A healthy and independent life requires skeletal muscles to maintain optimal function throughout the lifespan, which is in turn dependent on efficient activation of processes that regulate muscle development, homeostasis, and metabolism. Thus, identifying mechanisms that modulate these processes is of crucial priority. Noncoding RNAs (ncRNAs), including microRNAs (miRNAs) and long noncoding RNAs (lncRNAs), have emerged as a class of previously unrecognized transcripts whose importance in a wide range of biological processes and human disease is only starting to be appreciated. In this review,
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Epstein-Barr virus (EBV)-encoded small RNAs (EBERs) are polyA-, non-coding RNAs that are expressed abundantly in all forms of cells latently infected with EBV. EBERs (EBER1 and EBER2) contribute to the clonal proliferation of EBV-negative Burkitt's lymphoma (BL) cells in soft agar, tumorigenicity in SCID mice, up-regulation of the bcl-2 oncoprotein, resistance to apoptosis, and maintenance of malignant phenotypes in BL cells. EBERs induce the expression of interleukin (IL)-10 in BL cells, insulin-like growth factor 1 (IGF-I) in gastric and nasopharyngeal carcinoma cells, IL-9 in T cells, and I
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАОбзорПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Sequences of human beta-globin mRNA were determined by analysis of complementary DNA. beta-mRNA was transcribed into double-stranded cDNA by RNA-dependent DNA polymerase. cDNA was cut by restriction endonucleases and the fragments were terminally labeled by means of polynucleotide kinase and [gamma-32P]ATP. After purification, fragments were degraded by snake venom phosphodiesterase. Alternatively single-stranded [32P]cDNA was prepared by transcription in the presence of [alpha-32P]dCTP and actinomycin D; the product was digested by endonuclease IV and degraded by snake venom phosphodiesterase
СтатьяПоддержка правительства СШАПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Myotonic dystrophy type 1 (DM1) is a rare genetic disorder, characterised by muscular dystrophy, myotonia, and other symptoms. DM1 is caused by the expansion of a CTG repeat in the 3'-untranslated region of DMPK. Longer CTG expansions are associated with greater symptom severity and earlier age at onset. The primary mechanism of pathogenesis is thought to be mediated by a gain of function of the CUG-containing RNA, that leads to trans-dysregulation of RNA metabolism of many other genes. Specifically, the alternative splicing (AS) and alternative polyadenylation (APA) of many genes is known to
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The 3' untranslated regions (UTRs), located at the end of mRNA molecules, are believed to play a role in RNA replication and/or protein translation. Mutations in the tyrosinase (Tyr) gene are known to cause recessive albinism in humans and other species. In this study, to test whether the CRISPR/Cas9 system works on the mutation of the UTRs regulatory region in rabbit, the 3' UTR of the rabbit Tyr gene was deleted by a dual sgRNA directed CRISPR/Cas9 system. As expected, gray coat color and reduced melanin in hair follicles and irises was found in the mutated rabbit, thus increasing confidence
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
UNLABELLED: Osteoarthritis (OA) is a very common chronic and degenerative joint disease characterized by persistent destruction of articular cartilage. Recently, increasing evidence showed that circular RNAs (circRNAs) play critical roles in OA progression. However, the functions of circRNAs in OA and their underlying mechanisms of action remain unclear. In the present study, the expression levels of circRNA-UBE2G1 and HIF-1a were significantly increased in OA tissues, whereas miR‑373 expression was downregulated. Function assays showed that circRNA-UBE2G1 inhibition reduced the effects of LPS
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Hepatitis C Virus (HCV) is a plus-strand RNA virus that replicates its genome via a minus-strand intermediate, which in turn is the template for the synthesis of progeny plus-strand genomes. In order to characterize sequence elements in the HCV 5'-untranslated region (5'UTR) that are possibly involved in the regulation of minus-strand RNA synthesis starting at the genome's 3'end, we used a replicon system in which a possible function of these sequences is uncoupled from other functions like translation regulation. For the specific detection by RT-qPCR of minus strands newly synthesized in the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The utility of messenger RNA (mRNA) as a therapeutic modality has been widely demonstrated with the containment of COVID-19, yet the decisions in sequence design in the untranslated regions (UTRs) remain largely unexplored, especially in preclinical models. Here, we focus on the 5' UTR of mRNA and discover sequences that improve therapeutic potential in mouse models of aging and obesity. Bioinformatic analysis of RNA sequencing (RNA-seq), single-cell RNA-seq, ribosome profiling, and crosslinking and immunoprecipitation followed by sequencing data revealed that ribosomal protein (RP) mRNAs are
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria employ small regulatory RNAs (sRNA) and/or RNA binding proteins (RBPs) to respond to environmental cues. In Enterobacteriaceae, the FinO-domain containing RBP ProQ associates with numerous sRNAs and mRNAs, impacts sRNA-mediated riboregulation or mRNA stability by binding to 5'- or 3'-untranslated regions as well as to internal stem loop structures. Global RNA-protein interaction studies and sequence comparisons identified a ProQ-like homolog (PA2582/ProQ Pae ) in Pseudomonas aeruginosa (Pae). To address the function of ProQ Pae , at first a comparative transcriptome analysis of the Pa
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
CGG tandem repeat expansion in the 5'-untranslated region of the fragile X mental retardation-1 (FMR1) gene leads to unusual nucleic acid conformations, hence causing genetic instabilities. We show that the number of G…G (in CGG repeat) or C…C (in CCG repeat) mismatches (other than A…T, T…A, C…G and G…C canonical base pairs) dictates the secondary structural choice of the sense and antisense strands of the FMR1 gene and their corresponding transcripts in fragile X-associated tremor/ataxia syndrome (FXTAS). The circular dichroism (CD) spectra and electrophoretic mobility shift assay (EMSA) reve
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Enterovirus 71 (EV71), a single-stranded RNA virus, is one of the most serious neurotropic pathogens in the Asia-Pacific region. Through interactions with host proteins, the 5' untranslated region (5'UTR) of EV71 is important for viral replication. To gain a protein profile that interact with the EV71 5'UTR in neuronal cells, we performed a biotinylated RNA-protein pull-down assay in conjunction with LC-MS/MS analysis. A total of 109 proteins were detected and subjected to Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) analyses. These proteins were found to be highly c
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The Harlequin mutant mouse, characterized by loss of function of apoptosis-inducing factor, represents a reliable genetic model that resembles pathologies caused by human mitochondrial complex I deficiency. Therefore, we extensively characterized the retinal morphology and function of Harlequin mice during the course of neuronal cell death leading to blindness, with the aim of preventing optic atrophy. Retinas and optic nerves from these mice showed an isolated respiratory chain complex I defect correlated with retinal ganglion cell loss, optic atrophy, glial and microglial cell activation. Al
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Coronavirus nonstructural protein 15 (Nsp15) is a conserved uridine-preferring endoribonuclease (EndoU). Studies using mouse hepatitis virus (MHV), SARS-CoV-2, and other coronaviruses have shown that Nsp15 associates with replication-transcription complexes (RTCs) and contributes to viral immune evasion. Structural studies of alpha- and beta-coronavirus Nsp15 proteins reveal a hexameric enzyme that engages viral RNA substrates and cleaves at unpaired uridines through an RNase A-like, largely metal-independent mechanism stimulated by divalent cations. The Nsp15 hexamer functions as a dynamic, c
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA polymerase III (Pol III) transcribes cytosolic transfer RNAs (tRNAs) and other non-coding RNAs (ncRNAs) essential to cellular function. However, many aspects of Pol III transcription and processing, including RNA modifications, remain poorly understood, mainly due to a lack of available sensitive and systematic methods for their analysis. Here, we present DRAP3R (Direct Read and Analysis of Polymerase III transcribed RNAs), a modified nanopore direct RNA sequencing approach and analysis framework that enables the specific and sensitive capture of pre-mature Pol III transcribed RNAs. Applyi
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small regulatory RNAs (sRNAs) are involved in antiviral defense and gene regulation. Although roles of RNA-dependent RNA Polymerases (RdRPs) in sRNA biology are extensively studied in nematodes, plants and fungi, understanding of RdRP homologs in other animals is still lacking. Here, we study sRNAs in the ISE6 cell line, which is derived from the black-legged tick, an important vector of human and animal pathogens. We find abundant classes of ~22nt sRNAs that require specific combinations of RdRPs and sRNA effector proteins (Argonautes or AGOs). RdRP1-dependent sRNAs possess 5'-monophosphates
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Small RNAs (sRNAs) in bacteria have emerged as key players in transcriptional and post-transcriptional regulation of gene expression. Here, we present a statistical analysis of different sequence- and structure-related features of bacterial sRNAs to identify the descriptors that could discriminate sRNAs from other bacterial RNAs. We investigated a comprehensive and heterogeneous collection of 816 sRNAs, identified by northern blotting across 33 bacterial species and compared their various features with other classes of bacterial RNAs, such as tRNAs, rRNAs and mRNAs. We observed that sRNAs diff
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Mammalian arenavirus (mammarenavirus) mRNAs are characterized by 5'-capped and 3'-nonpolyadenylated untranslated regions (UTRs). We previously reported that the nonpolyadenylated 3'-UTR of viral mRNA (vmRNA), which is derived from the noncoding intergenic region (IGR), regulates viral protein levels at the posttranscriptional level. This finding provided the basis for the development of novel live-attenuated vaccines (LAVs) against human pathogenic mammarenaviruses. Detailed information about the roles of specific vmRNA 3'-UTR sequences in controlling translation efficiency will help in unders
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neurodegenerative diseases (NDs), including Alzheimer's disease, Parkinson's disease, Huntington's disease, and amyotrophic lateral sclerosis (ALS), represent a growing global health challenge characterized by progressive neuronal loss and a lack of definitive disease-modifying treatments. This review explores the emerging potential of targeting non-coding RNAs (ncRNAs), such as microRNAs (miRNAs), long non-coding RNAs (lncRNAs), and exosomal RNAs, to modulate pathogenic molecular pathways and address the underlying molecular origins of neurodegeneration. We evaluate the integration of advance
СтатьяОбзорПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Non-coding RNAs (ncRNAs) have emerged as critical regulators of osteoarthritis (OA) pathogenesis by modulating gene expression at the epigenetic, transcriptional, and post-transcriptional levels. Among the major ncRNA classes, microRNAs (miRNAs), long non-coding RNAs (lncRNAs), and circular RNAs (circRNAs) regulate key biological processes involved in OA progression, including extracellular matrix degradation, synovial inflammation, chondrocyte apoptosis, autophagy, osteoclastogenesis, and subchondral bone remodeling. Increasing evidence demonstrates that ncRNAs influence multiple OA-associate
СтатьяОбзорПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
RNA processing generates diverse protein-coding and non-coding transcripts, yet RNA biotype diversity during cellular differentiation is not well characterized. Merkel cells (MCs) are cutaneous mechanosensors. We analyzed full-length transcripts of FACS-sorted single mouse MCs at all stages of development and discovered that their terminal differentiation was accompanied by an emergence of non-coding transcripts associated with genes related to MC function. Non-coding RNAs upregulated during terminal differentiation included retained intron transcripts capable of forming nuclear condensates th
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.