of pleuropneumonia, and to other members of the family Pasteurellaceae that colonise tonsils. At present, very little is known about the genes involved in attachme
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Many metrics are currently used to evaluate the performance of ranking methods in virtual screening (VS), for instance, the area under the receiver operating characteristic curve (ROC), the area under the accumulation curve (AUAC), the average rank of actives, the enrichment factor (EF), and the robust initial enhancement (RIE) proposed by Sheridan et al. In this work, we show that the ROC, the AUAC, and the average rank metrics have the same inappropriate behaviors that make them poor metrics for comparing VS methods whose purpose is to rank actives early in an ordered list (the "early recogn
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The method of invariants is an important approach in biology for determining phylogenetic information which avoids the problems involving long branch lengths that plague some other methods. In this paper, we present a geometric framework underlying the method of invariants. This perspective sheds new lights on problems in the field. It has recently enabled the solution of questions on the number and structure of phylogenetic invariants and suggests possible avenues for future empirical and theoretical research.
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Predicting complex phenotypes from plant-microbiome multi-omics data has advanced significantly with machine learning and deep learning. However, traditional black-box models remain limited by their focus on predictive performance rather than mechanistic biological understanding. To bridge this gap, explainable artificial intelligence (XAI) has emerged as a key framework to transform biological data analysis from correlation mapping to hypothesis-driven discovery. This review synthesizes current advances in XAI methodologies, including post hoc feature attribution techniques and intrinsically
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования