UNLABELLED: Promyelocytic leukemia protein nuclear bodies (PML-NBs) are subnuclear domains implicated in cellular antiviral responses. Despite the antiviral activity, several nuclear replicating DNA viruses use the domains as deposition sites for the incoming viral genomes and/or as sites for viral DNA replication, suggesting that PML-NBs are functionally relevant during early viral infection to establish productive replication. Although PML-NBs and their components have also been implicated in the adenoviral life cycle, it remains unclear whether incoming adenoviral genome complexes target PM
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In situ imaging of genes of pathogenic bacteria can profile cellular heterogeneity, such as the emergence of drug resistance. Fluorescence in situ hybridization (FISH) serves as a classic approach to image mRNAs inside cells, but it remains challenging to elucidate genomic DNAs and relies on multiple fluorescently labeled probes. Herein, we present a dead Cas12a (dCas12a)-labeled polymerase chain reaction (CasPCR) assay for high-contrast imaging of cellular drug-resistant genes. We employed a syncretic dCas12a-green fluorescent protein (dCas12a-GFP) to tag the amplicons, thereby enabling high-
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The genomic landscape of Hodgkin lymphoma (HL) has been difficult to characterize due to the paucity of neoplastic cells and an abundant microenvironment. Such characterization is needed in order to improve treatment strategies.
MATERIALS AND METHODS: We performed comprehensive genomic profiling (CGP) using targeted next-generation sequencing on archival formalin-fixed paraffin embedded tumor samples from 63 patients to analyze the landscape of HL.
RESULTS: CGP was successful for 49/63 archival specimens (78%), and revealed aberrations impacting genes including B2M, TP53, and XPO
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Transcription and three-dimensional (3D) genome organization are closely coupled, but their precise relationship remains unresolved. Evidence from perturbation, imaging, and modeling studies suggests that transcription is not strictly required for the establishment of large-scale genome features such as compartments and topologically associating domains (TADs). Instead, transcription seems to exert more prominent effects at finer spatial scales, where it influences enhancer-promoter interactions, local chromatin loops, and microcompartments. RNA molecules, polymerase-driven supercoiling, and R
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing incidence of localized radiorecurrent prostate cancer demands a shift from modality-centric comparisons toward biomarker-driven patient selection. Light et al. provide a matched comparison of salvage focal therapy (sFT) versus salvage radical prostatectomy (sRP), reporting comparable 10-year cancer-specific survival but fewer complications with sFT. However, the study lacks integration of modern PSMA PET/CT restaging and genomic risk stratification (e.g., Decipher classifier), both of which could profoundly influence therapeutic outcomes. Moreover, salvage reirradiation-a promis
Письмо в редакциюПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite recent advances in the understanding of the genomic landscape of pediatric acute myeloid leukemia (pedAML), targeted treatments are only available for selected genomic alterations, and the functional link between genotype and outcome remains partially elusive. Functional precision medicine approaches to investigate treatment resistance and patient risk have not been applied systematically for pedAML. Here, we describe an advanced functional screening platform combining high-content imaging and deep learning-based phenotyping. In 45 patients with pedAML, we identify BCL2 and FLT3 inhibi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The cranial vault in humans is highly variable, clinically relevant, and heritable, yet its genetic architecture remains poorly understood. Here, we conduct a joint multi-ancestry and admixed multivariate genome-wide association study on 3D cranial vault shape extracted from magnetic resonance images of 6772 children from the ABCD study cohort yielding 30 genome-wide significant loci. Follow-up analyses indicate that these loci overlap with genomic risk loci for sagittal craniosynostosis, show elevated activity cranial neural crest cells, are enriched for processes related to skeletal developm
ОбзорСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Little is known about how genetic variation contributes to neuroanatomical variability, and whether particular genomic regions comprising genes or evolutionarily conserved elements are enriched for effects that influence brain morphology. Here, we examine brain imaging and single-nucleotide polymorphisms (SNPs) data from ∼2,700 individuals. We show that a substantial proportion of variation in cortical surface area is explained by additive effects of SNPs dispersed throughout the genome, with a larger heritable effect for visual and auditory sensory and insular cortices (h(2)∼0.45). Genome-wid
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка правительства СШАTwin StudyПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The genome of most bunyaviruses is divided over three (S, M, and L) single-stranded RNA segments of negative polarity. The three viral RNA segments are essential to establish a productive infection. RNA fluorescence in situ hybridization (FISH) enables the detection, localization, and quantification of RNA molecules at single-molecule resolution. This chapter describes an RNA FISH method to directly visualize individual segment-specific bunyavirus RNAs in fixed infected cells and in mature virus particles, using Rift Valley fever virus as an example. Imaging of bunyavirus RNA segments is a val
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CRISPR-Cas technology has evolved rapidly from a bacterial adaptive immune system to transformative use in molecular diagnostic and genomic engineering. Beyond traditional genome-editing capabilities, newly engineered versions of CRISPR/Cas can be used for programmable transcriptional regulation, epigenetic modification, molecular imaging, and ultrasensitive nucleic acid detection. Specifically, catalytic-inactive Cas proteins like dCas9 and dCas12 retain their ability to bind specific sequences on DNA but do not cleave it. Therefore, these proteins can be reversibly regulated by either CRISPR
