A hexanucleotide repeat expansion in C9orf72 is the most common genetic cause of amyotrophic lateral sclerosis and frontotemporal dementia. While repeat RNAs are implicated in disease pathogenesis, their mechanisms of action remain incompletely understood. Here, we show that GGGGCC repeat RNA engages chromatin genome-wide preferentially at promoter regions in patient cells. This interaction obstructs RNA polymerase II and transcription factors with GC-rich motifs, leading to broad transcriptional repression. Biochemical assays, single-molecule imaging, and native bisulfite sequencing analyses
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: We evaluated the clinical significance of human papilloma virus (HPV) screening in premalignant cervical lesions.
METHODS: This prospective study was performed at Dicle University, School of Medicine, Department of Obstetrics and Gynecology, from January 2009 to June 2009. A total of 60 cases were evaluated. Thirty cases had premalignant cervical lesions. The prevalence of HPV was analyzed by polymerase chain reaction and types determined by Hybrid Capture II. The cases that had premalignant cervical lesions were evaluated with colposcopy. Statistical analyses were carried out by usi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Multiple genetic and epigenetic alterations in several genes are implicated in the multistep process of human gastric carcinogenesis. In this study, we examined the polymorphisms of six DNA repair genes: APE1, HOGG1, XRCC1, XRCC3, XPD, and XPG in patients with gastric cancer (GC).
PATIENTS AND METHODS: Forty patients with GC and 247 controls were included in this study. DNA polymorphisms were determined by polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) method.
RESULTS: The frequency of the Asp/Glu genotype and Glu allele of APE1 in patients wi
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Two factors, is classification and its immunogenetics, may have contributed to an incomplete understanding of the pathogenic mechanism in the disease group commonly termed 'cicatricial pemphigoid'. We have previously demonstrated that pure ocular cicatricial pemphigoid (OCP) is a unique clinical and immunopathological entity. In an effort to better define the immunogenetic characteristics for patients with pure OCP, we performed HLA typing for the class II MHC gene HLA-DQB1*0301 allele, by amplifying genomic DNA extracted from patients with polymerase chain reaction, followed by hybridization
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Eight unrelated patients with Hunter syndrome were investigated for expression of iduronate-2-sulfatase (IDS) mRNA by reverse transcription (RT) linked to polymerase chain reaction (PCR), or RT-PCR. The entire coding region was studied by amplification of two overlapping segments of 0.7 and 1.1 kb. Seven children with Hunter syndrome had PCR products indistinguishable in size from normal. One patient, with clinically severe disease, did not produce either IDS product although mRNA for a control gene was readily amplified. This method rapidly identifies patients having absent or qualitatively a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Mutations in the type II receptor for bone morphogenetic protein (BMPR-II), a receptor member of the transforming growth factor-beta (TGF-beta) superfamily, underlie many cases of familial and sporadic primary pulmonary hypertension (PPH). We postulated that pulmonary artery smooth muscle cells (PASMCs) from patients with PPH might demonstrate abnormal growth responses to TGF-beta superfamily members.
METHODS AND RESULTS: For studies of (3)H-thymidine incorporation or cell proliferation, PASMCs (passages 4 to 8) were derived from main pulmonary arteries. In control cells, 24-hour
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS: To determine the applicability of rapid, sequence specific polymerase chain reaction (PCR)-based HLA class II genotyping for the distinction of complete from partial hydatidiform moles (HM) using DNA extracted from formalin fixed and paraffin wax embedded tissue.
METHODS: Nine HM were studied. DNA was extracted from formalin fixed and paraffin wax embedded tissue after mechanical separation of decidual and molar components. HLA class II DRB (DRB1, -3, -4, and -5) and DQB1 genotyping was performed using a parallel series of PCR reactions, each of which contained sequence specific primers
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The COVID-19 pandemic exposed critical vulnerabilities in global laboratory supply chains, disrupting the availability of key reagents and jeopardising the continuity of genomic surveillance for epidemic response. Sustaining sequencing capacity during shortages requires locally accessible alternatives to commercial kits.
METHODS: We developed ARTIC HELP (Homebrew Enzymes for Library Preparation), an open-source adaptation of the ARTIC nanopore sequencing protocol for viral genomic surveillance. We described cost-effective, generic replacements for enzyme mixes used in tiling multi
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Triptolide is a natural compound isolated from the Tripterygium wilfordii, which possesses anti-inflammatory and anti-tumor activities. Triptolide reportedly inhibits RNA polymerase II-mediated transcription and ATM activities to interfere with DNA repair. However, the roles of triptolide in DNA repair are still largely unknown. Triple negative breast cancer cells (TNBC) are insensitive to targeted anti-tumoral drugs, thus DNA damage chemotherapeutic drugs are the available treatments used in clinic, while the drug resistance of TNBC causes the challenge for successful cure. In this study, we
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To describe and evaluate a polymerase chain reaction (PCR) method for early diagnosis and prompt management of cytomegalovirus (CMV) retinitis in HIV-infected patients.
METHODS: A total of 110 HIV-infected patients (Centers for Disease Control and Prevention stages II to IV) were sampled sequentially for isolation of CMV from peripheral blood leukocytes (PBL; n = 560) and for amplification of CMV DNA in PBL. Semiquantitative analysis of the PCR product was performed and each PCR-positive specimen was assigned a score between 1+ and 4+ (corresponding to four points on a standard cur
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The EPG5 protein is a RAB7A effector involved in fusion specificity between autophagosomes and late endosomes or lysosomes during macroautophagy/autophagy. Mutations in the human EPG5 gene cause a rare and severe multisystem disorder called Vici syndrome. In this work, we show that zebrafish epg5-/- mutants from both heterozygous and incrossed homozygous matings are viable and can develop to the age of sexual maturity without conspicuous defects in external appearance. In agreement with the dysfunctional autophagy of Vici syndrome, western blot revealed higher levels of the Lc3-II autophagy ma
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Norovirus is a highly diverse RNA virus often implicated in foodborne outbreaks, particularly those associated with shellfish. Shellfish are filter feeders, and when harvested in bays exposed to wastewater overflow or storm overflows, they can harbor various pathogens, including human-pathogenic viruses. The application of Sanger or amplicon-based high-throughput sequencing (HTS) technologies to identify human pathogens in shellfish faces two main challenges: (i) distinguishing multiple genotypes/variants in a single sample and (ii) low concentrations of norovirus RNA. Here, we assessed the pe
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sheehan's Syndrome (SS) is defined as pituitary hormone deficiency due to ischemic infarction of the pituitary gland as a result of massive postpartum uterine hemorrhage. Herein, we aimed to investigate the roles of Factor II (G20210A), Factor V (G1691A), MTHFR (C677T and A1298C), PAI-1 4G/5G, and TNF- α (-308 G > A) gene polymorphisms in the etiopathogenesis of SS. Venous blood samples were obtained from 53 cases with SS and 43 healthy women. Standard methods were used to extract the genomic DNAs. Factor II (G20210A), Factor V (G1691A), and MTHFR (C677T and A1298C) polymorphisms were identif
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This paper discusses the development of rapid, reliable, and accurate polymerase chain reaction (PCR) assays for detecting opium poppy (Papaver somniferum L.) in food. Endpoint, quantitative, and digital PCRs were compared based on the amplification of a newly developed DNA marker targeting the NADPH-dependent codeinone reductase (COR) gene. Designed assays were shown to be highly specific and sensitive in discriminating opium poppy from other plant species, even in heat-treated and food samples. Digital PCR was the most sensitive, with a detection limit of up to 5 copies, i.e., approximately
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Na(+)-K(+)-2Cl(-) cotransporter 1 (NKCC1) is upregulated in diverse models of hypertension. We hypothesized that NKCC1 is upregulated via histone modification in the aortas of angiotensin II (Ang II)-induced hypertensive rats. An osmotic mini-pump containing Ang II was implanted in the subcutaneous tissues of the backs of Sprague-Dawley (SD) rats for 7 days. The systolic blood pressure was recorded every day by the tail-cuff method. On days 3 and 7, the mesenteric arteries were excised, cut into rings, mounted in organ baths and subjected to vascular contraction. The levels of Nkcc1 mRNA a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
It is known that high-risk human papillomavirus infection is the main etiological factor in cervical carcinogenesis. However, human papillomavirus screening is not sufficient for early diagnosis. In this study, we aimed to identify potential biomarkers common to cervical carcinoma and human papillomavirus infection by proteomics for human papillomavirus-based early diagnosis and prognosis. To this end, we collected 76 cases of fresh cervical tissues and 116 cases of paraffin-embedded tissue slices, diagnosed as cervical squamous cell carcinoma, cervical intraepithelial neoplasia II-III, or nor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: To validate the 8th edition of the American Joint Committee on Cancer/Union for International Cancer Control (AJCC/UICC) TNM staging system for human papillomavirus (HPV)-related oropharyngeal squamous cell carcinoma (OPSCC) and investigate whether a modified classification better reflects the prognosis.
MATERIALS AND METHODS: Medical records of patients diagnosed with non-metastatic HPV-related OPSCC between 2010 and 2016 at a single institution were retrospectively reviewed. HPV status was determined by immunohistochemical analysis of p16 and/or HPV DNA polymerase chain reaction (P
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The aim of the study was to devise a strategy for large batch analysis to determine HLA Class II alleles exhibited by candidate bone marrow transplant donors and prospective recipients using previously published DNA-based typing techniques. Special attention was directed towards the technical aspects of procedures, the level of typing resolution and the speed of data analysis. 200 blood samples from volunteer bone marrow transplant donors typed serologically for HLA-DR and DQ were further investigated using three DNA-based typing methods: (i) restriction fragment length polymorphism (RFLP) ana
Сравнительное исследованиеСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To investigate the incidence, determinants and significance of delayed clearance of serum HBsAg in chronic hepatitis B virus infection, a prospective follow-up study was conducted in two consecutive groups of patients. Group I consisted of 984 patients (859 men and 125 women) with biopsy-proven chronic type B hepatitis, whereas group II consisted of 1,598 asymptomatic chronic carriers (998 men and 600 women) with normal serum aminotransferase activity. During a mean follow-up period of 4.0 +/- 2.3 yr, 19 patients (1.9%) of group I cleared HBsAg from their serum, whereas 35 patients (2.2%) in g
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with the genetic disease xeroderma pigmentosum (XP) who lack the capacity to carry out nucleotides excision repair (NER) have a dramatically elevated risk of skin cancer on sun exposed areas of the body. NER is the DNA repair mechanism responsible for the removal of DNA lesions resulting from ultraviolet light. In addition, a subset of XP patients develop a progressive neurodegenerative disease, referred to as XP neurologic disease, which is thought to be the result of accumulation of endogenous DNA lesions that are repaired by NER but not other repair pathways. The 8,5-cyclopurine de
СтатьяОбзорResearch Support, N.I.H., IntramuralПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования