Omics data have been extensively analyzed to quantify the heterogeneity of cancer and other diseases. Recent studies have suggested that interconnections among omics variables, as reflected in network structures, can be more informative than simpler measures. Multiple types of omics variables can be connected via regulatory relationships, and there are studies modeling heterogeneity based on such regulations. Here, we conduct heterogeneity analysis based on both network structures and regulatory relationships. Significantly different from the existing literature, we consider network structures
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: HIV incidence estimation in population-based surveys often relies on interval-censored seroconversion times and complex survey designs, requiring computationally efficient Bayesian methods. We compared the computational efficiency and inferential performance of Hamiltonian Monte Carlo (HMC) and Metropolis-Hastings (MH) for Bayesian analysis of interval-censored HIV seroconversion times using a weighted log-logistic accelerated failure-time model.
METHODS: We conducted a simulation study of 5,400 datasets varying sample size, censoring, and weight dispersion under identical likelih
СтатьяСравнительное исследованиеПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Pistachio is an important agricultural commodity, and Iran is among the world's leading manufacturers, exporters, and consumers. However, extensive pesticide application in pistachio groves is a source of concern regarding residual contamination in edible nuts. In the present study, 25 pistachio samples collected from Sirjan orchards were analyzed for pesticide residues by the QuEChERS (Quick, Easy, Cheap, Effective, Rugged, and Safe) procedure followed by gas chromatography-mass spectrometry (GC-MS) quantification. Five pesticides from three priority chemical classes-organophosphates (dichlor
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Objective.Current guidelines for management of the neck in oral cavity squamous cell carcinoma (OCSCC) recommend elective nodal treatment of a large part of the regional lymphatic system. We present a model of bilateral lymphatic metastatic progression that estimates the risk of occult nodal involvement based on a patient's clinically diagnosed lymph node level (LNL) involvement, T-stage and tumour extension, enabling a more personalised risk assessment.Approach.We extended a previously published hidden Markov model of lymphatic metastatic progression in oropharyngeal squamous cell carcinoma t
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Alternative Model for Personality Disorders (AMPD) proposes a dimensional framework with two core criteria: Criterion A (personality functioning) and Criterion B (maladaptive traits). Debate remains regarding their incremental validity, with prior studies producing mixed results. This study employed a Delphi method with 17 experts in personality disorders (PDs) to evaluate the conceptual, discriminative, clinical, and informative value of both criteria. Consensus indicated that Criterion B captures individualized trait expressions, while Criterion A was seen as global or individualized, de
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
OBJECTIVES: Temporal trends in exposure are a common source of bias in the case-crossover design. We evaluated four different estimators of the exposure odds ratio (OR) that adjust for such trends.
METHODS: In a simulation study, we simulated 1 million individuals in a 5-year observation period and performed daily Bernoulli-trials to determine exposure status. Exposure probabilities followed a constant, increasing or decreasing trend, or one of three empirical trends based on real-world prescription drug use. The outcome rate was modified by a rate ratio (RR) of 0.5, 1.0 or 2.0. We tested fou
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
This study tests the dimensionality hypothesis, according to which diverse epistemically unfounded beliefs share a single underlying liability in addition to domain-specific components. We focus on conspiracy, paranormal, pseudoscientific, religious, and pseudo-profound ("bullshit") beliefs and examine whether their covariance structure is best captured by a common factor plus residual domain-specific factors. Using a nationally representative Russian sample (N = 1268), we modeled the five belief domains with competing confirmatory factor analysis models. We compared one-factor, correlated fac
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Survival analysis is an important area of medical research, yet existing models often struggle to balance simplicity with flexibility. Simple models require minimal adjustments but come with strong assumptions, while more flexible models require significant input and tuning from researchers. We present a survival model using a Bayesian hierarchical shrinkage method that automatically determines whether each covariate should be treated as static, time-varying, or excluded altogether. This approach strikes a balance between simplicity and flexibility, minimizes the need for tuning, and naturally
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Task-based functional magnetic resonance imaging (fMRI) experiments play a crucial role in modern data-driven neuroscience research. These studies often aim to understand how external stimuli trigger activation in specific brain regions and to explore functional connectivity patterns among predefined regions, commonly referred to as regions of interest (ROIs). Accurately estimating both brain activation and inter-regional connectivity is challenging due to complex spatiotemporal correlations and low signal-to-noise ratios inherent in fMRI data. This paper introduces a joint spatiotemporal Baye
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
In multi-site clinical research, diagnostic assessments can vary across sites even when standardized criteria and instruments are used, leading to inconsistent disease classification. This issue is examined in settings with an anchor variable that confidently identifies disease when positive but provides no information when negative. A random effects model is introduced for site-specific sensitivity, along with likelihood-based methods for estimation and hypothesis testing. The approach addresses two objectives: testing whether diagnostic sensitivity varies across sites, and quantifying the ma
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For many health conditions, there are highly efficacious treatment and prevention products. Maximizing their impact requires strategies that improve the reach of health screening in order to establish who could benefit. For example, HIV prevention strategies aim to expand risk screening and to improve uptake of pre-exposure prophylaxis (PrEP) among those experiencing risk. Often, these strategies induce changes at the group-level (e.g., health clinics or communities) and are evaluated through cluster randomized trials. This scenario creates a complex, multilevel-mediation-missing data problem
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Atypical breast lesions are high-risk findings found on some core needle biopsies that may represent concurrent malignancy. Clinical management remains uncertain due to wide variability in reported upgrade rates and an incomplete understanding of contributing risk factors. Risk prediction models have been developed to estimate likelihood of malignant upgrade (from atypia to malignancy), but these models are highly variable in performance and predictor selection. This systematic review evaluates existing models predicting upgrade to malignancy in high-risk breast lesions, focusing o
СтатьяСистематический обзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
For clinical prediction applications, we are often faced with small sample size data compared to the number of covariates. Such data pose problems for variable selection and prediction, especially when the covariate-response relationship is complicated. To address these challenges, we propose to incorporate external information on the covariates into Bayesian additive regression trees (BART), a sum-of-trees prediction model that utilizes priors on the tree parameters to prevent overfitting. To incorporate external information, an empirical Bayes (EB) framework is developed that estimates, assi
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The COVID-19 pandemic exhibited some interesting temporal dynamics that were not accounted for by the traditional susceptible-infectious-recovered (SIR) family of epidemic time series models. The recorded number of positive tests increased and declined in waves from March 2020 to October 2021. Additional variability appeared around the peak of the waves. The present study examined the time series of positive medical tests reported by the public health system for one U.S. State. The wave patterns were consistent with the probability density function associated with the swallowtail catastrophe m
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
We demonstrate a comprehensive semiparametric approach to causal mediation analysis, addressing the complexities inherent in settings with longitudinal and continuous treatments, confounders, and mediators. Our methodology utilizes a nonparametric structural equation model and a cross-fitted sequential regression technique based on doubly robust pseudo-outcomes, yielding an efficient, asymptotically normal estimator without relying on restrictive parametric modeling assumptions. We are motivated by a recent scientific controversy regarding the effects of invasive mechanical ventilation on the
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The use of multiple tests can improve medical decision making by balancing the benefits of correctly treating ill patients and avoiding unnecessary treatment for healthy individuals against the potential harms of missed diagnoses, inappropriate treatments, and the costs and risks associated with testing. We quantify the incremental net benefit (INB) of single and multiple tests by accounting for a patient's pre-test probability of disease and the associated benefits, harms, and cost of treatment and testing. We decompose the INB into two components: one that captures the value of information p
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
STUDY QUESTION: What is the best-performing model currently predicting live birth outcomes for IVF or ICSI?
SUMMARY ANSWER: Among the identified prognostic models, McLernon's post-treatment model outperforms other models in both the meta-analysis and external validation of a Chinese cohort.
WHAT IS KNOWN ALREADY: With numerous similar models available across different time periods and using various predictors in IVF prognostic models, there is a need to summarize and evaluate them, due to a lack of validated evidence distinguishing high-quality from low-quality prediction tools. However, the
СтатьяСистематический обзорМетаанализПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Motivated by a pregnancy miscarriage study, we propose a Bayesian joint model for longitudinal and time-to-event outcomes that takes into account different complexities of the problem. In particular, the longitudinal process is modeled by means of a nonlinear specification with subject-specific error variance. In addition, the exact time of fetal death is unknown, and a subgroup of women is not susceptible to miscarriage. Hence, we model the survival process via a mixture cure model for interval-censored data. Finally, both processes are linked through the subject-specific longitudinal mean an
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Multistate models offer a natural framework for studying many chronic disease processes. Interest often lies in identifying which among a large list of candidate variables play a role in the progression of such processes. We consider the problem of variable selection for progressive multistate processes under intermittent observation based on penalized log-likelihood. An Expectation-Maximization (EM) algorithm is developed such that the maximization step can exploit existing software for penalized Poisson regression thereby allowing for the use of common penalty functions. Simulation studies s
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Given the high incidence of cardio and cerebrovascular diseases (CVD), and their association with morbidity and mortality, their prevention is a major public health issue. A high level of blood pressure is a well-known risk factor for these events, and an increasing number of studies suggest that blood pressure variability may also be an independent risk factor. However, these studies suffer from significant methodological weaknesses. In this work, we propose a new location-scale joint model for the repeated measures of a marker and competing events. This joint model combines a mixed model inc
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования