Medulloblastoma (MB) is one of the most common pediatric brain tumors and it is estimated that one-third of patients will not achieve long-term survival. Conventional prognostic parameters have limited and unreliable correlations with MB outcome, presenting a major challenge for patients' clinical improvement. Acknowledging this issue, our aim was to build a gene signature and evaluate its potential as a new prognostic model for patients with the disease. In this study, we used six datasets totaling 1679 samples including RNA gene expression and DNA methylation data from primary MB as well as
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Necrotizing enterocolitis (NEC) is a multifactorial gastrointestinal disease with high morbidity and mortality among premature infants. This study aimed to identify novel methylation-regulated biomarkers in NEC intestinal tissue through multiomics analysis. We analyzed DNA methylation and transcriptome datasets from ileum and colon tissues of patients with NEC. We identify methylation-related differential genes (MrDEGs) based on the rule that the degree of methylation in the promoter region is inversely proportional to RNA transcription. These MrDEGs included ADAP1, GUCA2A, BCL2L14, FUT3, MISP
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Glioblastoma multiforme (GBM), the most prevalent subgroup of neuroepithelial tumors, is characterized by dismal overall survival (OS). Several studies have linked O6-methylguanine-DNA-methyltransferase (MGMT) promoter methylation to OS in GBM patients. However, MGMT methylation frequencies vary geographically and across ethnicities, with limited data for South Asian populations, including Pakistan. This study aimed to analyze MGMT promoter methylation in Pakistani GBM patients.
METHODS: Consecutive primary GBM patients diagnosed ≥ 18 years-of-age, with no prior chemotherapy or ra
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sex is an important covariate in all genetic and epigenetic research due to its role in the incidence, progression and outcome of many phenotypic characteristics and human diseases. Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a motor neuron disease with a sex bias towards higher incidence in males. Here, we report for the first time a blood-based epigenome-wide association study meta-analysis in 9274 individuals after stringent quality control (5529 males and 3975 females). We identified a total of 226 ALS saDMPs (sex-associated DMPs) annotated to a total of 159 unique genes. These ALS saDMPs were
СтатьяПрепринтПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Breast cancer is the most common cancer type among women. Despite advanced treatment strategies, some patients still face challenges in disease control, prompting the exploration of new therapeutic approaches. N6-Methyladenosine (m6A) methylation modification regulates RNA and plays a crucial role in various tumor biological processes, closely linked to breast cancer occurrence, development, prognosis, and treatment. M6A regulators impact breast cancer progression, development, and drug resistance by modulating RNA metabolism and tumor-related pathways. Researchers have begun to understand the
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Methylation, a key epigenetic modification, is essential for regulating gene expression and protein function without altering the DNA sequence, contributing to various biological processes, including gene transcription, embryonic development, and cellular functions. Methylation encompasses DNA methylation, RNA methylation and histone modification. Recent research indicates that DNA methylation is vital for establishing and maintaining normal brain functions by modulating the high-order structure of DNA. Alterations in the patterns of DNA methylation can exert significant impacts on both gene e
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Imprinted genes play important functions in placentation and pregnancy; however, research on their roles in different placental diseases is limited. It is believed that epigenetic alterations, such as DNA methylation, of placental imprinting genes may contribute to the different pathological features of severe placental diseases, such as pre-eclampsia (PE) and placenta accreta spectrum disorders (PAS).
RESULTS: In this study, we conducted a comparative analysis of the methylation and expression of placental imprinted genes between PE and PAS using bisulfite sequencing polymerase c
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
After tin and mercury salts were added to estuarine microbial mats increasing amounts of methyltin and methylmercury, respectively, were formed over a 30 to 100 hour time period. Inhibition of the methylation by molybdate, a metabolic inhibitor of sulfate reduction, stimulation by pyruvate addition and lack of methylation by sterilized mats, were evidence that sulfate reducing bacteria within the mats were responsible for the tin and mercury methylation. Methyl mercury was formed from mercuric chloride and mercuric cysteine, but not from mercuric sulfide. We suggest that mercury bound to organ
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Ankylosing spondylitis (AS) is a chronic inflammatory autoimmune disease, mainly characterized by perifibrocartilage osteitis of the sacroiliac joints and spinal enthesitis. To date, the exact pathogenesis of AS remains elusive. It is generally believed that AS is a multifactorial disease involving genetics, infection, environment, and immunity. Among them, genetic factors are the primary determinants of disease risk and severity. In recent years, epigenetic mechanisms such as DNA methylation have been extensively surveyed with respect to the pathogenesis of AS. This review summarizes the late
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alterations to DNA methylation have been identified in both hepatocellular carcinoma (HCC) tumor and circulating DNA from affected individuals. These markers have potential utility in HCC screening. Adherence to HCC screening is poor and acceptable HCC screening tests are needed.
METHODS: A feasibility study was performed on a subset of case patients and control subjects from a prior study of risk factors for HCC. Case patients (n=12) included adults aged 47-85 years with a first diagnosis of HCC between 2011 and 2016 and without viral hepatitis. Control subjects (n=12) were match
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Introduction: Some gene expression regulation in cancers can be controlled by epigenetic change like methylation. PTEN promoter methylation and expression were evaluated in endometrial cancer. Methods: The study was run on 39 tumor tissues of endometrial cancer patients and 41 normal endometrial tissues. After total RNA extraction, cDNA synthesis was done by reverse transcription of the total (real-time PCR) using SYBER Green master mix. DNA extraction and bisulfite treatment were conducted and methylation was semiquantified by the methylation-sensitive high-resolution melting method. Finally,
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA methylation is a fundamental epigenetic mark that governs gene expression and chromatin organization, thus providing a window into cellular identity and developmental processes1. Current datasets typically include only a fraction of methylation sites and are often based either on cell lines that underwent massive changes in culture or on tissues containing unspecified mixtures of cells2-5. Here we describe a human methylome atlas, based on deep whole-genome bisulfite sequencing, allowing fragment-level analysis across thousands of unique markers for 39 cell types sorted from 205 healthy ti
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Poor wound healing is a significant complication of diabetes, which is commonly caused by neuropathy, trauma, deformities, plantar hypertension and peripheral arterial disease. Diabetic foot ulcers (DFU) are difficult to heal, which makes patients susceptible to infections and can ultimately conduce to limb amputation or even death in severe cases. An increasing number of studies have found that epigenetic alterations are strongly associated with poor wound healing in diabetes.
AIM OF REVIEW: This work provides significant insights into the development of therapeutics for improvin
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVE: To investigate whether medication-overuse headache patients have differential DNA-methylation pattern.
METHODS: We collected blood samples from 120 medication-overuse headache-patients, 57 controls (29 episodic migraine patients and 28 healthy controls) in a hypothesis-generating cross-sectional case-control pilot study; 100 of the medication-overuse headache-patients were followed for six months and samples were collected at two and six months for the longitudinal methylation analyses. Blood cell proportions of leucocytes (neutrophils, NK-cells, monocytes, CD8+ and CD4+ T-cells, a
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
People with ovaries experience reproductive aging as their reproductive function and system declines. This has significant implications for both fertility and long-term health, with people experiencing an increased risk of cardiometabolic disorders after menopause. Reproductive aging can be assessed through markers of ovarian reserve, response to fertility treatment or molecular biomarkers, including DNA methylation. Changes in DNA methylation with age associate with poorer reproductive outcomes, and epigenome-wide studies can provide insight into genes and pathways involved. DNA methylation-b
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Electrical stimulation (ES) influences neural regeneration and functionality. We here investigate whether ES regulates DNA demethylation, a critical epigenetic event known to influence nerve regeneration. Retinal ganglion cells (RGCs) have long served as a standard model for central nervous system neurons, whose growth and disease development are reportedly affected by DNA methylation. The current study focuses on the ability of ES to rescue RGCs and preserve vision by modulating DNA demethylation. To evaluate DNA demethylation pattern during development, RGCs from mice at different stages of
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Acute aortic dissection (AAD) is a life-threatening cardiovascular disease. Recent studies have shown that DNA methylation may be associated with the pathological mechanism of AAD, but the panorama of DNA methylation needs to be explored.
METHODS: DNA methylation patterns were screened using Infinium Human Methylation 450 K BeadChip in the aortic tissues from 4 patients with Stanford-A AAD and 4 controls. Gene enrichment was analyzed by Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway and gene ontology (GO). DNA methylation levels of candidate genes were determined by pyrose
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND AIM: Aberrant DNA methylation has been found in various cancer types including gastric cancer, yet the genome-wide DNA methylation profile of gastric cardia cancer (GCC) remains unclear. Therefore, we aimed to profile the DNA methylation pattern of GCC and identify promising diagnostic epigenetic biomarkers.
METHODS: We investigated the genome-wide DNA methylation pattern in eight pairs of GCC and adjacent normal tissues using Illumina 850K microarrays. Subsequently, bisulfite-pyrosequencing and quantitative real-time PCR were performed on eight pairs of GCC-adjacent normal tis
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Aberrant DNA methylation plays a crucial role in oral carcinogenesis. Our previous study demonstrated hypermethylation of DAPK1, LRPPRC, RAB6C, and ZNF471 promoters in patients with tongue squamous cell carcinoma compared with normal samples. Methylation profiling using salivary DNA is considered a non-invasive alternative to tissue samples. Hence, the present study tested the DNA methylation status of these four promoters as indicators of oral cancer progression.
METHODS: We performed the bisulfite-based targeted next-generation sequencing of four candidate genes in saliva and tissu
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Parathyroid tumors are common endocrine neoplasias associated with primary hyperparathyroidism. Although numerous studies have studied the subject, the predictive value of gene biomarkers nevertheless remains low.
METHODS: In this study, we performed genomic analysis of abnormal DNA methylation in parathyroid tumors. After data preprocessing, differentially methylated genes were extracted from patients with parathyroid tumors by using t-tests.
RESULTS: After refinement of the basic differential methylation, 28241 unique CpGs (634 genes) were identified to be methylated. The methy
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования