BACKGROUND: Human T-lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) infects up to ten million people worldwide and is associated with inflammatory diseases, including HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis (HAM/TSP). Individuals with HAM/TSP are prone to pulmonary complications such as bronchiectasis, characterized by sustained mononuclear cell infiltration and elevated inflammatory mediators in bronchoalveolar lavage fluid. However, the epithelial mechanisms linking HTLV-1 exposure to lung inflammation remain poorly defined. METHODS: To study epithelial signaling in response to HTLV-1 e
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Gastrointestinal nematode (GIN) infections are the most prevalent parasitic diseases in grazing sheep worldwide, causing significant productivity losses, high mortality and, as a result, economic losses and emerging animal welfare concerns. Conventional control strategies, primarily relying on anthelmintic treatments, face limitations due to rising drug resistance and environmental concerns, underscoring the need for sustainable alternatives. Selective breeding for host genetic resistance has emerged as a promising strategy, while recent advances in transcriptomics and integrative omics resear
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Rheumatoid arthritis (RA) patients have a clearly increased possibility to develop tuberculosis (TB). However, the common molecular background, useful diagnostic molecules, and treatment-related targets of this comorbidity are still not sufficiently explained. We attempted to search the shared genetic factors and candidate drug targets for RA and TB by an integrated multi-omics way.
METHODS: Bulk transcriptome data sets for RA and TB were obtained from Gene Expression Omnibus (GEO). Differential expression analysis and weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) were firs
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Tuberculous meningitis (TBM), the most severe form of Mycobacterium tuberculosis infection, is characterized by high mortality and neurological sequelae, largely attributed to blood-brain barrier (BBB) disruption. While recent studies identified GSDMD-mediated endothelial pyroptosis as a key mechanism of inflammatory BBB damage, the full molecular landscape in TBM remains unclear.
METHODS: This study employed an integrated multi-omics approach, combining bulk and single-cell RNA sequencing of clinical and murine datasets with experimental validation, to identify central mediator
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Immune checkpoint inhibitor (ICI) therapy has become standard of care for late stage non-small cell lung cancer (NSCLC), producing durable responses in a subset of patients. However, inflammatory side eKects termed immune-related adverse events (irAEs) occur in up to 40% of ICI-treated NSCLC patients. Current approaches to alleviate irAEs include treatment with immune-suppressing corticosteroids. However, these treatments may undermine the eKicacy of ICIs by suppressing both the irAE and the anti-tumour immune response. To identify more specific therapeutic targets, a better unde
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The increasing biological complexity and heterogeneity of cancer have driven a shift in oncology drug discovery from single-target approaches toward system-level strategies capable of capturing multilayered disease regulation. Multi-omics technologies, including genomics, transcriptomics, proteomics, metabolomics, epigenomics, and microbiomics, have emerged as powerful tools for elucidating cancer-driving mechanisms, identifying therapeutic targets, and enabling biomarker-guided drug development. This review examines how integrative multi-omics approaches support cancer drug discovery and ther
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Glioblastoma (GBM) is characterized by marked intratumoral heterogeneity, diffuse invasion, and a profoundly immunosuppressive tumor microenvironment. In this study, we applied an integrative multi-omics and radiogenomic framework to identify candidate biomarkers reflecting complementary dimensions of GBM heterogeneity. Public bulk transcriptomic datasets were integrated to define GBM-related differentially expressed genes, which were intersected with curated microbiota-associated gene sets as a hypothesis-generating screening strategy. Machine-learning models with SHAP interpretation were use
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Fluoride, a common agricultural additive used to enhance plant resilience and pest control, poses toxicity risks when exposure surpasses safe thresholds, affecting ecosystems and human health. While its reproductive toxicity is recognized, the sex-specific and cross-generational effects remain underexplored. To address this gap, we employed an integrative approach combining transcriptomics (next-generation sequencing (NGS)), bioinformatic network analysis, gut microbiota sequencing, and in vivo functional assays. ICR mice (F0 generation), both male and female, were exposed to fluoride (100 mg/
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Pregnancy is a complex process that requires a tightly regulated immune environment to support fetal development and protect against infections. The main barrier between fetus and mother is a specialized organ, the placenta, where the role of specific immune cell populations remains incompletely understood.
METHODS: In this work, we used spatial transcriptomics at E12.5 to characterize immune and non-immune cell heterogeneity and spatial organization in the mouse placenta. In addition, we performed murine placental mononuclear cell flow cytometry proteomics, murine placental ery
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: UBA1 and UBA6 are classic ubiquitin-activating E1 enzymes, which participate in the ubiquitination degradation of intracellular proteins and are closely related to the occurrence and development of various diseases and tumors. However, at present, comprehensive analysis has not been used to study the role of UBA family in cancers.
METHODS: We extracted the relevant data of cancer patients from the TCGA database and studied the relationship between the expression patterns of UBA family and the survival rate, and stage of patients in pan-cancer, especially breast cancer (BRCA), colo
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND AND PURPOSE: Quantifying tumor heterogeneity from various dimensions is crucial for precise treatment. This study aimed to develop and validate multi-omics models based on the computed tomography images, pathological images, dose and clinical information to predict treatment response and overall survival of non-small cell lung cancer (NSCLC) patients undergoing chemotherapy and radiotherapy.
MATERIALS AND METHODS: This retrospective study included 220 NSCLC patients from three centers. Following feature extraction and selection, single-omics and multi-omics models were built for tr
СтатьяМногоцентровое исследованиеПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Major depressive disorder (MDD) is linked to a higher risk of premature aging, but the mechanisms underlying this association remain unclear. Using data from two population cohorts (UK Biobank and Finnish Twin Cohort), we evaluate the relationship between systemic and organ-specific proteomic and epigenetic aging acceleration and MDD. A lifetime history of MDD was associated with accelerated proteomic aging at both systemic and organ-specific levels-including the brain-in both cohorts, with stronger associations than those observed with systemic epigenetic aging. Systemic and brain-specific pr
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The myelodysplastic syndrome (MDS) is group of clonal hematopoietic stem cell disorders typified by peripheral cytopenia, dysplastic hematopoietic progenitors, a hypercellular or hypocellular bone marrow, and a high risk of conversion to acute myeloid leukemia. TP53 is a tumor suppressor gene that plays an important role in tumor suppression. Decitabine (DAC) monotherapy has been shown to improve the response rates in TP53-mutated MDS, while the molecular mechanisms of clinical responses are unclear. This study aimed to initially evaluate the TP53 gene locus mutation and the regulation mechani
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The dysregulation of human genes and proteins following SARS-CoV-2 infection significantly impacts the clinical symptoms and prognosis of COVID-19, particularly in immunocompromised individuals such as patients with hematological tumors. Despite this, a comprehensive multi-omics understanding of human host immune responses remains incomplete. Here, we conducted a multi-omics analysis of 89 peripheral blood samples (RNA sequencing) and 98 serum samples (proteome mass spectrometry) from 52 patients with COVID-19, including patients with hematological tumors and non-tumor individuals. By integrat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
INTRODUCTION: Reduced vaccine efficacy may hinder stable herd immunity. Traditional natural medicinal ingredients, such as Ganoderma lucidum products, have shown potential as safe and effective adjuvants to improve vaccine efficacy. However, their roles in assisting human epidemiological vaccines remain uninvestigated.
OBJECTIVES: This study aimed to evaluate Ganoderma lucidum spore powder (GLSP) as an adjuvant for coronavirus disease 2019 (COVID-19) vaccine boosters and to elucidate its underlying immunomodulatory mechanisms.
METHODS: The microneutralization assay was utilized to measure th
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Atherosclerosis is a chronic inflammatory disease of blood vessels, characterized by atherosclerotic lesions in large- and medium-sized arteries. IFNγ is a crucial mediator of atherosclerosis through activation of signal transducer and activator of transcription (STAT)1. Macrophages (MØ), in different subtypes, play a central role in atherosclerosis, from early foam cell formation to advanced plaque development and potential rupture. Recent evidence in MØ supports a collaborative role of STAT1 with PU.1, in association with histone acetylation and methylation marks, in MØ-specific IFNγ-activat
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Anti-N-methyl-D-aspartate receptor encephalitis (anti-NMDARE) is a prevalent type of autoimmune encephalitis caused by antibodies targeting the NMDAR's GluN1 subunit. While significant progress has been made in elucidating the pathophysiology of autoimmune diseases, the immunological mechanisms underlying anti-NMDARE remain elusive. This study aimed to characterize immune cell interactions and dysregulation in anti-NMDARE by leveraging single-cell multi-omics sequencing technologies.
METHODS: Peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from patients in the acute phase of anti-NMDAR
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: Sepsis-associated encephalopathy (SAE) constitutes a significant neurological manifestation of sepsis, characterized by high mortality rates and posing a critical threat to patient outcomes. Magnesium sulfate has multiple effects in the nervous system, including neuroprotection, sedation, anticonvulsant activity, enhanced neuroplasticity, anti - inflammation and promotion of nerve repair. It can regulate calcium homeostasis, exert antioxidant effects, and reduce the release of inflammatory factors, thereby alleviating neuronal damage and neurological deficits. This study integrated
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
BACKGROUND: As a predominant form of cancer affecting male populations, prostate cancer (PCa) demonstrates notably high incidence rates globally. The significant heterogeneity in tumor microenvironment (TME) composition (including epithelial and diverse cell populations) hinders clear interpretation of gene and biomarker roles in disease advancement and immune response modulation. Through combined analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data, this investigation evaluates prostate cancer-related genes' clinical relevance and prognostic potential.
METHODS: We applied approaches like Fin
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sepsis-associated acute kidney injury is a critical condition driven by immune dysregulation, particularly involving neutrophils, yet their heterogeneity and molecular contributions remain underexplored. This study employed a multi-omics approach, integrating single-cell and bulk RNA sequencing from 21 sepsis samples and Escherichia coli-induced sepsis datasets, alongside bioinformatics, machine learning, and experimental validation in a rat model and human peripheral blood. We identified four neutrophil subtypes-pro-inflammatory, anti-inflammatory, mature, and immature-revealing a significant
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
MedElevator
Войти в исследования