INTRODUCTION: Sida cordifolia (SC) is traditionally used for treat inflammatory disorders; however, its molecular composition and the mechanistic basis of action remain poorly characterized. This study aimed to identify its bioactive constituents and elucidate their multi-target anti-inflammatory potential using an integrated computational and experimental approach.
METHODS: Phytochemical profiling of the ethanolic extract was performed using LC-MS. The identified phytoconstituents were evaluated for their pharmacokinetic and toxicity profiles using in silico ADMET prediction. Molecular docki
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oestrogen receptor alpha (ERα) is a driver of hormone-dependent breast cancer, yet current therapies are often hindered by drug resistance and adverse effects. In this study, we developed a structure-based virtual screening workflow to identify novel quinoxaline derivatives as computationally prioritized potential ERα modulators. The quinoxaline analogues obtained from PubChem are screened through validated docking model of ERα. The top-ranked candidates were further refined by MD simulations in GROMACS for 300 ns to assess complex stability and interaction persistence, followed by MM-PBSA bin
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Cyanide (CN-) is a highly toxic anion with significant environmental and biological implications, necessitating the development of sensitive and selective detection platforms. In this work, we reported the design and synthesis of a novel excited-state intramolecular proton transfer (ESIPT)-based chemosensor (TSB) derived from 2-hydroxy-1-naphthaldehyde and 4-amino-1,2,4-triazole. Computational studies, including time-dependent density functional theory (TD-DFT), reduced density gradient scatter plots, and simulated infrared spectra, reveal the prevalence of strong intramolecular hydrogen bonds
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: This study investigates the impact of 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin (TCDD) on the pathogenesis of gastric cancer and its associated molecular mechanisms, particularly the interaction between TCDD and key targets and pathways.
METHODS: We employed various machine learning techniques and online databases to perform differential expression analysis on bulk gastric cancer sequencing data and organoid sequencing data to identify target genes and pathways related to TCDD and gastric cancer. A risk prediction model based on the expression levels of key intersection target genes was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Male EBP disorder with neurologic defects (MEND syndrome) is an extremely rare disorder with a prevalence of less than 1/1,000,000 individuals worldwide. It is inherited as an X-linked recessive disorder caused by impaired sterol biosynthesis due to nonmosaic hypomorphic EBP variants. MEND syndrome is characterized by variable clinical manifestations including intellectual disability, short stature, scoliosis, digital abnormalities, cataracts, and dermatologic abnormalities. The goal of this study was to investigate the disease-causing variants in a family of two patients affected
СтатьяКлинический случайПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori is a Gram-negative microaerophilic gastric pathogen, responsible for the cause of peptic ulcer around half of the global population. Although several antibiotics and combination therapies have been employed for H. pylori-related gastric ulcer and cancer regiments, identifying potent inhibitors for specific targets of this bacterium will help assessing better treatment periodicity and methods to eradicate H. pylori. Herein, 1,000,000 natural compounds were virtually screened against Helicobacter pylori Peptide deformylase (HpPDF). Pharmacophore hypotheses were created using
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
New complex compounds (I) - (IV) were synthesized by the reaction of 1-(2-fluorofluorophenyl) -1,4-dihydro-5H-tetrazole-5-thione (HL1), 1-(2-methylphenyl)-1,4-dihydro-5H-tetrazole-5-thione (HL2) and 1-(2-chlorochlorophenyl)-1,4-dihydro-5H-tetrazole-5-thione (HL3) with cadmium chloride. By X-ray diffraction analysis, molecular and crystal structures of complexes (I), (II), (III) and (IV) are determined. (CIF files CCDC № 2,003,797 (I), 1,993,454 (II), 2,151,359 (III), 2,098,997 (IV)). Hirshfeld surface analysis, frontier orbital analysis, atomic charges, electrostatic potential, nonlinear optic
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study aimed to screen putative drug targets associated with biofilm formation of multidrug-resistant Acinetobacter baumannii and Pseudomonas areugenosa and prioritize carbon nano-fullerene as potential lead molecule by structure-based virtual screening. Based on the functional role, 36 and 83 genes that are involved in biofilm formation of A. baumannii and P. areugenosa respectively were selected and metabolic network was computationally constructed. The genes that lack three-dimensional structures were predicted and validated. Carbon nano-fullerene selected as lead molecule and their dru
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We evaluated the specific binding of anti-intercellular adhesion molecule 1 (ICAM-1) conjugated liposomes (immunoliposomes, or ILs) to activated human coronary artery endothelial cells (HCAEC) with the purpose of designing a computed tomographic imaging agent for early detection of atherosclerotic plaques. Covalent attachment of anti-ICAM-1 monoclonal antibodies to pre-formed liposomes stabilized with polyethylene glycol yielded ILs, with a coupling efficiency of the ICAM-1 to the liposomes of 10% to 24%. The anti-ICAM-1-labeled ILs had an average diameter of 136 nm as determined by dynamic li
СтатьяПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Quantum computers offer the potential to simulate chemical systems beyond the capabilities of classical computers. However, current quantum computing approaches to ab initio molecular dynamics (AIMD) and vibrational analysis largely rely on the Variational Quantum Eigensolver (VQE), whose circuit depth, iterative optimization, and measurement overhead hinder the practical simulation of molecular systems. Here, we extend Sample-based Quantum Diagonalization (SQD), a quantum sampling-based electronic-structure method, to AIMD and vibrational analysis on noisy quantum hardware. The resulting fram
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Molecular imaging better identifies anatomic regions of metastatic spread of prostate cancer compared with conventional imaging, resulting in para-aortic (PA) nodal metastases being increasingly identified. Consequently, some radiation oncologists electively treat the PA lymph node region in patients with gross or high risk of PA nodal involvement. The anatomic locations of at-risk PA lymph nodes for prostate cancer are unknown. Our objective was to use molecular imaging to develop guidelines for the optimal delineation of the PA clinical target volume (CTV) in patients with prostate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: In the context of human immunodeficiency virus (HIV) treatment, the emergence of therapeutic failures with existing antiretroviral drugs presents a significant challenge. This study aims to employ advanced molecular modeling techniques to identify potential alternatives to current antiretroviral agents.
METHODS: The study focuses on three essential classes of antiretroviral drugs: nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs), non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NNRTIs), and protease inhibitors (PIs). Computational analyses were performed on a database of 3,343,
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, we conducted a comprehensive analysis of the interactions between the receptor-binding domain (RBD) of the SARS-CoV-2 spike protein and four neutralizing antibodies-S309, S304, CYFN1006, and VIR-7229. Using integrative computational modeling that combined all-atom molecular dynamics (MD) simulations, mutational scanning, and MM-GBSA binding free energy calculations, we elucidated the structural, energetic, and dynamic determinants of antibody binding. Our findings reveal distinct dynamic binding mechanisms and evolutionary adaptation driving the broad neutralization effect of th
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Schiff base (E)-4-((2-hydroxy-3,5-diiodobenzylidene)amino)-N-(pyrimidine)-2-yl) benzene sulfonamide (DIDA) compound was synthesis with condensation of 3,5-diiodosalicylaldehyde and sulfadiazine. The compound characterized with FTIR, X-ray crystallography and electronic spectra. The titled compound associated with experimental and theoretical method, DFT used for the theoretical method. The IR was calculated from DFT mode with B3LYP/GENSEP basic set. The electronic spectra computed from TD-DFT method with CAM-B3LYP functional, with IEFPCM solvation model and DMSO used as the solvent. Wave f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The discovery of NDM-1 and its variants has caused the emergence of antibiotic resistance in the community and hospital setting, causing major concern for health care across the globe. New Delhi Metallo-β-lactamase is known to hydrolyse almost all β-lactam antibiotics. Studies have shown the hydrolytic activates of NDM-1 and some of its variants, however a comparative study of these NDM variants has not been explored in detail. Hence, we proposed to check their catalytic activity by performing a comparative study between NDM-1 and its variants. The study was initiated to clone NDM variants (ND
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The characterization and synthesis of 3-chloro-2-{(2E)-2-[1-(4-chlorophenyl)ethylidene]hydrazinyl}pyridine (CCPEHP) was investigated in our study. Mass and UV-visible spectra were recorded in chloroform solvent. The CCPEHP molecule containing pyridine and chlorophenyl rings and hydrazone group crystallized in the triclinic system and P-1 space group. FTRaman and FTIR spectra were performed in the solid state. The optimized geometry of CCPEHP was computed by DFT/B3LYP method with 6-311 G (d, p) and 6-31 G (d, p) levels. The computed vibrational analysis, electronic absorption spectrum, electron
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Computational approaches are widely applied in drug discovery to explore properties related to bioactivity, physiochemistry, and toxicology. Over at least the last 20 years, the exploitation of machine learning on molecular data sets has been used to understand the structure-activity relationships that exist between biomolecules and druggable targets. More recently, these methods have also seen application for phenotypic screening data for neglected diseases such as tuberculosis and malaria. Herein, we apply machine learning to build quantum Quantitative Structure Activity Relationship models
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neutralizing antibodies targeting the SARS-CoV-2 spike receptor-binding domain (RBD) exhibit distinct patterns of potency, breadth, and resilience, yet the molecular mechanisms underlying these differences remain incompletely understood. Here, we employ an integrated computational framework combining structural analysis, conformational dynamics, mutational scanning, binding energetics, and allosteric network modeling to systematically dissect Class 3 and Class 4 antibodies. Analysis of single-antibody complexes (COV2-3835, COV2-3891, COV2-3906) and synergistic dual-antibody pairs reveals a fun
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A series of novel pyrimidine-based benzothiazole/phenyl hybrids was rationally designed and synthesized via molecular hybridization to develop promising anticancer agents. The compounds were evaluated against human lung carcinoma (A549) and breast adenocarcinoma (MCF-7) cell lines, while HEK-293 cells were used to assess selectivity toward normal cells. Among the derivatives, K12, K5, and K4 showed potent activity against A549 cells, with IC50 values of 6.18, 7.01, and 7.54 μM, respectively. K5 and K12 also showed significant activity against MCF-7 cells, with IC50 values of 8.33 and 9.30 μM,
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Many kinds of orchids have significant health benefits although adequate research on their biological functions is yet to be carried out. This study investigated the paracetamol-induced liver damage-protecting effect of epiphytic Aerides odorata methanol extract (AODE).
METHODS: The protective effects of AODE were studied by analyzing its effect on liver function parameters, messenger RNA (mRNA) expression, and tissue histopathological architecture. The results were confirmed by ligand-receptor interaction of molecular docking and multitarget interaction of network pharmacological
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования