RNA interference (RNAi) is being widely used in functional gene research and is an important tool for drug discovery. However, canonical double-stranded short interfering RNAs are unstable and induce undesirable adverse effects, and thus there is no currently RNAi-based therapy in the clinic. We have developed a novel class of RNAi agents, and evaluated their effectiveness in vitro and in mouse models of acute lung injury (ALI) and pulmonary fibrosis. The novel class of RNAi agents (nkRNA®, PnkRNA™) were synthesized on solid phase as single-stranded RNAs that, following synthesis, self-anneal
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In plants and invertebrate animals, RNA silencing is a form of nucleic acid-based adaptive immunity. By contrast, jawed vertebrates have evolved complex protein-based adaptive immunity. Although short interfering RNAs (siRNAs) have been used as artificial tools to silence viral infection in human cells, it remains unknown whether mammalian viruses naturally elicit such immunity in vertebral cells. Here, we report the evidence that HIV-1 encodes viral siRNA precursors in its genome and that natural HIV-1 infection provokes nucleic acid-based immunity in human cells. To combat this cellular defe
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis B virus (HBV) is a small double-stranded DNA virus that chronically infects 296 million people. Over half of its compact genome encodes proteins in two overlapping reading frames, and during evolution, multiple selective pressures can act on shared nucleotides. This study combines an RNA-based HBV cell culture system with deep mutational scanning (DMS) to uncouple cis- and trans-acting sequence requirements in the HBV genome. The results support a leaky ribosome scanning model for polymerase translation, provide a fitness map of the HBV polymerase at single-nucleotide resolution, and
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Systemic lupus erythematosus (SLE) patients with discoid lupus erythematosus (DLE) were reported to have milder disease. To test this observation, we used sandwich arrays containing 98 autoantigens to compare autoantibody profiles of SLE subjects without DLE (DLE-SLE+) (N=9), SLE subjects with DLE (DLE+SLE+) (N=10), DLE subjects without SLE (DLE+SLE-) (N=11), and healthy controls (N=11). We validated differentially expressed autoantibodies using immunoassays in DLE-SLE+ (N=18), DLE+SLE+ (N=17), DLE+SLE- (N=23), and healthy subjects (N=22). Arrays showed 15 IgG autoantibodies (10 against nuclea
Сравнительное исследованиеКонтролируемое клиническое исследованиеСтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАВалидационное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Trichomonas vaginalis (TV) is a parasitic protozoan responsible for the sexually transmitted infection trichomoniasis. Trichomonas vaginalis virus (TVV) is a nonsegmented, 4.5-5 kbp, double-stranded RNA virus, from the Totiviridae family, which inhabits TV. A capsid protein consisting of 120 subunits is covered in channels aiding in RNA release. TVV is closely associated with the Golgi complex and is transmitted vertically. TVV has four subspecies, TVV1, TVV2, TVV3, and TVV4. The clinical significance of TVV and its effect on the pathogenicity of TV is not well known. We performed a systematic
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The mitochondria-associated adapter protein MAVS (also called IPS-1, VISA or CARDIF, designated MAVS for reasons of simplicity in our manuscript) relays signals from cytoplasmic sensors of viral RNA to the IRF3 kinase complex and the interferon-beta (IFN-beta) gene. Using siRNA-mediated knock-down in macrophages we show that IFN-beta synthesis in response to transfected, intracellular double-stranded RNA (dsRNA), a pathogen-associated molecular pattern of viruses, is decreased in absence of MAVS. By contrast, the Gram-positive bacterium Listeria monocytogenes targets the IFN-beta gene without
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV)-encoded RNAs (EBERs) are the most abundant viral transcripts in latently EBV-infected cells. Recently, we found that EBERs play a key role in the maintenance of malignant phenotypes of Burkitt's lymphoma (BL) cells. They confer clonability in soft agarose, tumorigenicity in immunodeficient mice, resistance to apoptosis and induction of interleukin (IL)-10, which acts as an autocrine growth factor of BL cells. Furthermore, we demonstrated that EBERs confer resistance to interferon (IFN)-alpha-induced apoptosis by inhibition of double-stranded (ds) RNA-activated protein
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Согласно сообщениям, алкалоид Буфтенин, который можно найти в растительных экстрактах и секрециях кожи амфибийцев, обладает потенциальной антивирусной активностью. В настоящем исследовании проводится оценка антивирусной активности буфтенина на основе различных генетических характеристик бешеного вируса (RABV, однострунный, негативный вирус РНК), коронавируса канистры (CCOV, позитивный вирус РНК) и двух двойных вирусов ДНК (два штамма вируса герпеса простейшего типа 1/HSV-1 [KOS и ацикловирусно-стойкий HSV-1 штамм 29R] и аденовируса 2, CAV-2). Максимальные концентрации нетоксичного буфотинина в
СтатьяПоиск полного текста в очередиМашинный перевод · не проверен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bats are special in their ability to host emerging viruses. As the only flying mammal, bats endure high metabolic rates yet exhibit elongated lifespans. It is currently unclear whether these unique features are interlinked. The important inflammasome sensor, NLR family pyrin domain containing 3 (NLRP3), has been linked to both viral-induced and age-related inflammation. Here, we report significantly dampened activation of the NLRP3 inflammasome in bat primary immune cells compared to human or mouse counterparts. Lower induction of apoptosis-associated speck-like protein containing a CARD (ASC)
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Accurate monitoring of low levels of viral load (the number of viral particles per milliliter of plasma) in HIV-infected patients is important in terms of evaluation of the progress of antiretroviral therapy. The general approach for detection of low copy HIV RNA is reverse transcription combined with quantitative real-time PCR based on fluorescence detection. The selection of primers and the structure of fluorogenic oligonucleotide probes are crucial for sensitivity and accuracy of the assay. In this chapter, we report the RT-qPCR protocol for detection of low copy HIV RNA using double strand
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Influenza A viruses (IAV) have been the cause of several influenza pandemics in history and are a significant threat for the next global pandemic. Hospitalized influenza patients often have excess interferon production and a dysregulated immune response to the IAV infection. Obtaining a better understanding of the mechanisms of IAV infection that induce these harmful effects would help drug developers and health professionals create more effective treatments for IAV infection and improve patient outcomes. IAV stimulates viral sensors and receptors expressed by alveolar epithelial cells, like R
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although laboratory methods have advanced, the cause of many encephalitides is still unknown. Molecular methods like multiplex PCR and microarrays are considered to be often less sensitive than Next Generation Sequencing, whereas the latter is time-consuming and costly. These analyses require appropriate tissue preparations and are more difficult to perform on formalin-fixed, paraffin-embedded (FFPE) tissues. Anti-double-stranded RNA (dsRNA) antibodies could potentially identify virus infections independently of the viral genome and can be applied to FFPE material. This study examined the appl
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dengue virus is a single-stranded, positive-sense RNA virus that infects ~400 million people worldwide. Currently, there are no approved antivirals available. CRISPR-based screening methods have greatly accelerated the discovery of host factors that are essential for DENV infection and that can be targeted in host-directed antiviral interventions. In the present study, we performed a focused CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Palindromic Repeats) library screen to discover the key host factors that are essential for DENV infection in human Huh7 cells and identified the Protein Activat
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA interference (RNAi) is a post-transcriptional gene-silencing process that occurs in many eukaryotic organisms upon intracellular exposure to double-stranded RNA. Argonaute 2 (Ago2) protein is the catalytic engine of mammalian RNAi. It contains a PIWI domain that is structurally related to RNases H and possibly shares with them a two-metal-ion catalysis mechanism. Here we describe the expression in E. coli of mouse Ago2 and testing of its enzymatic activity in a RISC assay, i.e., for the ability to cleave a target RNA in a single position specified by a complementary small interfering RNA (
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Although genetic risk in coronary artery disease (CAD) is linked to changes in gene expression, recent discoveries have revealed a major role for A-to-I RNA editing in CAD. ADAR1 edits immunogenic double-stranded RNA (dsRNA), preventing activation of the dsRNA sensor MDA5 (IFIH1) and downstream interferon-stimulated gene signaling. Using human plaque analysis and human coronary artery smooth muscle cells (SMCs), here, we show that SMCs uniquely require RNA editing and that MDA5 activation regulates SMC phenotype. In a conditional SMC-specific Adar deletion mouse model on an atherosclerosis-pro
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
DNA-RNA hybrids cause genome instability by promoting transcription-replication conflicts. However, as they are stimulated at double-stranded breaks (DSBs), they can also impact DSB repair. We investigated whether the RNA chaperon ALYREF and its RNA helicase partner UAP56/DDX39B, both of which regulate RNA biogenesis and R-loops, also act at DSBs. We found that ALYREF, but not UAP56/DDX39B, is recruited to DSBs. Recruitment is partially dependent on transcription and hybrids, and fully dependent on polyADP-ribose (PAR). Consistently, we show that ALYREF, but not UAP56/DDX39B, binds PAR in vitr
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The regulation of immune responses by tumors is central to their survival. By diminishing the production of interferon (IFN) and other inflammatory mediators, tumors enhance immune evasion. Responses initiated by nucleic acid sensors and triggered by dysregulated RNA transcription and cytoplasmic DNA undergo down-modulation in tumors. A protein hub that involves the double-stranded RNA (dsRNA) editing enzyme adenosine deaminase RNA specific (ADAR), the RNase DICER1, and the dsRNA-activated kinase protein activator of PKR (PACT) mediates many of these tumor-intrinsic responses, with in vitro AD
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Plant viruses cause nearly half of the emerging plant diseases worldwide, contributing to 10-15% of crop yield losses. Control of plant viral diseases is mainly accomplished by extensive chemical applications targeting the vectors (i.e., insects, nematodes, fungi) transmitting these viruses. However, these chemicals have a significant negative effect on human health and the environment. RNA interference is an endogenous, cellular, sequence-specific RNA degradation mechanism in eukaryotes induced by double-stranded RNA molecules that has been exploited as an antiviral strategy through transgene
СтатьяОбзорПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND/AIM: Malignant pleural mesothelioma (MPM) is an intractable cancer, and causes of its malignant transformation are not well known. Adenosine deaminase acting on RNA (ADAR) is an RNA-editing enzyme that converts adenosine into inosine in double-stranded RNAs potentially involved in malignant development.
MATERIALS AND METHODS: To examine the role of ADAR1 and ADAR2 in MPM, small interfering RNAs (siRNAs) against ADAR1 or ADAR2 were used.
RESULTS: Transfection of siRNA against ADAR2 suppressed proliferation, motility, and invasiveness of MPM cells expressing both ADAR1 and ADAR2; ho
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA interference (RNAi) is an evolutionally conserved gene silencing mechanism present in a variety of eukaryotic species. RNAi uses short double-stranded RNA (dsRNA) to trigger degradation or translation repression of homologous RNA targets in a sequence-specific manner. This system can be induced effectively in vitro and in vivo by direct application of small interfering RNAs (siRNAs), or by expression of short hairpin RNA (shRNA) with non-viral and viral vectors. To date, RNAi has been extensively used as a novel and effective tool for functional genomic studies, and has displayed great pot
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования