Immunopeptidomics is the survey of all peptides displayed on a cell or tissue when bound to human leukocyte antigen (HLA) molecules using tandem mass spectrometry. When attempting to determine the targets of tumour-specific CD8+ T cells, a survey of the potential ligands in tumour tissues is invaluable, and, in comparison with in-silico predictions, provides greater certainty of the existence of individual epitopes, as immunopeptidomics-confirmed CD8+ T-cell epitopes are known to be immunogenic, and direct observation should avoid the risk of autoreactivity which could arise following immunisa
ОбзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The proteasome is critically involved in the production of MHC class I-restricted T cell epitopes. Approximately 20% of all peptides generated by the proteasome are too large for direct presentation by MHC class I molecules. Reits et al. (Immunity 2004. 20: 495-506) suggested that a major portion of proteasomal products are larger than 15 amino acids and require further degradation by the tripeptidyl peptidase II (TPPII) before becoming ligands of MHC class I molecules. Using the well-characterized lymphocytic choriomeningitis virus (LCMV) model, the role of TPPII in the processing of several
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza viruses continue to emerge and re-emerge, posing new threats for public health. Control and treatment of influenza depends mainly on vaccination and chemoprophylaxis with approved antiviral drugs. Identification of specific epitopes derived from influenza viruses has significantly advanced the development of epitope-based vaccines. Here, we explore the idea of using HLA binding data to design an epitope-based vaccine that can elicit heterosubtypic T-cell responses against circulating H7N9, H5N1, and H9N2 subtypes. The hemokinin-1 (HK-1) peptide sequence was used to induce immune resp
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CONTEXT: Papillary thyroid cancer (PTC) is characterized by a lymphocytic infiltration. PTC patients with lymphocytic infiltration may have a better clinical outcome.
OBJECTIVE: Characterization of tumor epitope-specific immunity and correlation analyses with the clinical outcome.
PATIENTS: 150 PTC patients; 40 Hashimoto thyroiditis (HT) patients; 21 healthy controls; 27,239 healthy whites (for HLA typing).
MAIN OUTCOME MEASURES: HLA class I restricted thyroperoxidase (TPO) and thyroglobulin (Tg) epitope-specific T cells (tetramer analyses), correlation analyses between HLA class II phenoty
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Exogenous Ags enter the endosomal pathway and are presented to CD4+ T cells in association with class II molecules whereas endogenously synthesized Ags, such as viral proteins, are presented to CD8+ T cells in association with MHC class I molecules. Therefore, most CTL activation strategies use live vectors although an alternative possibility could be to deliver the epitope into the cytosol by targeting it to an invasive nonreplicative vector. The adenylate cyclase toxin of Bordetella pertussis is able to invade a large number of eukaryotic cells and to deliver its catalytic domain to the cyto
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The immune system is able to recognize substances that originate from inside or outside the body and are potentially harmful. Foreign substances that bind to immune system components exhibit antigenicity and are defined as antigens. The antigens exhibiting immunogenicity can induce innate or adaptive immune responses and give rise to humoral or cell-mediated immunity. The antigens exhibiting mitogenicity can cross-link cell membrane receptors on B and T lymphocytes leading to cell proliferation. All antigens vary greatly in physicochemical features such as biochemical nature, struc
ОбзорСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The tumor-associated antigen MUC1 is a transmembrane glycoprotein, which is overexpressed in human carcinomas. Peptide epitopes, containing the PDTR fragment from the variable number of tandem repeat (VNTR) domains of MUC1 have been found to be immunodominant in T-cell and B-cell responses. However, little is known about the immunogenicity and specificity of T-cell epitopes from other regions of MUC1 that may also participate in immune responses against tumors. In this study, the combination of immunoinformatics, molecular modeling and a vaccine adjuvant strategy were used to predict and descr
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The intracerebral inoculation of Theiler's murine encephalomyelitis virus (TMEV) into susceptible strains of mice results in a chronic, immune-mediated demyelinating disease that shares many features with human multiple sclerosis. As with human MS, T lymphocytes seem to be critically important for the pathogenesis of this virally induced, demyelinating disease. Therefore, determining the fine specificity of the T cell response may be essential for elucidating the mechanism(s) involved in demyelination. By using fusion proteins and synthetic peptides, we have initially identified a region withi
СтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We have previously developed an antigen-delivery system based on hybrid recombinant porcine parvovirus-like particles (PPV-VLPs) formed by the self-assembly of the VP2 protein of PPV carrying a foreign epitope at its N terminus. In this study, different constructs were made containing a CD8(+) T-cell epitope of chicken ovalbumin (OVA) to analyse the influence of the sequence inserted into VP2 on the correct processing of VLPs by antigen-presenting cells. We analysed the presentation of the OVA epitope inserted without flanking sequences or with either different natural flanking sequences or wi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune diseases, often triggered by infection, affect ~5% of the worldwide population. Rheumatoid Arthritis (RA)-a painful condition characterized by the chronic inflammation of joints-comprises up to 20% of known autoimmune pathologies, with the tendency of increasing prevalence. Molecular mimicry is recognized as the leading mechanism underlying infection-mediated autoimmunity, which assumes sequence similarity between microbial and self-peptides driving the activation of autoreactive lymphocytes. T lymphocytes are leading immune cells in the RA-development. Therefore, deeper understandi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Ebola virus (EBOV) is a very contagious virus that is highly fatal in humans and animals. The largest epidemic was in West Africa in 2014, in which over 11,000 people died. However, to date, there are no licensed vaccines against it. Studies show that CD4+ and CD8+ T-cell responses, especially cytotoxic T-lymphocyte (CTL) responses, play key roles in protecting individuals from EBOV infection. Since HLA-restricted epitope vaccines are likely to be effective and safe immunization strategies for infectious diseases, the present study screened for CTL epitopes in the EBOV-nucleoprotein that a
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Helicobacter pylori (H. pylori) infects more than half of the world's population, causing chronic gastritis, peptic ulcers and gastric cancer. Urease B subunit (UreB), a conserved protein of H. pylori, is capable of inducing specific CD4(+) T-cell responses and provides protection against this infection. Previous studies have confirmed the effectiveness of rUreB subunit vaccines in generating CD4(+) T-cell-mediated protection, but less is known regarding the roles of different subtypes of T-cell immunity, such as Th1, Th2 and Th17, particularly the immunodominant epitopes inducing specific CD4
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CD8(+) Реакции T-клеток контролируют лимфоцитный хориомингит (LCMV) инфекцию H-2(b) мышей. Хотя антигенные реакции на инфекцию ЛКМВ хорошо изучены, мы обнаружили, что значительная часть реакции CD8(+) CD44(hi) T-клеток на ЛСМВ в H-2(b) мышах не была учтена известными эпитопами. Мы проверили пептиды, которые, по прогнозам, будут связывать основной гистокомпьютерный сложный класс I и перекрывать 15-мерные пептиды, охватывающие полный протеом ЛКМВ для гамма-интерферона (IFN-гамма) инъекции из CD8(+) Т клеток, полученных из мышей, инфицированных ЛCMV-H-2(b). Мы определили 19 новых эпитопов. Вместе
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Characterizing AChR-specific T lymphocyte clones is an important step towards the ability to induce antigen-specific tolerance in myasthenia gravis (MG). However, the limited supply of relatively inefficient autologous antigen presenting cells (APCs) makes establishing AChR-specific T lymphocyte lines difficult. In this study we targeted AChR to autologous surface IgM+ (sIgM+) APCs using heterobifunctional antibodies (bi-Ab) consisting of anti-sIgM linked to anti-AChR antibodies. FACScan analysis and whole cell-based radioimmunoassay (RIA) showed binding of bi-Ab/AChR conjugates to sIgM+ APCs.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
To study peripheral tolerance of CD8 T cells to a classically MHC-restricted peptide Ag expressed in hepatocytes, ALB1 transgenic (tg) mice expressing the CTL epitope GP33 of the lymphocytic choriomeningitis virus glycoprotein under control of the mouse albumin promoter were generated. ALB1 mice exclusively expressed the GP33 transgene in the liver and, at a 100- to 1000-fold lower level, in the thymus. TCR-tg mice specific for the GP33 epitope were used to directly follow GP33-specific T cells in vivo. These experiments revealed that 1) thymic expression of the GP33 transgene led to incomplet
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little data are available on cellular immune responses during infection with hepatitis E virus (HEV). We therefore mapped CD4 T-cell epitopes in open reading frame (ORF)2 and ORF3 proteins of HEV using lymphocyte proliferation assays and overlapping peptide libraries. Proliferation of peripheral blood mononuclear cells from 40 patients with acute hepatitis E and 21 healthy controls with recombinant HEV ORF2 protein or pools of overlapping HEV ORF2/ORF3 peptides was measured. HLA-DQB1 and HLA-DRB1 alleles were also determined. Mononuclear cells from patients with hepatitis E more often showed s
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Epitope vaccines have been suggested as a strategy to counteract viral escape and development of drug resistance. Multiple studies have shown that Cytotoxic T-Lymphocyte (CTL) and T-Helper (Th) epitopes can generate strong immune responses in Human Immunodeficiency Virus (HIV-1). However, not much is known about the relationship among different types of HIV epitopes, particularly those epitopes that can be considered potential candidates for inclusion in the multi-epitope vaccines.
RESULTS: In this study we used association rule mining to examine relationship between different typ
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Using T-cell clones derived from patients with Chlamydia trachomatis (CT)-induced reactive arthritis, we identified target antigens and mapped the peptide epitopes that were recognized. Several epitopes were conserved in homologous proteins of Chlamydia pneumoniae (CPN), and it was shown that these epitopes were generated following processing of the CPN proteins or CPN elementary bodies, i.e. the T-cell clones were indeed CT and CPN cross-reactive. Given that CPN infection is frequent, we wished to determine whether prior infection with CPN could have an effect on the response to subsequent in
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Recombinant Mycobacterium bovis bacille Calmette-Guèrin (rBCG) expressing the malarial epitopes F2R(II)EBA and (NANP)3 as well as two T cell epitopes of the M. tuberculosis ESAT-6 antigen, generated in favour of mycobacterium codon usage elicited specific immune response against these epitopes. Immunised Balb/c mice demonstrated an increase in almost all of the IgG subclasses against both malarial epitopes and enhanced splenocyte proliferative response against the malarial epitopes as well as selected peptides of ESAT-6. Furthermore, flow cytometric analyses showed elevated numbers of CD4+ lym
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Filamin c is an allergen with strong IgE-binding activity of Scylla paramamosain (named Scy p 9). In this study, the T cell epitopes of Scy p 9 were identified using the CD4+T lymphocyte proliferation assay in the mononuclear cells of the spleen allergic mice. Nine of the thirteen T cell epitope peptides that have been found have the ability to trigger the production of the Th1 cytokine (IFN-γ) and TGF-β. Meanwhile, the findings of the inhibitory Dot blot and basophil activation test of crab allergy patients showed that the mixed nine T cell epitope peptides lacked IgE-binding activity and was
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования