The alkA gene of Escherichia coli encodes a DNA glycosylase involved in base excision repair of DNA alkylation damage. In an attempt to define the reactions of the AlkA enzyme with methylated DNA, we discovered that the enzyme released substantial amounts of radioactivity from [methyl-3H]thymidine-labeled DNA even without any exposure of the DNA to methylating agents. The excised material was identified by chromatography as two different oxidized derivatives of thymine, 5-hydroxymethyluracil and 5-formyluracil. These products are formed in such DNA by one and two consecutive decays, respective
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ku protein is a relatively abundant DNA-binding protein which was first detected as the autoantigen in a patient with scleroderma-polymyositis overlap syndrome (hence the name 'Ku'). It is a heterodimer of two polypeptide chains of molecular weights 85,000 and 72,000, and it characteristically binds, in vitro, to the ends of DNA fragments, and translocates to form regular multimeric complexes, with one protein bound per 30 bp of DNA. We have studied the mechanism of interaction of Ku protein with DNA in vitro, using protein extracted from cultured monkey cells. We find that the precise structu
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this work, we have characterized the interactions of monospermine porphyrin derivative with calf thymus DNA (ct-DNA) and poly (dG-dC)2 in both B and Z conformation. By several spectroscopic techniques (UV-vis, electronic circular dichroism and resonance light scattering), the binding modes of monospermine porphyrin derivative with different DNA sequences have been elucidated. In the presence of ct-DNA, the porphyrin binds along the external double helix as well as in the presence of B conformation of poly (dG-dC)2 . Whilst when the Z form of the poly (dG-dC)2 is induced, a slight intercalat
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We report our studies on the adsorption properties of double-stranded DNA molecules on mica surfaces in a confined environment using a surface force apparatus. Specifically, we studied the influence of cation species and concentrations on DNA adsorption properties. Our results indicated that divalent cations (Mg(2+) and Co(2+)) preferred to form uniform and moderately dense DNA layers on a mica substrate. By measuring the interactions between DNA-coated mica and bare mica in an aqueous solution, obvious adhesion was observed in a cobalt chloride solution, possibly due to the ion-correlation at
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Oxidative damage to DNA may play an important role in aging and neurodegenerative diseases such as Alzheimer's disease (AD). Attack on DNA by reactive oxygen species, particularly hydroxyl radicals, can lead to strand breaks, DNA-DNA and DNA-protein cross-linking, sister chromatid exchange and translocation, and formation of at least 20 oxidized base adducts. Modification of DNA bases can lead to mutation and altered protein synthesis. In late-stage AD brain, several studies have shown an elevation of the base adducts 8 hydroxyguanine (8-OHG), 8-hydroxyadenine (8-OHA), 5-hydroxycytosine (5-OHC
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Human papilloma virus infection may have a latent form without characteristic changes in Pap-smears. Some data suggests there exists a possibility of materno-foetal transmission of the HPV infection. HPV infection may be one of the possible reasons for IUGR.
AIM: The main aim of the study was to find DNA HPV in the Pap-smear and placentas in pregnancy complicated by the intrauterine growth restriction.
MATERIAL AND METHODS: In two groups of women with normal Pap-smears, the material for DNA presence was taken from the uterine cervix and from the central part of placenta after the
Сравнительное исследованиеАннотация на английскомСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Cancer is a very dangerous disease whose treatment can be improved by removing the factors that cause side effects if the drugs prescribed for cancer are chiral in nature.
OBJECTIVES: A computational evaluation for the most biologically active enantiomeric form of chiral drugs attacking the DNA of the cell, was made for the first time, and compared with the experimental work done by others previously.
METHODS: All the enantiomeric structures of the drugs taken in the present study were obtained using Marvin sketch, and the structure of DNA to be docked with enantiomers, was obtai
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Optically active liquid-crystalline dispersions (LCD) of nucleic acids, obtained by polymer- and salt-induced (psi-) condensation, e.g., by mixing of aqueous saline solutions of low molecular weight DNA (≤106 Da) and polyethylene glycol (PEG), possess an outstanding circular dichroism (CD) signal (so-called psi-CD) and are of interest for sensor applications. Typically, such CD signals are observed in PEG content from ≈12.5% to ≈22%. However, in the literature, there are very conflicting data on the existence of psi-CD in DNA LCDs at a higher content of crowding polymer up to 30-40%. In the pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sparfloxacin, a quinolone antibacterial agent, frequently elicits photosensitive skin reactions. Our clinical studies of patients treated with sparfloxacin have demonstrated that this photosensitivity is primarily phototoxic and that a marked erythematous response is induced by sequential irradiation with ultraviolet A (UVA) and B (UVB) but not UVA or UVB alone, suggesting potential synergism between UVA and UVB. We evaluated the phototoxicity of this agent using in vitro DNA breaking activity and in vivo murine cutaneous responses. Sparfloxacin induced DNA strand breaks in vitro and converted
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Nanoscale bilayer mimetics such as protein or polymer-based nanodiscs are versatile tools to study the physical chemistry of lipid bilayers or the structures and functions of membrane proteins. Here, we introduce DNA-lipid nanodiscs (DLNs) in which the interface between hydrophobic lipids and the charged DNA is mediated through amphiphilic poly(ethylene)glycol (PEG). For this, we modified oligonucleotides with PEG and hybridized them to a single-stranded ring to form functionalized minicircles with a well-defined diameter. The center of these minicircles can be filled with a lipid bilayer thro
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artemis nuclease and DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (DNA-PKcs) are key components in nonhomologous DNA end joining (NHEJ), the major repair mechanism for double-strand DNA breaks. Artemis activation by DNA-PKcs resolves hairpin DNA ends formed during V(D)J recombination. Artemis deficiency disrupts development of adaptive immunity and leads to radiosensitive T- B- severe combined immunodeficiency (RS-SCID). An activated state of Artemis in complex with DNA-PK was solved by cryo-EM recently, which showed Artemis bound to the DNA. Here, we report that the pre-activated form (basa
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little is known about endogenous systemic lupus erythematosus (SLE) plasma DNA even though it is the presumed precursor of DNA-containing immune complexes, thought to play a central role in lupus glomerulonephritis. DNA purified from SLE plasma formed discrete bands, corresponding to sizes of about 150-200, 400, 600, and 800 bp, closely resembling the characteristic 200 bp "ladder" found with oligonucleosomal (ON) DNA. By radiolabeling DNA while in whole plasma, the very small amounts present could be further characterized. All of 24 such specimens formed two or more discrete bands on 6% PAGE.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: We studied the fine structure of DNA damage produced by the decay of 111In incorporated into duplex and triplex DNA strands to evaluate the usefulness of this radionuclide for sequence-specific DNA cleavage.
METHODS: Oligodeoxyribonucleotides (ODNs) were prepared with 111In attached by diethylenetriaminepentaacetic acid (DTPA) at the 5' end or 3' end through a long chemical linker or to an internal nucleotide position through a short linker. Subsequent formation of DNA duplexes and triplexes was confirmed by gel electrophoresis. The 111In-induced breaks were assayed in denaturing
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia trachomatis is an obligate intracellular bacterium that is responsible for the most prevalent bacterial sexually transmitted infections. Changes in DNA topology in this pathogen have been linked to its pathogenicity-associated developmental cycle. Here, evidence is provided that the balanced activity of DNA topoisomerases (Topos) contributes to Chlamydia developmental processes. Utilizing catalytically inactivated Cas12 (dCas12) based-clustered regularly interspaced short palindromic repeats interference (CRISPRi) technology, we demonstrate targeted knockdown of chromosomal topA tran
ПрепринтСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two families of DNA glycosylases (YtkR2/AlkD, AlkZ/YcaQ) have been found to remove bulky and crosslinking DNA adducts produced by bacterial natural products. Whether DNA glycosylases eliminate other types of damage formed by structurally diverse antibiotics is unknown. Here, we identify four DNA glycosylases-TxnU2, TxnU4, LldU1 and LldU5-important for biosynthesis of the aromatic polyketide antibiotics trioxacarcin A (TXNA) and LL-D49194 (LLD), and show that the enzymes provide self-resistance to the producing strains by excising the intercalated guanine adducts of TXNA and LLD. These enzymes
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The Escherichia coli uropathogenic-specific protein (Usp) is a bacteriocin-like genotoxin, active against mammalian cells and associated with E. coli strains that provoke pyelonephritis, prostatitis and bacteraemia. Usp is encoded by a small pathogenicity island with three downstream small open reading frames (Imu1-3) that are believed to provide immunity to the producer. To prevent host suicide, colicins, bacteriocins of E. coli, form tight complexes with their cognate immunity proteins. Colicin - immunity protein complexes are among the strongest protein complexes known. Here, th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The purpose of this work is to review stability and activation properties of type I receptor, in order to explain the reasons for its extreme in vitro instability. We demonstrate that the treatment of rat kidney cytosol with H2O2 prevents aldosterone binding, DNA/steroid-receptor complex interactions, and prevents the receptor thermal inactivation. In contrast, exogenous sulfhydryl reducing reagents are necessary to insure maximum binding of mineralocorticoid receptor and DNA/steroid-receptor interaction. However, the presence of beta-mercaptoethanol in thermal induced incubations reverts the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The XP cell strain XP29MA, its malignant counterpart XP29MAmal and a normal human fibroblast strain were tested for colony-forming ability after treatment with HECNU in the presence of m6G, m6Gua, and he7G. In XP29MAmal, inhibition of post-HECNU colony-forming ability was 35% when 0.25 mM of either m6G or m6Gua were present, whereas in XP29MA and the normal fibroblast strain no inhibition was detected. The he7G caused a similar but smaller inhibitory effect in XP29MAmal, but failed to do so in XP29MA. HECNU predominantly exerts its killing effect by alkylating O-6 of DNA-bound guanine and caus
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In this study, a one-step method is discussed for producing uniform cell-sized microgels using glass capillaries filled with a binary polymer blend of polyethylene glycol (PEG) and gelatin. Upon decreasing temperature, phase separation of the PEG/gelatin blends and gelation of gelatin occur, and then the polymer blend forms linearly aligned, uniformly sized gelatin microgels in the glass capillary. When DNA is added to the polymer solution, gelatin microgels entrapping DNA are spontaneously formed, and the DNA prevents the coalescence of the microdroplets even at temperatures above the melting
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The DNA replication of mpox virus is performed by the viral polymerase F8 and also requires other viral factors, including processivity factor A22, uracil DNA glycosylase E4, and phosphoprotein H5. However, the molecular roles of these viral factors remain unclear. Here, we characterize the structures of F8-A22-E4 and F8-A22-E4-H5 complexes in the presence of different primer-template DNA substrates. E4 is located upstream of F8 on the template single-stranded DNA (ssDNA) and is catalytically active, highlighting a functional coupling between DNA base-excision repair and DNA synthesis. Moreove
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования