An important component of tissues is the extracellular matrix (ECM), which not only forms a tissue scaffold, but also provides the environment for numerous biochemical reactions. Its composition is strictly regulated, and any irregularities can result in the development of many diseases, including cancer. Sarcoid is the most common skin cancer in equids. Its formation results from the presence of the genetic material of the bovine papillomavirus (BPV). In addition, it is assumed that sarcoid-dependent oncogenic transformation arises from a disturbed wound healing process, which may be due to t
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
B-cell non-Hodgkin lymphomas (B-NHLs) are highly heterogenous by genetic, phenotypic, and clinical appearance. Next-generation sequencing technologies and multi-dimensional data analyses have further refined the way these diseases can be more precisely classified by specific genomic, epigenomic, and transcriptomic characteristics. The molecular and genetic heterogeneity of B-NHLs may contribute to the poor outcome of some of these diseases, suggesting that more personalized precision-medicine approaches are needed for improved therapeutic efficacy. The germinal center (GC) B-cell like diffuse
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Tumor molecular screening allows categorization of molecular alterations to select the best therapeutic strategy. AT-rich interactive domain-containing 1A (ARID1A) gene mutations are present in gastric, endometrial, and clear cell ovarian tumors. Inactivation of this gene impairs mismatch repair (MMR) machinery leading to an increased mutation burden that correlates with microsatellite instability (MSI), associated with tumor-infiltrating lymphocytes and programmed death ligand 1 (PD-L1) expression. This is the first case report in lung adenocarcinoma of ARID1A gene alterations lea
Клинический случайСтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Long noncoding RNA (lncRNA) can regulate various physiological and pathological processes through multiple molecular mechanisms in cis and in trans. However, the role of lncRNAs in cardiac hypertrophy is yet to be fully elucidated.
METHODS: A mouse lncRNA microarray was used to identify differentially expressed lncRNAs in the mouse hearts following transverse aortic constriction-induced pressure overload comparing to the sham-operated samples. The direct impact of one lncRNA, Ahit, on cardiomyocyte hypertrophy was characterized in neonatal rat cardiomyocytes in response to phenyle
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Patients with congenital adrenal hyperplasia (CAH) are at risk of long-term cognitive and metabolic sequelae with some of the effects being attributed to the chronic glucocorticoid treatment that they receive. Our pilot study investigates genome-wide DNA methylation in patients with CAH to determine whether there is preliminary evidence for epigenomic reprogramming as well as any relationship to patient outcome. Here, we analysed CD4 + T cell DNA from 28 patients with CAH (mean age = 18.5 ± 6.5 years [y]) and 37 population controls (mean age = 17.0 ± 6.1 y) with the Infinium-HumanMethylation45
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Heart failure (HF) is a leading cause of morbidity and mortality in the United States and worldwide. As a multifactorial syndrome with unpredictable clinical outcomes, identifying the common molecular underpinnings that drive HF pathogenesis remains a major focus of investigation. Disruption of cardiac gene expression has been shown to mediate a common final cascade of pathological hallmarks wherein the heart reactivates numerous developmental pathways. Although the central regulatory mechanisms that drive this cardiac transcriptional reprogramming remain unknown, epigenetic contributions are
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human olfactory receptors (ORs) are seven-pass transmembrane G-protein coupled receptors (GPCR) involved in smell perception and many other signaling pathways. They are primarily expressed in the olfactory epithelium and ectopically expressed in several other organs and tissues. neXtProt contains 4 PE1 (protein existence 1, evidenced at the protein level) ORs, determined on the basis of either protein interaction data (i.e., OR1D4 and OR2AG1) or convincing genetic, haplotype, or biochemical data (i.e., OR1D2 and OR2J3). Not a single OR currently qualifies for neXtProt PE1 status based on mass
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Air pollution exposure represents a major health threat to the developing foetus. DNA methylation is one of the most well-known molecular determinants of the epigenetic status of cells. Blood DNA methylation has been proven sensitive to air pollutants, but the molecular impact of air pollution on new-borns has so far received little attention.
OBJECTIVES: We investigated whether nitrogen dioxide (NO2), particulate matter (PM10), temperature and humidity during pregnancy are associated with differences in placental DNA methylation levels.
METHODS: Whole-genome DNA-methylation was
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
AIMS/HYPOTHESIS: Intrauterine growth restriction (IUGR) is associated with increased susceptibility to obesity, metabolic syndrome and type 2 diabetes. Although the mechanisms underlying the developmental origins of metabolic disease are poorly understood, evidence suggests that epigenomic alterations play a critical role. We sought to identify changes in DNA methylation patterns that are associated with IUGR in CD3(+) T cells purified from umbilical cord blood obtained from male newborns who were appropriate for gestational age (AGA) or who had been exposed to IUGR.
METHODS: CD3(+) T cells w
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myxoid pleomorphic liposarcoma is a recently defined subtype of liposarcoma, which preferentially involves the mediastinum of young patients and shows mixed histological features of conventional myxoid liposarcoma and pleomorphic liposarcoma. While myxoid pleomorphic liposarcoma is known to lack the EWSR1/FUS-DDIT3 fusions characteristic of the former, additional genetic data are limited. To further understand this tumor type, we extensively examined a series of myxoid pleomorphic liposarcomas by fluorescence in situ hybridization (FISH), shallow whole genome sequencing (sWGS) and genome-wide
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Normal-weight polycystic ovary syndrome (PCOS) women exhibit adipose resistance in vivo accompanied by enhanced subcutaneous (SC) abdominal adipose stem cell (ASC) development to adipocytes with accelerated lipid accumulation per cell in vitro. The present study examines chromatin accessibility, RNA expression and fatty acid (FA) synthesis during SC abdominal ASC differentiation into adipocytes in vitro of normal-weight PCOS versus age- and body mass index-matched normoandrogenic ovulatory (control) women to study epigenetic/genetic characteristics as well as functional alterations
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Alcohol use disorder (AUD) is one of the most common forms of substance use disorders with a strong contribution of genetic (50%-60%) and environmental factors. Genome-wide association studies (GWAS) have identified a number of AUD-associated variants, including those in alcohol metabolism genes. These genetic variants may modulate gene expression, making individuals more susceptible to AUD. A long-term alcohol consumption can also change the transcriptome patterns of subjects via epigenetic modulations.
METHODS: To explore the interactive effect of genetic and epigenetic factors
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Despite extensive progress in Huntington's disease (HD) research, very little is known about the association of epigenetic variation and HD pathogenesis in human brain tissues. Moreover, its contribution to the tissue-specific transcriptional regulation of the huntingtin gene (HTT), in which HTT expression levels are highest in brain and testes, is currently unknown. To investigate the role of DNA methylation in HD pathogenesis and tissue-specific expression of HTT, we utilized the Illumina HumanMethylation450K BeadChip array to measure DNA methylation in a cohort of age-matched HD and control
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
A growing body of evidence supports the notion that epigenetic changes such as DNA methylation and histone modifications, both involving chromatin remodeling, contribute to fetal metabolic programming. We use a combination of gene-protein enrichment analysis resources along with functional annotations and protein interaction networks for an integrative approach to understanding the mechanisms underlying fetal metabolic programming. Systems biology approaches suggested that fetal adaptation to an impaired nutritional environment presumes profound changes in gene expression that involve regulati
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pretreatment prediction of neoadjuvant response remains an unresolved challenge in locally advanced rectal cancer, where management is moving towards risk-adapted and response-oriented treatment strategies. Prediction remains difficult because response reflects interacting tumour-intrinsic, immune, stromal, and spatial processes that are incompletely captured by standard clinical and radiological assessment. From a technology-centred perspective, in this Review we assess how molecular, spatial, image-based, and artificial intelligence-enabled approaches are being used to study and predict resp
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: Detection of molecular residual disease using circulating tumor DNA (ctDNA) may enable postoperative risk stratification and guide adjuvant therapy. We evaluated the prognostic value of a tissue-free, epigenomic ctDNA assay in patients with stage III colon cancer (CC) enrolled in a phase III adjuvant chemotherapy trial.
METHODS: Plasma samples were collected after surgery and before adjuvant infusional fluorouracil, leucovorin, and oxaliplatin alone or combined with cetuximab. ctDNA was analyzed using a tissue-free assay; in ctDNA-positive patients, tumor fraction (TF) was quantified
СтатьяКлиническое исследование III фазыРандомизированное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Muscle strength decline is a hallmark of aging and contributes to frailty and bone deterioration, yet the genomic and epigenomic mechanisms predicting functional strength remain unclear. We applied a multiomics approach to identify genetic and epigenetic signatures of muscle strength variability in postmenopausal women. A total of 141 women aged 50-70 yr underwent functional tests, biochemical analysis, anthropometry, blood pressure assessment, and dual-energy X-ray absorptiometry. Participants were classified into higher- and lower-strength groups based on validated upper and lower limb tests
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: DNA methylation accurately predicts chronological age, including gestational age (GA). Previous studies have used 5'-C-phosphate-G-3' sites (CpGs) on the EPIC or 450K arrays to generate epigenetic clocks for estimating GA.
OBJECTIVE: Using the Asthma&Allergy array, we estimated GA and calculated GA acceleration (GAA) in cord blood DNA from 2451 ancestrally diverse participants from 7 birth cohorts investigating early life risk factors for asthma and allergic diseases and disease onset in childhood.
METHODS: Two gestational epigenetic clocks were constructed: one used GA-associate
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Bipolar disorder (BD) is a major mood disorder influenced by both genetic and environmental factors. While DNA methylation from peripheral tissues can reflect both genetic and environmental influences and reveal insights into disease biology, it remains understudied in BD. DNA methylation signatures may complement polygenic scores (PGS) and hold potential as biomarkers. Here, we conducted the largest epigenome-wide association study (EWAS) of BD to date and evaluated the predictive value of polymethylation scores (PMS) in classifying case-control status.
METHODS: DNA methylation f
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Preeclampsia is a severe pregnancy complication that threatens maternal and neonatal health and well-being. Previous studies on epigenome-wide association studies (EWAS) of preeclampsia produced inconsistent results in cord blood tissues, and one possible explanation is their failure to rigorously adjust for cell proportions, gestational age, or other necessary variables.
METHODS: Here, we calculated the DNA methylation changes in cord blood from newborns affected by preeclampsia, using a multi-ethnic cohort from the Hawaii population (24 cases, 38 controls). We comprehensively ad
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.