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Chiari-like malformations (CM) and syringomyelia (SM) are common in Cavalier King Charles spaniels (CKCS) leading to variable manifestations of pain and scratch. Inheritance studies suggest a polygenic mode of inheritance and association studies have identified loci associated with the presence of SM on MRI. Given the poor correlation of clinical signs of CMSM with MRI findings, we hypothesized that an association study with clinical signs as the phenotype could reveal new loci of interest. The objectives of this study were to perform genome-wide association studies on CKCS using S
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coxsackievirus A9 (CVA9), an enterovirus, is a common cause of pediatric aseptic meningitis and neonatal sepsis. During cell entry, enterovirus capsids undergo conformational changes leading to expansion, formation of large pores, externalization of VP1 N termini, and loss of the lipid factor from VP1. Factors such as receptor binding, heat, and acidic pH can trigger capsid expansion in some enteroviruses. Here, we show that fatty acid-free bovine serum albumin or neutral endosomal ionic conditions can independently prime CVA9 for expansion and genome release. Our results showed that CVA9 trea
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: The brown anole is a model species of the genus Anolis, a squamate (encompassing lizards and snakes) group widely studied in evolutionary, behavioral, and developmental biology. Full genome annotation, the establishment of gene editing techniques, and comprehensive description of reproductive tract morphology and embryogenesis in this species, has laid the foundation for functional studies. However, analysis of brown anole oogenesis is still required and vital to optimize genome modification, mutant line establishment, and analyses of the evolution of reproductive developmental mec
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human genome organizes into several thousand chromatin packing domains that couple euchromatin and heterochromatin into unified nanoscale volumes. Prior work suggested these domains form by transcriptionally driven loops that guide packing domain assembly. Here, we study the process of transcriptionally driven domain formation and maintenance. By pairing auxin-inducible degron technology with nanoscopic imaging, transcriptomics, and Hi-C, we show that Pol-II regulates conformationally defined interphase chromatin packing domains. Pol-II facilitates nascent domain generation and maintains m
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In cancer biology, the functional interpretation of genomic alterations is critical to achieve the promise of genomic profiling in the clinic. For chronic lymphocytic leukemia (CLL), a heterogeneous disease of B-lymphocytes maturing under constitutive B cell receptor (BCR) stimulation, the functional role of diverse clonal mutations remains largely unknown. Here, we demonstrate that alterations in BCR signaling dynamics underlie the progression of B cells toward malignancy. We reveal emergent dynamic features-bimodality, hypersensitivity, and hysteresis-in the BCR signaling pathway of primary
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаResearch Support, N.I.H., IntramuralПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Endoscopic ultrasound (EUS) and intraductal ultrasound (IDUS) play very important roles in the field of biliary tract disease. Because of their excellent spatial resolution, the detection of small lesions and T- or N-staging of tumors have become possible. Additionally, contrast-enhanced EUS and the new imaging technique of detective flow imaging are reported to be useful for differential diagnosis. Furthermore, EUS-guided tissue acquisition is used not only for pathological diagnosis but also to collect tissue samples for cancer genome profiling. This review provides an overview of diagnosis
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multiple myeloma (MM) is increasingly understood as a spatially organized and dynamically evolving disease, in which malignant plasma-cell behavior is shaped by local immune, stromal, vascular, and metabolic contexts. Single-cell, spatial, and multi-omic technologies have resolved tumor-cell heterogeneity, bone marrow niche remodeling, immune dysfunction, and therapy-induced selection at unprecedented resolution, yet an integrated synthesis linking marrow architecture, extramedullary dissemination, circulating tumor cells, metabolic reprogramming, chimeric antigen receptor T (CAR-T) cell and T
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Terminal erythroid differentiation involves dramatic cellular remodeling that culminates in the expulsion of the nucleus, a process known as enucleation. While enucleation is conserved across mammals and is crucial for the generation of fully functional erythrocytes, the mechanisms governing this process have remained largely unknown, in part because the absence of genetic material in mature, enucleated red blood cells hinders genetic experimentation. Here, we performed a pooled, forward-genetic CRISPR-Cas9 screen in enucleated red blood cells derived from primary human hematopoietic stem/prog
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Artificial Intelligence (AI) is reshaping oncology by addressing key limitations in traditional cancer care and enabling data-driven, personalized approaches from diagnosis to treatment. This review explores the transformative role of AI across the cancer care continuum, highlighting its contributions, challenges, and future directions. AI has significantly advanced cancer detection and diagnosis by improving the interpretation of medical imaging (CT, MRI, PET scans, digital pathology) and liquid biopsies, allowing for early and accurate identification of tumors and biomarkers. In genomics and
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Dual molecular diagnoses are increasingly recognized with expanded genomic testing, and may result in blended phenotypes when two independent pathogenic findings contribute to the clinical presentation.
CASE PRESENTATION: A 3-year-old female patient presented with seizures beginning at 8 months of age (generalized tonic-clonic), severe global developmental delay/intellectual disability, generalized hypotonia, absent meaningful speech, and microcephaly (head circumference 44.1 cm, <3rd percentile). Craniofacial features included midface retrusion/hypoplasia, thick eyebrows, bilat
Клинический случайСтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования