UNLABELLED: Yellow fever virus is the causative agent of Yellow fever. The genome of the virus contains three structural and seven non-structural proteins. Of these seven nonstructural proteins, NS2B-NS3 protein complex has protease activity required for viral replication. Predicting the 3D structure of this complex and studying the interaction of residues at the recognized catalytic triad of the complex is an integral part to understand the virus replication mechanism. In the present study, the structure was determined for NS2B-NS3 complex by Homology modeling and modeled structure was valida
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Human Pegivirus (HPgV) is an understudied flavivirus that is highly prevalent and often persists in the blood and tissues of humans. HPgV-infected brain tissue from individuals with Parkinson's disease has shown significant transcriptomic and immune signaling differences compared to non-infected Parkinson's brains. The HPgV genome is similar to Hepatitis C Virus (HCV), a well-characterized flavivirus with multiple approved small-molecule therapeutics. Here, we used HCV crystal structures to create homology models for two HPgV non-structural (NS) proteins, the serine protease (NS3) and the RNA-
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacteria expressing type III secretion systems (T3SS) have been responsible for the deaths of millions worldwide, acting as key virulence elements in diseases ranging from plague to typhoid fever. The T3SS is composed of a basal body, which traverses both bacterial membranes, and an external needle through which effector proteins are secreted. We report multiple crystal structures of two proteins that sit at the tip of the needle and are essential for virulence: IpaD from Shigella flexneri and BipD from Burkholderia pseudomallei. The structures reveal that the N-terminal domains of the molecul
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The IgE response has been associated with both allergic reactions and immunity to metazoan parasites. Recently, we hypothesized that all environmental allergens bear structural homology to IgE-binding antigens from metazoan parasites and that this homology defines the relatively small number of protein families containing allergenic targets. In this study, known allergen structures (Pfam domains) from major environmental allergen families were used to predict allergen-like (SmProfilin, SmVAL-6, SmLipocalin, SmHSP20, Sm triosephosphate isomerase, SmThioredoxin, Sm superoxide dismutase, SmCyclop
СтатьяПолный текст не найденПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Biotic stress is a major cause of heavy loss in grape productivity. In order to develop biotic stress-resistant grape varieties, the key defense genes along with its pathway have to be deciphered. In angiosperm plants, lipase-like protein phytoalexin deficient 4 (PAD4) is well known to be essential for systemic resistance against biotic stress. PAD4 functions together with its interacting partner protein enhanced disease susceptibility 1 (EDS1) to promote salicylic acid (SA)-dependent and SA-independent defense pathway. Existence and structure of key protein of systemic resistance EDS1 and PAD
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Deoxyhypusine hydroxylase (DOHH) catalyzes the final step in the post-translational synthesis of an unusual amino acid hypusine (N(€)-(4-amino-2-hydroxybutyl) lysine), which is present on only one cellular protein, eukaryotic initiation factor 5A (eIF5A). We present here the molecular and structural basis of the function of DOHH from the protozoan parasite, Leishmania donovani, which causes visceral leishmaniasis. The L. donovani DOHH gene is 981 bp and encodes a putative polypeptide of 326 amino acids. DOHH is a HEAT-repeat protein with eight tandem repeats of α-helical pairs. Four conserved
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Erythrosine B, also known as FD&C Red No. 3, is a tetraiodofluorescein dye that is widely used as a biological stain and color additive in food and drugs. Recent data show that erythrosine B and Rose Bengal, its polychlorophenyl derivative, are potent inhibitors of both 5'-T4 and 5-T4 monoiododeiodinase activity. However, fluorescein, the nonhalogenated parent compound, has no effect on deiodinase activity. The X-ray crystal structure of erythrosine B was determined to elucidate the structural basis for its competition with T4 for its hormone protein binding sites. These structural results sho
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Stecrisp from Trimeresurus stejnegeri snake venom belongs to a family of cysteine-rich secretory proteins (CRISP) that have various functions related to sperm-egg fusion, innate host defense, and the blockage of ion channels. Here we present the crystal structure of stecrisp refined to 1.6-angstrom resolution. It shows that stecrisp contains three regions, namely a PR-1 (pathogenesis-related proteins of group1) domain, a hinge, and a cysteine-rich domain (CRD). A conformation of solvent-exposed and -conserved residues (His60, Glu75, Glu96, and His115) in the PR-1 domain similar to that of thei
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Neural Wiskott-Aldrich syndrome protein (N-WASP) is an essential regulator of actin cytoskeleton formation via its association with the actin-related protein (Arp) 2/3 complex. It is believed that the C-terminal Arp2/3 complex-activating domain (verprolin homology, cofilin homology, and acidic (VCA) or C-terminal region of WASP family proteins domain) of N-WASP is usually kept masked (autoinhibition) but is opened upon cooperative binding of upstream regulators such as Cdc42 and phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate (PIP2). However, the mechanisms of autoinhibition and association with Arp2/3
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Native lung surfactant protein C (SP-C) is a 4.2-kDa acylpeptide that associates with alveolar surfactant phospholipids via a transmembrane alpha-helix. This helix contains mainly Val, although poly-Val is inefficient in helix formation, and helical SP-C can spontaneously convert to beta-sheet aggregates and amyloid-like fibrils. SP-C is cleaved out from a 21-kDa integral membrane protein, proSP-C, in the alveolar type II cell. Recently several mutations localized in the endoplasmic reticulum-lumenal (C-terminal) part of proSP-C (CTproSP-C) have been associated with intracellular accumulation
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
PURPOSE: A unique cornea-associated antigen (CO-Ag) has been purified previously from stromal extracts. The protein is the target for autoantibodies in patients with Mooren's ulcer. In this study, the amino acid sequence of CO-Ag was analyzed and the structure-function properties of CO-Ag was determined.
METHODS: Purified CO-Ag was subjected to N-terminal sequencing by automated Edman degradation. Binding of calcium (Ca2+) to CO-Ag was measured by a direct (45)Ca2+ -binding assay.
RESULTS: The complete amino acid sequence of CO-Ag has been determined. The protein contains 70 amino acids in a
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод пока не подготовлен
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Chlamydia is amongst the rare bacteria that lack the critical cell division protein FtsZ. By annotation, Chlamydia also lacks several other essential cell division proteins including the FtsLBQ complex that links the early (e.g., FtsZ) and late (e.g., FtsI/Pbp3) components of the division machinery. Here, we report chlamydial FtsL and FtsQ homologs. Ct271 aligned well with Escherichia coli FtsL and shared sequence homology with it, including a predicted leucine-zipper like motif. Based on in silico modeling, we show that Ct764 has structural homology to FtsQ in spite of little sequence similar
СтатьяПолный текст не найденПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The human pathogen Mycoplasma genitalium is responsible for urethritis in men, and for cervicitis and pelvic inflammatory disease in women. The adherence of M. genitalium to host target epithelial cells is mediated through an adhesion complex called Nap, which is essential for infectivity. Nap is a transmembrane dimer of heterodimers of the immunodominant proteins P110 and P140. The M. genitalium genome contains multiple copies of portions that share homology with the extracellular regions of P140 and P110 encoded by the genes mg191 and mg192, respectively. Homologous recombination between the
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Schistosomiasis remains a public health concern in Brazil and is classified by the World Health Organization (WHO) as a Neglected Tropical Disease (NTD). Limitations of current diagnostic methods highlight the need for more sensitive approaches that improve the detection of Schistosoma mansoni while minimizing cross-reactivity with related helminths. Helminthiases contribute substantially to the global burden of disability-adjusted life years (DALYs). In this study, a peptide-based immunodiagnostic strategy was applied using sequences derived from a C-type lectin protein to evaluate relative s
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Humans express 15 formins that play crucial roles in actin-based processes, including cytokinesis, cell motility and mechanotransduction1,2. However, the lack of structures bound to the actin filament (F-actin) has been a major impediment to understanding formin function. Whereas formins are known for their ability to nucleate and elongate F-actin3-7, some formins can additionally depolymerize, sever or bundle F-actin. Two mammalian formins, inverted formin 2 (INF2) and diaphanous 1 (DIA1, encoded by DIAPH1), exemplify this diversity. INF2 shows potent severing activity but elongates weakly8-1
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
HCV NS5A is a dimeric phosphoprotein involved in HCV replication. NS5A inhibitors are among direct-acting antivirals (DAA) for HCV therapy. The Y93H mutant of NS5A is resistant to NS5A inhibitors, but the precise mechanism remains unclear. In this report, we proposed a Ser38-His93-Asn91 triad to dissect the mechanism. Using pymol 1.3 software, the homology structure of JFH1 NS5A was determined based on the dimer structure of genotype 1b extracted from the database Protein DataBank (www.ebi.ac.uk/pdbsum) with codes 1ZH1 and 3FQM/3FQQ. FLAG-NS5A-WT failed to form dimer in the absence of nonstruc
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Autoimmune and dysimmune inflammatory mechanisms on a genetically susceptible background are implicated in the etiology of Behçet's Disease (BD). Heat-shock protein-65 (HSP-65) derived from Streptococcus sanguinis was proposed as a triggering factor based on its homology with human HSP-60. However, none of the autoantigens identified so far in sera from BD share common epitopes with bacterial HSP-65 or has a high prevalence. Here, we report that sera from BD patients are immunoreactive against filamentous neuronal processes in the mouse brain, retina and scrotal skin in great majority of patie
СтатьяПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Bacillus anthracis, the causative agent of anthrax, requires surface (S)-layer proteins for the pathogenesis of infection. Previous work characterized S-layer protein binding via the surface layer homology domain to a pyruvylated carbohydrate in the envelope of vegetative forms. The molecular identity of this carbohydrate and the mechanism of its display in the bacterial envelope are still unknown. Analyzing acid-solubilized, purified carbohydrates by mass spectrometry and NMR spectroscopy, we identify secondary cell wall polysaccharide (SCWP) as the ligand of S-layer proteins. In agreement wi
СтатьяПоддержка NIH: внешняя программаПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
Rad23 proteins are involved both in the ubiquitin-proteasome pathway and in nucleotide excision repair (NER), but the relationship between these two pathways is not yet understood. The two human homologs of Rad23, hHR23A and B, are functionally redundant in NER and interact with xeroderma pigmentosum complementation group C (XPC) protein. The XPC-hHR23 complex is responsible for the specific recognition of damaged DNA, which is an early step in NER. The interaction of the XPC binding domain (XPCB) of hHR23A/B with XPC protein has been shown to be important for its optimal function in NER. We h
Сравнительное исследованиеСтатьяПоддержка службы здравоохранения СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.
The association of Zika virus (ZIKV) infections with microcephaly has resulted in an ongoing public-health emergency. Here we report the crystal structure of a C-terminal fragment of ZIKV nonstructural protein 1 (NS1), a major host-interaction molecule that functions in flaviviral replication, pathogenesis and immune evasion. Comparison with West Nile and dengue virus NS1 structures reveals conserved features but diverse electrostatic characteristics at host-interaction interfaces, thus possibly implying different modes of flavivirus pathogenesis.
СтатьяПоддержка исследования: вне правительства СШАПоиск полного текста в очередиПеревод в очереди
Обработка статьи · этапы, ошибки и управление
Загрузка состояния…
Ошибки и ограничения
История · было → стало
Состояние обновляется каждые 5 секунд, пока блок открыт. Процент показывается только там, где известен объём работы. Пауза останавливает продолжение этапа; текущий запрос к источнику может завершиться.